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基于多光谱方法和计算模拟的细胞色素CYP1A2与阿奇霉素的结合机制研究

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化学研究与应用 2024年第2期36卷 245-253页

作者：史梦洁林晓莲黄芝辉徐敏华何进锋刘红艳桂林理工大学化学与生物工程学院广西电磁化学功能物质重点实验室广西桂林541006

为了解阿奇霉素(AZI)在模拟的人体环境中与CYP1A2的结合情况,探索AZI在人体内的转化机制,本论文使用分子对接、分子动力学模拟、荧光光谱、紫外分光光度法、傅立叶变换红外光谱、圆二色光谱等多种实验方法,阐明AZI与CYP1A2之间的相互作... 详细信息

为了解阿奇霉素(AZI)在模拟的人体环境中与CYP1A2的结合情况,探索AZI在人体内的转化机制,本论文使用分子对接、分子动力学模拟、荧光光谱、紫外分光光度法、傅立叶变换红外光谱、圆二色光谱等多种实验方法,阐明AZI与CYP1A2之间的相互作用机制。分子对接结果表明AZI与CYP1A2的结合方式是半包裹并且以疏水作用力相结合。分子动力学模拟结果表明,CYP1A2-AZI复合物的均方根偏差(RMSD)值增大;均方根波动(RMSF)值表明复合物体系柔性较大;回旋半径(Rg)值表明蛋白质特定区域的结构松散。荧光猝灭光谱实验表明,CYP1A2与AZI是以静态猝灭机制结合在一起。热力学参数表明AZI与CYP1A2之间的主导作用力为疏水作用力。时间分辨光谱表明AZI对CYP1A2的机制为静态猝灭。紫外光谱实验表明AZI与CYP1A2反应生成了复合物。红外光谱实验结果表明CYP1A2的二级结构含量发生了改变。圆二色光谱证实AZI对CYP1A2的二级结构产生影响。

关键词：阿奇霉素 CYP1A2 相互作用分子计算模拟多光谱表征

部分P450酶与氯化前后红霉素及土霉素的相互作用研究

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部分P450酶与氯化前后红霉素及土霉素的相互作用研究

作者：林晓莲桂林理工大学

学位级别：硕士

抗生素的滥用给环境和生命体带来的危害已深受人们关注,当环境中残存的抗生素进入水消毒系统与含氯消毒剂相遇会发生一系列化学反应,生成有害或有潜在毒性的消毒副产物(disinfection by-products,DBPs),DBPs又通过水循环系统进入到生态... 详细信息

抗生素的滥用给环境和生命体带来的危害已深受人们关注,当环境中残存的抗生素进入水消毒系统与含氯消毒剂相遇会发生一系列化学反应,生成有害或有潜在毒性的消毒副产物(disinfection by-products,DBPs),DBPs又通过水循环系统进入到生态系统中,对环境和生命造成危害。细胞色素P450酶作为一种氧化酶,在生物体内外源性化学物质的代谢中起着关键的作用。本文以红霉素和土霉素为目标抗生素,以CYP3A4和CYP1A2为目标酶系,通过分子对接、动力学模拟、多光谱法及人结直肠癌细胞(Caco-2)活性实验探究了抗生素/氯化抗生素与细胞色素P450酶的相互作用机制。本文的研究内容如下:(1)分子对接模拟了细胞色素P450酶与大环内酯类、四环素类抗生素的相互作用。选择在人体中表达较为丰富的CYP3A4、CYP2C9和CYP1A2作为代表P450酶,通过分子对接分别模拟它们与大环内酯类和四环素类抗生素的相互作用,分析它们与不同抗生素间的对接效果,筛选出结合效果最佳的酶与抗生素的组合,结果表明CYP3A4与红霉素、CYP1A2与土霉素的结合能最低,理论结合效果最好。(2)开展了CYP3A4与红霉素及氯化红霉素的相互作用比较研究。首先利用多光谱法研究了CYP3A4与红霉素及氯化红霉素的相互作用;最后研究了红霉素及氯化红霉素对Caco-2细胞活性影响。多光谱法研究结果表明红霉素及氯化红霉素与CYP3A4可以发生相互作用,能量转移也可以诱导CYP3A4发生猝灭;且氯化红霉素对CYP3A4二级结构影响较大。细胞活性实验表明红霉素对Caco-2细胞的生长基本没有影响,氯化红霉素对Caco-2细胞的生长具有抑制作用,其IC值为7.53×10M。以上结果表明红霉素及氯化红霉素与CYP3A4间存在相互作用,氯化土霉素对Caco-2细胞的活性存在抑制作用。(3)进行了土霉素及氯化土霉素与CYP1A2的相互作用比较研究。首先利用多光谱法来解决土霉素及氯化土霉素与CYP1A2之间的相互作用;然后利用Caco-2细胞和土霉素及氯化土霉素进行活性研究。多光谱法结果表明土霉素及氯化土霉素可以使CYP1A2发生猝灭,并引起蛋白质结构的改变。细胞活性实验表明土霉素对Caco-2细胞的生长也基本没有影响,氯化土霉素对Caco-2细胞的生长具有抑制作用,其IC值为4.43×10M。以上结果表明土霉素及氯化土霉素与CYP1A2间存在相互作用,氯化土霉素对Caco-2细胞的活性存在抑制作用。

