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耦合不连续系统同步转换过程中的多吸引子共存

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物理学报 2016年第10期65卷 31-39页

作者：杨科利宝鸡文理学院非线性研究所宝鸡721016

本文研究了耦合不连续系统的同步转换过程中的动力学行为,发现由混沌非同步到混沌同步的转换过程中特殊的多吸引子共存现象.通过计算耦合不连续系统的同步序参量和最大李雅普诺夫指数随耦合强度的变化,发现了较复杂的同步转换过程:临界... 详细信息

本文研究了耦合不连续系统的同步转换过程中的动力学行为,发现由混沌非同步到混沌同步的转换过程中特殊的多吸引子共存现象.通过计算耦合不连续系统的同步序参量和最大李雅普诺夫指数随耦合强度的变化,发现了较复杂的同步转换过程:临界耦合强度之后出现周期非同步态(周期性窗口);分析了系统周期态的迭代轨道,发现其具有两类不同的迭代轨道:对称周期轨道和非对称周期轨道,这两类周期吸引子和同步吸引子同时存在,系统表现出对初值敏感的多吸引子共存现象.分析表明,耦合不连续系统中的周期轨道是由于局部动力学的不连续特性和耦合动力学相互作用的结果.最后,对耦合不连续系统的同步转换过程进行了详细的分析,结果表明其同步呈现出较复杂的转换过程.

关键词：同步转换不连续系统吸引子共存

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一类可变禁区的不连续系统的加周期分岔

物理学报 2015年第12期64卷 91-97页

作者：杨科利宝鸡文理学院非线性研究所宝鸡721016 陕西师范大学物理与信息技术学院理论与计算物理研究所西安710062

研究了一类可变禁区不连续系统的加周期分岔行为,发现由可变禁区导致不同类型的加周期分岔.研究表明,系统的迭代轨道和禁区的上下两个边界均可发生边界碰撞,从而产生加周期分岔.基于边界碰撞分岔理论,定义基本的迭代单元,解析推导出了... 详细信息

研究了一类可变禁区不连续系统的加周期分岔行为,发现由可变禁区导致不同类型的加周期分岔.研究表明,系统的迭代轨道和禁区的上下两个边界均可发生边界碰撞,从而产生加周期分岔.基于边界碰撞分岔理论,定义基本的迭代单元,解析推导出了相应的分岔曲线,在全参数空间中给出了不同加周期所出现的范围.与数值模拟结果比较,理论分析结果与数值结果高度一致.

关键词：不连续禁区边界碰撞分岔

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一个全局耦合不连续映像格子中的奇异态

物理学报 2014年第14期63卷 102-107页

作者：程兴超杨科利屈世显陕西师范大学物理学与信息技术学院理论与计算物理研究所西安710062 宝鸡文理学院物理与信息技术系非线性研究所宝鸡721016

文章研究了一类由既不可逆又不连续映像构成的全局耦合映像格子系统中的奇异态行为,计算了系统的同步序参量和空间振幅变化图.结果表明,在某些特定的参数区间内,耦合映像格子系统会出现奇异态或团簇态,并且敏感地依赖于耦合强度的选择.... 详细信息

文章研究了一类由既不可逆又不连续映像构成的全局耦合映像格子系统中的奇异态行为,计算了系统的同步序参量和空间振幅变化图.结果表明,在某些特定的参数区间内,耦合映像格子系统会出现奇异态或团簇态,并且敏感地依赖于耦合强度的选择.上述丰富的动力学现象是由于单映像中不连续、不可逆性以及空间耦合相互作用的结果.通过数值模拟找到了奇异态或团簇态出现的特定参数区域.

