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云南省2014―2018年HIV-1流行毒株遗传变异及基因亚型分布

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中华疾病控制杂志 2020年第7期24卷 791-796,850页

作者：周熙姝李健健张米刘家法杨壁珲潘小满董兴齐大理大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系大理671000 云南省传染病医院云南省艾滋病关爱中心昆明650301

目的调查云南省2014―2018年人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)毒株基因亚型和重组型流行分布情况及其原始传播溯源。方法收集2014―2018年云南省16个州(市)2 604例在定点医院随访的HIV感染者或艾滋病患者... 详细信息

目的调查云南省2014―2018年人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)毒株基因亚型和重组型流行分布情况及其原始传播溯源。方法收集2014―2018年云南省16个州(市)2 604例在定点医院随访的HIV感染者或艾滋病患者的血样及流行病学信息,扩增HIV-1pol区基因,应用Genotyping和BLAST在线分析工具及软件MEGA 6.06确定毒株亚型,通过计算基因距离和系统进化树分析鉴定HIV-1重组型,阐明云南省HIV-1基因亚型的地区和人群分布特征。结果经扩增后共获得1 843条pol区序列,云南省HIV-1毒株主要亚型占比为CRF08_BC 55.8%,CRF07_BC 13.4%, CRF01_AE 14.3%,C亚型3.1%,B(B’)亚型2.6%,独特重组型(unique recombinant forms, URFSs) 8.1%,其他2.7%。其中,CRF08_BC为最常见亚型。HIV-1基因型分布在年龄,感染途径,民族上的差异均有统计学意义(均有P<0.05)。16个州(市)各亚型的分布均有差异(均有P<0.05)。其中,德宏、保山和怒江主要以CRF01_AE为主,丽江和迪庆主要以CRF07_BC为主,其余地州主要以CRF08_BC为主。结论云南省16个州(市)HIV-1亚型以CRF08_BC流行为主,各种常见亚型均存在,仍有新型流行重组型(circulating recombinant forms, CRFs)出现,与2012―2014年的资料相比较,在地区、民族、年龄和感染途径方面有变化,应密切监测。

关键词：人类免疫缺陷病毒-1 流行毒株亚型分布特征变异

云南省HIV/AIDS病人原发性整合酶基因耐药突变情况

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中国艾滋病性病 2019年第4期25卷 327-330,341页

作者：邓雪媚刘家法张米李健健杨壁珲舒远路董兴齐大理大学云南大理671000 昆明医科大学附属传染病医院/云南省艾滋病关爱中心昆明650301

目的分析云南省原发性整合酶基因突变及相关耐药情况,为治疗提供参考依据。方法采集2015—2016年云南省14个地州(市)未接受过含整合酶抑制剂(INIs)抗病毒治疗的531例HIV-1感染者外周静脉血,分离血浆,-80℃冻存备用。所有感染者均进行个... 详细信息

目的分析云南省原发性整合酶基因突变及相关耐药情况,为治疗提供参考依据。方法采集2015—2016年云南省14个地州(市)未接受过含整合酶抑制剂(INIs)抗病毒治疗的531例HIV-1感染者外周静脉血,分离血浆,-80℃冻存备用。所有感染者均进行个案流行病学调查并签署知情同意书。采用反转录/巢式聚合酶链式反应扩增病毒pol基因区并进行序列测定,分析IN区耐药突变位点及其耐药程度。结果 531例未经INIs抗病毒治疗的病人血浆扩增成功513例,5.7%(29/513)存在原发IN基因突变,其中9例病人表现出对INIs原发性耐药。全部INIs耐药毒株均属于交叉耐药,包括5例部分交叉耐药和4例完全交叉耐药。共检出10个IN区主要突变位点,其中T66A、E92A/G、G118R、 E138A/K、 G140A、Y143S、 P145S和Q148H等8种主要突变类型引起INIs不同程度耐药;共检出8个IN次要突变位点,A128T出现频率最高,引起INIs耐药的次要突变位点是S153F和G163R。结论云南省存在原发性INIs基因突变且变异位点具有多样性和特异性,应加强IN区耐药监测,合理调整INIs的用药方案。

关键词：艾滋病病毒整合酶抑制剂原发耐药基因突变

云南省一株近全长HIV独特重组毒株(CRF01_AE/B/C)的重组模式分析

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中国皮肤性病学杂志 2022年第8期36卷 898-904页

作者：周熙姝张米刘家法王佳丽杨壁珲李健健董兴齐云南省传染病医院云南省艾滋病关爱中心云南昆明650301

目的通过分析云南省一株HIV-1独特重组毒株的基因结构和重组特点了解云南省独特重组毒株的演变情况。方法对云南省艾滋病关爱中心抗病毒治疗的耐药患者进行耐药监测后,从耐药监测序列库中200条序列进行全长扩增,扩增成功后选取具有代表... 详细信息

