检索结果-南通市图书馆

中国油脂 1994年第6期19卷 35-37页

作者：曹赞高鹏郝福云王希仁辽宁省铁岭市银州区植物油厂辽宁省铁岭市制米厂

本文主要叙述了浸出油厂容易被人们忽视的保温蒸汽管道自燃起火问题，对起火原因进行分析和探讨，并提出了相应的预防措施，以提高广大职工的防火、防爆认识，保证浸出油厂的安全生产。

关键词：浸出油厂保温蒸汽管道起火预防措施

美国土壤污染修复立法中的公民诉讼条款及其启示

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

华东理工大学学报（社会科学版） 2018年第3期33卷 87-97页

作者：翁孙哲曹赞刚浙江警察学院法律系浙江杭州310053

《超级基金法》是美国关于土壤污染修复的专门性立法,该法规定,在土壤污染的修复过程中,除非特殊情况,是禁止公民诉讼的,其目的是为了及时修复环境损害,保护公众健康和安全,但是绝对禁止诉讼,也可能造成土壤污染修复的延误,导致修复资... 详细信息

《超级基金法》是美国关于土壤污染修复的专门性立法,该法规定,在土壤污染的修复过程中,除非特殊情况,是禁止公民诉讼的,其目的是为了及时修复环境损害,保护公众健康和安全,但是绝对禁止诉讼,也可能造成土壤污染修复的延误,导致修复资金增加,从而加重了责任人的负担。因此,是否应允许在土壤污染修复过程中的公民诉讼,需要利益平衡。立法应明确载明修复过程中允许公民诉讼的情形以及原告提起诉讼时应承担的义务。

关键词：土壤污染公民诉讼利益平衡司法审查

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

细胞穿膜肽的穿膜活性与序列特征的关系

生物化学与生物物理进展 2016年第1期43卷 75-82页

作者：曹赞霞董川赵立岭王吉华德州学院山东省生物物理重点实验室德州253023 德州学院物理与电子信息学院德州253023 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心成都610054

细胞穿膜肽(cell penetrating peptides,CPPs)是一种小分子多肽,能够容易地穿过细胞膜.这类分子,尤其是具有靶向功能的CPPs为高效率投送药物到靶细胞带来希望.因此,对其展开研究对于生物医学有着一定的意义.本工作主要从序列水平对具有... 详细信息

细胞穿膜肽(cell penetrating peptides,CPPs)是一种小分子多肽,能够容易地穿过细胞膜.这类分子,尤其是具有靶向功能的CPPs为高效率投送药物到靶细胞带来希望.因此,对其展开研究对于生物医学有着一定的意义.本工作主要从序列水平对具有不同穿膜活性的CPPs进行研究,试图找出影响CPPs穿膜活性的因素,以及不同活性CPPs与非穿膜肽(Non CPPs)序列上的差异,并引入一种分析生物序列的方法.我们基于CPPsite数据库和不同的文献获取CPPs和Non CPPs序列,并进一步从CPPs序列中提取具有高、中、低穿膜活性的穿膜肽(HCPPs、MCPPs、LCPPs)用于构建数据集.基于这些数据集,开展了以下研究:首先,利用方差分析的方法,对不同活性的CPPs以及Non CPPs的氨基酸及二级结构组成进行分析,发现氨基酸的静电与疏水相互作用对CPPs的穿膜活性起到了重要影响,同时螺旋结构和无规卷曲也会影响CPPs的穿膜活性;其次,使用理化性质与长度将不同活性的CPPs展示在二维平面上,发现在某些特殊的性质下不同活性的CPPs与Non CPPs可以产生聚簇现象,HCPPs、MCPPs以及LCPPs和Non CPPs被分成了三簇,这种现象显示了它们之间的差异;最后,本文引入了生物序列理化质心的概念,将组成序列的残基看作质点,进而把序列抽象成质点系进行研究,并将此方法应用到CPPs的分析中,通过PCA方法将不同活性的CPPs投射到三维平面上,结果发现绝大部分CPPs聚在一起,部分LCPPs与Non CPPs聚在一起.此工作对于CPPs的设计,以及理解不同活性CPPs序列上的差异具有一定的意义.另外,本文引入的生物序列理化质心的分析方法也可以用于其他生物问题的分析,同时它们可以作为某些生物分类问题的输入参数,在模式识别中起到一定的作用.

