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浙江丽水发现德化脊蛇

动物学杂志 2024年

作者：黄汝怡杨典成吴军朱滨清黄松李晨虹黄山诺尔生物多样性研究所生态环境部南京环境科学研究所上海海洋大学水产与生命学院安徽师范大学生命科学学院安徽省生物资源保护与开发重点实验室

2021年10月8日和2022年5月18日，于浙江省丽水市龙泉市剑池街道石武村（119°09′38″E,28°04′59″N，海拔225 m）和兰巨乡炉岙村（119°12′25″E,27°55′25″N，海拔933 m）分别采到1条小型蛇类。这2号标本在形态上与德化脊蛇（Ach... 详细信息

2021年10月8日和2022年5月18日，于浙江省丽水市龙泉市剑池街道石武村（119°09′38″E,28°04′59″N，海拔225 m）和兰巨乡炉岙村（119°12′25″E,27°55′25″N，海拔933 m）分别采到1条小型蛇类。这2号标本在形态上与德化脊蛇（Achalinusdehuaensis）相近；在基于线粒体COI基因片段构建的脊蛇属系统发育树上，它们与德化脊蛇正模标本（采集号：YBU13013）高支持率（92%）聚为单系，与德化脊蛇正模标本间的未校正遗传距离为3.19%，小于脊蛇属物种间的未校正遗传距离（4.47%～23.34%）。因此，结合形态和分子数据，将其鉴定为是闪皮蛇科（Xenodermidae）脊蛇属的德化脊蛇，系浙江省爬行动物分布新记录种，标本现保存在安徽师范大学标本馆（馆藏号：ANU20230018和ANU20230019）。

关键词：德化脊蛇浙江省新记录线粒体COI基因系统发育分析未校正遗传距离

RNA测序观察低氧培养环境下卵巢癌细胞内管家基因表达的变化

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中国实验诊断学 2024年第6期28卷 727-731页

作者：李晶杜珍武李晨虹祝贺吉林大学第二医院妇产科吉林长春130041 吉林大学第二医院骨科研究所吉林长春130041

卵巢癌是危害女性健康的主要恶性肿瘤之一。阐明卵巢癌发生和进展的分子机制有助于提升卵巢癌诊断与治疗水平。明确卵巢癌细胞在不同病理与生理条件下差异基因表达模式是研究其分子机制重要途径。实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)是一种... 详细信息

卵巢癌是危害女性健康的主要恶性肿瘤之一。阐明卵巢癌发生和进展的分子机制有助于提升卵巢癌诊断与治疗水平。明确卵巢癌细胞在不同病理与生理条件下差异基因表达模式是研究其分子机制重要途径。实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)是一种快速有效的检测细胞内基因表达水平的技术^([1])。在基因表达分析中,需要控制不同样本之间总体转录活性差异的变量,使用内部控制(参考)基因是最常用的方法。

关键词：实时定量聚合酶链反应主要恶性肿瘤差异基因表达管家基因卵巢癌细胞女性健康生理条件基因表达分析

基于基因富集的鸟类线粒体基因组快速获取方法研究

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生物技术进展 2024年第4期14卷 618-630页

作者：邱冰滢陈雪瑶王辉李晨虹张东升上海海洋大学水产与生命学院上海201306

动物线粒体基因常常被作为系统发育研究、环境DNA、物种鉴定的分子标记,如COX1、12S rRNA等,而不同学者使用的位点各不相同,导致参考数据库难以统一,而使用完整的线粒体基因组序列作为参考,可以很好地解决这个问题。建立本地物种的线粒... 详细信息

