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中国水产科学 2024年第1期31卷 1-13页

作者：王晶晶李旭鹏薛倩曹宝祥栾生罗坤隋娟代平曹家旺谭建陈宝龙傅强孔杰高焕孟宪红江苏海洋大学海洋科学与水产学院江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

本研究旨在探讨凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei)易位子相关蛋白α亚基(translocon-associatedproteinalpha,TRAPα)基因特征及其在抗白斑综合征病毒(white spot syndrome, WSSV)中的作用。通过PCR和Sanger测序技术,获得凡纳滨对虾TRAPα的开放阅读框(openreadingframe,ORF)序列,将该基因命名为Lv-trapα,并进行生物信息学分析。采用real-time PCR分析Lv-trapα基因在健康凡纳滨对虾和感染WSSV不同时间点的凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中的Lv-trapα表达水平。同时,利用重亚硫酸氢盐测序技术(bisulfite sequencing PCR, BSP)检测健康凡纳滨对虾和感染WSSV后96 h的凡纳滨对虾肝胰腺组织中Lv-trapα基因上游DNA序列的甲基化水平。结果显示,Lv-trapα的ORF全长873 bp,共编码290个氨基酸,预测相对分子质量为32466.4,理论等电点为4.45。多序列比对发现TRAPα蛋白的保守性较高。Lv-trapα DNA序列中有8个单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP),其中1个SNP位点处于外显子区域且属于错义突变,其余7个SNP位点处于内含子区域。real-time PCR结果显示, Lv-trapα基因在凡纳滨对虾肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄中均有表达,且在感染WSSV后显著上调表达(P<0.05)。值得注意的是,在感染WSSV后96 h,体内病毒含量不同的凡纳滨对虾肝胰腺中Lv-trapα的表达水平差异显著,高病毒含量组中Lv-trapα的表达水平显著高于低病毒含量组(P<0.05),提示Lv-trapα表达水平和WSSV复制水平存在正相关性。BSP结果显示,Lv-trapα基因上游1个CpG位点(存在于NCBI数据库NW＿020872863.1第360336-360337 nt位置)的甲基化水平和Lv-trapα表达水平呈负相关,该CpG位点的甲基化水平和凡纳滨对虾体内WSSV病毒含量也呈负相关。本研究可为深入研究凡纳滨对虾抗WSSV的分子机制和抗病分子育种提供理论参考。

关键词：凡纳滨对虾白斑综合征病毒(WSSV) TRAP 表达水平 SNP DNA甲基化

凡纳滨对虾不同品系生长和急性肝胰腺坏死病抗性遗传参数估计

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渔业科学进展 2024年

作者：黄桂仙李旭鹏田吉腾栾生孔杰曹宝祥刘宁罗坤谭建曹家旺代平陈宝龙强光峰刘绵宇刘杨王宏杰刘学会隋娟孟宪红上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室邦普种业科技有限公司海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所会达水产养殖有限公司(唐山)

为开展凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长和急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease， AHPND)抗性复合选育，本研究以自主选育的凡纳滨对虾高抗和快大品系为研究对象进行生长和AHPND抗性测试。实验家系共计70个... 详细信息

