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全基因组关联分析在果树品质及抗性性状中的研究进展

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江苏农业科学 2024年第11期52卷 10-19页

作者：李嘉琦刘有春魏鑫杨艳敏杨玉春王升高树清林佳琦徐艺格孙斌张舵王兴东王宏光刘成辽宁省果树科学研究所辽宁营口115009

全基因组关联分析(genome-wide association analysis,GWAS)是一种基于连锁不平衡理论的成本低、精度高的基因分型方法,用于影响复杂性状的基因或基因组区域定位。随着果树各树种基因组的陆续公布,近年来GWAS在果树研究中得到广泛应用... 详细信息

全基因组关联分析(genome-wide association analysis,GWAS)是一种基于连锁不平衡理论的成本低、精度高的基因分型方法,用于影响复杂性状的基因或基因组区域定位。随着果树各树种基因组的陆续公布,近年来GWAS在果树研究中得到广泛应用。本文介绍了GWAS的基本原理和影响因素,综述了GWAS在仁果类、核果类、柑橘类、浆果类和其他经济类果树中的研究进展,关联性状主要集中在果实品质性状评估(风味、香气、质地、果实外观、色泽、单果重等)和抗性基因鉴定(苹果褐斑病、李痘病毒、褐腐病、草莓枯萎病、葡萄裂果等)等方面,梳理了利用结构变异、转座子开展关联分析的研究报道,基于GWAS+TWAS等衍生应用在作物中的研究进展分析了对果树相关研究的借鉴和参考意义,最后归纳了果树GWAS研究的不足,并提出未来研究方向和建议。

关键词：全基因组关联分析(GWAS) 果树品质性状抗性性状

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不同光质对树莓组培苗生长的影响

北方果树 2024年第2期 5-9页

作者：杨艳敏刘有春张舵王升王宏光林佳琦刘成辽宁省果树科学研究所辽宁熊岳115009

该研究以树莓‘秋红’为试验材料,探究在红蓝光基础上添加不同单色光质对其组培苗生长及光合特性的影响,筛选有利于树莓组培苗生长的较佳光质。试验结果表明,红蓝光(2∶1)+15%绿光处理更有利于树莓组培苗的生长,其茎粗、生根率、根长、... 详细信息

该研究以树莓‘秋红’为试验材料,探究在红蓝光基础上添加不同单色光质对其组培苗生长及光合特性的影响,筛选有利于树莓组培苗生长的较佳光质。试验结果表明,红蓝光(2∶1)+15%绿光处理更有利于树莓组培苗的生长,其茎粗、生根率、根长、单株鲜重和干重均优于荧光灯和红蓝光(2∶1)处理的,叶绿素含量、净光合速率(Pn)、实际光化学效率(Y[II])、相对电子传递速率(rETR)均表现出较佳的优势,可推荐作为树莓组培苗较优的组培光质。

关键词：树莓 LED光质生长光合特性

基于电子鼻的蓝莓重要亲本及杂交后代香气物质研究

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北方果树 2024年第4期 6-12,20页

作者：李嘉琦刘有春王兴东杨艳敏林佳琦魏鑫刘成辽宁省果树科学研究所/辽宁省小浆果遗传改良与高效栽培重点实验室辽宁熊岳115009

作者以6个蓝莓重要亲本和70份遗传后代(包括正反交及半同胞系后代)为试材,利用电子鼻技术对果实香气物质进行检测,采用主成分分析(PCA)、线性判别分析(LDA)和负荷加载分析法(LO)评价蓝莓果实香气。结果表明,蓝莓果实中香气物质W1W(硫化... 详细信息

作者以6个蓝莓重要亲本和70份遗传后代(包括正反交及半同胞系后代)为试材,利用电子鼻技术对果实香气物质进行检测,采用主成分分析(PCA)、线性判别分析(LDA)和负荷加载分析法(LO)评价蓝莓果实香气。结果表明,蓝莓果实中香气物质W1W(硫化物、萜烯类)响应值最高,其次是W1S(甲烷类)、W5S(氮氧化合物)、W2S(乙醇)。这4种传感器对应的香气物质对蓝莓香气贡献大。北高丛与南高丛蓝莓亲本香气物质存在较大差异,南高丛香气物质高于北高丛。两两亲本杂交的遗传后代香气物质存在广泛分离,LDA可解释近85%以上的变异,能区分出不同亲本的遗传后代,各杂交组合存在差异。其中‘布里吉塔’与N5的杂交组合Hi平均总响应值、超高亲率及优选率均最高,而‘伯克利’与N6的杂交组合Cj最低。说明Hi组合杂交后代果实香气明显浓于Cj组合,且易受低值亲本影响;Hi、Ai等同父异母半同胞系杂交后代与母本紧密聚类。初步判断香气物质遗传受母本影响大。筛选出Hi-1、Hi-2、Hi-5、Ad-5、Ja-3和Jc-126个香气浓郁的备选优系。