动物线粒体基因常常被作为系统发育研究、环境DNA、物种鉴定的分子标记,如COX1、12S rRNA等,而不同学者使用的位点各不相同,导致参考数据库难以统一,而使用完整的线粒体基因组序列作为参考,可以很好地解决这个问题。建立本地物种的线粒体基因组数据库,对环境DNA研究尤为重要。根据鸟类线粒体基因组内10个保守位点开发了针对鸟类的线粒体基因组基因富集探针,利用该探针富集并组装、注释了17种共19只采集于上海地区的鸟类样本的线粒体基因组,在没有白腹鸫(Turdus pallidus)参考线粒体基因组的条件下组装获得了该物种的完整线粒体基因组。同时,针对白腹鸫样本“不富集,直接建库”和“先富集,后建库”两种方法的测序结果进行了对比,结果表明基因富集可以显著提高全基因组文库中线粒体DNA的占比;随后对两种方法的测序结果进行随机抽样,结果表明在约40000条序列(约0.012 G测序量)的极端情况下,富集后结果可达到约75%的覆盖度,而未富集的样本仅有约25%的覆盖度;在测序量约0.24 GB时,富集后的样本首次达到100%覆盖度。相对于传统使用引物逐段扩增获取线粒体基因组的方法,研究提出的RNA探针为获取鸟类线粒体基因组提供了更加高效、快捷的方法。

关键词：线粒体基因组鸟类基因富集

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林寿宁教授治疗便秘常用药对经验总结

广西中医药大学学报 2024年第4期27卷 42-45页

作者：谭钧月朱永苹李晨虹莫家懿徐晓庆陈耿顺广西中医药大学研究生院广西南宁530200 广西中医药大学附属瑞康医院广西南宁530011

林寿宁教授擅长治疗消化系统疾病,尤其是在药对的运用方面具有丰富的经验。林教授认为“脾虚肠燥”为便秘的基本病机,治疗应以健脾润肠为主,并注重脾胃与各脏腑之间的联系,强调宣肺润肠、通腑导滞、疏肝下气、清热凉肠、健脾助运、滋阴... 详细信息

林寿宁教授擅长治疗消化系统疾病,尤其是在药对的运用方面具有丰富的经验。林教授认为“脾虚肠燥”为便秘的基本病机,治疗应以健脾润肠为主,并注重脾胃与各脏腑之间的联系,强调宣肺润肠、通腑导滞、疏肝下气、清热凉肠、健脾助运、滋阴补血、补肾温阳等治法互相作用,临床中善用紫菀-杏仁、枳实-厚朴、佛手-枳壳、炒槐花-地骨皮、黄芪-生白术、玄参-麦冬、火麻仁-郁李仁、肉苁蓉-当归等药对治疗便秘,并注重针对不同年龄层患者的生理病理特点遣方组药,从而获得较好的临床疗效。

关键词：便秘林寿宁药对名医经验

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海南新沙塘鳢的繁殖和胚胎发育

湖南农业大学学报（自然科学版） 2024年第1期50卷 63-70页

作者：柯伟清刘至治钟英斌李晨虹刘志伟上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心上海201306 苏州大学苏州医学院基础医学与生物科学学院江苏苏州215123 江苏省泥鳅遗传与育种重点实验室江苏苏州215123 上海海洋大学环境DNA技术与水生态健康评估工程中心上海201306

为探究海南新沙塘鳢(Neodontobutishainanens)繁殖和胚胎发育的特性,观察并记录10对人工繁育的海南新沙塘鳢的繁殖周期,采用显微镜观察其胚胎发育过程及其形态变化。结果显示:在28℃水温下,人工繁育的海南新沙塘鳢约6月龄时达到性成熟,... 详细信息

为探究海南新沙塘鳢(Neodontobutishainanens)繁殖和胚胎发育的特性,观察并记录10对人工繁育的海南新沙塘鳢的繁殖周期,采用显微镜观察其胚胎发育过程及其形态变化。结果显示:在28℃水温下,人工繁育的海南新沙塘鳢约6月龄时达到性成熟,能够连续多次产卵,繁殖周期约5~9d;在交配前后1d的时间里,雄性海南新沙塘鳢出现体色(特别是鳃部)变黑的现象;海南新沙塘鳢受精卵呈椭圆形,其一端具黏性附着细丝;在(20±2)℃水温下,其胚胎发育历时约157 h,可分为受精卵、卵裂期、囊胚期、原肠期、神经胚期、器官形成期、肌肉效应期和孵化出膜期8个时期,分别历时50 min、4 h 30 min、6 h 40 min、5 h、2 h、16 h、110 h、12 h;在胚胎发育过程中,其卵黄囊上始终出现油球。海南新沙塘鳢的繁殖和胚胎发育特征与其他塘鳢科鱼类相似,但在器官发育时序上存在差异。