为开展凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)生长和急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease， AHPND)抗性复合选育，本研究以自主选育的凡纳滨对虾高抗和快大品系为研究对象进行生长和AHPND抗性测试。实验家系共计70个(高抗家系40个，快大家系30个)，实验个体共计1 760尾(高抗个体800尾，快大个体960尾)。2个品系分2批次进行VpAHPND定量口饲感染。批次内实验个体达半数死亡后停止投喂毒饵。利用个体动物模型和父母本阈值模型评估2个品系3 个性状(体重、感染VpAHPND后个体存活时间、家系半致死存活率)的遗传力；利用两性状动物模型评估3个性状两两之间的遗传相关。结果显示，高抗系体重遗传力估计值为0.599±0.120，为高遗传力水平；个体存活时间遗传力估计值为0.240±0.072，为中等遗传力水平；家系半致死存活率遗传力估计值为0.173±0.051，为低等遗传力水平。快大系体重、个体存活时间和家系半致死存活率的遗传力估计值分别为0.266±0.082、0.374±0.096、0.257±0.048，均为中等遗传力水平。经Z-score检验，2个品系各性状遗传力估计值与0差异均达到极显著水平(P0.05)；2个品系内的个体存活时间与家系半致死存活率遗传相关分别为0.997±0.129、0.967±0.044，为高度正相关。结果表明，在实际选育过程中，可将生长和AHPND抗性作为选育指标纳入综合选择指数进行选种制种；为简化抗性测试过程，可将家系半致死存活率作为选育群体的AHPND抗性指标。本研究为开展凡纳滨对虾生长和AHPND抗性优良品种的选育提供了参考。

关键词：凡纳滨对虾生长 AHPND抗性遗传力遗传相关

利用“黄海芯1号”55K SNP芯片评估凡纳滨对虾选育群体的遗传多样性与基因组近交水平

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海洋与湖沼 2024年第2期55卷 479-488页

作者：刘丹阳孔杰王平陈荣坚傅强罗坤陈宝龙隋娟孟宪红代平谭建曹家旺李旭鹏康子仪刘绵宇强光峰迟长凤栾生浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心浙江舟山316022 中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科技中心海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室山东青岛266071 海南中正水产科技有限公司海南东方572633 广东海兴农集团有限公司广东广州511400

凡纳滨对虾的主要选育目标分为两个方面:一是培育具有较强抗病、抗逆性的“高抗系”(GK),二是培育具有快速生长特性的“快大系”(KD)。然而,国内缺少针对这两个选育群体的遗传多样性特别是基因组近交水平的调查分析研究。基于液相芯片... 详细信息

凡纳滨对虾的主要选育目标分为两个方面:一是培育具有较强抗病、抗逆性的“高抗系”(GK),二是培育具有快速生长特性的“快大系”(KD)。然而,国内缺少针对这两个选育群体的遗传多样性特别是基因组近交水平的调查分析研究。基于液相芯片“黄海芯1号”(55 K SNP)的基因分型数据,首次分析了GK(1064尾个体)和KD(564尾个体)选育群体的遗传结构和遗传多样性,调查了连续性纯合片段(ROH)的基因组分布特征,并重点评估了两个群体的基因组近交水平。PCA及进化树分析表明GK及KD群体可明确分层,亲缘关系热图表明KD群体内个体间的亲缘关系比GK群体更近。GK群体包括的家系数量更多,导致其遗传多样性高于KD群体;两群体间的F_(st)为0.09,存在中等遗传分化。GK和KD群体每个ROH的平均长度分别为(1.70±0.34)Mb和(1.65±0.38)Mb,每个样本ROH的平均数量分别为1.98±1.30和2.07±1.37。GK和KD群体0.8~1.25 Mb长度的ROH占比分别为11.41%和19.17%,表明KD群体的选育历史比GK群体更长。两个群体>2.25 Mb长度的ROH片段占比分别为10.26和9.74%,表明两个群体短期内未发生近亲交配。七种基因组近交系数评估结果表明,KD群体的近交水平高于GK群体。不依赖基础群体等位基因频率的F_(ROH)和F_(HOM)方法可准确地评价育种群体的真实近交水平,而F_(VR1)、F_(YA1)和F_(LH1)等依赖基础群体等位基因频率的方法可以用来比较群体及个体间的相对近交水平。上述结果为准确地评估育种群体的近交水平和优化育种方案提供了重要参考依据。

关键词：凡纳滨对虾 “黄海芯1号” 遗传多样性连续性纯合片段基因组近交系数

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IFIT3:食管鳞状细胞癌潜在的治疗靶点及预后标志物

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IFIT3:食管鳞状细胞癌潜在的治疗靶点及预后标志物

作者：曹家旺南方医科大学

学位级别：硕士

目的本研究旨在寻找食管鳞状细胞癌潜在的治疗靶点基因,并探讨其作为食管鳞状细胞癌患者预后标志物的可能。方法通过生物信息学分析从食管鳞状细胞癌和癌旁组织中筛选靶基因,再经过组织RNA提取、RT-qRCR进行验证。采用Mann-Whitney U非... 详细信息