关键词：电子鼻香气蓝莓育种亲本杂交后代

矮化香蕉赤霉素合成途径相关基因的克隆和功能验证

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矮化香蕉赤霉素合成途径相关基因的克隆和功能验证

作者：林佳琦广西大学

学位级别：硕士

矮化突变是香蕉无性繁殖后代中常见的表型变异之一,迄今,对引起香蕉矮化变异的调控机理的研究尚未获得十分清楚的认识。已有的众多研究结果表明,内源赤霉素是影响植物株高的重要激素之一,赤霉素生物合成途径中的关键酶编码基因的突变会... 详细信息

矮化突变是香蕉无性繁殖后代中常见的表型变异之一,迄今,对引起香蕉矮化变异的调控机理的研究尚未获得十分清楚的认识。已有的众多研究结果表明,内源赤霉素是影响植物株高的重要激素之一,赤霉素生物合成途径中的关键酶编码基因的突变会导致植物矮化。为探究赤霉素生物合成途径中的关键酶基因在香蕉矮化中的分子调控机理,本试验以威廉斯B6（Musa AAA Group Cavendish Williams）野生型亲本及其矮化突变体为试验材料,根据研究公布的相关基因c DNA序列设计合成引物,通过RT-PCR技术克隆两试验香蕉材料的赤霉素合成途径相关的三个关键酶基因GA2ox、GA3ox、CPS的c DNA序列,并对克隆序列进行测序、序列比对和分析其预测编码蛋白的结构与功能。同时,利用荧光实时PCR技术对克隆基因在两试验香蕉材料的不同发育阶段的假茎、叶片和果实中的转录表达进行定量检测和分析,并构建克隆基因的植物表达载体,进行遗传转化研究其功能。研究获得的主要结果如下:1、克隆得到威廉斯B6矮化突变体和其野生型亲本中的GA2ox、GA3ox、CPS三个基因的相应的六条c DNA序列。将来自矮化突变体香蕉GA2ox、GA3ox、CPS三个基因的克隆序列分别命名为GA2ox-A、GA3ox-A、CPS-A,来自野生型亲本香蕉GA2ox、GA3ox、CPS三个基因的克隆序列分别命名为GA2ox-G、GA3ox-G、CPS-G。测序和序列比对结果显示:GA2ox-A和GA2ox-G的序列长度均为994 bp,开放阅读框均为813 bp,均编码270个氨基酸。二者的氨基酸序列有99.63%的相似性,序列间存在1个位点的氨基酸残基差异;GA3ox-A和GA3ox-G基因的序列长度均为1096 bp,开放阅读框均为864 bp,编码287个氨基酸。二者的氨基酸序列有98.26%的相似性,序列间存在5个位点的氨基酸残基差异;CPS-A和CPS-G基因的开放阅读框全长均为2163 bp,均编码720个氨基酸。二者的氨基酸序列有98.89%的相似性,序列间存在8个位点的氨基酸残基差异。2、GA2ox在矮化突变体叶片、假茎和开花期果实中的表达水平均高于野生型亲本,尤其是在生长前中期的15和20叶龄期,GA2ox在矮化突变体叶片和假茎中的表达水平较野生型高4.3-28.9倍;GA3ox在矮化突变体假茎中的表达水平整体上均低于野生型亲本,其中GA3ox在矮化突变体假茎中的表达水平较野生型低2.2-32倍。但在果实中,GA3ox在矮化突变体中的表达水平显著高于野生型亲本;CPS基因在矮化突变体叶片和假茎中的表达水平均低于野生型亲本。但在果实中,CPS在矮化突变体中的表达水平均显著高于野生型亲本。3、GA2ox-A和GA2ox-G蛋白分子质量分别为30067.30 Da和30085.33 Da,理论等电点分别为5.05和5.04,属酸性蛋白;GA3ox-A和GA3ox-G蛋白分子质量分别为30661.14 Da和30735.28 Da,理论等电点均为9.78,属碱性蛋白。CPS-A和CPS-G蛋白分子质量分别为82412.15 Da和82359.00 Da,理论等电点分别为6.17和6.03,属酸性蛋白。疏水性预测（GRAVY）分析结果发现,矮化突变体及野生型亲本GA2ox、GA3ox、CPS蛋白均属于亲水性蛋白,且均为不稳定性蛋白,均无信号肽,无跨膜结构。二级结构预测结果发现,矮化突变体及野生型亲本GA2ox、GA3ox、CPS蛋白均包括α螺旋、β折叠、延伸链和无规则卷曲四种构象。亚细胞定位预测结果发现,矮化突变体及野生型亲本GA3ox蛋白主要位于线粒体,GA2ox、CPS蛋白主要位于细胞质。保守结构域分析结果显示,矮化突变体及野生型亲本GA2ox、GA3ox、CPS蛋白分别具有GA2ox、GA3ox、CPS基因家族典型的保守结构域。4、构建了GA2ox-A基因的植物表达载体,菌落PCR、测序结果验证了所构建的植物表达载体中克隆基因序列的准确性,完成了构建植物表达载体转化烟草,并且获得10株转GA2ox-A基因再生烟草植株。综上所述,本研究结果揭示了威廉斯B6矮化突变体及其野生型亲本赤霉素合成途径中三个关键酶基因GA2ox、GA3ox、CPS结构间的差异,并且发现GA2ox、GA3ox、CPS基因在矮化突变体及其野生型亲本不同发育期的叶片、假茎和果指中的表达水平均存在显著差异。同时获得转基因再生烟草植株,为进一步研究其功能奠定基础。本研究结果对于揭示香蕉矮秆突变的内在机制具有重要作用。

