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基于网络药理学和分子对接探讨“酸枣仁-石菖蒲”药对改善小鼠失眠的机制

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中国现代应用药学 2023年第14期40卷 1917-1925页

作者：陈倩倩徐佳禛王长江嘉兴市第二医院药学部浙江嘉兴314000

目的利用网络药理学和分子对接探究酸枣仁-石菖蒲药对改善失眠的物质基础和潜在分子机制,并建立对氯苯丙氨酸(p-chlorophenylalanine,PCPA)诱导的失眠小鼠模型进行体内实验验证。方法首先通过TCMSP数据库收集酸枣仁和石菖蒲的化学成... 详细信息

目的利用网络药理学和分子对接探究酸枣仁-石菖蒲药对改善失眠的物质基础和潜在分子机制,并建立对氯苯丙氨酸(p-chlorophenylalanine,PCPA)诱导的失眠小鼠模型进行体内实验验证。方法首先通过TCMSP数据库收集酸枣仁和石菖蒲的化学成分并筛选得到潜在活性成分及其靶点;在Gene Cards、OMIM和TTD数据库中获得失眠相关的基因,取得酸枣仁-石菖蒲药对和失眠疾病的交集靶点,然后在Cytoscape 3.6.1软件中构建中药-化合物-靶点-疾病网络图;利用STRING数据库建立蛋白相互作用网络图;借助DAVID数据库进行靶点GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;接着采用分子对接技术进行初步验证;ICR雄性小鼠60只随机分为正常组,模型组,酸枣仁-石菖蒲高、中、低剂量组(8.0,4.0,2.0 g·kg^(–1)),地西泮组(3 mg·kg^(–1));除正常组外,第1天和第2天腹腔注射PCPA(30 mg·mL^(–1))建立失眠模型;然后连续给药7 d,正常组和模型组小鼠灌胃等体积生理盐水。测定戊巴比妥钠阈上剂量(55 mg·kg^(–1))所致的小鼠睡眠潜伏期和持续期,行为学中旷场实验的垂直得分和水平得分,以及高架十字迷宫的进入开放臂次数百分比(open arm entry,OE%)和开臂活动百分比(open arm time,OT%);利用HE染色观察脑组织病理学情况;通过ELISA法检测各组小鼠血清中TNF-α和CASP3表达水平;最后利用Western blotting法检测各组小鼠脑组织中AKT1和p-AKT1蛋白的表达情况。结果筛选获得酸枣仁和石菖蒲的潜在活性成分为9个和5个,与失眠共同靶点为34个;GO富集分析结果共得到160条GO分析条目,KEGG通路分析发现信号通路主要与炎症信号通路有关,其中AKT1、CASP3和TNF为关键靶点;分子对接结果显示筛选得到的化合物与关键靶点具有较高的结合活性。动物实验结果显示酸枣仁-石菖蒲药对可显著缩短失眠模型小鼠睡眠潜伏期,延长睡眠持续期,降低垂直得分和水平得分,提高OE%和OT%,恢复海马组织病理损伤,显著降低TNF-α和CASP3的含量,提高AKT1蛋白在脑组织中的表达水平。结论酸枣仁-石菖蒲可通过作用于TNF-α、CASP3、AKT1、p-AKT1等靶点调节TNF信号通路发挥治疗失眠的作用。

关键词：酸枣仁石菖蒲失眠网络药理学分子对接

溴化咪唑类离子液体对胞嘧啶结构和性质影响的计算研究

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环境科学学报 2018年第10期38卷 4113-4123页

作者：徐佳禛牟永晓曹建平王朝杰温州医科大学药学院温州325035

离子液体被称为绿色溶剂得到广泛的应用,但离子液体并非完全无毒性,其中关于离子液体基因毒性的相关实验报道不少.本文运用密度泛函理论M06-2X和ωB97XD方法在6-311++G(2d,p)基组水平,对阳离子(C_(2/4)mim^+)、阴离子(Br^-)、离子液体([... 详细信息