目的通过分析云南省一株HIV-1独特重组毒株的基因结构和重组特点了解云南省独特重组毒株的演变情况。方法对云南省艾滋病关爱中心抗病毒治疗的耐药患者进行耐药监测后,从耐药监测序列库中200条序列进行全长扩增,扩增成功后选取具有代表性的独特二代重组毒株进行研究。采集血浆500μL,分离血浆并提取纯化血浆中的RNA。全长序列分为三个部分,运用RT-PCR的方法分别扩增该病毒基因的3'半分子,gag区和pol区,扩增产物测序后获得该毒株近全长基因序列。用Genotyping、BLAST、RIP和jpHMM在线分析工具和Simplot3.5软件进行重组分析。结果获得8850 bp近全长HIV-1基因序列,重组分析显示,该条序列是以C亚型为骨架,B(B')和C亚型作为片段插入的一条位置重组毒株,该条序列共有10个重组断点将序列分为11个片段,其中5个为C片段,4个B片段,2个CRF01_AE片段。结论云南省HIV-1URF的多样性不断演变,尤其是以C、B(B')和CRF01_AE亚型的二代重组,需要持续监测,以应对诊断、抗逆转录病毒治疗和预防方面日益增加的挑战。

关键词：人类免疫缺陷病毒-1 独特重组型近全长基因序列

云南地区HIV/AIDS患者合并深部真菌感染的类型及免疫学特征分析

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中国病原生物学杂志 2020年第1期15卷 42-46,51页

作者：孙艾丝刘家法张米李健健李正伦杨壁珲董兴齐云南省传染病医院云南省艾滋病关爱中心云南昆明650301 大理大学公共卫生学院

目的分析云南地区近5年HIV/AIDS患者合并深部真菌感染的类型与免疫学特征。方法采集住院HIV/AIDS患者送检血液、脑脊液、骨髓、痰及脓液等标本进行菌种的培养及鉴定,用流式细胞技术检测合并深部真菌感染的HIV患者外周血T淋巴细胞亚群。... 详细信息

目的分析云南地区近5年HIV/AIDS患者合并深部真菌感染的类型与免疫学特征。方法采集住院HIV/AIDS患者送检血液、脑脊液、骨髓、痰及脓液等标本进行菌种的培养及鉴定,用流式细胞技术检测合并深部真菌感染的HIV患者外周血T淋巴细胞亚群。结果 645例合并深部真菌感染的HIV/AIDS中分离出菌株702株,共11种,包括念珠菌304株(占43.3%),马尔尼菲篮状菌231株(占32.91%),新型隐球菌151株(占21.51%)。不同感染类型患者的CD4^+T淋巴细胞水平比较差异有统计学意义(χ^2=77.414,P<0.01)。合并马尔尼菲篮状菌和新型隐球菌感染者的CD8^+T淋巴细胞水平比较差异有统计学意义(χ^2=33.624,P<0.01)、马尔尼菲篮状菌与念珠菌感染的患者CD8^+T淋巴细胞水平比较差异有统计学意义(χ^2=13.161,P<0.01)。HIV/AIDS患者合并感染真菌种类与CD4^+T/CD8^+T水平具有相关关系(χ^2=45.013,P<0.01)。结论 HIV/AIDS患者易合并深部真菌感染,且不同菌种感染者的T淋巴细胞亚群构成不同。应根据艾滋病患者CD4^+、CD8^+ T淋巴细胞计数及CD4^+T/CD8^+T比值变化,进行治疗以降低病死率。

关键词： HIV/AIDS 深部真菌免疫状况流行特征

云南省38对HIV-1双阳性夫妻的分子流行病学特征分析

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中华疾病控制杂志 2019年第3期23卷 263-267页

作者：刘家法李健健邓雪媚张念杨壁珲张米董兴齐云南省传染病专科医院/艾滋病关爱中心检验科昆明650301

目的分析云南省38对人免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1, HIV-1)双阳性夫妻的分子流行病学特征。方法收集云南省传染病专科医院检验科2014-2016年HIV-1抗体初筛及确证阳性的样本及实验室资料,筛选出41对双阳性夫妻... 详细信息

目的分析云南省38对人免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus type 1, HIV-1)双阳性夫妻的分子流行病学特征。方法收集云南省传染病专科医院检验科2014-2016年HIV-1抗体初筛及确证阳性的样本及实验室资料,筛选出41对双阳性夫妻,采用逆转录套式聚合酶链反应(reverse transcription nested polymerase chain reaction,RT-nested-PCR)扩增后测序,将序列进行比对拼接,运用合格的pol基因区序列构建系统进化树并分析亚型,并计算每对双阳夫妻间序列的基因距离差异。结果共获得38对双阳性夫妻pol基因区序列76条,主要基因亚型为CRF08_BC(45,59.2%)、CRF07_BC(18,23.7%)和CRF01_AE(7,9.2%),另外还有C(4,5.3%)和B(2,2.6%)。系统进化树分析及基因距离计算可明确有9对双阳夫妻为夫妻间传播。结论随着HIV性传播比例的逐年上升,夫妻间传播应当成为重点关注的问题,HIV感染的晚发现是造成夫妻间传播的主要因素,对于特殊人群应及早加强监测及检测,减少艾滋病夫妻间的传播的发生。

