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DNA-蛋白质相互作用研究方法进展

生物工程学报 2025年

作者：王梦贞于畅雷宇金红星申杰孙际宾河北工业大学化工学院中国科学院天津工业生物技术研究所中国科学院大学国家合成生物技术创新中心

DNA与蛋白质的相互作用是细胞生命活动的重要机制，是DNA复制和转录调控的基础，对细胞的生长发育和环境适应至关重要。这种相互作用本质上是通过蛋白质的DNA结合结构域特异性识别和结合DNA序列实现的。深入研究和理解这些相互作用不仅... 详细信息

DNA与蛋白质的相互作用是细胞生命活动的重要机制，是DNA复制和转录调控的基础，对细胞的生长发育和环境适应至关重要。这种相互作用本质上是通过蛋白质的DNA结合结构域特异性识别和结合DNA序列实现的。深入研究和理解这些相互作用不仅有助于揭示生物学机制，也对疾病研究、药物开发、工业菌种设计与改造等具有重要的指导意义。本文综述了传统的DNA-蛋白质相互作用研究方法和近年来发展的新方法，分析其技术原理、优势、局限性和应用案例，也进一步探讨了相关新技术可能的改进方向和潜在应用场景，能够帮助研究人员全面、快速地了解不同DNA-蛋白质相互作用研究方法的特点、挑战和未来的发展方向，并为相关方法的进一步创新、融合提供参考。

关键词： DNA 蛋白质相互作用研究方法新进展

基于转录组学探讨金担子素A抗白色念珠菌的作用机制

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国际口腔医学杂志 2025年

作者：易嘉欣廖建春黄怡费伟郭骏电子科技大学医学院口腔医学系德阳市罗江区人民医院口腔科四川省医学科学院·四川省人民医院口腔科四川省医学科学院·四川省人民医院(温江院区)口腔科

目的探究金担子素A (AbA)对白色念珠菌的抑菌活性及潜在作用机制，评估其未来作为新型抗真菌药物的应用潜力。方法首先测定了AbA的最低抑菌浓度（MIC），并探究其对菌丝形成及细胞壁完整性的影响。随后，利用转录组测序探讨了白色念... 详细信息

目的探究金担子素A (AbA)对白色念珠菌的抑菌活性及潜在作用机制，评估其未来作为新型抗真菌药物的应用潜力。方法首先测定了AbA的最低抑菌浓度（MIC），并探究其对菌丝形成及细胞壁完整性的影响。随后，利用转录组测序探讨了白色念珠菌在AbA作用下的响应机制。结果体外实验结果显示AbA的MIC值为0.062 5μg/mL，并能显著抑制白色念珠菌的形态转换、破坏其细胞壁完整性。通过转录组测序共筛选出700个差异表达基因，其中上调基因465个，下调基因235个。京都基因（GO）富集分析结果显示：细胞外周、细胞质膜、真菌型细胞壁及氧化还原酶活性相关的通路最为富集。基因组百科全书（KEGG）富集分析结果表明代谢途径通路的富集程度最高。结论 AbA对白色念珠菌具有较强的抑制作用，其潜在抗菌机制可能包括抑制菌丝形成、破坏细胞质膜、降低免疫逃逸能力以及抑制代谢活动。明确以上机制能够为制定更有效的抗真菌治疗策略提供重要理论依据。

关键词：白色念珠菌金担子素A 转录组测序基因组百科全书富集分析京都基因富集分析

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神经形态计算:从脉冲神经网络到边缘部署

软件学报 2025年

作者：俞诗航易梦军吴洲申富饶赵健计算机软件新技术国家重点实验室(南京大学) 南京大学计算机学院南京大学人工智能学院南京大学电子科学与工程学院

受生物神经系统启发,神经形态计算的概念于20世纪80年代被提出,旨在模拟生物大脑的结构和功能,实现更高效、更具生物合理性的计算方式.作为神经形态计算的代表模型,脉冲神经网络(SNN)因其脉冲稀疏性,事件驱动性、生物可解释性以及硬件... 详细信息

受生物神经系统启发,神经形态计算的概念于20世纪80年代被提出,旨在模拟生物大脑的结构和功能,实现更高效、更具生物合理性的计算方式.作为神经形态计算的代表模型,脉冲神经网络(SNN)因其脉冲稀疏性,事件驱动性、生物可解释性以及硬件契合性等优势,在资源严格受限的边缘智能任务中得到了广泛应用.针对脉冲神经网络的边缘部署情况进行梳理和汇总,首先从脉冲神经网络模型自身的原理出发,论述脉冲神经网络的高能效计算方式以及巨大的边缘部署潜力.然后介绍当下常见的脉冲神经网络硬件实现工具链,并重点对脉冲神经网络在各类神经形态硬件平台的部署情况做详细的整理与分析.最后,考虑到硬件故障行为已发展为当下研究中不可避免的问题,对脉冲神经网络边缘部署时的故障与容错研究进行概述.从软件模型原理到硬件平台实现,全面系统地介绍神经形态计算的最新进展,分析脉冲神经网络边缘部署时遇到的困难与挑战,并针对这些挑战给出未来可能的解决方向.

