检索结果-南通市图书馆

作者：李祥芳大理大学

学位级别：硕士

目的:对云南省西部地区HIV相关的疑似非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)临床分离株进行菌种鉴定;对得到的优势菌株鸟分枝杆菌(mycobacterium avium,MAV)和本课题组前期收集鉴定的MAV用MATR-VNTR法进行基因分型,探讨优势... 详细信息

目的:对云南省西部地区HIV相关的疑似非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)临床分离株进行菌种鉴定;对得到的优势菌株鸟分枝杆菌(mycobacterium avium,MAV)和本课题组前期收集鉴定的MAV用MATR-VNTR法进行基因分型,探讨优势菌群基因型特征以及流行趋势;通过比例法检测MAV的药物敏感性,探讨HIV相关的鸟分枝杆菌耐药现状,基因多态性与耐药的相关性。方法:1、菌种鉴定:将NTM进行抗酸染色,用PNB和TCH鉴别培养基对NTM进行初步鉴别,提取初步鉴别出的菌株的DNA,与基因引物16S r RNA、rpo B、hsp65分别进行PCR扩增、电泳和测序,将测序完成的基因序列输入NCBI的Gen Bank中进行BLAST比对,分析其同源性,得到菌种鉴定结果。2、基因分型:对鉴定出的优势菌株MAV进行MATR-VNTR基因分型,选择12个MATR基因位点,用这些位点作为引物进行PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳,得到MAV菌株的DNA扩增条带,将条带图片导入Quantity One软件进行数字化处理,根据公式计算出位点的重复次数和HGDI值。将合并后的重复次数导入Bio Numerics(6.6)软件中,用UPGM和MST功能分别做出聚类分析树状图和最小生成树图。3、药敏实验:使用比例法对优势菌株MAV进行药敏实验。选择阿米卡星(AMI)、卡那霉素(K)、链霉素(SM)、卷曲霉素(CPM)、利奈唑胺(LINE)、克拉霉素(CLAR)、左氧氟沙星(LFX)、利福布丁(RBU)、异烟肼(INH)、乙胺丁醇(EMB)10种药物进行药敏实验。4、统计学分析:使用统计学软件SPSS 26.0对MAV基因型与乙胺丁醇敏感性之间的相关性进行分析。结果:1、菌种鉴定:云南省西部地区的HIV相关的50株NTM中,鸟分枝杆菌44株(占88%),戈登分枝杆菌2株(占4%),结核分枝杆菌2株(占4%),脓肿分枝杆菌1株(占1%),胞内分枝杆菌1株(占2%)。其中鸟分枝杆菌最多,为此次鉴定的优势菌株。2、基因分型:44株MAV基因分型后有10个MATR基因位点(MATR 1、2、3、4、5、6、7、9、13、15)的HGDI值大于0.5,即多样性指数高。将合并后的67株MAV的重复次数做UPGM和MST分析,67株MAV被分为5个(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ)主要基因群,61个独立菌株模式,有成簇菌株存在,成簇的菌株有3簇(在Ⅰ群和Ⅳ群),每簇包含2株菌,其中有2簇是来自相同的分离地,聚类率为8.96%(6/67),聚类率低,表明MATR-VNTR基因分型法对云南省西部地区的MAV的分辨率高。3、药敏实验:44株MAV均对利福布丁(耐药率0%,0/44)敏感,除6个菌株,所有其他菌株都对乙胺丁醇(耐药率86%,38/44)耐药。所有菌株都对其余8种药物全部耐药。4、统计学分析:MAV基因型与乙胺丁醇药物敏感性之间无显著相关性。结论:1、云南省西部地区的NTM优势菌株为鸟分枝杆菌。2、MATR-VNTR基因分型法适用于云南省西部地区的MAV基因分型,MATR基因位点的分辨率较高,且说明MAV具有基因多态性和地域性。3、44株MAV均对利福布丁敏感,可为临床治疗提供参考。4、MAV基因型与乙胺丁醇药物敏感性之间无显著相关性。

关键词：非结核分枝杆菌鸟分枝杆菌菌种鉴定基因分型药敏

新型冠状病毒ORF3a蛋白质的生物信息学分析

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中国感染控制杂志 2023年第2期22卷 224-228页

作者：王瑄李祥芳丁寿鹏吴利先南昌大学玛丽女王学院江西南昌330031 大理大学基础医学院云南大理671000

目的用生物信息学分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)基因ORF3a蛋白质。方法从UniProt数据库获取ORF3a蛋白质的氨基酸序列,应用ProtParam tool分析其理化性质,SOPMA、SWISS-MODEL预测二、三级结构,PortScale、Signal IP 4.0 S... 详细信息

