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猪促炎细胞因子多重TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用

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中国农业大学学报 2012年第2期17卷 117-123页

作者：施开创梁媛陈芳芳屈素洁莫胜兰李军广西动物疫病预防控制中心南宁530001

为建立及应用定量检测猪促炎细胞因子mRNA表达水平的方法,从分子水平研究脑心肌炎病毒(EMCV)的致病机制,分别构建含有猪促炎细胞因子IL-1β、IL-6、TNF-α以及管家基因β-actin基因片段的重组质粒标准品,建立了检测IL-1β/β-actin、IL... 详细信息

为建立及应用定量检测猪促炎细胞因子mRNA表达水平的方法,从分子水平研究脑心肌炎病毒(EMCV)的致病机制,分别构建含有猪促炎细胞因子IL-1β、IL-6、TNF-α以及管家基因β-actin基因片段的重组质粒标准品,建立了检测IL-1β/β-actin、IL-6/β-actin、TNF-α/β-actin的多重TaqMan real-time PCR检测方法。标准曲线的相关系数均达到0.998以上;初始模板的检出下限均达到10拷贝/μL;只有以目标cDNA为模板,并加入特异性引物和探针的反应才能检测到荧光信号;组内与组间的变异系数均小于2%。应用所建立的检测方法,对猪源EMCV GXLC株感染仔猪心肌中IL-1β、TNF-α、IL-6mRNA的表达水平进行检测。结果表明,所建立的多重TaqMan real-time PCR检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可以用于猪IL-1β、IL-6、TNF-α基因的检测及定量分析。

关键词：猪促炎细胞因子脑心肌炎病毒多重荧光定量RT-PCR TaqMan探针

两种血凝抑制试验检测鸡新城疫病毒抗体效价结果的比较分析

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广西畜牧兽医 1993年第4期9卷 10-12页

作者：施开创广西农业大学 530005

用常量法和微量法血凝抑制(HI)试验检测了130份鸡血清样本中的鸡新城疫病毒(NDV)抗体效价,经统计学方法分析表明,用两种方法测得的抗体效价差异不显著(P>0.05)。

关键词：鸡病新城疫病毒抗体血凝试验

猪凋亡细胞因子Fas、FasL、TNFR1和TNF-α SYBR GreenⅠ real-time PCR检测方法的建立

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中国兽医科学 2009年第10期39卷 910-916页

作者：施开创莫胜兰许瑞胜陆文俊刘棋广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001 广西大学动物科学技术学院广西南宁530005

分别针对猪凋亡细胞因子Fas、FasL、TNFR1、TNF-α基因以及看家基因β-actin的序列设计了1对特异性引物,构建含有各自引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测Fas、FasL、TNFR1、TNF-α及β-actin的SYBR GreenⅠreal-ti me PC... 详细信息

分别针对猪凋亡细胞因子Fas、FasL、TNFR1、TNF-α基因以及看家基因β-actin的序列设计了1对特异性引物,构建含有各自引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测Fas、FasL、TNFR1、TNF-α及β-actin的SYBR GreenⅠreal-ti me PCR方法。该方法线性关系好(r2≥0.995),敏感性高,初始模板的检出下限除TNFR1为1×102copies/μL外,其他均为1×101copies/μL;特异性强,扩增产物形成单一的特异性熔解峰;重复性好,组内与组间的变异系数均小于3%。应用所建立的方法对猪生殖与呼吸综合征病毒感染仔猪外周血单个核细胞中Fas、FasL、TNFR1和TNF-αmRNA的表达水平进行了检测。结果表明,建立的real-ti me PCR检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好。

关键词：猪凋亡细胞因子荧光定量PCR SYBR GreenⅠ

广西区2008-2011年猪繁殖与呼吸综合征病毒Nsp2基因的遗传变异分析

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中国兽医科学 2012年第8期42卷 784-790页

作者：赵日浪施开创林昌华赵国明何贻坚刘棋广西大学动物科学技术学院广西南宁530005 广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为了解广西壮族自治区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况,对2008-2011年间来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行Nsp2基因的扩增和测序分析。结果显示,获得的49个毒株均为美洲型,其中46株具有高致病性变异毒株的序列... 详细信息