目的本研究旨在寻找食管鳞状细胞癌潜在的治疗靶点基因,并探讨其作为食管鳞状细胞癌患者预后标志物的可能。方法通过生物信息学分析从食管鳞状细胞癌和癌旁组织中筛选靶基因,再经过组织RNA提取、RT-qRCR进行验证。采用Mann-Whitney U非参数检验、Kaplan-Meier生存分析研究差异表达基因的相对表达量与食管鳞状细胞癌患者临床病理、预后的相关性并进行亚组分析,Kaplan-Meier和cox比例风险模型分析影响食管鳞状细胞癌患者预后的因素。结果GEO2R检测出食管鳞状细胞癌/癌旁组织中差异表达的基因279个,聚类分析和富集分析表明Cluster 4在免疫相关功能上发挥着重要作用,PPI网络显示 IFIT3 是基因簇中的核心基因。IFIT3(Interferon-induced protein with tetratricopepide repeats 3)作为干扰素刺激后应答的重要基因之一,在抗病毒和抗肿瘤过程中都发挥着重要作用。临床患者组织样本qPCR验证了 IFIT3在癌/癌旁组织中差异表达(P1,P<0.05)。结论研究表明IFIT3是食管鳞状细胞癌与癌旁组织之间的差异表达基因,且相对表达量与临床病理、预后相关,提示在食管鳞状细胞癌的发生发展中扮演着重要角色,可作为判断食管鳞状细胞癌患者不良预后的重要指标。

关键词： IFIT3 食管鳞状细胞癌靶点预后

零鱼粉饲料与高鱼粉饲料饲喂下凡纳滨对虾饲料利用效率相关性状的遗传评估

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渔业科学进展 2023年

作者：朱相燕孟宪红代平孔杰栾生曹家旺谭建邢群海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室邦普种业科技有限公司浙江海洋大学水产学院中国水产科学研究院黄海水产研究所海水养殖生物育种与可持续产出全国重点实验室

为探讨选育零鱼粉需求凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)品种的可能性，解决目前鱼粉短缺、饲料成本居高不下的问题，本研究在零鱼粉饲料(蛋白含量占38%)和高鱼粉饲料(鱼粉含量占25%，蛋白含量占42%)饲喂条件下进行凡纳滨对虾饲料利用... 详细信息

为探讨选育零鱼粉需求凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)品种的可能性，解决目前鱼粉短缺、饲料成本居高不下的问题，本研究在零鱼粉饲料(蛋白含量占38%)和高鱼粉饲料(鱼粉含量占25%，蛋白含量占42%)饲喂条件下进行凡纳滨对虾饲料利用效率相关性状的遗传评估。选择30个家系进行40 d的单尾饲养实验，发现饲喂高鱼粉饲料的对虾的平均增重率(62.00%)和平均饲料效率比(124.00%)明显高于饲喂零鱼粉饲料(23.50%和49.40%)。对虾摄食量和增重率在零鱼粉饲料和高鱼粉饲料饲喂下的遗传力在0.458±0.140到0.699±0.155之间，饲料效率比在零鱼粉饲料和高鱼粉饲料饲喂下的遗传力分别为0.186±0.098和0.341±0.110。由于没有剖分出共同环境效应，遗传力都存在一定程度高估，因此，零鱼粉饲料饲喂下的饲料效率比的遗传变异并不高。摄食量和增重率在2种饲料间的遗传相关分别为0.580±0.171和0.676±0.155，表示这2个性状存在中等的基因型与饲料互作效应。饲料效率比在2种饲料间的遗传相关仅为0.299±0.304，表示该性状存在严重的基因型与饲料互作效应。综上结果来看，使用零鱼粉饲料不利于凡纳滨对虾的养殖效益及选育工作的开展。