关键词：神经网络脉冲神经网络神经形态计算边缘智能

基于折叠PMF-FFT的高动态B1C信号无模糊度快速捕获算法

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系统工程与电子技术 2025年

作者：金志威李路遥樊易升马振洋中国民航大学民航航空器适航审定技术重点实验室中国民航大学安全科学与工程学院

北斗三号系统新增的B1C导航信号在捕获过程中存在码相位搜索时间长、匹配滤波器系数计算复杂度高及自相关函数具有多峰性等难点。本文针对高动态场景，使用短时相关匹配滤波器和快速傅里叶变换的结合信号捕获算法，同时对B1C信号进行了... 详细信息

北斗三号系统新增的B1C导航信号在捕获过程中存在码相位搜索时间长、匹配滤波器系数计算复杂度高及自相关函数具有多峰性等难点。本文针对高动态场景，使用短时相关匹配滤波器和快速傅里叶变换的结合信号捕获算法，同时对B1C信号进行了数据折叠和自相关函数重构，简化了匹配滤波器系数生成的复杂度，实现了B1C信号的无模糊度快速捕获。实验结果表明，在满足高动态捕获需求的前提下，运算复杂度和捕获时间显著减少，检测概率最大提升32.4%，最大副峰值降低了约125倍。此外，该算法捕获的最小信号功率比天线最低接收功率小1.5dB，具备一定抗热噪声能力。

关键词：高动态北斗三号 B1C信号快速捕获无模糊捕获

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聚乙二醇/粉煤灰定形相变材料的制备与性能

功能材料 2025年

作者：闫贞玮高建明马舒佳郭彦霞山西大学资源与环境工程研究所国家环境保护煤炭废弃物资源化高效利用重点实验室

传统模板法制备介孔硅基材料存在合成工艺复杂、成本高昂的问题。本研究以粉煤灰为原料,采用矿相活化和酸刻蚀两步法合成了一种介孔硅基材料,工艺简单且能耗低。以聚乙二醇（PEG）为相变材料,通过真空浸渍法制备了定形复合相变材料。利... 详细信息

传统模板法制备介孔硅基材料存在合成工艺复杂、成本高昂的问题。本研究以粉煤灰为原料,采用矿相活化和酸刻蚀两步法合成了一种介孔硅基材料,工艺简单且能耗低。以聚乙二醇（PEG）为相变材料,通过真空浸渍法制备了定形复合相变材料。利用扫描电子显微镜（SEM）、傅立叶变换红外光谱（FT-IR）、X射线衍射仪（XRD）、热重（TG）对所制备的材料成分、形貌和热性能等进行了表征。BET测试表明这种介孔硅基材料比表面积可达492 m2/g,孔容为0.42 cm3/g。复合相变材料在105℃下仍然可以保持固体形状,PEG4000的最大质量负载量为61.69%,熔融相变焓为57 J/g。实验表明所制备的定形复合相变材料具有良好的储热性能和热稳定性能,粉煤灰基复合相变材料是一种很有潜力的绿色环保的热能储存材料。

关键词：活化酸处理二氧化硅基孔材料定形复合相变材料焓

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手性琥珀酸脱氢酶抑制剂的研究进展

农药学学报 2025年

作者：宋瑞李素贞付继珍王富芸刘瑾李莉山西农业大学植物保护学院山西农业大学食品科学与工程学院

琥珀酸脱氢酶抑制剂(succinate dehydrogenase inhibitors，SDHIs)是继甲氧基丙烯酸酯类和三唑类之后的第三大类杀菌剂，因其具有广谱杀菌特性广泛用于防治各类植物的真菌性病害。目前，市场化的SDHIs杀菌剂中8种具有手性特征，本文以... 详细信息

琥珀酸脱氢酶抑制剂(succinate dehydrogenase inhibitors，SDHIs)是继甲氧基丙烯酸酯类和三唑类之后的第三大类杀菌剂，因其具有广谱杀菌特性广泛用于防治各类植物的真菌性病害。目前，市场化的SDHIs杀菌剂中8种具有手性特征，本文以其为研究对象，从分离分析方法、生物活性、环境行为、生态毒性四方面对其对映体选择性进行阐述，以期为后续手性SDHIs高效绿色单体开发应用提供理论基础，为其在农业生产过程中的安全合理使用提供科学指导。

关键词：琥珀酸脱氢酶抑制剂对映体选择性

华南埃迪卡拉纪-寒武纪(551～523Ma)硅质海绵动物的分布及其对海洋氧化的影响

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中国科学:地球科学 2025年

作者：叶炎张磊陈灿常珊易雨昊冯庆来中国地质大学(武汉)地质过程与矿产资源国家重点实验室中国地质大学(武汉)地球科学学院 Department of Geology Lund University 成都理工大学沉积地质研究院成都理工大学自然资源部深时地理环境重建与应用重点实验室湖北省地质局第二地质大队湖北师范大学城市与环境学院中国石油化工股份有限公司江汉油田分公司勘探开发研究院