关键词：海南新沙塘鳢胚胎发育沙塘鳢科

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环境DNA技术与传统捕捞揭示崇明岛内河鱼类多样性

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上海海洋大学学报 2022年第6期31卷 1434-1444页

作者：凌岚馨范共胡云黄俊满李晨虹上海海洋大学环境DNA技术与水生态健康评估工程中心上海201306 上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室上海201306

崇明岛位于长江入海口,其内河网密布,鱼类资源众多,但违规捕捞现象屡禁不止,严重影响崇明岛鱼类资源。鱼类多样性是水生态环境保护的一个重要指标,为评估上海崇明岛内鱼类资源、揭示鱼类多样性,于2020年6月至2021年5月在崇明岛内河设置2... 详细信息

崇明岛位于长江入海口,其内河网密布,鱼类资源众多,但违规捕捞现象屡禁不止,严重影响崇明岛鱼类资源。鱼类多样性是水生态环境保护的一个重要指标,为评估上海崇明岛内鱼类资源、揭示鱼类多样性,于2020年6月至2021年5月在崇明岛内河设置24个采样位点,利用环境DNA(eDNA)技术与传统捕捞手段,每个季度进行了1次共4次采样调查。调查共检出13个目级阶元的78种鱼类,其中鲤形目最多,约占44%。基于捕获鱼类样本计算的全年香农-威纳多样性指数为2.08,基于eDNA数据计算的全年香农-威纳样性指数值为2.96,表明崇明岛具有较丰富的鱼类多样性。两种方法检测出共同的优势种为鳊(Parabramis pekinensis)、似鳊(Pseudobrama simoni)、麦穗鱼(Pseudorasbora parva)、子陵吻虾虎鱼(Rhinogobius giurinus)、大鳍(Acheilognathus macropterus),表明崇明岛内河鱼类群落结构由淡水鱼类主导。主坐标分析和PERMANOVA检验结果显示东-西部群落鱼类组成存在差异(R2=0.101 2,P=0.027 6)。研究结果亦表明eDNA技术可以作为传统鱼类资源调查的一个重要辅助手段。本研究为崇明岛内河鱼类资源现存状况、合理利用及保护提供了基础资料。

关键词： eDNA 崇明岛生态调查生物多样性

基于RPA-LFD技术快速鉴别大西洋鳕鱼的研究

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食品与发酵工业 2022年

作者：王慧芳喻勇新李晨虹陈文隽凌岚馨周颖上海海洋大学食品学院农业农村部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室上海海洋大学环境DNA技术与水生态健康评估工程中心上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室

该研究建立了重组酶聚合酶扩增反应(recombinase polymerase amplification，RPA)结合侧流层析试纸条技术(RPA-lateral flow dipstick，RPA-LFD)快速鉴别大西洋鳕鱼制品真伪的方法。对比大西洋鳕和常用来冒充鳕鱼的鱼类线粒体基因组序...

该研究建立了重组酶聚合酶扩增反应(recombinase polymerase amplification，RPA)结合侧流层析试纸条技术(RPA-lateral flow dipstick，RPA-LFD)快速鉴别大西洋鳕鱼制品真伪的方法。对比大西洋鳕和常用来冒充鳕鱼的鱼类线粒体基因组序列，设计针对大西洋鳕的特异性探针和引物，建立针对大西洋鳕鱼的RPA-LFD检测方法。实验内容重点包括，筛选最佳引物和探针并评估其特异性，优化反应温度、时间和现场检测条件，并对20份市售“大西洋鳕鱼”及常见的冒充鳕鱼的鱼类制品进行现场检测，评估检测效果。实验结果表明，RPA-LFD检测方法特异性强，在44 ℃、14 min条件下的检测效果最好。在现场开展快速检测，效果良好，20份鳕鱼制品检测结果经过基因测序证实和产品真实成分一致。该研究建立的大西洋鳕鱼RPA-LFD检测方法特异性强、反应耗时短、操作简便、结果可视，有良好的现场快速检测应用前景，为大西洋鳕鱼制品现场快速检测提供了新思路，为水产品市场监管提供了技术支持。

