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苹果抗褐斑病菌侵染的转录组学分析

苹果抗褐斑病菌侵染的转录组学分析

作者：李海录西北农林科技大学

学位级别：硕士

苹果褐斑病(Marssonina leaf blotch of apple)是由Diplocarpon mali(有性态)、Marssonina coronariae(无性态)引起的世界性苹果早期落叶病害之一,该病害引起生长季节苹果叶片黄化和早落,进而造成严重的经济损失。目前生产实践当中多数... 详细信息

苹果褐斑病(Marssonina leaf blotch of apple)是由Diplocarpon mali(有性态)、Marssonina coronariae(无性态)引起的世界性苹果早期落叶病害之一,该病害引起生长季节苹果叶片黄化和早落,进而造成严重的经济损失。目前生产实践当中多数苹果主栽品种对褐斑病表现为感病,利用品种抗病性是解决和控制该病害最根本最有效的途径。因此,挖掘抗病种质资源、明确抗病机理在我国苹果抗病育种中具有重要意义。前期研究发现苹果属山定子砧木是较优良的抗褐斑病材料,目前有关山定子与苹果褐斑病菌互作的研究相对较少,其抗病机理尚不明确。本研究中,通过对侵染苹果褐斑病菌的抗(山定子)、感(富士)两种寄主材料进行转录组测序,利用生物信息学方法从转录水平上研究苹果属山定子抗苹果褐斑病菌的作用机理、为揭示山定子抗褐斑病的机理奠定基础,进而为抗病种质资源挖掘利用和抗病育种提供理论依据和指导。主要获得以下结果:1.通过有参转录组分析获得被苹果褐斑菌侵染的抗感两种寄主材料的转录表达谱。GO(Gene Ontology)富集分析发现苹果属山定子叶片内应对外界生物刺激、应激反应和防御反应相关通路被显著富集,同时在受到苹果褐斑病菌侵染时,寄主富士叶片内大量的涉及生物学代谢等相关过程的差异基因被富集。KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集发现寄主山定子叶片内的类胡萝卜素生物合成通路以及不饱和脂肪酸的生物合成代谢通路在被苹果褐斑病菌侵染时表现活跃,而富士叶片内的黄酮类生物合成通路以及一些氨基酸的代谢通路表现活跃。此外在苹果褐斑病菌侵染寄主山定子和富士叶片的差异基因当中都存在植物抗性基因,但富士中R(resistance)基因和LRR(leucine-rich repeats)结构的百分比却明显小于山定子。q RT-PCR验证结果与转录表达谱一致。本试验发现蔷薇科苹果属的这些潜在抗性基因将为未来对苹果褐斑病的研究提供理论基础。2.利用无参考转录组分析苹果褐斑病菌侵染抗褐斑病寄主材料苹果属山定子,共获得山定子48 868个unigenes。利用NR(Non-Redundant)、Swiss-Prot(Swiss-Prot Protein Sequence Database)、KOG(Eukaryotic Orthologous Groups of Proteins)、GO、KEGG等常用数据库对组装的48 868条unigenes进行同源性预测,NR数据库中的序列同源性比较表明,25 797个unigenes直接比对到了蔷薇科苹果基因上。将unigenes与KOG数据库进行比对,按功能分为25类。KEGG注释将所有的unigenes定位到145个代谢途径分支,包括核糖体代谢通路、碳水化合物代谢等。简单重复序列(simple sequence repeats SSR)位点分析,共搜索到12517个SSR位点。基因的差异表达计算用RSEM软件,基因的差异表达分析用edge R软件,错误发现率FDR(False Discovery Rate)2或logFold Change录组分析结果一致。这些研究结果可为明确山定子抗苹果褐斑病的分子机理提供了基础资料。

关键词：苹果褐斑病转录组山定子富士高通量测序

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四环素牙症与龋病调查

青海医药杂志 1986年第4期 48-49页

作者：肖令仪金志昌李海录中国人民解放军第四医院口腔科

近年来,青少年中患有四环素牙症的颇为多见,对其与龋病的关系文献报告结论不一。我们于1985年对西宁市中学生做了四环素牙症与龋病的调查,现将结果报告如下。资料与方法一调查对象:西宁市东郊中学学生共1636人,年龄12～18岁,性别男791人... 详细信息