关键词：凡纳滨对虾饲料效率比遗传力遗传相关基因型与饲料互作

基于微卫星标记评估凡纳滨对虾收获体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数

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水产学报 2022年第4期46卷 583-593页

作者：孙坤李旭鹏隋娟曹家旺谭建罗坤栾生孔杰孟宪红上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室

为更加准确地评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数，实验利用8个微卫星位点对凡纳滨对虾69个家系母本和子代进行基因分型，并利用分型信息进行系谱重构和分子亲缘关系相关度的计算，以重构系谱、分子亲缘关系度以及物... 详细信息

为更加准确地评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数，实验利用8个微卫星位点对凡纳滨对虾69个家系母本和子代进行基因分型，并利用分型信息进行系谱重构和分子亲缘关系相关度的计算，以重构系谱、分子亲缘关系度以及物理系谱分别构建加性遗传相关矩阵，进而对体长、体质量和抗WSSV性状的遗传参数进行评估。最终通过交叉验证的方法，比较三者对遗传参数评估的预测能力以及准确性。分型结果显示，8个微卫星位点，共检测到166个等位基因，各位点等位基因数为12～45个，亲本和子代群体每个位点平均等位基因数分别为9.50个和18.13个，平均观测杂合度分别为0.618和0.709，平均期望杂合度分别为0.749和0.775，平均多态性信息含量分别为0.711和0.750，所有位点均表现高度多态性。遗传力分析结果显示，利用物理系谱、重构系谱以及分子亲缘相关度对体长的遗传力估计值分别为0.119±0.031、0.120±0.032、0.132±0.030，对体质量的遗传力估计值分别为0.176±0.039、0.182±0.040、0.172±0.034，对抗WSSV性状的遗传力估计值分别为0.135±0.033、0.134±0.033、0.098±0.031，在体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传力中，以分子亲缘相关度评估的标准差小于重构系谱和物理系谱。通过交叉验证，三者对遗传参数评估的预测能力以及准确性从高到低分别为分子亲缘相关度、重构系谱、物理系谱。研究表明，利用微卫星分子标记评估凡纳滨对虾体长、体质量以及抗WSSV性状遗传参数比利用物理系谱评估具有更高的准确性，但同样利用微卫星分子标记进行遗传评估，直接利用子代的亲缘相关度比重构系谱具有更好的效果。本研究为凡纳滨对虾遗传参数的评估提供了更为精确的方法，为进一步良种选育提供了参考资料。

关键词：凡纳滨对虾微卫星分子亲缘关系系谱重构遗传力

中国对虾免疫致敏（类免疫）反应的诱导及其分子机制初探

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中国对虾免疫致敏（类免疫）反应的诱导及其分子机制初探

作者：曹家旺上海海洋大学

学位级别：硕士

本实验选取中国对虾新品种“黄海2号”为实验对象,以干热、60Coγ射线和双乙烯亚胺(binary ethyleneimine,BEI)灭活的白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)为媒介,诱导中国对虾产生免疫致敏(immune priming)反应;并分析比较... 详细信息

