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甘蓝型油菜MAGIC群体结构分析

中国油料作物学报 2017年第6期39卷 746-753页

作者：罗开周金枝杨植全杨庆勇周永明华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室湖北武汉430070 华中农业大学信息学院农业生物信息湖北省重点实验室湖北武汉430070

MAGIC(multi-parent advanced generation inter-cross)群体是新一代遗传作图及育种群体。为了探究异源四倍体甘蓝型油菜的MAGIC群体的结构,利用60对SSR引物分析包括554个株系的甘蓝型油菜MAGIC群体的遗传多样性和遗传距离。60对SSR共... 详细信息

MAGIC(multi-parent advanced generation inter-cross)群体是新一代遗传作图及育种群体。为了探究异源四倍体甘蓝型油菜的MAGIC群体的结构,利用60对SSR引物分析包括554个株系的甘蓝型油菜MAGIC群体的遗传多样性和遗传距离。60对SSR共检测到261个位点,平均4.35个位点/对,多态性信息量平均为0.48。用STRUCTURE 2.3.4进行群体结构分析,显示MAGIC群体可划分为2个亚群,其中303个株系归属亚群1,234个株系归属亚群2,剩下的17个株系无特定亚群归属,属混合亚群。研究结果表明该群体具有较高的遗传多样性。

关键词：甘蓝型油菜 MAGIC群体群体结构遗传多样性

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基于甘蓝型油菜高通量测序数据的变异检测方法比较

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基于甘蓝型油菜高通量测序数据的变异检测方法比较

基于GWAS和eQTL挖掘油菜含油量相关的转录因子及其调控网络

中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会

作者：柳叶茂杨植全杨庆勇华中农业大学信息学院

随着高通量测序技术不断发展,很多物种的参考基因组图谱被成功构建,各种基于参考基因组鉴定群体变异基因型的方法也被纷纷提出。为了探究检测方法的选择对检测异源多倍体甘蓝型油菜变异的影响,我们选择了近几年在基因组研究领域使用比... 详细信息

随着高通量测序技术不断发展,很多物种的参考基因组图谱被成功构建,各种基于参考基因组鉴定群体变异基因型的方法也被纷纷提出。为了探究检测方法的选择对检测异源多倍体甘蓝型油菜变异的影响,我们选择了近几年在基因组研究领域使用比较广泛的4个工具,bcftools(版本1.6)、VarScan(版本2.4.1)、GATK(版本3.4-46-gbc02625)和sentieon(版本201704.01),基于模拟的100份油菜重测序的数据(深度分别是7×、15×、30×)进行了变异检测分析,并从时间消耗、准确率方面综合分析比较了这几个变异检测工具的结果。在相同的计算环境下,在时间消耗方面,每处理一个7×测序深度的样本数据,sentieon仅使用185s能生成最终的变异文件,而bcftools、VarScan和GATK3分别大约使用了1.5h、2h和5h。在检测到变异数据和准确率方面,当在处理低深度测序的数据(7×)时,对比参考数据集,4种工具(依次是bcftools、VarScan、GATK和sentieon)检测的变异数量占参考黄金集分别为158.2%、13.62%、75.14%和82.75%,假阳性率则依次为68.09%、63.39%、39.12%和39.27%。当测序深度提高到15×,4种工具检测到的变异的数量比(假阳性)则依次为87.66%(35.19%)、62.33%(42.71%)、85.74%(34.75%)、94.35%(34.62%);当测序深度达到30×,4种工具检测到的变异的数量比(假阳性)依次为85.87%(33.9%)、80.23%(33.55%)、81.49%(33.3%)、90.43%(33.35%)。综上,在处理异源多倍体的重测序数据时,无论是从耗时、检测的变异数量、准确率方面看,sentieon都是最优的变异检测工具。其次的工具选择取决于测序深度和科研工作者对时间消耗的敏感度:1)当测序深度高时,bcftools、VarScan、GATK都是可以选择的,只是GATK会花费更长的时间;2)当测序深度低时,选择GATK会是比较不错方案,bcftools虽然能检测到数目可观的变异,但是大部分的变异是无效的,假阳性率非常高,而VarScan检测的结果,在数目上偏低,会遗漏相当一部分变异,这对于后期的分析工作是不利的。

