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长江中华绒螯蟹资源联动修复模式构建与应用

中国水产 2024年第3期580卷 56-61页

作者：冯广朋庄平赵峰陈宇顺方弟安王思凯中国水产科学研究院东海水产研究所中国科学院水生生物研究所中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

根据中华绒螯蟹生活史、资源现状和生境需求,围绕长江口、干流和湖泊三个重要栖息生境,项目团队开展了深入系统的生境修复和资源养护工作,构建了“三区联动(河口—干流—湖泊)、五位一体(生境重建+生境修复+自然恢复+资源增殖+综合管控... 详细信息

根据中华绒螯蟹生活史、资源现状和生境需求,围绕长江口、干流和湖泊三个重要栖息生境,项目团队开展了深入系统的生境修复和资源养护工作,构建了“三区联动(河口—干流—湖泊)、五位一体(生境重建+生境修复+自然恢复+资源增殖+综合管控)”的生境修复与资源养护联动模式,促进长江中华绒螯蟹天然资源恢复,个体规格、雌雄比例、分布密度等资源特征指标均有提升,取得显著成效。

关键词：项目团队生境修复中华绒螯蟹三区联动天然资源资源增殖生境重建雌雄比例

基于SSR标记的钱塘江中下游三角鲂4个放流苗种群体遗传多样性和遗传结构检测

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中国农学通报 2024年第13期40卷 157-164页

作者：张敏莹方弟安周彦锋匡箴任泷郑宇辰徐东坡中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

为检测钱塘江中下游三角鲂放流苗种群体遗传多样性和遗传结构,采用毛细管电泳基因分型技术,基于9对荧光标记SSR引物对来自4个放流苗种群体的192尾样本进行扩增和基因分型测序。结果表明,各群体单个位点检测到的等位基因数Na均值为(20±2... 详细信息

为检测钱塘江中下游三角鲂放流苗种群体遗传多样性和遗传结构,采用毛细管电泳基因分型技术,基于9对荧光标记SSR引物对来自4个放流苗种群体的192尾样本进行扩增和基因分型测序。结果表明,各群体单个位点检测到的等位基因数Na均值为(20±2)~(24±2),有效等位基因数Ne均值为(10.76±1.51)~(13.66±1.33),其中余杭群体等位基因数Na和有效等位基因数Ne最大,建德和桐庐群体的这2项指标大体相当;4个群体Shannon’s信息指数I均值为(2.55±0.13)~(2.83±0.09);4个群体观测杂合度Ho均值为(0.83±0.08)~(0.94±0.03),期望杂合度He均值为(0.88±0.02)~(0.92±0.01),绝大多数位点表现出杂合子过剩;余杭、建德、桐庐、富阳各群体的私有等位基因数依次为54、9、15、17个;4个放流三角鲂苗种群体遗传多样性处于较高水平,部分群体出现了杂合子过剩和等位基因丢失现象。分子方差分析显示,98.7%的遗传变异来自群体内的个体间,1.3%遗传变异来自群体间,4个放流群体间遗传分化指数为0.013~0.017,遗传分化很小(0

关键词：三角鲂放流苗种群体微卫星遗传多样性遗传结构

基于离散SNP标记解析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)对水温和盐度的适应性

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基因组学与应用生物学 2022年

作者：罗慧匡箴罗颖祁洪芳方弟安中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室青海湖裸鲤救护中心青海省青海湖裸鲤繁育与保护重点实验室上海海洋大学水产与生命学院

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境，为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制，采用基因分型测序(genotyping by sequencing， GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散SNP(single ... 详细信息

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境，为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制，采用基因分型测序(genotyping by sequencing， GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散SNP(single nucleotide polymorphism， SNP)标记筛选，探讨其可能受到自然选择作用的相关SNP标记，并对离散SNP标记所在序列进行序列比对及功能注释。研究共得到1 566个高度变异的适应性离散位点，分别有391条、26条和96条序列的功能在NR、GO和KEGG数据库得到注释。NR注释显示，相似比例序列所占比例最高的前2种物种分别是鱇浪白鱼(Anabarilius graham )和鲤(Cyprinus carpio )。GO注释分析发现，注释到细胞过程(Cellular process)、代谢过程(Metabolic process)和结合(Binding)的contigs较多。KEGG注释分析显示，注释到代谢通路(metabolic pathways)和神经活性配体-受体相互作用信号通路(Neuroactive ligand-receptor interaction)的contigs最多，其中，注释到代谢通路的基因包括ctu1、cps1、gba2、acyl-CoA、fasn、plcg1、adgre1等，我们推测这些基因与青海湖裸鲤的本地适应性相关。研究结果证明青海湖裸鲤可能形成了与温度、盐度等环境因子相关的本地适应性现象，研究结果为进一步深入探讨青海湖裸鲤的本地适应性机制提供了技术方法和数据支撑。

