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CRISPR/Cas核糖核蛋白介导的植物基因组编辑

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遗传 2020年第6期42卷 556-564页

作者：李霞施皖耿立召许建平先正达北京创新中心北京102206

CRISPR/Cas(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins)系统作为一种重要的基因编辑工具,自诞生以来被广泛应用于作物的性状改良。与CRISPR/Cas DNA载体介导的植物基因组编辑相比,CRISPR/Cas核糖核蛋白(CRISPR/Cas ribonucleoprotein,CRISPR/Cas RNP)介导的植物基因组编辑具有作用迅速、脱靶率低和无外源DNA插入(DNA-free)等优点,因而无需清除CRISPR编辑工具而更容易获得纯合的编辑体。但是,由于植物细胞转化方法和细胞再生技术的限制,不借助筛选标记的辅助将CRISPR/Cas RNP直接导入植物细胞并获得高效基因编辑仍比较困难,直接限制了CRISPR/Cas RNP在植物基因组编辑中的广泛应用。本文系统介绍了CRISPR/Cas RNP基因组编辑技术的分子作用机理及其优势,并总结了CRISPR/Cas RNP导入植物细胞的方法,最后对CRISPR/Cas RNP在植物基因组编辑中的新应用和新思路进行了展望,以期为进一步改进CRISPR/Cas RNP基因组编辑技术和扩大其在作物改良中的应用提供参考。

关键词： CRISPR/Cas 基因编辑核糖核蛋白无外源DNA插入植物转化

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重新发现使徒群岛苏必利尔湖上的冰雪传奇

环球人文地理 2015年第23期 82-95页

作者：施皖范吉青施皖史炎冰

使徒群岛的22个岛屿,宛若撒落在苏必利尔湖上的一把珍珠。传说中,它是神明为西迁的奥吉布瓦人选定的新家园。在北美近代史上,它几经易手,也几经沉浮:在伐木业、捕鱼业和采石业让自然资源枯竭之后,它又转向旅游业,经过人们40年不懈的努力... 详细信息

使徒群岛的22个岛屿,宛若撒落在苏必利尔湖上的一把珍珠。传说中,它是神明为西迁的奥吉布瓦人选定的新家园。在北美近代史上,它几经易手,也几经沉浮:在伐木业、捕鱼业和采石业让自然资源枯竭之后,它又转向旅游业,经过人们40年不懈的努力,终于成为国家湖岸,此后的数十年间,野性重归,冰洞奇景惊爆全美,为苏必利尔湖抒写了不朽传奇。

关键词：苏必利尔湖奥吉布瓦人

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如何高效制备生殖系传递的嵌合体小鼠

生殖与避孕 2012年第10期32卷 685-689页

作者：杨冠恒施皖生曾凡一上海市儿童医院上海交通大学附属儿童医院医学遗传研究所上海200040

目前,嵌合体技术已成为胚胎干细胞(ES细胞)和诱导多能性干细胞(iPS细胞)研究不可或缺的一部分,嵌合体小鼠模型主要用于基因功能、调控机制、致病机理等各方面的研究。要安全可靠地进行ES细胞和iPS细胞的各种应用性研究,首先需要验证细... 详细信息

目前,嵌合体技术已成为胚胎干细胞(ES细胞)和诱导多能性干细胞(iPS细胞)研究不可或缺的一部分,嵌合体小鼠模型主要用于基因功能、调控机制、致病机理等各方面的研究。要安全可靠地进行ES细胞和iPS细胞的各种应用性研究,首先需要验证细胞在体内向各种组织定向分化的能力,特别是生殖系传递的能力。而高效制备多能性干细胞生殖系传递的嵌合体小鼠,需要在分子水平、细胞水平、动物个体水平以及制备方法等各方面全面综合地分析考虑,才能达到实验设计的最优化。制备嵌合体小鼠主要有注射法和聚集法2种方法,各有利弊,在整个制备过程中,需要考虑不同发育阶段以及不同小鼠品系胚胎的分化潜能、选用远交系和杂交系的胚胎作为受体,同时要考虑ES细胞的遗传背景,选择低代次的远交系和杂交系的ES细胞或者iPS细胞,以及优选KSR培养体系。对于操作者,需根据实际情况,全方位地综合考虑,从而制定出合理的操作方案。

关键词：胚胎干细胞(ES细胞) 嵌合体生殖系传递诱导性多能性干细胞(iPS细胞)

