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基于活性和亲和性的泛素探针的发展与合成

生物化学与生物物理进展 2024年第3期51卷 598-623页

作者：许玲魏翠娜鲁显福李宜明安徽医科大学第一附属医院合肥230022 合肥工业大学食品与生物工程学院农产品生物化工教育部工程中心合肥230009

泛素(ubiquitin,Ub)作为一种重要的翻译后修饰,参与调控细胞内几乎所有的生命活动。泛素化通常由E1s、E2s、E3s以及去泛素化酶(deubiquitinating enzyme,DUBs)相互协调完成,并在底物蛋白上形成不同链长、不同连接类型的泛素链。这些泛... 详细信息

泛素(ubiquitin,Ub)作为一种重要的翻译后修饰,参与调控细胞内几乎所有的生命活动。泛素化通常由E1s、E2s、E3s以及去泛素化酶(deubiquitinating enzyme,DUBs)相互协调完成,并在底物蛋白上形成不同链长、不同连接类型的泛素链。这些泛素链可以产生多样的拓扑结构,被含有泛素结合域(Ub binding domain,UBD)的不同识别蛋白结合,进而传递不同的信号。泛素化过程或者识别蛋白的读取一旦发生错误,对细胞来说都可能是灾难性的。为深入了解泛素相关的生理机制,多种泛素探针被设计与合成,用于对目标蛋白酶或识别蛋白进行标记和监测。本综述总结了当前的泛素探针(包括基于活性和基于亲和性的探针)的最新发展,并详细阐述了它们的合成策略。进一步介绍了细胞穿梭型泛素探针在活细胞内的最新应用。

关键词：泛素活性亲和性探针化学合成

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基于无线通讯的电压源远程校准系统研究

基于无线通讯的电压源远程校准系统研究

作者：李宜明河北大学

学位级别：硕士

计量是关于测量及其应用的科学,是实现单位统一,保证量值准确可靠的活动。通过计量校准活动来实现计量仪器的量值传递与溯源。目前对于计量仪器的校准方式大多数都是利用实验室校准的方式,该方式周期长效率低,而且实验室离线校准的方式... 详细信息

计量是关于测量及其应用的科学,是实现单位统一,保证量值准确可靠的活动。通过计量校准活动来实现计量仪器的量值传递与溯源。目前对于计量仪器的校准方式大多数都是利用实验室校准的方式,该方式周期长效率低,而且实验室离线校准的方式只能得到计量仪器的基本误差,无法得到计量仪器在现场应用条件下使用时所产生的附加误差。随着远程校准系统的开发成为了近年来的研究热点,学者们发现远程校准系统能够建立起远程量值传递与溯源的传递链,通过远程校准所建立的远程量值传递与溯源系统,不仅仅解决了附加误差无法被测得的问题,保证了校准数据采集的准确可靠,还能提高校准效率,为仪器的智能应用奠定基础。本文在目前计量仪器量值传递与溯源的研究基础上,针对直流电压源传统校准方式效率较低、附加误差难以测量和受操作人员技术水平影响较大等问题,结合无线通讯技术,提出了一种基于无线通讯的电压源远程校准系统,以完成对直流电压(1.0-3.0)V的远程校准活动。通过对多功能标准源校准规范和非实物基准(时间与频率)标准远程校准规范的分析,结合传统直流电压源实际校准方法,提出基于无线通讯的电压源远程校准系统整体方案。其次,针对系统的校准方案、硬件、上位机和算法四个部分进行详细设计。之后基于设计的电压值采集模块将直流电压源输出的电压信号进行准确的采集,通过校准实验,对校准数据进行详细的分析,并与传统电压源校准系统进行了对比。本文主要创新成果如下:(1)提出了基于无线通讯的电压源远程校准方法。本课题研究在充分调研总结现有的量值传递与溯源实现方式的基础上,针对目前直流电压源校准效率偏低和附加误差无法测量等问题,提出了基于无线通讯进行电压量值远程校准的新思路,并给出了基于传统电压值校准方法中的标准源法的电压源远程校准总体实施方案及系统具体结构等,在工程上该电压源远程校准系统能等效替代传统标准源法完成直流电压源(1.0-3.0)V的远程校准活动。(2)设计了基于无线通讯的电压源远程校准装置。设计了高精度电压值采集模块,将标准电压源和待检电压源输出的直流电压量进行准确的采集,通过无线通讯的方式将现场数据回传至校准实验室;开发了远程校准系统应用软件,利用Qt开发平台在上位机开发的优越性,结合数据处理算法,对校准系统应用软件部分进行了模块化设计,明确了校准流程,设计了实时采集界面和校准系统工作界面等,实现了将远程校准活动的流程变得可控。(3)构建了基于无线通讯的电压源远程校准模型。通过分析传统标准源法和基于无线通讯的电压源远程校准系统量值传递链的关系,构建了电压源远程校准模型,又基于该模型进行了远程校准实验,通过不确定度分析并与传统标准源法进行对比,验证了本课题研究所构建的模型的准确性,表明了该远程校准系统能够达到实验室校准的效果。

