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赖氨酰氧化酶LOXL2稳定性的理论计算研究

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第5期40卷 685-695页

作者：林李锐林凯邹海鹰许丽艳李恩民东庚汕头大学医学院生物化学与分子生物学教研室广东汕头515041 汕头大学医学院生物信息学教研室广东汕头515041 汕头大学医学院医学信息学研究中心广东汕头515041 汕头大学医学院广东省沿海高发地区分子生物学重点实验室广东汕头515041 汕头大学医学院肿瘤研究中心广东汕头515041 汕头市医学科学院广东汕头515041

赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾... 详细信息

赖氨酰氧化酶LOXL2是一种依赖于铜离子的胺氧化酶,催化胶原蛋白和弹性蛋白的赖氨酸残基侧链发生氧化脱氨,发挥着稳固细胞外基质的作用。而稳定性是蛋白质的一个重要特性,直接影响蛋白质的分子动态及其正常功能发挥,这与人类的健康和疾病密切相关。然而,关于LOXL2的稳定性目前鲜有报道,哪些位点对其稳定性有显著影响尚不清楚。本研究采用冷冻电镜和Alphafold2的数据,建立LOXL2的全长结构,通过分子动力学模拟得到其优化构象。再通过4种方法(mCSM,PremPS,DeepDDG和FoldX),计算所有位点的稳定性属性,筛选出对稳定性有显性影响的位点(定义为关键位点)。结果表明,95个关键位点对LOXL2的稳定性具有显著影响,在5个结构域上的分布数量依次为14、13、8、11和26,而结构域间的连接肽段上也有23个关键位点。在这些关键位点中,类型及数量分别为Leu(24个)、Val(20个)、Ile(12个)、Trp(11个)、Phe(11个)、Tyr(6个)、Cys(6个)、Met(4个)和Arg(1个)。其中大部分关键位点(88个)为疏水性质,这与蛋白质折叠的主要力量为疏水作用的情况是一致的,而Cys两两成对,构成二硫键,对LOXL2的结构及功能发挥重要作用。讨论中,我们将预测结果与实验值进行比较,并用自由能微扰方法,对部分关键位点进行比较,从多方面论证此项工作的可信度。此项研究,可为靶向LOXL2的疾病治疗研究,提供重要指导。

关键词：赖氨酰氧化酶样2 稳定性分子动力学模拟计算预测吉布斯自由能

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从利益平衡角度论个人信息泄露的潜在风险

中南财经政法大学研究生论丛 2022年第1期 113-121页

作者：李恩民厦门大学知识产权研究院福建厦门361001

在大数据时代,个人信息一旦泄露将面临巨大的潜在风险。然而,目前《个人信息保护法》并未明确个人信息泄露但尚未发生损害时应当如何处理。目前学界的讨论多集中于是否突破侵权行为的构成要件,而对于这类潜在风险背后的利益格局探讨较... 详细信息

在大数据时代,个人信息一旦泄露将面临巨大的潜在风险。然而,目前《个人信息保护法》并未明确个人信息泄露但尚未发生损害时应当如何处理。目前学界的讨论多集中于是否突破侵权行为的构成要件,而对于这类潜在风险背后的利益格局探讨较少。潜在风险是否需要救济、如何救济,应当从平衡个人信息的保护和利用的角度出发,探究在发生潜在风险时不同主体的利益状况,在现行立法的基础上,选择最能实现利益平衡的方案。在考虑个人和信息业者利益的基础上,对风险的救济应当局限于预防费用的支出、精神损害的赔偿,并且不应当将救济潜在风险作为免除信息业者在风险现实化时的赔偿责任的理由。

关键词：个人信息保护侵权损害赔偿

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戊戌维新运动中倡导科学技术的活动

南开学报（哲学社会科学版） 1990年第6期 44-52页

作者：李恩民

以1898年的政治改革为标志的整个要求变法时期（1895--1903），维新志士们同时也在倡导研习与推广近代科学技术。这里指的维新志士，除政治活动家外，同时也包括一切具有革新与进步思想的知识分子。