为了解广西壮族自治区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的遗传变异情况,对2008-2011年间来自广西各地的部分PRRSV阳性病料进行Nsp2基因的扩增和测序分析。结果显示,获得的49个毒株均为美洲型,其中46株具有高致病性变异毒株的序列特征,即其Nsp2蛋白缺失第481位和第533～561位aa,其余3株不具有上述缺失,属于PRRSV传统毒株。广西区49个毒株Nsp2基因间核苷酸序列的同源性介于84.8%～99.7%,与VR-2332、CH-1a、HB-1及JXA1株核苷酸序列的同源性分别为80.5%～83.7%、89.7%～92.6%、92.4%～96.3%、92.8%～99.3%,而与LV株核苷酸序列同源性仅为51.0%～53.9%。基于Nsp2基因核苷酸序列所绘制的遗传进化树,可将所有美洲型PRRSV毒株分为4个亚群,广西区的49个毒株有3株分布在以HB-1株为代表的Ⅲ亚群,46株分布在以JXA1株为代表的Ⅳ亚群。表明,当前广西区PRRSV流行毒株均为美洲型毒株,并且以Ⅳ亚群为优势基因亚群,各毒株间的Nsp2基因序列存在一定的差异,但没有明显的地域特征。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒遗传变异 Nsp2基因

美洲型与欧洲型PRRSV多重TaqMan荧光定量RT-PCR鉴别检测方法的建立及应用

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中国兽医科学 2014年第4期44卷 412-418页

作者：官家明施开创李凤梅张步娴陈汉忠邹联斌李军广西大学动物科学技术学院广西南宁530005 广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型经典毒株、高致病性变异毒株以及欧洲型毒株基因组的序列差异,设计2对特异性引物和3条TaqMan探针,经过反应条件的优化,建立了能同时检测并区分PRRSV美洲型经典毒株、变异毒株以及欧洲型毒株的... 详细信息

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型经典毒株、高致病性变异毒株以及欧洲型毒株基因组的序列差异,设计2对特异性引物和3条TaqMan探针,经过反应条件的优化,建立了能同时检测并区分PRRSV美洲型经典毒株、变异毒株以及欧洲型毒株的多重荧光定量RT-PCR方法。该方法线性关系好,标准曲线的相关系数均达到0.999以上;特异性强,只有PRRSV出现阳性反应,而与口蹄疫病毒、猪瘟病毒、猪伪狂犬病病毒、猪细小病毒、猪圆环病毒2型均无交叉反应;敏感性高,经典毒株、变异毒株、欧洲型毒株的检出下限分别为1.13、1.37、1.39copies/μL,均比普通RT-PCR敏感100倍;重复性好,组内及组间变异系数均小于1.5%。应用所建立的方法对采集的282份临床病料进行检测,结果 PRRSV阳性101份,其中95份为变异毒株、6份为经典毒株、4份为变异毒株和经典毒株混合感染,未检测到欧洲型毒株。结果表明,本研究建立的多重TaqMan荧光定量RT-PCR方法可为PRRSV的快速鉴别诊断及流行病学调查提供有效的技术手段。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒美洲型毒株欧洲型毒株多重TaqMan荧光定量RT-PCR

新城疫病毒和传染性支气管炎病毒双重荧光定量RT-PCR检测方法的建立

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中国预防兽医学报 2014年第11期36卷 867-871页

作者：屈素洁施开创邹联斌张步娴梁媛莫胜兰粟艳琼胡杰李军广西区动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为建立鸡新城疫病毒(NDV)和鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的快速鉴别检测方法,本研究根据NDV和IBV的基因保守序列,设计了2对特异性引物和2条用不同荧光基团标记的Taq Man探针;经过对反应条件的优化,建立了能够同时检测NDV和IBV的双重荧光定... 详细信息

为建立鸡新城疫病毒(NDV)和鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的快速鉴别检测方法,本研究根据NDV和IBV的基因保守序列,设计了2对特异性引物和2条用不同荧光基团标记的Taq Man探针;经过对反应条件的优化,建立了能够同时检测NDV和IBV的双重荧光定量RT-PCR方法。该方法对NDV和IBV的检测灵敏度均为10拷贝/μL,比常规RT-PCR敏感性高100倍;该方法对禽流感病毒、传染性喉气管病病毒、鸡白血病病毒、禽呼肠弧病毒检测结果均为阴性,表明其具有良好的特异性;批内和批间重复变异系数均小于2%。利用所建立的双重荧光定量RT-PCR方法及常规RT-PCR,对185份组织样品进行检测,符合率为100%。该方法可以用于NDV和IBV的快速定量检测。

关键词：新城疫病毒传染性支气管炎病毒双重荧光定量RT-PCR

鸡传染性支气管炎病毒广西株N、M基因的克隆与序列分析

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中国畜牧兽医 2015年第12期42卷 3119-3125页

作者：屈素洁施开创粟艳琼胡杰莫胜兰张步娴李军邹联斌广西动物疫病预防控制中心南宁530001

为研究鸡传染性支气管炎病毒（IBV）广西流行株的遗传变异情况,本研究从广西发病鸡中分离鉴定了1株IBV。参照GenBank中IBV的核苷酸序列设计2对引物,利用RT-PCR技术对分离毒株的N、M基因进行了克隆、序列测定,并与GenBank中发表的国内外... 详细信息