关键词：计量学无线通讯远程校准直流电压源不确定度

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基于活性和亲和性泛素探针的最新发展与合成

生物化学与生物物理进展 2023年

作者：许玲魏翠娜鲁显福李宜明安徽医科大学第一附属医院合肥工业大学食品与生物工程学院农产品生物化工教育部工程中心

泛素 (Ubiquitin，Ub) 作为一种重要的翻译后修饰，参与调控细胞内几乎所有的生命活动。泛素化通常由E1s、E2s、E3s以及去泛素化酶（Deubiquitinating enzyme，DUBs）相互协调完成，并在底物蛋白上形成不同链长、不同连接类型的泛素链... 详细信息

泛素 (Ubiquitin，Ub) 作为一种重要的翻译后修饰，参与调控细胞内几乎所有的生命活动。泛素化通常由E1s、E2s、E3s以及去泛素化酶（Deubiquitinating enzyme，DUBs）相互协调完成，并在底物蛋白上形成不同链长、不同连接类型的泛素链。这些泛素链可以产生多样的拓扑结构，被含有泛素结合域 (Ub binding domain，UBD)的不同的识别蛋白结合，进而传递不同的信号。泛素化过程或者识别蛋白的读取一旦发生错误，对细胞来说都可能是灾难性的。为深入了解泛素相关的生理机制，多种泛素探针被设计与合成，用于对目标蛋白酶或识别蛋白进行标记和监测。在本综述中，我们总结了当前的泛素探针包括基于活性和基于亲和性的探针的最新发展，并详细阐述了它们的合成策略。进一步，我们介绍了细胞穿梭型泛素探针在活细胞内的最新应用。

关键词：泛素活性亲核性探针化学合成

基于共视法的电压源远程校准方法及一致性评价研究

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仪器仪表学报 2023年第8期44卷 308-318页

作者：方立德段思涵唐佐李宜明梁玉娇河北大学大学质量技术监督学院保定071002 计量仪器与系统国家地方联合工程研究中心保定071000 河北省能源计量与安全检测技术重点实验室保定071000

本文针对传统电压源校准方法存在的问题,提出了一种基于卫星共视法的电压源远程校准方法,该方法以非实物标准传递为基础,实现将标准器置于实验室而无需传递至现场进行远程校准,可解决引入附加误差的问题,通过设计基于共视法的电压源远... 详细信息

本文针对传统电压源校准方法存在的问题,提出了一种基于卫星共视法的电压源远程校准方法,该方法以非实物标准传递为基础,实现将标准器置于实验室而无需传递至现场进行远程校准,可解决引入附加误差的问题,通过设计基于共视法的电压源远程校准系统,建立校准模型,根据共视原理,实现标准端和被校端电压值远程比对,完成校准。本文对远程校准方法和传统校准方法在直流0~1 V校准点校准结果进行了对比,结果显示两种方法的校准结果差距在5.2×10^(-5)V以内。本文给出了两种方法在直流1 V校准点的不确定度评定过程,并通过传递比较法对两种方法的校准结果进行了一致性评价,结果表明,远程法在1 V校准点的扩展不确定度为9.18244×10^(-5)V(k=2),且校准结果与传统法具有一致性。

关键词：计量学共视法远程校准一致性评价不确定度

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生物模拟转氨反应在蛋白质修饰中的应用

有机化学 2013年第9期33卷 1874-1883页

作者：王志鹏李娟李宜明清华大学化学系北京100084 合肥工业大学医学工程学院合肥230009

作为化学生物学研究的重要方向,生物正交反应的发展与应用为生命科学研究提供了有力武器.利用生物正交反应,人们可以将合成分子与目标天然大分子在特定位点上实现特异性连接,进而达成诸如标记、定位、功能化、固定等一系列目标.生物模... 详细信息

作为化学生物学研究的重要方向,生物正交反应的发展与应用为生命科学研究提供了有力武器.利用生物正交反应,人们可以将合成分子与目标天然大分子在特定位点上实现特异性连接,进而达成诸如标记、定位、功能化、固定等一系列目标.生物模拟转氨反应及其衍生反应是一类特异性蛋白质N端修饰的生物正交反应,与天然蛋白侧链、C端的连接反应相互补充.由于该反应具有高效性、通用性、温和性及不需要引入突变或非天然氨基酸等优点,从发现以来已较为广泛地运用于蛋白质化学生物学的多个相关领域.在介绍其基本原理及反应优化的基础上,综述该类反应的发展及应用情况.