近年来,青少年中患有四环素牙症的颇为多见,对其与龋病的关系文献报告结论不一。我们于1985年对西宁市中学生做了四环素牙症与龋病的调查,现将结果报告如下。资料与方法一调查对象:西宁市东郊中学学生共1636人,年龄12～18岁,性别男791人,女845人。

关键词：四环素牙患龋率四环素变色牙龋病龋均

苹果褐斑病菌侵染苹果属山定子的转录组学分析

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农业生物技术学报 2017年第1期25卷 32-42页

作者：李海录宋艳艳冯浩黄丽丽强晓玉韩青梅西北农林科技大学植物保护学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室

苹果褐斑病是由苹果褐斑病菌(Diplocarpon mali)引起的苹果(Malus domestica)早期落叶病害之一,该病害引起叶片黄化和早落,造成严重的经济损失。本研究采用新一代高通量测序技术Illumina Hiseq2500对被苹果褐斑病菌侵染的山定子(***)叶... 详细信息

苹果褐斑病是由苹果褐斑病菌(Diplocarpon mali)引起的苹果(Malus domestica)早期落叶病害之一,该病害引起叶片黄化和早落,造成严重的经济损失。本研究采用新一代高通量测序技术Illumina Hiseq2500对被苹果褐斑病菌侵染的山定子(***)叶片进行转录组测序,利用生物信息学方法对基因表达和功能进行研究。通过测序获得46.86 Gb碱基序列信息,对测序数据进行序列过滤、拼接、组装、去冗余,共获得48 868个单基因簇(unigenes)。从长度分布、GC含量、表达水平等方面对unigenes进行评估,结果显示,测序质量好,可信度高。此外利用美国国家生物技术信息中心(National Center of Biotechnology Information,NCBI)的NR(Non-Redundant)、Swiss-Prot蛋白质序列数据库(Swiss-port Protein Sequence Database)、KOG(Eukaryotic Orthologous Groups of Proteins)、基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)等常用数据库对组装的48 868条unigenes进行同源性预测,NR数据库中的序列同源性比较表明,25 797个unigenes直接比对到了蔷薇科苹果基因上。将unigenes与KOG数据库进行比对,根据其功能大致可分为25类。以KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将unigenes定位到145个代谢途径分支,包括核糖体代谢通路、碳水化合物代谢等。利用RSEM软件进行差异表达计算,edge R软件进行差异表达分析,通过设定阈值错误发现率(false discovery rate,FDR)2或log2(FC)录组分析结果一致。本研究通过二代高通量转录组测序技术研究山定子在抗褐斑病中的相关基因,为明确山定子抗褐斑病的分子机理提供了基础资料。

关键词：山定子苹果褐斑病转录组高通量测序

保水材料对旱作谷子苗期生长特性及土壤水分的影响

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作物杂志 2014年第4期 105-111页

作者：米俊珍刘景辉李立军张星杰张磊李海录内蒙古农业大学农学院内蒙古呼和浩特010019

在内蒙古清水河县进行大田试验，研究3种保水材料（聚丙烯酸钾、聚丙烯酰胺和腐殖酸）及不同施用年限对旱作谷子苗期生长特性及土壤水分的影响，筛选出适合该地区抗旱保苗的保水材料。结果表明，各保水材料处理均能提高出苗率，2011年... 详细信息

在内蒙古清水河县进行大田试验，研究3种保水材料（聚丙烯酸钾、聚丙烯酰胺和腐殖酸）及不同施用年限对旱作谷子苗期生长特性及土壤水分的影响，筛选出适合该地区抗旱保苗的保水材料。结果表明，各保水材料处理均能提高出苗率，2011年表现为A1〉B1〉C1〉CK，较CK提高了7．57～12．88个百分点，2012年表现为A2〉B2〉C2〉A1〉B1〉C1〉CK，较CK提高了0．76～12．88个百分点，2013年表现为A3〉B3〉C3〉A2〉B2〉C2〉A1〉B1〉C1=CK，较CK提高了0．00—20．45个百分点；保水材料对谷子株高和鲜干重具有显著影响，且连续施入3年的效果优于施入2年和只施入1年的，但在株高方面，保水材料的年际效果差异不明显；保水材料可以提高0～100cm土层土壤含水量和贮水量，0～60cm各土层各处理差异明显。因此，3种保水材料均具有明显的蓄水保墒效果，提高谷子出苗率，促进谷子生长，以连续施用3年聚丙烯酸钾和聚丙烯酰胺效果最好。