本实验选取中国对虾新品种“黄海2号”为实验对象,以干热、60Coγ射线和双乙烯亚胺(binary ethyleneimine,BEI)灭活的白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)为媒介,诱导中国对虾产生免疫致敏(immune priming)反应;并分析比较不同诱导方式对二次感染WSSV后对虾死亡率、平均存活时间及相对免疫保护率的影响,并分析了可能与免疫致敏反应相关的FcDscam基因在组织和时空上的变化规律,以期探究中国对虾免疫致敏反应的发生机制,为对虾疾病的预防探寻新的方法。具体研究内容如下:本实验拟探究经热灭活的WSSV能否诱导中国对虾产生免疫致敏反应。实验将患有典型白斑综合征症状的对虾取腹部肌肉剁碎后经60℃灭活1 h,采用单尾定量口饲的方法,连续6 d投喂不同水温条件(15℃、23℃、28℃、32℃)下的实验组对虾(E15℃、E23℃、E28℃、E32℃);同时设置常温(23℃)条件下阳性对照组C23℃(投喂未经灭活的WSSV毒饵)、对照组CF23℃(只投喂商业配合饲料)。在实验第13d对存活个体进行第二次人工WSSV感染,结果显示,WSSV经60℃处理1 h可彻底失活,表现为连续投喂6天至第二次人工感染期间无对虾死亡,而阳性对照组C23℃死亡率为100%。截止实验第19 d,E15℃、E23℃、E28℃、E32℃各组存活率分别为80.41%、33.29%、8.47%、16.43%,CF23℃组的存活率为8.89%,E15℃组与其它各实验组差异极显著(P0.05);对各组实验材料进行WSSV绝对荧光定量检测,结果显示,经热灭活WSSV诱导的中国对虾二次感染WSSV后,28℃环境下病毒的增殖速度最快,高温(32℃)和低温(15℃)都会不同程度抑制WSSV的增殖速率。实验证明,热灭活WSSV可以诱导中国对虾产生免疫致敏反应,对感染WSSV后的中国对虾具有一定的保护作用;温度与WSSV的增殖速率密切相关。通过同源克隆和RACE技术获得了中国对虾(***)Dscam基因cDNA序列全长,并对该序列进行生物信息学分析。结果显示,中国对虾Dscam基因全长6624 bp,其中包括171 bp的5’端非编码区(5’UTR),459 bp的3’端非编码区(3’UTR);开放阅读框(ORF)的长度为5994 bp,共编码1997个氨基酸,命名为FcDscam。该基因编码的蛋白含有一个信号肽(signal peptide)、10个Ig(immunoglobulin,Ig)结构域,6个FNIII(fibronectin type III,FNIII)功能区,1个胞质尾区(cytoplasmic tail),1个跨膜结构域(transmembrane domain)。经同源比对和系统进化树分析,凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)与中国对虾的相似性最高,为92.4%,在系统进化树中,先与凡纳滨对虾聚为一支,然后同其它几种甲壳动物红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)、通讯螯虾(Pacifastacus leniusculus)、普通滨蟹(Carcinus maenas)和中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)聚为一大支。连续投喂6 d热灭活WSSV饵料诱导免疫致敏反应,在0 d,6 d,12 d及二次感染后12 h,24 h,48h,72 h,168 h分别取样,用RT-PCR的方法检测FcDscam相对表达量。结果显示,FcDscam基因在第12 d开始上调,与对照组差异显著(P<0.05);二次感染后24 h,相对表达量达到最大值,与对照组差异极显著(P<0.01);48 h后基因表达量开始下降。实验表明,中国对虾存在Dscam基因,并在免疫致敏过程中发挥重要作用。为了探究如何有效的诱导对虾等无脊椎动物的免疫致敏反应,实验通过物理方法60Coγ辐照灭活患典型白斑综合征的对虾肌肉,连续10 d投喂灭活的WSSV饵料;使用化学试剂双乙烯亚胺灭活白斑综合征病毒悬液,在实验第1 d和6 d注射灭活的WSSV病毒悬液,10 d后将诱导存活的个体均分为注射感染组和口饲感染组,并分别设置阳性对照和阴性对照,分别进行二次感染。二次感染7 d,γ-射线诱导组相对免疫保护率为20.94%(口饲)和13.64%(注射);BEI灭活诱导组相对免疫保护率为45.23%(口饲)和11.11%(注射)。在免疫诱导阶段,0 d,3 d,6 d和10 d及二次感染后0 h(10 d),6 h,12 h,24 h,48 h取BEI灭活组样品,通过实时荧光