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基于热释红外的蚂蚁搜索机器人群智系统设计

电子世界 2014年第5期 154-156页

作者：施皖毛丽民俞雷鲁波常熟理工学院电气与自动化工程学院

本文针对搜索机器人如何快速,准确的进行搜索行动,提出一种以人体热释红外检测为引导的群智蚂蚁搜索机器人方案。该设计方案的蚂蚁搜索机器人,体积小,速度快。蚂蚁搜救机器人在搜索的过程中,通过红外信息,相互通信。每个蚂蚁搜索机器人... 详细信息

本文针对搜索机器人如何快速,准确的进行搜索行动,提出一种以人体热释红外检测为引导的群智蚂蚁搜索机器人方案。该设计方案的蚂蚁搜索机器人,体积小,速度快。蚂蚁搜救机器人在搜索的过程中,通过红外信息,相互通信。每个蚂蚁搜索机器人在一定范围内,而且搜索的过程彼此独立,通过红外传感器实现不同蚂蚁搜索机器人之间不断进行信息交流和传递,从而能够相互协作,快速、准确的搜寻到幸存者。

关键词：搜索蚂蚁机器人热释红外

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基于声誉的协同众包激励机制研究

华中科技大学学报(自然科学版) 2024年第9期52卷 94-100页

作者：刘辉章闯李晓皖安徽工业大学计算机科学与技术学院

针对协同众包中的搭便车、不公平和不安全等问题，提出基于声誉的激励机制．该机制综合考虑成员的直接声誉和间接声誉评估其贡献，并利用区块链技术的透明性和不可篡改性存储声誉值，确保声誉数据的真实可靠．首先，采用高斯混合模型对... 详细信息

针对协同众包中的搭便车、不公平和不安全等问题，提出基于声誉的激励机制．该机制综合考虑成员的直接声誉和间接声誉评估其贡献，并利用区块链技术的透明性和不可篡改性存储声誉值，确保声誉数据的真实可靠．首先，采用高斯混合模型对成员任务完成的质量进行预测，并结合其历史声誉值来计算直接声誉值；然后，为了衡量每个成员在团队中的重要程度，采用聚集函数和PageRank算法．前者评估成员的局部影响力，后者衡量其全局影响力．基于成员在团队中的重要性区分度和执行任务的历史记录，分别计算成员在团队中的重要性及成员与其交互成员间的相似度对其间接声誉的影响权重，计算成员的间接声誉值．在此基础上，运用Shapley值实现收益分配的公平性，解决了成员搭便车问题．最后，基于实际数据集，将此激励机制与现有的报酬分配方法进行比较，验证其公平性和有效性．

关键词：协同众包激励机制区块链聚集函数高斯混合模型 Shapley值声誉

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大坝位移性态的多模型联合预警方法

武汉大学学报（信息科学版） 2024年第2期49卷 280-290页

作者：姜振翔陈辉陈鲁皖南昌工程学院水利与生态工程学院江西南昌330099

传统方法采用单一的模型开展大坝位移性态预警,虚假警报频次较高。为提升预警结果的可靠性,提出多模型联合预警方法。以水位-温度-时效模型(hydraulic-season-time,HST)、自回归滑动平均模型(autoregressive moving average,ARMA)为研... 详细信息

传统方法采用单一的模型开展大坝位移性态预警,虚假警报频次较高。为提升预警结果的可靠性,提出多模型联合预警方法。以水位-温度-时效模型(hydraulic-season-time,HST)、自回归滑动平均模型(autoregressive moving average,ARMA)为研究对象,采用核密度估计探讨了两类模型残差的一维分布规律。在此基础上,对两类模型的联合残差进行了频率分析,发现了联合残差非尾部弱相关、尾部强相关的分布特征。采用Copula函数对HST-ARMA联合残差进行拟合,得到了联合分布函数,实现了大坝位移性态的多模型联合预警。算例表明,采用单一的HST模型或ARMA模型预警,受建模序列特征以及模型结构特征的影响,虚假警报发生率高达23.17%~27.94%。而采用HST-ARMA联合预警,能够充分结合各模型的优势,虚假警报发生率可降至0.00%~0.63%。多模型联合预警能够有效降低虚假警报的发生频次,预警结果能够更加真实地反映大坝位移性态,可为提升大坝安全管理水平提供参考。