离子液体被称为绿色溶剂得到广泛的应用,但离子液体并非完全无毒性,其中关于离子液体基因毒性的相关实验报道不少.本文运用密度泛函理论M06-2X和ωB97XD方法在6-311++G(2d,p)基组水平,对阳离子(C_(2/4)mim^+)、阴离子(Br^-)、离子液体([C_(2/4)mim]Br)与胞嘧啶(C)作用体系的几何结构、能量学特征、谱学性质和电子结构等进行计算研究.两种方法计算得到5种最稳定结构C-C_2mim-1、C-C_4mim-1、C-Br-1、C_21和C_41,经BSSE校正后的结合能分别为-99.1(-103.9)、-99.6(-104.3)、-102.2(-99.3)、-97.3(-100.7)和-104.5(-105.6)kJ·mol^(-1),体系中胞嘧啶变形能在2.8~6.9 kJ·mol^(-1)范围内.复合物中胞嘧啶的C2=O7和N1―H键的伸缩振动频率均发生一定程度的红移.分子中的原子理论(Atoms in molecule)得到阳离子、阴离子、离子液体与胞嘧啶作用以静电作用为主.自然键轨道分析(Natural bond orbitals)表明C_21和C_41的稳定化能主要来源于LP Br→BD~* N1—H、LP Br→BD~* N1―C2和LP O7→BD~* C2―H之间的相互作用.极化连续介质模型(Polarizable continum model)计算表明水溶液环境可削弱溴化咪唑类离子液体对胞嘧啶结构和性质的影响.

关键词： M06-2X ωB97XD 胞嘧啶溴化咪唑类离子液体溶剂化效应

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噻替哌和替哌水解机理的计算研究

噻替哌和替哌水解机理的计算研究

治疗药物监测信息化管理体系的构建与应用成效

中国化学会第30届学术年会-第十九分会：化学中的量子与经典动力学

作者：徐佳禛李慧丹王燕妮王朝杰温州医科大学药学院

噻替哌和替哌是临床上广泛使用的广谱抗肿瘤药物,其分子结构见Fig.1。在CAM-B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平上优化了[Thiotepa(Tepa)-nHO](n=1,4)反应过程中反应物、中间体、过渡态及产物的几何构型,并对各个过渡态和中间体进行了振动分... 详细信息

噻替哌和替哌是临床上广泛使用的广谱抗肿瘤药物,其分子结构见Fig.1。在CAM-B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平上优化了[Thiotepa(Tepa)-nHO](n=1,4)反应过程中反应物、中间体、过渡态及产物的几何构型,并对各个过渡态和中间体进行了振动分析确认其真实性。同时,结合极化连续介质模型(PCM)研究Thiotepa(Tepa)在水环境中的水解反应过程并与真空环境中的计算结果进行比较。结果表明:两条水解途径和两种水解环境中的作用模式相似,最显著的结构变化发生在与P原子相连的三个氮杂环丙烷上。对于单分子水参与的水解反应,Thiotepa(Tepa)的第二步水解为限速步骤,其能垒分别为54.3和220.9 kJ·mol,速率常数为1.07×10和1.45×10s,与文献在B3LYP/6-311++G(d,p)水平上计算结果一致。对于四分子水参与的水解反应,噻替哌限速步骤的能垒比单分子水参与的限速能垒高138.4 kJ·mol,不利于噻替哌水解.但替哌限速步骤的能垒则比单分子水参与的限速步骤能垒低43.7 kJ·mol,说明四分子水参与反应有利于替哌的水解.

关键词：噻替哌替哌密度泛函水解

来源： cnki会议评论

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中国临床药学杂志 2023年第8期32卷 584-588页

作者：徐佳禛王长江李旭梅浙江省嘉兴市第二医院药学部嘉兴314000

目的探讨临床药师参与的治疗药物监测(TDM)信息化管理体系的构建及应用成效。方法药学部联合医务科、信息科通过对HIS系统的改造,建立信息化的TDM管理模块,该模块涉及住院医师工作站、医师手机端App和临床药师工作站。比较TDM信息化管... 详细信息

目的探讨临床药师参与的治疗药物监测(TDM)信息化管理体系的构建及应用成效。方法药学部联合医务科、信息科通过对HIS系统的改造,建立信息化的TDM管理模块,该模块涉及住院医师工作站、医师手机端App和临床药师工作站。比较TDM信息化管理体系实施前(2021年)与实施后(2022年)的临床药师TDM干预率、干预成功率、血药浓度达标率及临床满意度。结果TDM信息化管理体系实施后,临床药师TDM干预率由实施前的40.6%升至100.0%,血药浓度达标率由实施前的59.4%上升至77.0%,差异均具有统计学意义(P<0.05);临床药师TDM干预成功率与实施前均在80%左右,且差异无统计学意义。医师对TDM模块和对临床药师解读报告的专业水平满意度较高。结论TDM信息化管理体系的实施,可有效提高临床药师TDM干预率和血药浓度达标率,有助于提高药物治疗的有效性和安全性。