关键词：中国对虾免疫致敏灭活 Dscam 绝对荧光定量白斑综合征病毒

凡纳滨对虾高低繁殖力群体卵巢组织学观察及相关候选基因的表达分析

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渔业科学进展 2023年

作者：张建春孔杰曹家旺谭建代平孟宪红罗坤傅强陈宝龙刘东亚邢群隋娟栾生中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室上海海洋大学水产与生命学院邦普种业科技有限公司

生产中，凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)雌虾的繁殖性能表现出巨大差异。本研究以一个生产周期中雌虾产卵频次为繁殖力指标性状，以高繁殖力和低繁殖力雌虾为研究对象，对雌虾不同卵巢发育阶段(增殖期、小生长期、大生长期和成熟期)... 详细信息

生产中，凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)雌虾的繁殖性能表现出巨大差异。本研究以一个生产周期中雌虾产卵频次为繁殖力指标性状，以高繁殖力和低繁殖力雌虾为研究对象，对雌虾不同卵巢发育阶段(增殖期、小生长期、大生长期和成熟期)进行组织学观察。针对在前期选择清除分析中筛选到的繁殖候选基因TRX2、PARD3、PLCβ4和RERE，采用实时荧光定量PCR方法首次分析比较它们在高、低繁殖力雌虾不同卵巢发育阶段卵巢、眼柄组织中的表达规律。组织观察结果显示，低繁殖力雌虾卵巢在整个生产周期中无法发育至成熟期，高繁殖力雌虾卵巢在卵黄颗粒的形成和积累、皮质棒形成等关键过程的速度要快于低繁殖力雌虾。基因表达检测结果显示，在卵巢小生长期和大生长期，TRX2、PLCβ4和RERE基因在高繁殖力组卵巢的表达量均显著高于低繁殖力组卵巢(P<0.05)，4个基因在高繁殖力组成熟期卵巢中均维持较高的表达水平；在不同时期的眼柄组织中，低繁殖力组中TRX2、PARD3、PLCβ4和RERE基因的表达量均高于高繁殖力组。研究结果表明上述4种基因可能在凡纳滨对虾卵巢发育过程中发挥重要作用。以上结果为深入研究凡纳滨对虾雌虾繁殖力产生差异的分子机制以及分子辅助育种提供重要参考。

关键词：凡纳滨对虾繁殖卵巢组织学基因表达模式

基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析

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水产学报 2023年第1期47卷 165-174页

作者：刘杨栾生刘绵宇李旭鹏孟宪红罗坤隋娟谭建代平曹家旺陈宝龙孔杰湖州师范学院生命科学学院中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响，本实验对26个全同胞家系进行Vp AHPND侵染，收集686尾个体的存活时间数据，对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0 K SNP)进行基因分型，基于A、G和H亲缘... 详细信息

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响，本实验对26个全同胞家系进行Vp AHPND侵染，收集686尾个体的存活时间数据，对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0 K SNP)进行基因分型，基于A、G和H亲缘关系矩阵估计Vp AHPND侵染后存活时间的遗传参数；采用随机和等距抽取方式，基于55.0K SNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K)，利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测Vp AHPND侵染后存活时间的基因组育种值，利用交叉验证方法计算其预测准确性，并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示，Vp AHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平，估计值为0.68～0.79。在55.0 K SNP密度下，针对242尾基因分型个体数据集(G242)，利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%；针对686尾表型测定个体数据集(P686)，利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535，后者比前者提升了4.90%。对于8个低密度SNP面板，当SNP密度≥10.0 K时，基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小(1.1%～1.8%)；随着SNP密度自10.0 K不断降低，基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低，其中5.0 K密度降幅为0.6%～2.6%、1.0 K密度降幅为5.8%～11.0%、0.5 K密度降幅为11.4%～17.2%、0.1 K密度降幅为38.8%～41.6%。10.0 K与55.0 K SNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99，表明利用10.0 K SNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV。研究表明，使用10.0 K SNP面板对Vp AHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0 K SNP芯片近似的预测准确性，为低密度SNP分型芯片设计提供了参考。

关键词：凡纳滨对虾 AHPND 低密度SNP面板基因组预测准确性