关键词：

环境DNA技术在水生生物监测中的挑战、突破和发展前景

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上海海洋大学学报 2023年第3期32卷 564-574页

作者：李晨虹凌岚馨谭娟林晓龙王辉孙冰皎李曌上海海洋大学环境DNA技术与水生态健康评估工程中心上海201306 上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室上海201306 上海市环境科学研究院上海200233 中国环境监测总站北京100102

近年来,人类活动影响导致水生态系统平衡遭到破坏,水生生物多样性锐减,水生态健康状况堪忧。快速、有效地监测水生生物是评价水生态健康,科学开展水生态环境保护和管理的前提。环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术是一种运用分子生物... 详细信息

近年来,人类活动影响导致水生态系统平衡遭到破坏,水生生物多样性锐减,水生态健康状况堪忧。快速、有效地监测水生生物是评价水生态健康,科学开展水生态环境保护和管理的前提。环境DNA(environmental DNA,eDNA)技术是一种运用分子生物学方法,从环境样品中提取DNA并进行测序和分析来反映物种信息的技术。由于该技术只需采集环境样品(水、土壤、沉积物等)便能获得大量物种信息,具有非入侵性、灵敏性及低成本等特点,近年来备受关注。但是,已有的研究实践表明,目前eDNA技术仍然面临一些挑战,阻碍了其常态化、业务化应用。从生物多样性调查、入侵和濒危物种监测、食性研究等方面列举了eDNA技术在水生生物监测中的应用实例,并总结目前eDNA技术在采样效率、假阳性和假阴性、来源不确定性、数据库缺失和定量结果不准确等5个方面所面临的问题和挑战;进一步探讨研究者针对这些问题所提出的相应解决方案和技术突破。最后,对eDNA技术未来的发展前景进行了展望,以期为研究人员使用eDNA技术提供启发。

关键词： eDNA技术应用挑战突破展望

重组酶聚合酶扩增反应结合侧流层析试纸条技术快速鉴别大西洋鳕鱼制品真伪

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食品与发酵工业 2022年第17期48卷 291-297页

作者：王慧芳喻勇新李晨虹陈文隽凌岚馨周颖上海海洋大学食品学院上海201306 农业农村部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室上海201306 上海海洋大学环境DNA技术与水生态健康评估工程中心上海201306 上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室上海201306

建立了重组酶聚合酶扩增反应(recombinase polymerase amplification,RPA)结合侧流层析试纸条技术(RPA-lateral flow dipstick,RPA-LFD)快速鉴别大西洋鳕鱼制品真伪的方法。对比大西洋鳕鱼和常用来冒充鳕鱼的鱼类线粒体基因组序列,设计... 详细信息

建立了重组酶聚合酶扩增反应(recombinase polymerase amplification,RPA)结合侧流层析试纸条技术(RPA-lateral flow dipstick,RPA-LFD)快速鉴别大西洋鳕鱼制品真伪的方法。对比大西洋鳕鱼和常用来冒充鳕鱼的鱼类线粒体基因组序列,设计针对大西洋鳕鱼的特异性探针和引物,建立针对大西洋鳕鱼的RPA-LFD检测方法。该实验筛选最佳引物和探针并评估其特异性,优化反应温度、时间和现场检测条件,并对20份市售“大西洋鳕鱼”及常见的冒充鳕鱼的鱼类制品进行现场检测,评估检测效果。实验结果表明,RPA-LFD检测方法特异性强,在44℃、14 min条件下的检测效果最好。在现场开展快速检测,效果良好,20份鳕鱼制品检测结果经过基因测序证实和产品真实成分一致。该研究建立的大西洋鳕鱼RPA-LFD检测方法特异性强、反应耗时短、操作简便、结果可视,有良好的现场快速检测应用前景,为大西洋鳕鱼制品现场快速检测提供了新思路,为水产品市场监管提供了技术支持。

关键词：大西洋鳕鱼重组酶聚合酶扩增反应真伪侧流层析试纸条技术现场快速检测