关键词：细胞穿膜肽(CPPs) 穿膜活性序列差异理化质心

分子动力学模拟Cu2＋对α-突触核蛋白(1-17)肽段构象变化的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

物理化学学报 2012年第2期28卷 479-488页

作者：曹剑曹赞霞赵立岭王吉华德州学院山东省功能大分子生物物理重点实验室山东德州253023 山东师范大学物理与电子科学学院济南250014

利用分子动力学模拟研究铜离子(Cu2+)对α-突触核蛋白1-17号氨基酸肽段(α-synuclein(1-17))构象变化的影响,采用GROMOS 43A1力场对Cu2+-α-synuclein(1-17)复合体和α-synuclein(1-17)肽段单体分别进行了6组独立的分子动力学模拟,每组... 详细信息

利用分子动力学模拟研究铜离子(Cu2+)对α-突触核蛋白1-17号氨基酸肽段(α-synuclein(1-17))构象变化的影响,采用GROMOS 43A1力场对Cu2+-α-synuclein(1-17)复合体和α-synuclein(1-17)肽段单体分别进行了6组独立的分子动力学模拟,每组模拟时间为500ns,总模拟时间为3μs.研究结果表明:Cu2+与α-synuclein(1-17)肽段结合使其更易向β折叠片结构折叠,促进了其二级结构的形成,增强了构象的稳定性;Cu2+增大了α-synuclein肽段疏水残基的溶剂可及表面积,增强了其疏水残基的暴露程度.自由能分析指出,Cu2+-α-synuclein(1-17)复合体的自由能比α-synuclein(1-17)肽段低,构象稳定,采样空间紧密,其自由能极小构象为β折叠片结构.构象聚类分析进一步表明,Cu2+使得α-synuclein(1-17)肽段构象趋于稳定.总之,Cu2+诱导固有无序蛋白α-synuclein(1-17)肽段由无序向有序转变,降低了构象的自由能,同时Cu2+增强了α-synuclein(1-17)肽段的疏水性,使得α-synuclein肽段因疏水作用更倾向于形成β折叠片结构,加速其疏水性聚集.

关键词：动力学模拟 Cu2+-α-突触核蛋白二级结构自由能纤维化聚集

残基突变对P53-DNA结合域肽段构象影响的分子动力学模拟

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

物理化学学报 2012年第7期28卷 1665-1675页

作者：许朝莹赵立岭曹赞霞王吉华山东省功能大分子生物物理重点实验室(德州学院) 山东德州253023 山东师范大学物理与电子科学学院济南250014 德州学院物理系山东德州253023

基于分子动力学模拟方法研究了R249S、R248W和G245S突变对P53-DNA结合域肽段(残基230-258)结构的影响.采用GROMACS软件包和GROMOS43A1分子力场,分别对野生型wtP53肽段、单点突变型P53-R249S肽段、两点突变型P53-R249S/R248W肽段和三点... 详细信息

基于分子动力学模拟方法研究了R249S、R248W和G245S突变对P53-DNA结合域肽段(残基230-258)结构的影响.采用GROMACS软件包和GROMOS43A1分子力场,分别对野生型wtP53肽段、单点突变型P53-R249S肽段、两点突变型P53-R249S/R248W肽段和三点突变型P53-R249S/R248W/G245S肽段进行了4组独立的分子动力学模拟,每组体系模拟时间为500ns.研究结果表明:R249S单残基突变影响肽段残基形成二级结构的情况,但不改变肽段三维结构的模式,同时使该肽段结构相对稳定;R249S和R248W两残基同时突变会加剧R249S突变对肽段的影响,同时导致三维结构发生较大变化,构象弯曲呈现双turn结构,肽段稳定性进一步增大;G245S突变对肽段的影响与R249S和R248W同时突变对其结构的影响相反,在两残基突变的基础上,G245S突变会使原突变引起的变化减弱甚至消失,同时使得该肽段结构稳定性减小.该研究对认识肿瘤致病分子机制和设计新药物有重要意义.

关键词： P53蛋白残基突变结构变化分子动力学模拟结构异质性

固有无序超嗜热菌FlgM蛋白在两种不同温度下的构象变化特征

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

物理化学学报 2015年第2期31卷 384-392页

作者：朱玉风曹赞霞赵立岭王吉华山东师范大学物理与电子科学学院济南250014 山东省功能大分子生物物理重点实验室山东德州253023 德州学院生物物理研究所山东德州253023

基于分子动力学模拟方法比较了超嗜热菌FlgM蛋白在常温(293K)和生理温度(358K)下的结构特征.基于GROMACS软件包,采用OPLS-AA分子力场和TIP3P水模型,对超嗜热菌FlgM蛋白在293和358K进行了2组独立的长时间分子动力学模拟,每组体系模拟时间... 详细信息