关键词：油菜高通量重测序变异检测测序深度工具比较

来源： cnki会议评论

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基于GWAS和eQTL挖掘油菜含油量相关的转录因子及其调控网络

中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会

作者：周金枝杨植全郭亮杨庆勇周永明华中农业大学

甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38,以下简称油菜)是我国重要的油料作物,系统研究油菜种子发育过程中的脂质代谢相关基因的表达调控及其与表型之间的联系,对于揭示菜籽油分形成和积累的调控关系非常关键。为了挖掘甘蓝型油菜含油量... 详细信息

甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38,以下简称油菜)是我国重要的油料作物,系统研究油菜种子发育过程中的脂质代谢相关基因的表达调控及其与表型之间的联系,对于揭示菜籽油分形成和积累的调控关系非常关键。为了挖掘甘蓝型油菜含油量相关的转录因子(TF),揭示油脂合成相关基因的转录调控机制,我们通过对505份油菜种子含油量进行GWAS分析,鉴定出了380个与含油量显著相关的SNP。同时我们利用上述群体中309份材料的基因表达数据和基因型数据,鉴定出107个eQTL热点区域,并发现eQTL热点中TF显著富集,表明eQTL热点中可能存在与脂肪酸代谢相关的TF。通过整合油菜GWAS和eQTL数据和拟南芥脂类代谢网络等多组学信息,本研究鉴定了甘蓝型油菜种子含油量相关的转录因子并构建其调控网络。其中16个转录因子同时存在与含油量性状和脂类代谢基因显著关联的SNP位点,并且大部分转录因子都具有一因多效(调控多个含油量相关基因)。

关键词：甘蓝型油菜 eQTL GWAS 转录因子调控网络

来源： cnki会议评论

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成都市集成电路产业发展影响因素研究

成都市集成电路产业发展影响因素研究

作者：杨植电子科技大学

学位级别：硕士

浅析技术密集型发电企业两票实施中存在的问题及整改措施

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广东安全生产技术 2024年第8期 64-65页

作者：杨植广东粤电中山热电厂有限公司广东中山528400

发电行业属于技术、劳动力、资本密集型产业,现场作业环境复杂、危害因素较多。随着电力生产的快速多元化发展,新产业、新技术、新工艺、新材料、新装备带来的安全风险增多,发电企业安全生产管理的难度不断加大。本文针对发电企业的操... 详细信息

发电行业属于技术、劳动力、资本密集型产业,现场作业环境复杂、危害因素较多。随着电力生产的快速多元化发展,新产业、新技术、新工艺、新材料、新装备带来的安全风险增多,发电企业安全生产管理的难度不断加大。本文针对发电企业的操作票和工作票所引发的事故进行梳理分析,找出两票易引致异常事件的共性与原因,为技术密集型发电企业运行操作危险性及防范措施提供科学建议,总结已发生事故的经验教训,规避未发生的事故,进一步提高技术密集型发电企业的安全管理水平。

关键词：发电企业操作票工作票防范措施

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油菜根肿病抗性遗传改良与应用

华中农业大学学报 2021年第2期40卷 1-5页

作者：王燕燕杨植全杨庆勇张椿雨华中农业大学国家油菜工程技术研究中心武汉430070 华中农业大学植物科学与技术学院武汉430070 华中农业大学信息学院武汉430070

油菜是我国重要的油料作物,但近年受根肿病危害严重,发病面积66.7万hm^(2)以上,已成为影响油菜安全生产的头号杀手。油菜根肿病防治的方法较多,但最经济最有效的途径是抗性遗传改良。为了加快我国油菜根肿病抗性遗传改良的步伐,本文重... 详细信息

油菜是我国重要的油料作物,但近年受根肿病危害严重,发病面积66.7万hm^(2)以上,已成为影响油菜安全生产的头号杀手。油菜根肿病防治的方法较多,但最经济最有效的途径是抗性遗传改良。为了加快我国油菜根肿病抗性遗传改良的步伐,本文重点对抗性资源的发掘、抗性基因定位、抗病育种主要进展进行了总结,并适时提出一些尚待解决的科学或产业问题。由于长期种植单一抗性的油菜品种容易导致抗性丧失,本文还提出了持久抗性品种选育的可能途径,特别是对如何科学应用抗病品种给出了建议。