关键词：香蕉矮化赤霉素基因克隆表达分析

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大报文高效安全传输方法研究与实现

大报文高效安全传输方法研究与实现

作者：林佳琦军事科学院

学位级别：硕士

随着网络应用技术的快速发展,4K/8K、VR、AR等高质量富媒体信息传输交互需求日益增多,引起单个帧的信息容量达到数十MB级,远远大于现有MTU(一般为1500B),在这种情况下,现有终端协议栈通常将报文分片后进行传输,网络设备通常每个分片的... 详细信息

随着网络应用技术的快速发展,4K/8K、VR、AR等高质量富媒体信息传输交互需求日益增多,引起单个帧的信息容量达到数十MB级,远远大于现有MTU(一般为1500B),在这种情况下,现有终端协议栈通常将报文分片后进行传输,网络设备通常每个分片的报文通常作为独立的单元进行处理,一旦其中任何一个分片遭受攻击或丢失,都会导致整个内容的安全性受损或需要进行重传,从而降低了传输效率。为此本文提出了一种基于流式签名的链式传输方法,利用链式串联的方法将分片的报文作为一个逻辑的整体进行转发处理,提高了整个报文安全传输的效率,在此基础上利用网络遥测根据链式报文的大小,自适应地调整端侧的拥塞控制参数,以控制发包速率,从而确保了报文传输的效率和可靠性。通过XDP和DPU技术的应用,开发了终端协议栈,验证了软硬件加速架构的功能性。具体的主要贡献如下:1.提出了一种基于流式签名的链式传输机制,受交通网络的启发提出了一种链式转发的模型,利用哈希函数对每个分片报文计算完整性签名,设计了一种流式签名机制,将每个分片报文和上一个分片报文通过期望哈希关联起来形成一个逻辑链;报文转发时只检查链头安全性和转发策略,后续链通过查表确认安全性基础上采取相同的转发策略,有效提高报文传输安全性和转发效率。2.提出了一种基于网络遥测的拥塞控制算法,终端利用网络遥测技术实时感知网络设备的队列深度、带宽等状态。通过采用梯度优化方法计算权重并将其转化为网络拥塞程度,再结合链式报文的长度计算出拥塞窗口和发送速率等拥塞参数。系统能够自适应地、精确地调整发包速率,从而降低了由于网络拥塞等情况导致分片报文重传的概率,进而提高整个报文传输的效率。3.设计并实现了软硬件加速的终端协议栈。通过采用XDP和DPU两种技术,分别开发了终端协议栈的原型,旨在降低数据拷贝次数和由CPU计算引起的开销。在XDP的软件架构中,成功解决了数据拷贝的问题,导致报文处理性能平均提升了95%以上,但没有减少计算开销,在此基础上,进一步引入DPU来协助终端计算与调度功能,使整个处理过程的开销平均降低了45%以上。

关键词：大报文链式转发网络遥测拥塞控制零拷贝

StreamLNet:结合流线可视化的流场原位压缩方法

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计算机辅助设计与图形学学报 2022年第7期34卷 1127-1137页

作者：林佳琦解利军季候风陆曼君浙江大学航空航天学院杭州310027

为了解决大规模计算流体力学数据量巨大引起的可视化和数据存储困难,提出一种原位流线提取和速度场压缩方法.在计算流体数值模拟的原位,首先使用均匀随机方法在流场中分布和生成一定数量的流线;然后基于该组流线训练一个深度神经回归网... 详细信息