关键词：大坝位移监控模型分布分析连接函数联合预警

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基于BERT和集成学习的抗菌肽预测

电子科技大学学报 2024年第4期53卷 635-640页

作者：高皖陵赵俊岳振宇安徽农业大学信息与人工智能学院合肥230036

利用计算方法准确识别抗菌肽是近年来生物信息学领域研究的重点问题。传统的机器学习方法需要自主从序列信息中提取和选择特征,导致抗菌肽识别准确率低。为此提出基于BERT的深度学习预测方法,从预训练策略、词向量嵌入、预测性能等方面... 详细信息

利用计算方法准确识别抗菌肽是近年来生物信息学领域研究的重点问题。传统的机器学习方法需要自主从序列信息中提取和选择特征,导致抗菌肽识别准确率低。为此提出基于BERT的深度学习预测方法,从预训练策略、词向量嵌入、预测性能等方面比较了4种现有基于BERT的抗菌肽预测模型,并基于集成学习思想提出了一个新的抗菌肽预测工具。实验结果表明,该模型在多个性能评价指标上都有所提升。

关键词：抗菌肽评估 BERT 集成学习预训练模型

不确定环境下的农业剩余物供应链网络配置优化

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不确定环境下的农业剩余物供应链网络配置优化

作者：张皖中南林业科技大学

学位级别：硕士

我国是农业大国,随着农户生产水平和农业技术水平的提升,我国每年会产生大量的农作物秸秆、畜禽粪便、农膜等农业剩余物。大量农作物秸秆就地焚烧,畜禽粪便乱排乱放,造成了严重的环境污染以及资源的浪费。近年来,国家高度重视农业剩余... 详细信息

我国是农业大国,随着农户生产水平和农业技术水平的提升,我国每年会产生大量的农作物秸秆、畜禽粪便、农膜等农业剩余物。大量农作物秸秆就地焚烧,畜禽粪便乱排乱放,造成了严重的环境污染以及资源的浪费。近年来,国家高度重视农业剩余物的循环再利用工作,加快构建农业剩余物循环利用体系。为了保障农业剩余物的有效利用,农业剩余物供应链网络的配置优化显得十分重要。农业剩余物具有季节性和地域分散等特点,导致农业剩余物回收面临着供应不确定性的挑战。与此同时,广大消费者对农业剩余物相关产品的需求量也存在变化,使供应链网络运营存在诸多阻力。如何在保障农业剩余物回收企业利益的情况下配置供应链网络是决策者需要考虑的问题。因此,本文以农业剩余物供应链网络为主要研究对象,分析供应和需求不确定环境下农业剩余物供应链网络配置优化。本文在对农业剩余物、农业剩余物供应链网络理论阐述的基础上,分析了供应和需求不确定下的农业剩余物供应链网络配置优化问题。运用实物期权和期权博弈的方法,构建了单一主体和市场竞争两种模式下的最优配置规模和时机即临界值模型,并通过具体算例对不同情形下的最优策略对比分析。结果表明:(1)供应不确定环境下,市场竞争模式的最优策略优于单一主体无竞争模式下的最优决策,市场竞争模式下配置的供应链网络规模更大,能够有效促进农业剩余物的回收再利用。但是当不确定因素发生变动时,单一主体模式则更加稳定,当波动率变化范围在[0.06,0.12]时,单一主体模式配置规模以及供应量临界值的变化率为175.92%和89.59%,而市场竞争模式下的变化率为279.95%和158.29%。(2)从需求端的角度出发,发现在竞争环境下的最优结果也优于无竞争环境下的最优配置结果。在敏感性分析中进一步探索不确定因素的影响发现,单一主体与市场模式下的最优配置规模和需求临界值与需求量增长率和波动率成正比。随着需求不确定性的增加,最优决策值也随之增加。而无风险利率则与单一主体和市场竞争模式下的最优配置策略成反比,当建设周期固定时,无风险利率的增加会导致最优策略值的减少。对不确定环境下的农业剩余物供应链网络配置优化问题的设计,能够更好地考虑现实中供应和需求不确定的条件。因此,合理配置供应链网络的规模和时机可以有效地促进农业剩余物的回收利用,减少资源浪费,给农业剩余物的回收利用提供一些决策支持和帮助。

关键词：农业剩余物供应链网络配置优化实物期权

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北斗原子钟时变特性分析与钟差预报方法研究

北斗原子钟时变特性分析与钟差预报方法研究

作者：卢玉皖安徽理工大学

学位级别：硕士