关键词：油菜根肿病抗性遗传改良抗病育种持久抗性基因定位种质资源聚合选育

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成本管理优化策略与企业绩效关系研究

商业2.0 2024年第2期 31-33页

作者：杨植娥云南省玉溪市易门县易门铜业有限公司

本文旨在研究成本管理优化策略与企业绩效之间的关系，对成本管理优化策略进行概述，对企业绩效的定义、度量指标和评价模型进行了阐述，探讨了成本管理优化策略对企业绩效的影响机制，并通过研究验证了二者之间的关系。本文以案例分析... 详细信息

本文旨在研究成本管理优化策略与企业绩效之间的关系，对成本管理优化策略进行概述，对企业绩效的定义、度量指标和评价模型进行了阐述，探讨了成本管理优化策略对企业绩效的影响机制，并通过研究验证了二者之间的关系。本文以案例分析的方式分析了成本管理优化策略在实践中的应用及效果，并对其未来研究方向进行展望。

关键词：成本管理优化策略企业绩效影响机制决策依据

托珠单抗联合血浆置换治疗老年类风湿关节炎并冷球蛋白血症1例

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中华医学杂志 2024年第24期104卷 2266-2267页

作者：杨植林鑫邓翼遥张勇强皮明婧查艳袁静贵州中医药大学第二临床医学院贵阳贵州省人民医院肾脏风湿免疫科国家卫生健康委员会肺脏免疫性疾病诊治重点实验室贵阳

本文报道1例老年类风湿关节炎(RA)合并冷球蛋白血症、急性脑梗死、多重感染的诊疗过程。患者女, 66岁, 因"关节疼痛半年, 加重伴左侧胸痛3 d"于2023年8月18日入住贵州省人民医院。患者自2023年3月出现双上肢小关节疼痛, 继发左侧胸痛、... 详细信息

本文报道1例老年类风湿关节炎(RA)合并冷球蛋白血症、急性脑梗死、多重感染的诊疗过程。患者女, 66岁, 因"关节疼痛半年, 加重伴左侧胸痛3 d"于2023年8月18日入住贵州省人民医院。患者自2023年3月出现双上肢小关节疼痛, 继发左侧胸痛、左侧肢体肌力下降、发热、咳嗽, 采用托珠单抗联合血浆置换及对症处理后病情明显改善, 且未见不良反应。随诊近4个月, 患者遵医嘱服药, RA逐步控制。

关键词：关节炎, 类风湿冷球蛋白血症托珠单抗脑梗死

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选区激光熔化石墨烯增强金属基复合材料研究进展

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材料科学与工艺 2024年第3期32卷 104-116页

作者：杨植禄马盼张楠方亚成张志宇魏水淼王灿上海工程技术大学材料科学与工程学院上海201620

石墨烯拥有不同于传统材料的特殊性能,如优异的结构力学性能以及导热性能,自被发现以来即获得广泛的关注,其中一个重要应用是作为增强相来增强金属基材料,从而获得高性能的结构和功能复合材料。近年来为了满足复合材料性能优化及结构精... 详细信息

石墨烯拥有不同于传统材料的特殊性能,如优异的结构力学性能以及导热性能,自被发现以来即获得广泛的关注,其中一个重要应用是作为增强相来增强金属基材料,从而获得高性能的结构和功能复合材料。近年来为了满足复合材料性能优化及结构精密复杂的需求,对其制造方法提出了更高的要求。选区激光熔化(Selective Laser Melting,SLM)作为增材制造技术的一种,避免了传统制造技术成本高、周期长、精度低等问题,可更加灵活地实现功能-结构-材料一体化。本文总结了SLM制备石墨烯及其增强金属基(铝、镍、钛、铁、铜)复合材料的应用研究与发展现状,讨论了石墨烯增强金属基复合材料所面临的主要问题,并展望了石墨烯增强金属基复合材料的应用与发展前景。

关键词：选区激光熔化石墨烯金属基复合材料制备方法性能