关键词：生物模拟转氨反应磷酸吡哆醛生物正交反应蛋白质N末端修饰

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山东省林业发展中林业技术创新路径分析

中文科技期刊数据库（全文版）农业科学 2022年第9期 47-49页

作者：顾凤春李宜明日照市林业科学研究院山东日照276800 日照市国有大沙洼林场山东日照276800

论述了林业发展中林业技术创新在优化林业产业结构、推动可持续发展、降低成本提高产量方面的重要性;对山东省林业产业发展存在的问题进行了分析,提出提高林业技术创新发展的策略,包括:加强林业技术创新队伍的建设、引进林业技术创新人... 详细信息

论述了林业发展中林业技术创新在优化林业产业结构、推动可持续发展、降低成本提高产量方面的重要性;对山东省林业产业发展存在的问题进行了分析,提出提高林业技术创新发展的策略,包括:加强林业技术创新队伍的建设、引进林业技术创新人才、积极引领林业市场发展走向、利用城市废旧木材等资源、加大科技投入与财政支持等措施。

关键词：林业发展林业技术创新路径

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多肽酰肼法合成翻译后修饰物蛋白NEDD8

有机化学 2016年第11期36卷 2763-2768页

作者：管超建王涛王君李宜明合肥工业大学生物与医学工程学院合肥230009

NEDD8(神经前体细胞表达发育下调蛋白8)是真核生物体内一种重要的类泛素化蛋白,参与调控细胞内一系列重要的生命过程.目前获得NEDD8的主要方法是生物重组表达,该策略的缺点在于表达量不高且需要除去外加纯化标签的步骤.本研究结合高温... 详细信息

NEDD8(神经前体细胞表达发育下调蛋白8)是真核生物体内一种重要的类泛素化蛋白,参与调控细胞内一系列重要的生命过程.目前获得NEDD8的主要方法是生物重组表达,该策略的缺点在于表达量不高且需要除去外加纯化标签的步骤.本研究结合高温辅助固相合成技术与基于多肽酰肼连接的一锅连接-脱硫策略,较为高效地获得了均一性的NEDD8蛋白,为进一步研究NEDD8修饰蛋白的结构与功能提供了基础.

关键词： NEDD8 高温辅助固相合成多肽酰肼连接一锅连接脱硫

转肽酶Sortase A在蛋白质修饰中的应用

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化学进展 2014年第10期26卷 1741-1751页

作者：谭祥龙许玲石景李宜明合肥工业大学医学工程学院合肥230009 中国药科大学生命科学与技术学院南京211198 中国科学技术大学化学系合肥230026

近年来,发展蛋白质与多肽的化学选择性连接与修饰方法已成为化学生物学的研究热点。这类方法可以在很大程度上弥补基因工程技术无法制备翻译后修饰蛋白与人工改造蛋白的缺陷,得到目前无法通过生物表达的功能蛋白。20世纪90年代末,人们... 详细信息

近年来,发展蛋白质与多肽的化学选择性连接与修饰方法已成为化学生物学的研究热点。这类方法可以在很大程度上弥补基因工程技术无法制备翻译后修饰蛋白与人工改造蛋白的缺陷,得到目前无法通过生物表达的功能蛋白。20世纪90年代末,人们从金黄色葡萄球菌中分离得到转肽酶Sortase A,它能够选择性识别特异性多肽序列LPXTG,并在特定位点切断氨基酸的肽键进而将其与一个新的肽链连接。该特性使Sortase A有望成为一种高效、通用的蛋白质修饰的工具。与传统的化学合成相比,Sortase催化的化学半合成方法,可以较好的解决化学合成蛋白的尺寸问题。本文就近年来Sortase A在蛋白质修饰及合成中的研究进展进行简要综述。

关键词：转肽酶Sortase A 生物正交反应转肽反应特异性蛋白质修饰

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K33位乙酰化修饰SUMO蛋白的化学合成

高等学校化学学报 2016年第11期37卷 1987-1992页

作者：王业海孔一夫陈晨晨李宜明合肥工业大学生物与医学工程学院合肥230009 中国科学院强磁场科学中心合肥230031

采用高温辅助固相合成技术及基于多肽酰肼的自然化学连接技术,高效获得了小泛素相关修饰物(SUMO)蛋白及33位赖氨酸(K33)乙酰化SUMO蛋白.聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和圆二色光谱分析结果表明,与生物表达蛋白相比,化学合成蛋白具有较... 详细信息

采用高温辅助固相合成技术及基于多肽酰肼的自然化学连接技术,高效获得了小泛素相关修饰物(SUMO)蛋白及33位赖氨酸(K33)乙酰化SUMO蛋白.聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和圆二色光谱分析结果表明,与生物表达蛋白相比,化学合成蛋白具有较好的纯度和类似的二级结构.

关键词：小泛素相关修饰物乙酰化高温辅助固相合成多肽酰肼自然化学连接