目的用生物信息学分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)基因ORF3a蛋白质。方法从UniProt数据库获取ORF3a蛋白质的氨基酸序列,应用ProtParam tool分析其理化性质,SOPMA、SWISS-MODEL预测二、三级结构,PortScale、Signal IP 4.0 Server、TMHMM Server 2.0分析ORF3a蛋白质亲疏水性、信号肽、跨膜区。应用ABCpred、SYFPEITHI和NetPhos 3.1 Server预测B、T细胞表面抗原表位及磷酸化位点,VaxiJenv 2.0、AlgPred server预测抗原性和过敏原性。结果ORF3a蛋白质含275个氨基酸,为稳定、疏水性蛋白质,有3个跨膜螺旋区、29个磷酸化位点,含多个T、B细胞抗原表位,具有抗原性和非过敏原性。结论ORF3a蛋白质结构稳定,含多个T、B细胞抗原表位,可为研究SARS-CoV-2多表位疫苗提供基础。

关键词： SARS-CoV-2 ORF3a 生物信息学分析多表位疫苗

44株HIV/MAV双重感染者MAV基因分型和药敏结果分析

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中国感染控制杂志 2023年第3期22卷 275-279页

作者：李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的了解云南省西南地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/鸟结核分枝杆菌(MAV)双重感染者MAV的基因型和耐药情况。方法选取12个可变数目串联重复序列(VNTR)特异性位点,采用分枝杆菌串联重复序列(MATR-VNTR)基因分型法对MAV进行基因分型;采用聚... 详细信息

目的了解云南省西南地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/鸟结核分枝杆菌(MAV)双重感染者MAV的基因型和耐药情况。方法选取12个可变数目串联重复序列(VNTR)特异性位点,采用分枝杆菌串联重复序列(MATR-VNTR)基因分型法对MAV进行基因分型;采用聚合酶链反应(PCR)扩增菌株DNA后进行琼脂糖凝胶电泳,获得MAV的DNA指纹图谱,再应用Quantity One和BioNumerics 6.7软件对电泳图进行数字化处理并通过非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析。采用比例法测试44株MAV对10种不同抗菌药物的敏感性。结果各位点VNTR基因分型的Hunter-Gaston指数(HGDI)存在差异,其中MATR-5最高,为0.68,MATR-1、2、3、4、6、7、9、13、15位点的HGDI值均≥0.5;通过聚类分析,44株MAV分为6个集群。药敏试验结果显示,利福布丁对MAV的体外抗菌活性最好(耐药率为0),其次是乙胺丁醇(耐药率86.4%,38/44),所有菌株对其余8种药物均耐药。结论选取的12个位点VNTR基因分型法在云南省西南地区具有较高分辨率,来自云南省不同地区的MAV分离株耐药情况严峻。

关键词：鸟结核分枝杆菌基因分型 VNTR 药敏试验 HIV

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非结核分枝杆菌的致病机制研究进展

中国病原生物学杂志 2022年第3期17卷 352-355页

作者：李祥芳丁寿鹏高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫教研室云南大理671000

非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)是除麻风分枝杆菌、结核杆菌复合群以外的分枝杆菌。近年来,NTM的感染人数逐年增多,而且NTM对治疗结核杆菌的药物大部分耐药,导致NTM病防治困难,因此NTM感染致病机制的研究备受关注。... 详细信息

非结核分枝杆菌(Nontuberculous mycobacteria,NTM)是除麻风分枝杆菌、结核杆菌复合群以外的分枝杆菌。近年来,NTM的感染人数逐年增多,而且NTM对治疗结核杆菌的药物大部分耐药,导致NTM病防治困难,因此NTM感染致病机制的研究备受关注。本文主要从生物膜的形成、感染宿主细胞和其在HIV合并感染中的致病作用等方面的致病机制做一综述,为该病的临床防治提供依据。

关键词：非结核分枝杆菌致病机制感染免疫综述

结核分枝杆菌Rv3529c蛋白的生信分析及原核表达

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中国感染控制杂志 2023年第6期22卷 621-628页

作者：陈瑞枫王瑄马枫茜李祥芳丁寿鹏吴利先大理大学基础医学院医学微生物学与免疫学教研室云南大理671000 南昌大学玛丽女王学院江西南昌330031

目的通过生物信息学软件预测结核分枝杆菌Rv3529c基因编码蛋白的结构和功能,并对其进行原核表达。方法利用UniproKB数据库、PredictProtein服务、AlphaFold系统、SWISS-MODEL服务、ProtParam蛋白分析工具、ProtScale、DeepTMHMM服务和... 详细信息

目的通过生物信息学软件预测结核分枝杆菌Rv3529c基因编码蛋白的结构和功能,并对其进行原核表达。方法利用UniproKB数据库、PredictProtein服务、AlphaFold系统、SWISS-MODEL服务、ProtParam蛋白分析工具、ProtScale、DeepTMHMM服务和SignalP-5.0服务、ProtCompB方法、IEDB数据库和STRING数据库等生物信息学预测软件对Rv3529c编码蛋白的二级和三级结构、理化性质、疏水性、信号肽、跨膜区、亚细胞定位及免疫表位进行分析预测。利用分子克隆技术构建表达质粒载体pET-32a-Rv3529c并进行原核表达,运用UniprotKB数据库的Blast工具对氨基酸序列进行比对,采用MEGA 11软件构建进化树,进行系统进化分析,运用STRING数据库分析蛋白间相互作用。结果 Rv3529c基因全长1 155 bp,共编码384个氨基酸。Rv3529c基因编码蛋白分子量为43.35 kDa,等电点为6.04,二级结构以α-螺旋为主,该蛋白为稳定的亲水性蛋白,无跨膜区、无信号肽,预测该蛋白亚细胞定位在细胞质中或细胞膜上,存在多个抗原抗体表位,与多个蛋白质有相互作用。经克隆、表达、鉴定、纯化后获得浓度和纯度较高的Rv3529c蛋白。结论成功克隆、表达、纯化结核分枝杆菌Rv3529c蛋白,并初步预测其结构及功能。