关键词：艾滋病病毒抗体双阳夫妻分子流行病学

云南省HIV-1 B(B′)、C亚型毒株的耐药突变分析

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中国皮肤性病学杂志 2019年第5期33卷 547-552页

作者：舒远路杨翠先张米李健健刘家法杨壁珲邓雪媚董兴齐大理大学云南大理671000 云南省传染病专科医院/艾滋病关爱中心云南昆明650301

目的调查云南省艾滋病病毒1型B(B′)、C亚型毒株在ART失败后的耐药突变特征。方法对云南省15个地州定点医院2016年随访ART失败的HIV/AIDS患者的1 591份血浆样本,采用RT-PCR扩增HIV-1 pol区蛋白酶和反转录酶基因,通过BLAST、jpHMM at GOB... 详细信息

目的调查云南省艾滋病病毒1型B(B′)、C亚型毒株在ART失败后的耐药突变特征。方法对云南省15个地州定点医院2016年随访ART失败的HIV/AIDS患者的1 591份血浆样本,采用RT-PCR扩增HIV-1 pol区蛋白酶和反转录酶基因,通过BLAST、jpHMM at GOBICS和MEGA6.06软件确证亚型,进行耐药突变位点的分析。结果共获得B(B′)、C亚型毒株分别为27例和63例,其中B(B′)、C亚型检测出发生耐药突变分别为22例和37例,耐药突变率为81.48%和58.73%。病毒载量在B(B′)、C亚型耐药突变的毒株间差异有统计学意义(P0.05)。在所有检出耐药突变位点中,仅K103和A71突变率在两种亚型间差异有统计学意义(P<0.05)。在所有治疗方案中,仅TDF/3TC/EFV方案在两种亚型间的耐药突变率和病毒载量差异有统计学意义(P<0.05)。结论 B(B′)、C亚型毒株ART失败后的耐药突变特征有差异,应加强两种亚型的耐药监测。

关键词：艾滋病病毒1型亚型耐药突变

云南省HIV-1感染儿童一线抗病毒治疗病毒学反弹影响因素研究

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中国艾滋病性病 2021年第2期27卷 180-182页

作者：杨壁珲杨翠先刘家法李健健王佳丽张桂仙楼金成张米云南省传染病医院昆明650301

目的观察云南省艾滋病病毒(HIV-1)感染儿童抗病毒治疗(ART)的疗效,探讨ART过程中出现病毒学反弹的影响因素。方法通过"国家艾滋病抗病毒治疗信息系统"收集资料,并进行描述性分析,采用COX比例风险回归模型分析发生病毒学反弹的影响因素... 详细信息

目的观察云南省艾滋病病毒(HIV-1)感染儿童抗病毒治疗(ART)的疗效,探讨ART过程中出现病毒学反弹的影响因素。方法通过"国家艾滋病抗病毒治疗信息系统"收集资料,并进行描述性分析,采用COX比例风险回归模型分析发生病毒学反弹的影响因素。结果2005年1月1日至2015年12月31日,云南省随访治疗1年以上且在治疗过程中第一年病毒学得到抑制的548例儿童感染者,其中有85例在随后的治疗中出现病毒学反弹。不同疗程组中疗程在13~24个月组病毒学反弹比例(40.71%)高于25~36个月组(11.76%)和≥37个月组(4.84%)。最近7天有漏服药物病毒学反弹的风险高于未漏服者[风险比(HR)=4.111,95%可信区间(CI):2.679~6.310],发生药物不良反应者病毒学反弹的风险高于未发生者(HR=1.767,95%CI:0.994~3.141)。结论云南省HIV-1感染儿童病毒学反弹发生的时间段主要在治疗的13~24个月。最近7天漏服药物和发生药物不良反应是影响儿童抗病毒治疗发生病毒学反弹的主要因素,通过提高儿童的服药依从性可以降低抗病毒治疗中病毒学反弹的发生。

关键词：儿童艾滋病病毒感染者病毒学反弹一线抗病毒治疗

云南省2014-2016年抗病毒失败HIV/AIDS基因型耐药情况调查

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中华疾病控制杂志 2019年第9期23卷 1107-1113页

作者：李健健潘小满张米刘家法杨翠先杨壁珲李惠琴董兴齐云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心昆明650301 昆明医科大学公共卫生学院昆明650000