关键词：细胞色素P4503A4酶细胞色素P4501A2酶红霉素土霉素相互作用

香型水稻种质资源筛选与Badh2等位变异分析

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分子植物育种 2022年

作者：胡明珠杨瑰丽刘洪林晓莲梁雪雨刘永柱郭涛王慧华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心华南农业大学农学院

香味是重要的稻米品质性状之一，挖掘新的香稻种质资源和香味基因Badh2有利等位变异将有利于优质香稻品质的改良。本研究以包含591份来源广泛的水稻的自然群体为材料，通过氢氧化钾浸泡法筛选香稻种质，利用基因组重测序技术对香味性状... 详细信息

香味是重要的稻米品质性状之一，挖掘新的香稻种质资源和香味基因Badh2有利等位变异将有利于优质香稻品质的改良。本研究以包含591份来源广泛的水稻的自然群体为材料，通过氢氧化钾浸泡法筛选香稻种质，利用基因组重测序技术对香味性状的主效基因Badh2进行基因分型，同时结合气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术对香稻香味挥发性物质成分2-AP进行定量分析。研究结果表明：共筛选出63份香型水稻种质，其中56份具有badh2-E7等位变异，2份具有badh2-E4-5等位变异，1份具有badh2-E2等位变异，1份具有badh2-E14.1等位变异；在编号为313-11261的水稻材料中发现其第14外显子具有一个SNP突变，为新的Badh2等位变异类型badh2-E14.2，而‘黑126’在Badh2编码区没有发现突变位点；利用GC-MS分析香味特征物质2-AP含量发现，‘玉针香’的2-AP含量最高，而表型鉴定香味浓郁的‘紫香糯’2-AP测定结果却低至无法定量，但其质谱中含有2-AP特征离子碎片。本研究在不同香稻的Badh2编码区发现多个等位突变类型，这些香稻种质资源将为稻米香味遗传分析以及香稻品种改良提供理论基础。

关键词：香稻香味基因 Badh2 气相色谱-质谱联用 2-乙酰基-1-吡咯啉

氯普鲁卡因复合舒芬太尼用于硬膜外分娩镇痛的效果观察

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黑龙江医药 2023年第1期36卷 33-35页

作者：叶敏涛林晓莲杨泽萍揭阳市揭东区妇幼保健院广东揭阳揭东515500

目的:探讨氯普鲁卡因复合舒芬太尼用于硬膜外分娩镇痛的效果。方法:选择2019年7月至2021年5月在我院实施硬膜外分娩镇痛初产妇60例,年龄24~40岁,BMI20~28kg/m 2,ASA分级Ⅰ级,随机分为L组和R组,每组30例。两组产妇均实施硬膜外分娩镇痛,... 详细信息