关键词：青海湖裸鲤简化基因组测序离散SNP标记功能注释本地适应性

淮河荆涂峡鲤、长吻鮠国家级水产种质资源保护区生态健康评价

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南方水产科学 2023年第1期19卷 30-38页

作者：王东伟陈永进方弟安周彦锋南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081

评价水域生态健康状况可判别水生态恢复成效,是水环境管理的有效手段。为探究淮河荆涂峡鲤(Cyprinus carpio)、长吻鮠(Leiocassis longirostris)国家级水产种质资源保护区的水生态健康状况,根据2020年浮游植物群落结构的调查结果,结合... 详细信息

评价水域生态健康状况可判别水生态恢复成效,是水环境管理的有效手段。为探究淮河荆涂峡鲤(Cyprinus carpio)、长吻鮠(Leiocassis longirostris)国家级水产种质资源保护区的水生态健康状况,根据2020年浮游植物群落结构的调查结果,结合形态功能群分类法,构建了基于浮游植物生物完整性指数的保护区生态健康评价体系。选择受干扰较小的采样点为参照点,对候选参数进行非参数检验和相关性分析,确定最终的评价参数,采用比值法确定分级评价标准,对保护区水体进行健康评价。结果显示,浮游植物优势功能群演变趋势为Ⅲ+Ⅳ+Ⅴ(春季)→Ⅲ+Ⅳ+Ⅴ+Ⅵ(夏季)→Ⅴ+Ⅵ(秋季)→Ⅳ+Ⅴ+Ⅵ(冬季),除核心区的优势功能群为Ⅲ+Ⅳ+Ⅴ+Ⅵ外,实验区、涡河和淮河干流优势功能群均为Ⅲ+Ⅳ+Ⅴ+Ⅵ。保护区68.06%的样点评价结果为“一般”及以上,总体水生态健康状况良好,具体表现为冬季优于秋季、夏季次之、春季最差的时间格局,以及淮河干流优于涡河、实验区优于核心区的空间格局。

关键词：种质资源保护区浮游植物水生态健康评价生物完整性指数 MBFG分类法

长江下游四大家鱼仔稚鱼时空分布特征及影响因子分析

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长江流域资源与环境 2023年第3期32卷 478-486页

作者：丁隆强黎加胜徐东坡方弟安任鹏中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室江苏无锡214081 南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081

为探究长江下游安庆-南通江段四大家鱼仔稚鱼资源的时空分布特征,于2019年4至8月在长江下游安庆、南京和南通江段逐月开展四大家鱼仔稚鱼的空间分布和动态资源调查。结果显示,共采集产漂流性卵鱼类仔稚鱼107990尾,隶属于2目2科19种,其... 详细信息

为探究长江下游安庆-南通江段四大家鱼仔稚鱼资源的时空分布特征,于2019年4至8月在长江下游安庆、南京和南通江段逐月开展四大家鱼仔稚鱼的空间分布和动态资源调查。结果显示,共采集产漂流性卵鱼类仔稚鱼107990尾,隶属于2目2科19种,其中四大家鱼972尾,以鲢(Hypophthalmichthys molitrix)为主,占家鱼捕获量67.28%。各江段四大家鱼仔稚鱼平均丰度依次为2.57、0.90和0.60 ind./100 m^(3),家鱼仔稚鱼资源自安庆向南通方向逐渐减少;安庆江段5月和7月仔稚鱼平均密度显著高于其他月份,南京和南通江段高峰期发生在6月。Kruskal-Wallis检验表明各江段四大家鱼仔稚鱼的水平分布存在差异,具体表现为近岸仔稚鱼密度显著高于江心。Pearson检验分析显示,调查期间安庆江段四大家鱼仔稚鱼日丰度与水温和水位日上涨率呈显著正相关(P<0.05);南京江段家鱼仔稚鱼日丰度与水温和水流量日上涨率均呈显著正相关(P<0.05);南通江段家鱼仔稚鱼日丰度与水位和水流量日上涨率呈显著正相关(P<0.05)。研究结果揭示了长江下游四大家鱼仔稚鱼的时空格局及与水文环境因子的相关性,阐明江湖连通系统对家鱼早期资源补充具有重要作用,研究结果可为保护长江家鱼补充群体和修复洲滩和沿江岸线等鱼类重要栖息地提供支撑。