关键词：不连续不可逆映像奇异态团簇态

基于序列信息的转录因子结合位点和启动子理论预测

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基于序列信息的转录因子结合位点和启动子理论预测

作者：杨科利内蒙古大学

学位级别：硕士

基因转录调控一直是生物信息学研究的一个重要内容，转录因子结合位点和启动子的识别是研究基因转录调控的重要环节，是构建基因调控网络的一个核心问题。本文基于已知的转录因子结合位点和启动子序列数据，从序列信息出发，提出了整合... 详细信息

基因转录调控一直是生物信息学研究的一个重要内容，转录因子结合位点和启动子的识别是研究基因转录调控的重要环节，是构建基因调控网络的一个核心问题。本文基于已知的转录因子结合位点和启动子序列数据，从序列信息出发，提出了整合位点保守型参量和位置权重矩阵预测转录因子结合位点的位置权重矩阵打分函数方法以及联合位置权重矩阵和离散增量预测启动子的支持向量机方法。基于转录因子结合位点序列通常比较短且保守，引入矩阵模型描述转录因子结合位点的特性，同时依据转录因子结合位点的位点保守性各不相同，将碱基保守性参数引入矩阵模型，从而提出预测转录因子结合位点的位置权重打分函数算法(PWMSA)。首先将四种碱基随机出现的频率作为背景频率，以单碱基位点保守性参量结合单碱基位置权重矩阵的PWMSA算法对22种转录因子结合位点进行预测，总体Self-consistency检验为87.59％，10-fold cross-validation检验为85.48％。然后考虑到基因序列中的四种碱基并非随机出现，以四种碱基实际出现的频率作为背景频率，用PWMSA算法对酵母九种转录因子结合位点进行预测，Self-consistency检验预测成功率达83.14％，10-fold cross-validation检验预测成功率为77.51％。同时，引进两种最新的评价指标，将PWMSA算法与现有的10种预测转录因子结合位点的软件进行比较，结果表明PWMSA算法的评价指标均高于现有的算法，在核苷酸和结合位点片段两种评价水平上，预测成功率分别高出其他算法4％，7％个百分点。考虑到转录因子结合位点之间存在碱基相互作用共同贡献与蛋白的亲和力，利用已知的9种酵母转录因子结合位点序列构建近邻核苷酸二联体位置权重矩阵，计算位点近邻二联体核苷酸保守性参量，使用PWMSA算法对9种酵母转录因子结合位点进行预测，Self-consistency检验和10-fold cross-validation检验预测成功率分别达到88.04％，81.10％，明显高于单碱基位置权重矩阵的结果。基于启动子序列的内容特征和信号特征与非启动子序列的区别，利用离散量方法提取启动子序列的内容特征;构建核心启动子元件的位置权重矩阵，使用位置权重矩阵提取启动子序列的信号特征，最后提取启动子和非启动子序列碱基组份特征。构建了基于综合启动子序列的内容特征和信号特征预测启动子序列的支持向量机分类器，并对人类PolⅡ启动子进行预测，10-fold cross-validation检验为95.70％，对另外选取的独立测试集预测成功率为98.30％，同时与现有的7种预测启动子的软件和算法进行比较，我们的算法预测成功率敏感性为97.00％，特异性为97.98％，结果明显优于现有的预测算法和软件。

关键词：转录因子结合位点启动子位置权重矩阵离散增量支持向量机

不同真空处理时间对SOD、HRP和α-AMY活性的影响

同方学位论文库评论

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同方学位论文库

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真空 2009年第6期46卷 71-73页

作者：许强杨科利宝鸡文理学院物理系陕西宝鸡712007

将超氧化物歧化酶(SOD)、辣根过氧化物酶(HRP)和淀粉酶(α-AMY)置于真空环境中不同时间,测试真空对超氧化物歧化酶、辣根过氧化物酶和α-淀粉酶活性的影响。不同真空处理时间对酶蛋白活性有不同影响,在处理时间为3～15min范围,超氧化物... 详细信息

将超氧化物歧化酶(SOD)、辣根过氧化物酶(HRP)和淀粉酶(α-AMY)置于真空环境中不同时间,测试真空对超氧化物歧化酶、辣根过氧化物酶和α-淀粉酶活性的影响。不同真空处理时间对酶蛋白活性有不同影响,在处理时间为3～15min范围,超氧化物歧化酶、辣根过氧化物酶和α-淀粉酶相对活性基本上都呈降低的趋势。因此,在离子注入生物效应的研究中,应该考虑真空对生物体所产生的影响。