目的调查云南省16个州市2014-2016年接受抗病毒治疗失败的感染人类免疫缺陷病毒/艾滋病免疫缺陷综合征(human immunodeficiency virus/acquired immune deficiency syndrome, HIV/AIDS)患者基因型耐药变异、耐药程度及突变位点分布情况... 详细信息

目的调查云南省16个州市2014-2016年接受抗病毒治疗失败的感染人类免疫缺陷病毒/艾滋病免疫缺陷综合征(human immunodeficiency virus/acquired immune deficiency syndrome, HIV/AIDS)患者基因型耐药变异、耐药程度及突变位点分布情况。方法采用横断面调查方法,收集患者耐药相关流行病学信息。通过In-house方法,运用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增患者HIV-1 pol基因序列,测序后进行比对分析,阐明三类抗病毒药物耐药情况。结果 2014-2016年全省发生耐药突变1 368(58.8%)例。粗略估计HIV-1总体耐药率为1.6%(1 368/84 146)。16个地市均有耐药毒株出现,总体耐药率以昭通市最高为4.5%,治疗失败人群耐药率最高为德宏,达到72.9%(100/145)。核苷类抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitors, NRTIs)、非核苷类抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors, NNRTIs)以及蛋白酶抑制剂(protease inhibitor, PIs)的耐药率分别为51.1%(699/1 368)、91.2%(1 248/1 368)和9.6%(132/1 368);三类药物出现频率最高的突变位点依次为NRTIs-M184V(71.1%)、NNRTIs-K103N(43.7%)和PIs-K20I(24.2%)。结论目前云南省的HIV-1耐药呈现低流行水平,耐药率在各地市的分布存在一定差异,三类药物中以NNRTIs和NRTIs耐药为主,全省总体耐药情况与2008-2012年结果比较变化明显。我们应加强抗病毒治疗的管理和基因型耐药的检测,以降低耐药发生率,控制耐药毒株发生和传播。

关键词：人类免疫缺陷病毒- 1 高效联合抗逆转录病毒治疗基因型耐药突变位点

云南省德宏和昆明地区高效抗逆转录病毒治疗后HIV-1流行毒株pol区基因变异分析

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中华检验医学杂志 2011年第4期34卷 315-320页

作者：杨绍敏樊移山李惠琴杨壁珲李健健高丽钟敏雷素云周曾全云南省传染病专科医院艾滋病关爱中心检验科昆明650301

目的调查云南省德宏和昆明两个地区HIV-1流行毒株pol区基因在接受HAART后的变异情况.方法选择接受HAART 1年以上血浆HIV-1病毒载量＞1 000拷贝/ml的139例HIV/AIDS患者,提取血浆中HIV-1 RNA,采用RT-nested-PCR扩增HIV-1的pol区基因蛋... 详细信息

目的调查云南省德宏和昆明两个地区HIV-1流行毒株pol区基因在接受HAART后的变异情况.方法选择接受HAART 1年以上血浆HIV-1病毒载量＞1 000拷贝/ml的139例HIV/AIDS患者,提取血浆中HIV-1 RNA,采用RT-nested-PCR扩增HIV-1的pol区基因蛋白酶（PR）和逆转录酶（RT）基因片段,测定DNA序列.经拼接整理后与美国斯坦福大学网站提供的HIV耐药数据库（Stanford HIV Drug Resistance Database）进行比对,分析耐药突变位点,采用MEGA 4.1构建系统进化树以确定HIV的亚型,结合HIV/AIDS患者流行病学资料进行综合分析.结果昆明地区患者HIV以T215F/NY/I、M41L/M和T69G/N/I/S/A/D突变较多,突变率分别为39%（24/62）、27%（17/62）和27%（17/62）,高于德宏地区患者HIV的相应突变率[分别为16%（11/69）、13%（9/69）和9%（6/69）],差异有统计学意义（x2值分别为8.646、4.242和7.909,P均＜0.05）.德宏地区HIV-1流行毒株pol区基因亚型主要为CRF01_AE亚型为32%（22/69）、C亚型为25%（17/69）、B亚型19%（13/69）.而昆明地区主要是08_BC亚型60%（37/62）、CRF01_AE亚型21%（13/62）和07_BC亚型15%（9/62）.结论云南省德宏、昆明两地区HIV-1流行毒株pol区基因PR、RT基因突变频率存在部分差异,昆明地区T215F/N/Y/I、M41L/M和T69G/N/I/S/A/D突变率高于德宏地区.两地共检出HIV-1流行毒株pol区基因CRF01_AE、B、C、BC、08_BC和07_BC共6种基因亚型.

关键词：抗逆转录病毒治疗,高效 HIV-1 pol基因产物,人免疫缺陷病毒抗药性,细菌突变逆转录聚合酶链反应