关键词：长江下游四大家鱼仔稚鱼时空分布影响因子

基于离散SNP位点解析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)对水温和盐度的适应性

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基因组学与应用生物学 2023年第1期42卷 25-33页

作者：罗慧匡箴罗颖祁洪芳方弟安中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部淡水渔业和种质资源利用重点实验室无锡214081 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 青海湖裸鲤救护中心青海省青海湖裸鲤繁育与保护重点实验室西宁810016

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态... 详细信息

青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点筛选,探讨其可能受到自然选择作用的相关SNP位点,并对离散SNP位点所在contigs进行序列比对及功能注释。研究共得到1 566个高度变异的适应性离散SNP位点。NR(non-redundant protein sequences)注释显示,相似比例序列所占比例最高的前两个物种分别是鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)和鲤(Cyprinus carpio)。GO注释分析发现,注释到细胞过程、代谢过程和结合的contigs较多。KEGG注释分析显示,注释到代谢通路和神经活性配体-受体相互作用通路的contigs最多,其中,注释到代谢通路的基因包括ctu1、cps1、gba2、fasn和plcg1等,推测这些基因与青海湖裸鲤的本地适应性相关。研究结果证明青海湖裸鲤可能形成了与温度、盐度等环境因子相关的本地适应性机制,研究结果为进一步深入探讨青海湖裸鲤的本地适应性机制提供了技术方法和数据支撑。

关键词：青海湖裸鲤基因分型测序离散SNP位点功能注释本地适应性

江下游安庆段鳜属(Siniperca)仔稚鱼时空特征及影响因子

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大连海洋大学学报 2022年

作者：黎加胜方弟安徐东坡唐阅丁隆强黄中家任鹏上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心南京农业大学无锡渔业学院中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站中国农业科学研究院研究生院

为了解长江安庆段鳜属(Siniperca)鱼类早期资源现状，探究鳜属仔稚鱼时空特征及影响因子，于2018—2020年4—8月在该江段开展鱼类早期资源调查。结果表明：3年间鳜属仔鱼的首次出现时间分别为4月29日、4月30日、5月5日，早期资源发生的...

为了解长江安庆段鳜属(Siniperca)鱼类早期资源现状，探究鳜属仔稚鱼时空特征及影响因子，于2018—2020年4—8月在该江段开展鱼类早期资源调查。结果表明：3年间鳜属仔鱼的首次出现时间分别为4月29日、4月30日、5月5日，早期资源发生的时间有所延迟；各年仔稚鱼累计出现时间分别为44天、54天、68天，出现频率分别达到40.74%、55.67%、69.39%，累计采集数量依次为175、313、404尾，均呈现出逐年上升的趋势；每年仔稚鱼高峰期的出现时间分别为7月14日—8月6日、7月16日—7月27日及6月18日—7月20日，对应平均丰度依次为0.073、0.051、0.044 ind./m；受水文动力影响仔稚鱼漂流密度的空间分布存在差异，整体呈现出左岸 (0.056 ind./m) ＞右岸 (0.046 ind./m) ＞江心 (0.026 ind./m) 的特征；相关性分析显示，仔稚鱼丰度变化同流量、水位以及水温均呈显著正相关(P＜0.05)，与透明度呈显著负相关(P＜0.05)，仔稚鱼丰度的时间动态特征同流量及水温的季节变动模式相一致。研究表明，调查期间鳜属鱼类繁殖产卵的最适水温为25.6～29.2℃，水温梯度改变刺激了其繁殖事件的发生，仔稚鱼绝对数量的逐年增多反映出安庆江段鳜属鱼类的年际补充量得到稳步提升，资源恢复的形势向好。

关键词：

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长江下游苏通江段刀鲚产卵场的初步研究

水产学报 2022年第8期46卷 1377-1388页

作者：薛向平彭云鑫方弟安徐东坡王小豪任可成上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业农村部长江下游渔业资源环境科学观测实验站南京农业大学无锡渔业学院