目的:探讨氯普鲁卡因复合舒芬太尼用于硬膜外分娩镇痛的效果。方法:选择2019年7月至2021年5月在我院实施硬膜外分娩镇痛初产妇60例,年龄24~40岁,BMI20~28kg/m 2,ASA分级Ⅰ级,随机分为L组和R组,每组30例。两组产妇均实施硬膜外分娩镇痛,L组氯普鲁卡因600mg+舒芬太尼50μg+生理盐水稀释至100mL,R组罗哌卡因100mg+舒芬太尼50μg+生理盐水稀释至100mL。记录两组产妇镇痛前、镇痛后5min、镇痛后30min、胎儿娩出时疼痛VAS评分、改良Bromage评分、胎心率;记录两组产妇第一产程、第二产程时间;记录两组胎儿娩出后1min和5min的Apgar评分。结果:两组产妇镇痛后5min、镇痛后30min、胎儿娩出后的疼痛VAS评分较镇痛前明显降低(P0.05);两组产妇第一产程和第二产程比较无明显差异(P>0.05);两组胎儿娩出后1min和5min的Apgar评分比较无明显差异(P>0.05)。结论:氯普鲁卡因复合舒芬太尼用于硬膜外分娩镇痛,效果与罗哌卡因复合舒芬太尼相当,但氯普鲁卡因起效更快,不影响产程和新生儿评分。

关键词：氯普鲁卡因舒芬太尼硬膜外分娩镇痛

右美托咪定不同给药时机对剖宫产术中寒战反应的影响

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妇儿健康导刊 2023年第20期2卷 130-132页

作者：林晓莲叶敏涛杨泽萍广东省揭阳市揭东区妇幼保健院麻醉科广东揭阳522000

目的探讨右美托咪定不同给药时机对剖宫产术中寒战反应的影响。方法回顾性分析2021年4月至2023年4月于揭阳市揭东区妇幼保健院行择期子宫下段剖宫产术的60例产妇,根据不同给药时机将产妇分为麻醉后组(A组)和麻醉前组(B组),每组30例。两... 详细信息

目的探讨右美托咪定不同给药时机对剖宫产术中寒战反应的影响。方法回顾性分析2021年4月至2023年4月于揭阳市揭东区妇幼保健院行择期子宫下段剖宫产术的60例产妇,根据不同给药时机将产妇分为麻醉后组(A组)和麻醉前组(B组),每组30例。两组产妇均进行腰硬联合麻醉,A组产妇在腰硬联合麻醉操作后即刻缓慢静脉滴注右美托咪定,B组产妇在腰硬联合麻醉前15 min缓慢静脉滴注右美托咪定。比较两组产妇麻醉前后、切皮时、手术结束时的平均动脉压和心率,记录两组产妇寒战和不良反应发生情况。结果在麻醉前、麻醉后、切皮时、手术结束时两组产妇平均动脉压和心率比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。B组产妇寒战发生率低于A组(P<0.05)。两组均未发生不良反应。结论子宫下段剖宫产术中在腰硬联合麻醉操作前静脉滴注右美托咪定预防寒战反应效果更佳。

关键词：右美托咪定不同给药时机寒战反应子宫下段剖宫产术

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反应堆舱包容失效的辐射监测判断方法

核动力工程 2024年第1期45卷 145-148页

作者：林晓玲汪林 92609部队北京100077

堆舱包容失效是判断应急状态升级的重要技术条件,是应急决策的重要技术依据。本文提出了采用舱室辐射水平作为堆舱包容失效判定依据的方法,确定了用于判定包容失效的可监测量(131I核素活度浓度和舱室γ剂量率),建立了舱室辐射水平与堆... 详细信息

堆舱包容失效是判断应急状态升级的重要技术条件,是应急决策的重要技术依据。本文提出了采用舱室辐射水平作为堆舱包容失效判定依据的方法,确定了用于判定包容失效的可监测量(131I核素活度浓度和舱室γ剂量率),建立了舱室辐射水平与堆舱泄漏率之间的传递关系,并给出判据量值的计算方法。

关键词：反应堆舱包容失效泄漏率辐射监测核事故

基于低场核磁弛豫特性的油茶籽油支持向量机掺伪鉴别模型的建立与评价

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食品科学 2024年第10期45卷 19-27页

作者：林晓浪傅利斌王欣上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 上海市虹口区市场监督管理局上海200081

油茶籽油商业价值高,有必要开发快速准确的油茶籽油掺伪鉴别方法。本实验研究低场核磁共振(low-field nuclear magnetic resonance,LF-NMR)弛豫特性结合支持向量机(support vector machine,SVM)鉴别油茶籽油掺伪的可行性。在比较了油茶... 详细信息