海绵动物不仅是最基础的后生动物,而且是海洋中重要的生态工程师,因而海绵动物的起源与早期演化问题一直吸引学界的关注.前人研究表明,海绵动物门在寒武纪第二世快速演化,而纽芬兰统的海绵化石分布零星,且保存较差.但是,近年来越来越多... 详细信息

海绵动物不仅是最基础的后生动物,而且是海洋中重要的生态工程师,因而海绵动物的起源与早期演化问题一直吸引学界的关注.前人研究表明,海绵动物门在寒武纪第二世快速演化,而纽芬兰统的海绵化石分布零星,且保存较差.但是,近年来越来越多的海绵骨针化石在全球各地,尤其是华南的埃迪卡拉纪-寒武纪转折期地层中被发现,激起了海绵动物早期演化的新一轮思考和讨论.长期以来,海洋氧化被认为是生物演化的驱动因素之一,但是其与海绵动物演化的关系目前不甚清晰.本文旨在通过系统总结华南五个剖面埃迪卡拉纪-寒武纪转折期硅质海绵骨针的分布规律,探讨硅质海绵动物的早期演化模式.空间上,依据现阶段的地层对比框架,单轴骨针在埃迪卡拉纪晚期出现于下大陆架-斜坡地区,可能在寒武纪早期扩张到上大陆架和深水盆地.时间上,五个剖面的资料显示,单轴海绵骨针的数量、大小和多样性逐渐增加,同时伴随双轴、三轴和多轴海绵骨针的出现.尽管部分海绵骨针的生物属性还存疑,但是最早出现的骨针都是单轴骨针,且具备与现代普通海绵动物类似的骨针集合体形式,据此推测硅质普通海绵动物的出现可能早于硅质六射海绵动物.此外,贵州四方井剖面和湖南燕子桥剖面的地球化学研究表明,海绵动物的出现对应更为缺氧的环境.最后,本研究用箱式模型模拟海绵动物繁盛对海水溶解氧含量的影响,结果发现海绵动物的滤食效应对深海氧化具有较弱的促进作用.

关键词：埃迪卡拉纪-寒武纪转折期海绵动物深海氧化硅浓度箱式模型

计及实时交通流的电动汽车灵活性多速率联合优化

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电力自动化设备 2025年第1期 200-207页

作者：李春燕赖伟彬刘杨易德荣杨坤张谦重庆大学输变电装备技术全国重点实验室

由于交通网-电网之间的耦合愈加紧密，电动汽车（EV）作为灵活性资源参与调度的潜力愈加明显。针对现阶段交通网-电网耦合网络对交通流实时性考虑不足的现状，提出一种计及实时交通流的EV灵活性多速率联合优化（MRCO）策略。构建考虑交... 详细信息

由于交通网-电网之间的耦合愈加紧密，电动汽车（EV）作为灵活性资源参与调度的潜力愈加明显。针对现阶段交通网-电网耦合网络对交通流实时性考虑不足的现状，提出一种计及实时交通流的EV灵活性多速率联合优化（MRCO）策略。构建考虑交通拥堵的动态交通模型，基于速度-流量实用模型建立道路实时车流量与等效道路邻接矩阵的关系，提出考虑拥堵的等效最优路径搜索算法；建立以电网侧为主体的EV灵活性实时调度模型，针对交通网-电网的EV调度时间尺度不同的问题，提出基于MRCO的实时滚动优化算法，以适应交通路况实时多变的要求。基于某区域路网及IEEE 33节点系统对所提模型进行有效性验证，结果表明，所提策略能在满足用户出行需求的前提下，提高EV灵活性，促进可再生能源消纳。

关键词：电动汽车灵活性交通拥堵实时调度多速率联合优化

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一种方差缩减的联邦学习算法

运筹学学报(中英文) 2025年

作者：贾泽慧侯俊茹谢小磊岳素云南京信息工程大学数学与统计学院

联邦学习是一种分布式机器学习框架,可实现多个设备协同训练模型,而无需共享原始数据,从而极大程度上保护了数据隐私。然而,联邦学习仍然面临通信效率和计算效率等方面的挑战。为提高算法的通信效率和计算效率,本文提出了一种方差缩减... 详细信息

联邦学习是一种分布式机器学习框架,可实现多个设备协同训练模型,而无需共享原始数据,从而极大程度上保护了数据隐私。然而,联邦学习仍然面临通信效率和计算效率等方面的挑战。为提高算法的通信效率和计算效率,本文提出了一种方差缩减的联邦学习算法FedCOM-VR。该算法采用周期通信和信息压缩以提高算法的通信效率,且在本地更新中采用方差缩减的随机梯度估计,使得算法的步长和本地更新次数都可取为常数,从而加快算法的求解速度,并降低计算复杂度。本文证明了FedCOM-VR算法具有次线性收敛率,且在PL条件下,给出了算法的线性收敛率。最后,本文通过数值实验展示了FedCOM-VR算法的高效性。

关键词：联邦学习分布式优化方差缩减动量