为了解决大规模计算流体力学数据量巨大引起的可视化和数据存储困难,提出一种原位流线提取和速度场压缩方法.在计算流体数值模拟的原位,首先使用均匀随机方法在流场中分布和生成一定数量的流线;然后基于该组流线训练一个深度神经回归网络模型StreamLNet,该模型以流场中任意位置的速度作为输出,以该位置周围若干流线节点的相对位置关系和速度属性作为输入,学习二者间的映射关系;最后舍弃原始流场数据,仅存储该组流线和StreamLNet模型用于后续数据可视化和流场恢复.对典型流体仿真数据的实验结果表明,所提方法在原位实现流线可视化的同时,可以以2%~3%的相对误差的代价获得几十倍到几百倍的压缩比.

关键词：流场压缩原位可视化科学可视化深度神经网络回归模型

顶空-气相色谱法测定伊班膦酸钠中多种残留溶剂

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色谱 2024年第5期42卷 481-486页

作者：周冉王飞林佳睿贾梦王妍石家庄学院化工学院河北石家庄050035 石家庄学院科研处河北石家庄050035

采用顶空-气相色谱建立了同时测定伊班膦酸钠原料药中5种残留溶剂含量的方法。以Agilent DB-624毛细管色谱柱(30 m×0.32 mm×1.8μm)为分离柱,考察了顶空平衡温度、平衡时间等对残留溶剂测定的影响。实验结果表明,在顶空平衡温度为80... 详细信息

采用顶空-气相色谱建立了同时测定伊班膦酸钠原料药中5种残留溶剂含量的方法。以Agilent DB-624毛细管色谱柱(30 m×0.32 mm×1.8μm)为分离柱,考察了顶空平衡温度、平衡时间等对残留溶剂测定的影响。实验结果表明,在顶空平衡温度为80℃、平衡时间为20 min的条件下,甲醇、丙酮、苯、甲苯、1-戊醇的质量浓度与峰面积之间存在良好的线性关系,相关系数r值均大于0.990。各溶剂的检出限依次为2.88、0.011、0.90、0.24、0.024 ng/mL,定量限依次为11.5、0.043、3.6、0.96、0.096 ng/mL。各溶剂的回收率为86.3%~101.9%,相对标准偏差(n=3)均小于2.49%。该方法操作简便、准确可靠,适用于伊班膦酸钠原料药中5种残留溶剂的同时快速测定。

关键词：顶空-气相色谱法残留溶剂 1-戊醇伊班膦酸钠

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戏曲俊扮妆容考

戏剧艺术 2024年第3期 178-190,I0004-I0006页

作者：李芽林佳上海戏剧学院舞台美术系上海京剧院

中国戏曲俊扮从古至今的发展与演变历程背后有着相应的审美动因与技术路径。俊扮的功能主要是为了美化角色,进而通过“变形取神”来塑造人物。因此,其早期是通过敷粉、施朱、描黛和贴画面花来进行美化妆扮。随着戏曲的逐渐成熟,又出现... 详细信息

中国戏曲俊扮从古至今的发展与演变历程背后有着相应的审美动因与技术路径。俊扮的功能主要是为了美化角色,进而通过“变形取神”来塑造人物。因此,其早期是通过敷粉、施朱、描黛和贴画面花来进行美化妆扮。随着戏曲的逐渐成熟,又出现了通过“梳水头”、贴片子和面部牵引术的方法来重塑脸型;通过勒头吊眉眼来增强人物精气神;通过戴假髯来塑造生脚人物等技术方式。这些技术方式使得戏曲人物造型在舞台上不仅“打远”,而且美观,并实现了塑造人物的需要,最终形成戏曲舞台俊扮的审美程式。

关键词：戏曲俊扮容妆旦脚生脚

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山水画校本课程在小学阶段实施中的思与行

新智慧 2022年第32期 35-37页

作者：林佳琦江苏省常熟市沙家浜中心小学

山水画是我国传统的绘画形式之一,是一种以描写山川自然景色为主体的绘画形式,在中国历史上流传千年之久,实施山水画校本课程教学是新课程改革理念下学校开发特色课程的重要体现。本文通过对山水画校本课程在学校实施中的问题、策略与... 详细信息

山水画是我国传统的绘画形式之一,是一种以描写山川自然景色为主体的绘画形式,在中国历史上流传千年之久,实施山水画校本课程教学是新课程改革理念下学校开发特色课程的重要体现。本文通过对山水画校本课程在学校实施中的问题、策略与建议等方面进行探讨,力求为学校开发山水画校本课程提供参考。

关键词：校本课程特色课程新课程改革理念绘画形式小学阶段自然景色山水画策略与建议