关键词：谷子保水材料出苗率土壤水分鲜干重相关性

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下颌总义齿引起恶心呕吐1例

实用口腔医学杂志 1990年第1期 29-29页

作者：李海录,杨耀鹏解放军第四医院解放军第四医院

患者,女,56岁,一年前因下颌牙全部缺失在我科作义齿修复,因出现恶心欲吐,平时不能戴用,只在进食时勉强使用。两月后曾复诊检查:下颌总义齿固位较差,两侧基托后缘覆盖磨牙后垫的1/2,舌、唇、颊侧基托长度适中,余未见明显异常,给于自凝塑... 详细信息

患者,女,56岁,一年前因下颌牙全部缺失在我科作义齿修复,因出现恶心欲吐,平时不能戴用,只在进食时勉强使用。两月后曾复诊检查:下颌总义齿固位较差,两侧基托后缘覆盖磨牙后垫的1/2,舌、唇、颊侧基托长度适中,余未见明显异常,给于自凝塑料直接法垫底后固位良好,

关键词：总义齿固位基托恶心欲吐

苹果褐斑病原菌侵染苹果属山定子的转录组学研究

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苹果褐斑病原菌侵染苹果属山定子的转录组学研究

中国植物病理学会2016年学术年会

作者：李海录宋艳艳冯浩黄丽丽韩青梅旱区作物逆境生物学国家重点实验室/西北农林科技大学植物保护学院

苹果褐斑病（Marssonina leaf blotch of apple）是由Diplocarpon mali引起的东亚地区苹果生产中主要早期落叶病害之一,该病害引起生长季节叶片黄化和早落,进而造成严重的经济损失。前期研究发现山定子对褐斑病具有一定抗性,但病分子机... 详细信息

苹果褐斑病（Marssonina leaf blotch of apple）是由Diplocarpon mali引起的东亚地区苹果生产中主要早期落叶病害之一,该病害引起生长季节叶片黄化和早落,进而造成严重的经济损失。前期研究发现山定子对褐斑病具有一定抗性,但病分子机理尚不清楚。本研究采用新一代高通量测序技术Illumina Hiseq2500对被侵染的苹果褐斑病菌的苹果属山定子进行转录组双端测序,利用生物信息学方法对基因表达谱研究和功能基因预测。通过测序,获得了46.86G包含碱基序列信息。对测序数据进行序列过滤、拼接、组装、去冗余,共获得48 868个单基因簇unigenes,平均长度1 007bp,序列信息达到了32Mb。另外,从长度分布、GC含量、表达水平等方面对unigenes进行评估,数据显示测序质量好,可信度高。此外,对组装的48 868条unigenes进行了NR、Swiss-port、KOG、GO、KEGG等五大数据库预测,NR数据库中的序列同源性比较表明,25 797个unigenes直接比对到了蔷薇科苹果属苹果（Malus domestica）基因上,表明本研究的测序及unigenes组装结果可靠。将unigenes与KOG数据库进行比对,根据其功能大致可分为25类。以KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将unigenes定位到147个代谢途径分支,包括核糖体代谢通路、碳水化合物代谢等。利用RSEM软件进行差异表达计算,edgeR软件进行差异表达分析,通过设定阈值FDR＜0.05,logFC＞2或者logFC＜-2筛选差异基因,共鉴定出上调基因1 230个,下调基因1 869个,GO富集和Pathway富集结果表明差异基因参与植物的病原互作、植物信号转导通路等相关代谢通路。通过二代高通量转录组测序技术研究苹果属山定子抗褐斑病中的作用,为明确山定子在抗褐斑病的分子机理奠定理论基础,对于培育抗褐斑病品种具有重要的指导意义。