关键词：真空辣根过氧化物酶超氧化物歧化酶 OL一淀粉酶相对活性

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非局域耦合帐篷映像中的完全同步周期态

陕西师范大学学报（自然科学版） 2015年第3期43卷 26-30页

作者：杨科利屈世显陕西师范大学物理学与信息技术学院陕西西安710119 宝鸡文理学院物理与光电技术学院陕西宝鸡721016

研究了非局域耦合帐篷映像中的周期态,通过计算耦合系统的信息熵和同步序参量,发现系统中存在两类周期态,即非同步周期态和完全同步周期态。非同步周期态在空间呈现连续的波型分布,时间上也呈现周期性。其空间周期随着耦合半径的减小而... 详细信息

研究了非局域耦合帐篷映像中的周期态,通过计算耦合系统的信息熵和同步序参量,发现系统中存在两类周期态,即非同步周期态和完全同步周期态。非同步周期态在空间呈现连续的波型分布,时间上也呈现周期性。其空间周期随着耦合半径的减小而减小,时间周期随系统参数的改变而变化。当完全同步态出现时,系统中各格点的动力学状态同步到单映像的非稳定周期态,这与以往的耦合系统中系统同步于单映像的稳定周期轨道有所不同。这类同步态的出现归因于格点间的动力学耦合,可以模拟神经元间触突耦合的丰富放电行为。

关键词：周期态信息熵同步帐篷映像

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电场对脂肪酶紫外光谱及其活性的影响

食品工业科技 2008年第9期29卷 143-144页

作者：许强杨科利宝鸡文理学院物理系陕西宝鸡712007

用不同电场强度处理脂肪酶,测试电场处理前后的紫外光谱和酶的活性。结果表明:脂肪酶紫外光谱发生了明显的变化,说明电场可以改变酶的构象;一定电场强度可使酶活性增加,活性的增加可能是由酶构象的改变引起的。研究结果对解释静电宏观... 详细信息

用不同电场强度处理脂肪酶,测试电场处理前后的紫外光谱和酶的活性。结果表明:脂肪酶紫外光谱发生了明显的变化,说明电场可以改变酶的构象;一定电场强度可使酶活性增加,活性的增加可能是由酶构象的改变引起的。研究结果对解释静电宏观生物效应具有重要意义。

关键词：电场脂肪酶紫外光谱构象活性

Time-Delay Enhanced Coherence Resonance in a Discrete Neuron with Noises

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Chinese Physics Letters 2014年第8期31卷 8-11页

作者：王参军杨科利屈世显 InstituteofTheoreticalandComputationalPhysics SchoolofPhysicsandInformationTechnologyShaanxiNormalUniversityXi'an710062 NonlinearResearchInstitute BaojiUniversityofArtsandSciencesBaoji721016

Coherence resonance in a discrete excitable neuronal model with noises and time delays is investigated. The effects of the time delays on coherence resonance are revealed in two cases： Gaussian white and Gaussian color noises, respectively. The coefficient of variation of interspike intervals is calculated by numerical simulation. The results show that the coherence resonance is enhanced with the time delay increasing in the weak noises intensity cases, while there is no effect in the large noise intensity. Moreover, the coherence resonance can be held back by the self-correlation time, when the system is driven by a color noise.

关键词： STOCHASTIC resonance RESEARCH TIME delay systems RESONANCE RANDOM noise theory ADDITIVE white Gaussian noise channels

Noise destroys the coexistence of periodic orbits of a piecewise linear map

维普期刊数据库评论

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Chinese Physics B 2013年第3期22卷 205-208页

作者：王参军杨科利屈世显 Institute of Theoretical & Computational Physics School of Physics and Information TechnologyShaanxi Normal University Nonlinear Research Institute Baoji University of Arts and Sciences

The effects of Gaussian white noise and Gaussian colored noise on the periodic orbits of period-5（P-5） and period-6（P-6） in their coexisting domain of a piecewise linear map are investigated *** probability densities of some orbits are *** the noise intensity is D = 0.0001,only the orbits of P-5 exist,and the coexisting phenomenon is *** the other hand,the self-correlation time τ of the colored noise also affects the coexisting *** τc〈τ〈τc,only the orbits of P-5 appear,and the stability of the orbits of P-5 is ***,when τ〉τc（τc and τc are critical values）,only the orbits of P-6 exist,and the stability of the P-6 orbits is enhanced *** τ〈τc,the orbits of P-5 and P-6 coexist,but the stability of the P-5 orbits is enhanced and that of P-6 is weakened with τ increasing.

关键词： piecewise linear map noise periodic orbit