关键词：治疗药物监测信息化管理体系应用成效

基于密度泛函理论研究噻替哌和替哌水解反应机理

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计算机与应用化学 2017年第7期34卷 521-527页

作者：徐佳禛李慧丹牟永晓王朝杰温州医科大学药学院浙江温州325035

运用DFT中的CAM-B3LYP方法并结合PCM在6-311++G(d,p)基组水平计算研究[Thiotepa(Tepa)-n H_2O](n=1,4)在气相和水相中水解反应的反应物、中间体、过渡态及产物几何结构、势能曲线和电子结构。结果表明:气相中Thiotepa(Tepa)-1H_2O第二... 详细信息

运用DFT中的CAM-B3LYP方法并结合PCM在6-311++G(d,p)基组水平计算研究[Thiotepa(Tepa)-n H_2O](n=1,4)在气相和水相中水解反应的反应物、中间体、过渡态及产物几何结构、势能曲线和电子结构。结果表明:气相中Thiotepa(Tepa)-1H_2O第二步水解过程(X-COM1-2-H_2O→X-TS1-2)为限速步骤,能垒为227.4(206.3)k J?mol-1,速率常数分别为9.30×10-29和4.83×10-25 s-1。气相中Thiotepa(Tepa)-4H_2O水解反应的限速步骤速率常数比Thiotepa(Tepa)-1H_2O增大了1.98×103-4.59×105倍,表明增加第一溶剂层后Thiotepa(Tepa)水解速率加快。考虑远程溶剂化效应后,Thiotepa(Tepa)-1H_2O水解反应限速步骤的活化能垒降低了16.2和21.4 k J?mol-1,而Thiotepa(Tepa)-4H_2O反应限速步骤能垒增加了24.4和35.7 k J?mol-1,水解难度增加,但两种水解途径的氢键复合物及产物能量均降低,热力学有利。气相和水相中的计算结果均表明噻替哌能垒比替哌高,与实验测定水解结果一致。氢键复合物电子密度拓扑分析表明在X—H···Y体系中氢键强度为O···H>Nleaving···H>S···H。

关键词：噻替哌替哌水解反应密度泛函理论电子密度拓扑分析

不同环境对二苯甲酮单重态和三重态结构及性质的影响

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温州医科大学学报 2017年第6期47卷 406-411页

作者：李慧丹徐佳禛牟永晓王朝杰温州医科大学药学院浙江温州325035

目的:分析二苯甲酮(BP)单重态和三重态在气相和溶剂相(环己烷、氯仿、乙醚、乙醇)中的结构和谱学性质变化。方法:采用密度泛函理论和含时密度泛函方法在CAM-B3LYP/6-311++G(d,p)基组水平下计算分析BP的几何结构、紫外吸收光谱和红外光谱... 详细信息

目的:分析二苯甲酮(BP)单重态和三重态在气相和溶剂相(环己烷、氯仿、乙醚、乙醇)中的结构和谱学性质变化。方法:采用密度泛函理论和含时密度泛函方法在CAM-B3LYP/6-311++G(d,p)基组水平下计算分析BP的几何结构、紫外吸收光谱和红外光谱,并运用极化连续介质模型考察溶剂效应。结果:BP的单重态和三重态都是非平面对称分子;单重态紫外吸收峰有2个,其中最大吸收波长λmax随溶剂极性的增大而红移;三重态吸收峰比单重态多一个,吸收强度减小。红外光谱中单重态的νC=O随着溶剂极性的增大向低波数方向移动;三重态中νC=O消失,出现一个νC-O和νC-C的混合振动峰以及C-H弯曲振动峰。结论:随着溶剂极性的增大,单重态λmax和νC=O红移,三重态紫外吸收峰均发生不同程度的红移,但三重态的几何构型及红外振动峰变化不明显。

关键词：二苯甲酮密度泛函理论紫外吸收光谱红外光谱

四种抗非小细胞肺癌药的谱学性质及其概念密度泛函分析

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计算机与应用化学 2017年第10期34卷 749-758页