关键词：山定子苹果褐斑病转录组高通量测序

来源： cnki会议评论

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榆林地区食用绿豆高产栽培及病虫害防治技术

农业科技通讯 2022年第9期 208-210页

作者：李海录强羽竹井苗李振姣付治忠王孟榆林市农业科学研究院陕西榆林719000

榆林是我国小杂粮主产区之一,食用绿豆种植历史悠久,绿豆属豆科植物,也是榆林地区的主要粮食作物。绿豆生育期短,抗逆性强,适应性强,可以在多种环境中栽培种植,具有非常高的经济价值。本文作者从种植栽培、田间管理、病虫害综合防治几... 详细信息

榆林是我国小杂粮主产区之一,食用绿豆种植历史悠久,绿豆属豆科植物,也是榆林地区的主要粮食作物。绿豆生育期短,抗逆性强,适应性强,可以在多种环境中栽培种植,具有非常高的经济价值。本文作者从种植栽培、田间管理、病虫害综合防治几方面对目前榆林地区食用绿豆高产栽培技术进行了归纳总结,为榆林地区食用绿豆产业发展及农业生产推广提供了理论依据和技术思路。

关键词：绿豆栽培技术病虫害防治榆林

不同覆膜栽培模式对绿豆主要农艺性状及产量的影响

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农业科技通讯 2023年第9期 79-82,91页

作者：王小英王斌王孟强羽竹李海录李振姣郭爱琴榆林市农业科学研究院陕西榆林719000

为探索适合榆林地区绿豆高产高效栽培技术,2021年和2022年连续2年就不同覆膜栽培模式对绿豆植物学性状、经济性状和产量的影响进行了研究。结果表明,从2年各性状平均值来看,不同覆膜栽培模式对绿豆株高、单株荚数和百粒重的影响达到了... 详细信息

为探索适合榆林地区绿豆高产高效栽培技术,2021年和2022年连续2年就不同覆膜栽培模式对绿豆植物学性状、经济性状和产量的影响进行了研究。结果表明,从2年各性状平均值来看,不同覆膜栽培模式对绿豆株高、单株荚数和百粒重的影响达到了差异显著水平,对主茎分枝数、主茎节数、荚长和单荚粒数的影响差异不显著。各覆膜处理产量较不覆膜处理产量增加0.44%~11.44%。在同种覆膜栽培模式下均是膜际栽培模式的绿豆产量大于膜上栽培模式的绿豆产量。膜际栽培比露地不覆膜栽培产量增加了5.94%~11.44%,比膜上栽培产量增加了0.83%~6.24%,膜际栽培增收效果明显。因此,建议今后膜际栽培模式可作为绿豆覆膜栽培的主要推广模式。

关键词：绿豆膜际栽培农艺性状产量

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财政支农投入、农村地理环境与财政支农效率

江西财经大学学报 2024年

作者：曾广录长沙大学经济与管理学院

当前，地方政府财政压力较大。如何节约财政资源和提升财政支农效率对于全面推进乡村振兴战略具有重要意义。为此，将农村地理环境因素纳入公共产品理论框架，探讨了财政支农投入与农村地理环境的耦合关系及其对财政支农效率的影响。并... 详细信息

当前，地方政府财政压力较大。如何节约财政资源和提升财政支农效率对于全面推进乡村振兴战略具有重要意义。为此，将农村地理环境因素纳入公共产品理论框架，探讨了财政支农投入与农村地理环境的耦合关系及其对财政支农效率的影响。并基于2011—2020年湖南省农村88个县（市）的面板数据进行了实证分析。结果发现：财政支农投入能够推动农业经济发展和农民收入增长；农村地理环境对农业经济发展和农民收入增长具有制约作用，从而影响财政支农效率的提高；财政支农投入与农村地理环境的耦合协调显著地提高了财政支农效率。因此，从强化农村地理环境意识、创新支农资金投入方式、加强支农资金管理三个方面提高财政支农效率。

关键词：财政支农投入农村地理环境财政支农效率公共产品耦合协调度