基于分子动力学模拟方法比较了超嗜热菌FlgM蛋白在常温(293K)和生理温度(358K)下的结构特征.基于GROMACS软件包,采用OPLS-AA分子力场和TIP3P水模型,对超嗜热菌FlgM蛋白在293和358K进行了2组独立的长时间分子动力学模拟,每组体系模拟时间为1500ns.主要分析了两种温度下超嗜热菌FlgM蛋白的二级结构特征、整体构象变化及半无序化区域和结构化区域的构象特征.研究结果表明:在常温下,N端具有一定程度的螺旋成分,但在生理温度下,超嗜热菌FlgM蛋白的结构变得松散,螺旋结构减少,构象稳定性减弱,H1螺旋散开,FlgM蛋白构象灵活性增强,不稳定程度增加.这些不同温度的结构变化说明:半无序化区域(N端)在非结合状态下有一定的螺旋结构,但该段螺旋的稳定性随温度升高而降低.超嗜热菌FlgM蛋白会通过增加结构的无序程度使结构更加灵活,以适应高温,从而使该类固有无序蛋白更好地行使其功能,如提高同其他成分的结合速率等.

关键词： FlgM蛋白固有无序蛋白分子动力学模拟温度适应性结构特征

分子动力学模拟研究穿透肽的跨膜机制及引导新肽设计

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

科学通报 2014年第22期59卷 2160-2168页

作者：曹赞霞刘磊王吉华山东省功能大分子生物物理重点实验室(德州学院) 德州253023

细胞穿透肽在体内缺乏细胞和组织专一性,使得这类载体的临床应用受到很多限制.成功设计各类疾病特异性靶向穿透肽的关键是充分认识这类多肽的跨膜分子机制.分子动力学模拟已逐渐成为开展该领域研究不可或缺的重要工具,与实验研究相互促... 详细信息

细胞穿透肽在体内缺乏细胞和组织专一性,使得这类载体的临床应用受到很多限制.成功设计各类疾病特异性靶向穿透肽的关键是充分认识这类多肽的跨膜分子机制.分子动力学模拟已逐渐成为开展该领域研究不可或缺的重要工具,与实验研究相互促进,对特异性靶向穿透肽的设计具有重要的指导作用.目前,利用分子动力学模拟主要开展的研究内容包括跨膜过程、跨膜自由能变化、多肽序列结构特征以及不同细胞膜组成如何影响其跨膜机制等.随着分子模型及增强采样方法的发展,单组模拟能够直接快速获取多肽跨膜自由能和构象变化.因此,分子动力学模拟对如何改造或设计细胞靶向穿透肽提供理论依据和指导,对改善药物跨膜能力、减少药物对其他健康组织的毒害等方面有着重要的科学和实际意义.

关键词：细胞穿透肽跨膜分子机制跨膜自由能分子动力学模拟细胞靶向穿透肽

固有无序蛋白质无序与有序接点处的氨基酸序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物物理学报 2011年第9期27卷 801-811页

作者：曹赞霞张红梅赵岩王吉华山东省高校生物物理重点实验室山东德州253023 德州学院物理系山东德州253023 华中科技大学生命科学与技术学院武汉430074 中国科学技术大学生命科学学院合肥230027

近几年发现的固有无序蛋白质数量不断增加,但目前的研究主要集中于无序区域的序列分析,预测软件的开发也主要基于无序区域的序列和结构特征。目前,尚没有针对无序区域与有序区域接点处氨基酸序列分析的报道,也未发现比较不同功能固有无... 详细信息

近几年发现的固有无序蛋白质数量不断增加,但目前的研究主要集中于无序区域的序列分析,预测软件的开发也主要基于无序区域的序列和结构特征。目前,尚没有针对无序区域与有序区域接点处氨基酸序列分析的报道,也未发现比较不同功能固有无序蛋白质的无序区域序列特征的研究。本文将目前所发现的固有无序蛋白质按功能划分为分子伴侣、分子组装等8组,建立其二级数据库;然后,运用ProtParam软件对固有无序蛋白质无序与有序接点处的氨基酸序列进行相关特征分析,这些特征参数包括氨基酸组成、净电荷、芳香族氨基酸含量和疏水性。基于数据库和分析统计工具的考虑,文章在每组序列的接点两侧,分别选择了1～5个氨基酸作为研究对象。结果表明,不同功能的固有无序蛋白质接点处无序区域和有序区域的氨基酸种类、净电荷含量、芳香族氨基酸含量,以及疏水性,都存在不同程度的差异;但是就整体而言,固有无序蛋白质接点处无序区域的亲水氨基酸(D、E、K、G)含量比较高,而接点处有序区域的疏水氨基酸(C、W、L、I、F)含量比较高;接点处无序区域的净电荷高于有序区域的净电荷,无序区域的芳香族氨基酸含量低于有序区域。本研究揭示了固有无序蛋白质有序与无序接点处的序列特征,将为无序蛋白质的预测添加新的输入信息,有助于开发和改进固有无序蛋白质预测软件。

关键词：固有无序蛋白接点序列分析无序区域有序区域