为研究鸡传染性支气管炎病毒（IBV）广西流行株的遗传变异情况,本研究从广西发病鸡中分离鉴定了1株IBV。参照GenBank中IBV的核苷酸序列设计2对引物,利用RT-PCR技术对分离毒株的N、M基因进行了克隆、序列测定,并与GenBank中发表的国内外参考毒株进行比对分析。结果显示,N基因序列全长为1 230bp,编码409个氨基酸,M基因序列全长为678bp,编码225个氨基酸。与参考毒株相比,分离株的N基因核苷酸序列同源性为87.2%~93.3%,推导的氨基酸序列同源性为90.0%~94.4%;M基因的核苷酸序列同源性为83.6%~91.0%,推导的氨基酸序列同源性为82.7%~92.9%。在遗传进化树中,本试验分离株Guangxi156株与BJ株和LX4株两个参考株位于同一个分支上,亲缘关系较近,而与其他参考株属于不同的分支,亲缘关系较远。结果表明,本试验分离株是一株新的IBV变异株。

关键词：鸡传染性支气管炎病毒 N基因 M基因基因克隆序列分析

猪源脑心肌炎病毒GXLC株对仔猪的致病性试验

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中国兽医科学 2012年第2期42卷 138-143页

作者：施开创胡丽萍郑敏粟艳琼陆文俊杨荣广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为研究猪源脑心肌炎病毒(EMCV)GXLC株对仔猪的致病性,将其接种4周龄健康断乳仔猪,观察临床症状及病理变化,检测心、脑、脾组织及血清中的病毒含量,测定血清抗体效价,检测心、脑、脾组织中IL-1β、TNF-α、IL-6mRNA的表达水平。结果显示... 详细信息

为研究猪源脑心肌炎病毒(EMCV)GXLC株对仔猪的致病性,将其接种4周龄健康断乳仔猪,观察临床症状及病理变化,检测心、脑、脾组织及血清中的病毒含量,测定血清抗体效价,检测心、脑、脾组织中IL-1β、TNF-α、IL-6mRNA的表达水平。结果显示,仔猪感染后,出现体温升高、精神不振、腹泻等症状;剖检发现心包积液,心脏变软,脑充血;组织病理学观察发现心肌炎、脑炎,病理炎症分值显著提高;心、脑、脾、血清中均可检测到大量病毒;血清中出现高效价的中和抗体;感染仔猪心、脑、脾组织中IL-1β、TNF-α、IL-6mRNA的表达水平显著上调,而且细胞因子的表达高峰期与出现临床症状、病理损害的时间密切相关。表明,猪源EMCV GXLC株对仔猪具有致病性,IL-1β、TNF-α、IL-6等促炎细胞因子在EMCV对仔猪的致病过程中发挥重要作用。

关键词：猪源脑心肌炎病毒致病性促炎细胞因子仔猪

山羊痘病毒SERPIN蛋白抑制宿主细胞凋亡活性的鉴定

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中国兽医科学 2013年第1期43卷 15-21页

作者：郑敏梁媛韦显凯刘棋莫胜兰施开创李春艳郑列丰李军广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001 新乡市动物卫生监督所河南新乡453003

采用PCR扩增长为1 041bp的山羊痘病毒(GTPV)serpin基因,构建真核表达质粒pcDNA-Ser-pin;将其转染HeLa细胞,经G418筛选,克隆纯化、鉴定,获得1株稳定表达GTPV SERPIN蛋白的HeLa细胞株;然后通过检测凋亡诱导剂TNF-α和放线菌酮作用后的细... 详细信息

采用PCR扩增长为1 041bp的山羊痘病毒(GTPV)serpin基因,构建真核表达质粒pcDNA-Ser-pin;将其转染HeLa细胞,经G418筛选,克隆纯化、鉴定,获得1株稳定表达GTPV SERPIN蛋白的HeLa细胞株;然后通过检测凋亡诱导剂TNF-α和放线菌酮作用后的细胞形态学变化、细胞活力和caspase活性,对GTPV SERPIN蛋白抑制宿主细胞凋亡的活性进行了鉴定。序列分析结果表明,GTPV SERPIN与正痘病毒SPI-1和SPI-2的氨基酸序列同源性为36%～38%;与痘苗病毒SPI-2空间构型相近,VADC基序和P1氨基酸(天门冬氨酸)相同。细胞试验结果显示,GTPV SERPIN蛋白能抑制由TNF-α和放线菌酮诱导的细胞凋亡,抑制率达70%左右,且这种抑制作用与其下调细胞caspase-8活性有关。证实GTPV SERPIN能抑制宿主细胞凋亡,可能是GTPV的致病因子之一。

关键词：山羊痘病毒 SERPIN蛋白细胞凋亡