关键词：结核分枝杆菌 Rv3529c蛋白原核表达生物信息学表位

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孕妇免疫预防新生儿破伤风

中华妇产科杂志 1993年第2期28卷 107-108页

作者：李祥芳吴萍 630010，重庆医科大学第二医院四川省涪陵市妇幼保健所

四川省妇幼卫生示范扩展县基础调查结果1987年新生儿破伤风死亡率为566.78/10万,个别山区达1045.75/10万。破伤风为新生儿死因顺位第三位。为降低其发生率及死亡率,我们在以山区和丘陵为主要地形的涪陵市开展孕妇注射破伤风类毒素(破类),使

关键词：新生儿破伤风孕妇免疫学预防

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外泌体的抗感染作用研究进展

中国比较医学杂志 2022年第12期32卷 115-119页

作者：马枫茜陈瑞枫丁寿鹏李祥芳吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

外泌体是由多种细胞分泌的纳米囊泡,能够传递蛋白质、脂质和核酸等生物活性大分子,在细胞间信息传递中起着重要作用。越来越多的研究表明,某些类型细胞如间充质干细胞、NK细胞和中性粒细胞等细胞来源的外泌体具有治疗潜力,参与调节免疫... 详细信息

外泌体是由多种细胞分泌的纳米囊泡,能够传递蛋白质、脂质和核酸等生物活性大分子,在细胞间信息传递中起着重要作用。越来越多的研究表明,某些类型细胞如间充质干细胞、NK细胞和中性粒细胞等细胞来源的外泌体具有治疗潜力,参与调节免疫系统,能够增强免疫细胞的杀伤能力;另外从感染细胞释放的外泌体也能促进抗原提呈和免疫细胞活化,激活多种细胞免疫因子,介导细胞免疫反应。本文就外泌体在抗病毒感染、细菌感染和真菌感染中的直接或间接作用进行了综述,为临床应用提供依据。

关键词：外泌体病毒细菌真菌

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盐田港一期港口工程及其集装箱码头设计特点

港口装卸 1997年第1期 32-35页

作者：李祥芳交通部水运规划设计院

盐田港一期港口工程及其集装箱码头设计特点交通部水运规划设计院李祥芳１概述盐田港位于深圳市东部大鹏湾内，地理位置优越。南与香港隔海相望，西与沙头角管理区相接，东为大小梅沙，北邻广东惠阳地区。水陆交通便捷，公路经沙头角至... 详细信息

盐田港一期港口工程及其集装箱码头设计特点交通部水运规划设计院李祥芳１概述盐田港位于深圳市东部大鹏湾内，地理位置优越。南与香港隔海相望，西与沙头角管理区相接，东为大小梅沙，北邻广东惠阳地区。水陆交通便捷，公路经沙头角至深圳１９ｋｍ、广州１８８ｋｍ、香港...

关键词：港口工程盐田港集装箱码头设计

鸟分枝杆菌MAV-4563蛋白的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2022年第9期17卷 1015-1019页

作者：马枫茜陈瑞枫丁寿鹏李祥芳高婧华吴利先大理大学基础医学院微生物与免疫学教研室云南大理671000

目的应用生物信息学方法预测分析鸟结核分枝杆菌MAV-dalidaxue4563基因编码蛋白的结构功能和生物学特性。方法采用Protparam、ProtScaleon Expasy,TMHMM Server v 2.0,SignalP4.1,PSORT,NetPhos 3.1,BLAST,SOPMA,Phyre2,ABCpred,SYFPEITHI等生物信息学软件分析MAV4563蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、保守域、二结构及三级结构同源建模、B细胞和T细胞表位等生物学特征。结果MAV4563基因全长756 bp,编码251个氨基酸的蛋白。该蛋白分子质量为28 ku,等电点为9.23,分子式(formula)为C_(1264)H_(2013)N_(385)O_(353)S_(7),为不稳定的疏水性蛋白。该蛋白无跨膜区,无信号肽,预测亚细胞定位于细胞质中,有13个磷酸化位点;蛋白二级结构中无规则卷曲占41.83%;预测该蛋白含多个B细胞和T细胞表位,其中MHC-I型和MHC-II型表位集中在蛋白C端的后90个氨基酸区域。结论预测MAV-4563蛋白含多个B细胞和T细胞表位,其中B细胞表位和MHC-I型表位集中在C端的后90个氨基酸区域,该区域可激活NTM特异性CTL和Th免疫应答,可作为非结核病的靶向疫苗抗原,为进一步研究该蛋白的治疗性T细胞疫苗奠定了基础。

关键词：鸟结核分枝杆菌 MAV-4563蛋白 T细胞疫苗