为揭示苏通江段刀鲚早期资源的时空分布情况，本实验于2018—2020年每年5～8月对该江段累计进行84 d的早期资源调查。调查期间共采集到刀鲚受精卵646枚，其中2019年采集到328枚，占总数的50.77%；其中在4月没有采集到刀鲚受精卵，5和6... 详细信息

为揭示苏通江段刀鲚早期资源的时空分布情况，本实验于2018—2020年每年5～8月对该江段累计进行84 d的早期资源调查。调查期间共采集到刀鲚受精卵646枚，其中2019年采集到328枚，占总数的50.77%；其中在4月没有采集到刀鲚受精卵，5和6月采集到刀鲚受精卵的平均丰度均显著高于其他采集月份，各年采集到刀鲚受精卵峰值分别出现在5月15日(4.96枚/100 m~3),6月16日(26.48枚/100 m~3),5月24日(26.11枚/100 m~3)。Pearson相关性分析显示，各采样断面空间分布存在显著性差异，平均丰度分布江左岸(1.42枚/100 m~3)>江右岸(0.87枚/100 m~3)>江心(0.69枚/100 m~3)；苏通江段下游S1(崇明岛绿华镇水域)和S2(海门市新通海沙水域)、中游S5(南通港闸区水域)和上游S8(如皋长青沙典园水域)采集到刀鲚受精卵的平均丰度和频次均显著高于其他采集断面；环境因子分析显示，刀鲚受精卵丰度与温度呈极显著负相关，在水温21.1～25.3°C、溶氧6.80～7.41 mg/L范围内采集到刀鲚受精卵的丰度较高。结果表明，5和6月为长江苏通江段刀鲚产卵高峰期，在水温21.1～25.3°C、溶氧6.80～7.41 mg/L范围内适宜刀鲚产卵，推测崇明岛绿华镇、海门市新通海沙、南通港闸区和如皋长青沙典园附近水域为刀鲚的潜在产卵场。本研究调查数据为开展刀鲚资源修复提供基础数据和参考。

关键词：刀鲚产卵场苏通江段鱼类早期资源时空分布

长江如皋段的浮游动物群落结构及其与水环境因素的关系

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湿地科学 2023年第4期21卷 555-563页

作者：孙海博王小豪何苗方弟安周天鹏南京农业大学无锡渔业学院江苏无锡214081 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心江苏无锡214081

为了解长江如皋段水体中浮游动物群落的结构,在长江如皋段长青沙岛和民主沙岛附近水域中,共布设9个采样断面、22个采样点,分别于2021年5月、6月和7月中旬,开展了浮游动物野外调查,采集了浮游动物和江水样品,并进行了浮游动物物种鉴定和... 详细信息

为了解长江如皋段水体中浮游动物群落的结构,在长江如皋段长青沙岛和民主沙岛附近水域中,共布设9个采样断面、22个采样点,分别于2021年5月、6月和7月中旬,开展了浮游动物野外调查,采集了浮游动物和江水样品,并进行了浮游动物物种鉴定和水样测试分析;利用Shannon-Wiener指数、Pielou均匀度指数、Simpson优势度指数和Margalef丰富度指数,研究长江如皋段中的浮游动物群落的多样性;采用单因素方差分析方法,分析各采样日水体理化指标值的差异性;采用相关分析方法,分析浮游动物密度值、生物量值与水体理化指标值的关系;采用典范对应分析方法,分析17种浮游动物生物量与水体理化指标值的关系。研究结果表明,调查期间,在长江如皋段,共记录浮游动物30属39种,其中,枝角类的物种数量最多,浮游动物群落有8种优势物种;长江如皋段的浮游动物群落的多样性水平总体较高,5月和7月采样日浮游动物群落的多样性水平高于6月采样日;浮游动物密度以原生动物密度和轮虫密度为主,6月采样日的浮游动物密度明显偏大;浮游动物生物量以轮虫生物量和枝角类生物量为主,6月采样日的浮游动物生物量明显大于5月和7月采样日;水体中的总磷含量、磷酸盐含量和氨氮含量是影响浮游动物密度和生物量的主要影响因素。

关键词：浮游动物群落结构环境因素长江如皋段