作者：王燕妮黄鹏李慧丹徐佳禛王朝杰温州医科大学附属第三医院药学部浙江温州325200 温州医科大学药学院浙江温州325000

吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼和阿法替尼是四个相继被批准上市的用于治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)。本工作采用B3LYP/6-311++G^(**)水平对上述四种EGFR-TKIs进行结构优化,并计算了它们的红... 详细信息

吉非替尼、厄洛替尼、埃克替尼和阿法替尼是四个相继被批准上市的用于治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)。本工作采用B3LYP/6-311++G^(**)水平对上述四种EGFR-TKIs进行结构优化,并计算了它们的红外、核磁共振谱和紫外-可见光谱,分析比较出几何结构的差异对谱学性质的影响。此外,通过概念密度泛函理论(CDFT)探讨分析四种化合物的化学性质。研究结果表明,喹唑啉环侧链的不同主要影响碳原子的化学位移值;第二代EGFR-TKIs阿法替尼与第一代相比,具有共轭结构多、电负性高和亲电指数大的特点。

关键词： EGFR-TKIs CDFT 红外核磁紫外-可见

以“两个毫不动摇”为保障推进中国式现代化的政治经济学阐释

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社会科学辑刊 2024年第5期 31-39页

作者：李政周希禛辽宁大学经济学院湖南湘江研究院

“两个毫不动摇”是坚持和完善社会主义基本经济制度、构建高水平社会主义市场经济体制的必然要求,是“两个结合”的重要成果和中国特色社会主义道路的主要特征,也是中国经济快速发展和社会长期稳定的重要法宝,为实现中国式现代化奠定... 详细信息

“两个毫不动摇”是坚持和完善社会主义基本经济制度、构建高水平社会主义市场经济体制的必然要求,是“两个结合”的重要成果和中国特色社会主义道路的主要特征,也是中国经济快速发展和社会长期稳定的重要法宝,为实现中国式现代化奠定了坚实的物质基础并提供了强有力的制度保障。坚持和落实“两个毫不动摇”,促进各种所有制经济优势互补、共同发展,实现“国民共进”,是中国式现代化具有现代化一般特征和以人民为中心等中国特色的必要条件。为实现中国经济高质量发展,要进一步全面深化改革,创造更加公平、更有活力的市场环境,保证各种所有制经济依法平等使用生产要素、公平参与市场竞争、同等受到法律保护,不断完善落实“两个毫不动摇”的体制和机制。

关键词： “两个毫不动摇” 中国式现代化高水平社会主义市场经济体制社会主义基本经济制度

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基于网络药理学对虎杖作用于非小细胞肺癌机制研究

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新中医 2022年第11期54卷 171-178页

作者：陶静查丽计建军徐佳禛姜宁华王长江嘉兴市第二医院药学部浙江嘉兴314000

目的:基于网络药理学的方法探索虎杖中对非小细胞肺癌(NSCLC)有治疗作用的有效成分及其可能的机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中筛选虎杖的有效成分、预测药物靶点;在在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物靶标数据... 详细信息

目的:基于网络药理学的方法探索虎杖中对非小细胞肺癌(NSCLC)有治疗作用的有效成分及其可能的机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中筛选虎杖的有效成分、预测药物靶点;在在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物靶标数据库(TTD)、GeneCards和DrugBank等数据库中检索NSCLC的相关靶点;对虎杖药物靶点和NSCLC疾病靶点取交集,利用String蛋白数据库平台绘制蛋白互作(PPI)网络图,导入至Cytoscape 3.8.0软件中进行分析获得潜在核心靶点,AutoDockTools软件对有效成分和核心潜在靶点进行分子对接验证;在Metascape基因功能分析网站中对潜在核心靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:获得虎杖有效成分18个,药物靶点296个,虎杖对NSCLC的潜在核心靶点179个。网络分析显示虎杖作用于NSCLC的关键有效成分包括白藜芦醇、槲皮素、芹菜素、木犀草素和大黄素,关键靶点包括p53肿瘤蛋白(TP53)、v-AKT鼠胸腺瘤病毒癌基因同源物1(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、胰岛素(INS)等,分子对接结果也显示关键有效成分与关键靶点蛋白具有较好的对接活性。GO富集和KEGG通路分析显示虎杖作用于NSCLC的途径包括经典的癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、P53信号通路、TNF信号通路等。结论:通过网络药理学分析提示虎杖中的多个有效成分,可以作用于多个靶点,通过多个途径作用于NSCLC。

关键词：虎杖非小细胞肺癌网络药理学作用机制分子对接