油茶籽油商业价值高,有必要开发快速准确的油茶籽油掺伪鉴别方法。本实验研究低场核磁共振(low-field nuclear magnetic resonance,LF-NMR)弛豫特性结合支持向量机(support vector machine,SVM)鉴别油茶籽油掺伪的可行性。在比较了油茶籽油、3种其他种类的正常/氧化的食用油及多种二元掺兑油样的LF-NMR弛豫特性的基础上进行主成分分析,设计了具有二叉树结构的SVM多分类器,采用ReliefF算法进行特征筛选,建立并验证了油茶籽油掺伪的SVM鉴别模型。研究表明,油脂种类、氧化程度及掺兑比例均会影响油样的LF-NMR弛豫特性。当特征数为9时,SVM多分类模型性能最佳,准确率可达90.77%,对油茶籽油、掺兑类型及比例的平均召回率为90.87%、精确率为90.83%、F1分数为0.90。这表明基于LF-NMR弛豫特性的SVM模型可用于油茶籽油的掺伪鉴别。

关键词：油茶籽油掺伪鉴别低场核磁共振支持向量机主成分分析 ReliefF算法

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一种考虑时滞的结构显式最优控制方法

振动工程学报 2024年

作者：林晓祥苏成亚热带建筑与城市科学全国重点实验室华南理工大学土木与交通学院广州城市理工学院

时滞严重影响控制系统的性能和受控结构的稳定性,一定程度上限制了主动控制技术的工程应用。时滞经典最优控制方法虽然能够考虑时滞问题带来的影响,但该方法在控制律设计中将时滞问题转化为无时滞问题,需要引入考虑时滞段内控制力的扩... 详细信息

时滞严重影响控制系统的性能和受控结构的稳定性,一定程度上限制了主动控制技术的工程应用。时滞经典最优控制方法虽然能够考虑时滞问题带来的影响,但该方法在控制律设计中将时滞问题转化为无时滞问题,需要引入考虑时滞段内控制力的扩维状态向量,因此需要求解扩阶Riccati方程,增加了控制律设计的计算量。本文致力于发展一种考虑时滞的结构显式最优控制方法。建立时滞系统动力响应的时域显式表达式,进而建立关于时滞最优控制力的无约束线性二次型优化问题,推导得到时滞显式最优控制律。由于在显式表达式中可以方便地考虑时滞控制力对结构动力响应的影响,所以时滞显式最优控制律的推导过程无需进行状态向量的扩维处理,且无需求解Riccati方程。以地震激励下设置主动控制装置的三层剪切型结构为数值算例,研究了时滞对主动控制效果的影响,并验证了所提方法的有效性。

关键词：时滞主动控制经典最优控制显式最优控制

童年期逆境对大脑认知功能的影响——基于去偏机器学习框架的中介效应分析

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复旦学报（医学版） 2024年第4期51卷 528-535页

作者：崔航林晓蕾复旦大学大数据学院统计学专业上海200433 复旦大学附属华山医院医学研究院上海200040

目的基于去偏机器学习框架的中介效应分析,来探究童年逆境对认知功能的影响过程中起关键作用的大脑区域。方法将包含460名志愿者的数据集随机分组分为训练集(n=368)和验证集(n=92)。为了提高结果的稳定性,本研究运用去偏机器学习中介分... 详细信息

目的基于去偏机器学习框架的中介效应分析,来探究童年逆境对认知功能的影响过程中起关键作用的大脑区域。方法将包含460名志愿者的数据集随机分组分为训练集(n=368)和验证集(n=92)。为了提高结果的稳定性,本研究运用去偏机器学习中介分析方法,根据训练集构建模型并得出结论,然后用验证集进行验证,最后采用Bonferroni方法对识别出显著性的脑区进行矫正。结果训练集与验证集的实验结果相似,左上顶叶的效用显著(验证集P<0.001),表现为正向作用(验证集effect size=0.78);右前额极前扣带回和左下颞叶(训练集与验证集P值均<0.001)也效应显著,并被识别出在这一过程中具有负向作用(验证集effect size分别为-0.037,-0.034)。效应显著的脑区与认知功能之间的关联与既往研究结果一致。结论左上顶叶、右前额极前扣带回和左下颞叶在童年逆境对认知功能产生影响的过程中起到关键作用,其中左上顶叶表现为正向作用,右前额极前扣带回和左下颞叶表现为负向作用。

关键词：童年期逆境结构磁共振成像认知功能中介分析去偏机器学习