关键词：戊戌维新运动近代科学技术政治活动家政治改革知识分子进步思想志士变法

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中国科技七十年

历史教学（下半月） 1991年第8期 7-14页

作者：李恩民南开大学历史系讲师、在职博士生

科学技术作为生产力,既是推动历史前进的强大动力,又是衡量人类社会文明与进步程度的一个重要标尺。自本世纪20年代以来,中国社会的各个层面都发生了前所未有的巨变,科学技术亦然。探讨了七十年来中国科学技术的发展历程,将有助于中国... 详细信息

科学技术作为生产力,既是推动历史前进的强大动力,又是衡量人类社会文明与进步程度的一个重要标尺。自本世纪20年代以来,中国社会的各个层面都发生了前所未有的巨变,科学技术亦然。探讨了七十年来中国科学技术的发展历程,将有助于中国现代科学文化史的研究,对人们正确理解科学与社会的关系,也有某种启迪。一中国科技界出现了新气象(1921—1937)

关键词：十年现代科学文化人类社会原子能技术科研机构中华自然科学社世界科学奖励条例赵忠尧编缉

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戊戌时期的科技近代化趋势

历史研究 1990年第6期 123-135页

作者：李恩民南开大学

科技近代化,即建立完整的近代科学技术体系。这是人类社会文明与进步的一个重要内容,是整个社会近代化的一个标尺。中国的科技近代化,经历了与西方资本主义国家不同的发展历程,它首先是引进西方先进国家的近代科技成果。

关键词：戊戌时期近代化趋势洋务时期自然科学重要内容逻辑方法引进科学研究近代科学科技成果

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戊戌时期科学书籍的编译及其特点

中州学刊 1989年第6期 106-109页

作者：李恩民南开大学历史系

戊戌变法是资产阶级维新派为挽祖国于沉沦而发动的一场政治改革运动。维新志士最迫切的政治愿望就是兴民权、设议院,实行君主立宪。然而,严酷的社会现实又使他们不得不承认,国势之振兴,民权之发扬,必“自大开民智始”。因为“民智不开,... 详细信息

戊戌变法是资产阶级维新派为挽祖国于沉沦而发动的一场政治改革运动。维新志士最迫切的政治愿望就是兴民权、设议院,实行君主立宪。然而,严酷的社会现实又使他们不得不承认,国势之振兴,民权之发扬,必“自大开民智始”。因为“民智不开,遽用民权,则举国聋瞽,守旧愈甚,取乱之道也。”这样,开启千百万黎民百姓的智慧就成为变法维新、立宪救国的当务之急,而在维新派看来,能够担当这一历史重任的只有近代科学。科学能够“将世界之迷梦打破”,结束人类“为神异所愚”和“为君主所屈”的历史,“科学之力日盛,则迷信之力日衰”。

关键词：译书局戊戌时期科学书籍算学梁启超维新派西书康有为西学《时务报》

惩治伪劣商品犯罪《决定》第三条第一款的适用——兼与王名湖同志商榷

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法学 1995年第5期 26-28页

作者：李恩民新疆生产建设兵团人民检察院农八师分院

全国人大常委会《关于惩治生产、销售伪劣商品犯罪的决定》(以下称《决定》)第3条第1款规定:“生产、销售不符合卫生标准的食品,造成严重食物中毒事故或者其他严重食源性疾患,对人体健康造成严重危害的,处7年以下有期徒刑,并处罚金;后... 详细信息

全国人大常委会《关于惩治生产、销售伪劣商品犯罪的决定》(以下称《决定》)第3条第1款规定:“生产、销售不符合卫生标准的食品,造成严重食物中毒事故或者其他严重食源性疾患,对人体健康造成严重危害的,处7年以下有期徒刑,并处罚金;后果特别严重的,处7年以上有期徒刑或者无期徒刑,并处罚金或者没收财产。”目前,在司法实践中对于该规定的理解不尽一致,而且影响到对该类犯罪案件的处理。

关键词：销售不符合卫生标准的食品罪销售伪劣商品犯罪的决定》《决定》伪劣食品销售伪劣产品罪假冒注册商标食物中毒事故食源性疾患人体健康犯罪的同类客体