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新型动物专用大环内酯类抗生素泰地罗新的合成

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精细化工中间体 2024年第4期54卷 17-21页

作者：邓玉晓马居良孔祥雨闫磊刘葵葵李欣孙晋瑞徐令文张彬李新志刘文涛山东省药学科学院山东济南250101 济南久隆医药科技有限公司山东济南250101

以泰乐菌素为起始物料,经还原胺化、水解、碘代、取代反应合成泰地罗新,纯度99.7%(HPLC),总收率60.1%,产物结构经质谱、~1HNMR和^(13)CNMR谱确证。该合成方法“三废”少,反应条件温和,工艺操作简单,具有工业化应用前景。

关键词：泰地罗新泰乐菌素固体酸

鳄梨中干旱与低温胁迫相关NAC转录因子的表达分析

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分子植物育种 2021年

作者：罗玛妮娅王毅张璋原晓龙王丽娟冯发玉徐令文郑元西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

NAC转录因子是植物转录因子的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，对其蛋...

NAC转录因子是植物转录因子的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，对其蛋白理化性质、系统进化树及基因表达谱分析，并对干旱和低温胁迫相关基因进行qRT-PCR验证。转录组分析结果表明，在干旱胁迫下有56个PaNACs表达，低温胁迫下共有53个PaNACs表达。系统进化树结果表明，PaNAC25和参与干旱胁迫的拟南芥ANAC019、ANAC055和ANAC072聚为1支，PaNAC10、PaNAC50和PaNAC51分别与刚毛柽柳ThNAC24、茶树CsNAC17、水稻OsNAC022聚为1支。qRT-PCR结果显示，鳄梨NAC转录因子中PaNAC10、PaNAC25、PaNAC50和PaNAC51参与干旱胁迫响应，PaNAC35和PaNAC69参与低温胁迫响应。本研究结果为进一步探究鳄梨NAC转录因子家族生物学特性及基因功能奠定基础，揭示NAC基因参与非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：

基于SSR技术的21个泡核桃品种遗传多样性和亲缘分析

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分子植物育种 2022年第7期20卷 2359-2365页

作者：徐令文王毅原晓龙陆斌郝佳波张雨马骏王飞西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 昆明市林业技术推广总站昆明650033

为了解云南省核桃的种质资源信息,本研究以21个泡核桃品种资源为试验材料,使用SSR技术进行遗传多样性分析和聚类分析。结果表明,在21个泡核桃品种样本中使用的12对引物平均等位基因数目为7.9167,平均每个位点有效等位基因数目、香农指数... 详细信息

为了解云南省核桃的种质资源信息,本研究以21个泡核桃品种资源为试验材料,使用SSR技术进行遗传多样性分析和聚类分析。结果表明,在21个泡核桃品种样本中使用的12对引物平均等位基因数目为7.9167,平均每个位点有效等位基因数目、香农指数(Shannon wiener index)、多态信息含量(Polymorphism information content)分别为4.3516、1.6436、0.7055。12对引物多态信息含量(PIC)高于0.25,说明这12对引物对样本均有良好多态性。亲缘关系分析中,21个泡核桃品种被分为7个类群,说明这21个泡核桃品种遗传多样性较为丰富,在品种选育过程中基因交流广泛,遗传背景较为复杂。

关键词：核桃 SSR 遗传学分析聚类分析

竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析

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经济林研究 2021年第4期39卷 148-157页

作者：冯发玉王毅王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据... 详细信息

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证。【结果】从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因。对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101~621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性。基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关。qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达。基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸。【结论】鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控。

关键词：竹叶花椒 MYB 皮刺生物信息学分析基因表达分析

深纹核桃与防御相关的萜烯合成酶基因鉴定分析

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福建农林大学学报（自然科学版） 2021年第6期50卷 789-797页

作者：徐令文王毅郝佳波张雨赵敏赵川李贤忠陆斌西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

在深纹核桃(Julans sigillata ***)转录组数据中,鉴定萜烯合成酶的基因家族成员,并使用生物信息学方法分析其理化性质、蛋白结构,对不同状态下的表达模式进行分析.深纹核桃萜烯合成酶基因家族中含有65个基因,所含氨基酸176~852个,平均... 详细信息

在深纹核桃(Julans sigillata ***)转录组数据中,鉴定萜烯合成酶的基因家族成员,并使用生物信息学方法分析其理化性质、蛋白结构,对不同状态下的表达模式进行分析.深纹核桃萜烯合成酶基因家族中含有65个基因,所含氨基酸176~852个,平均分子质量62228,平均理论等电点值为5.72,除JsTPS6、JsTPS23、JsTPS56分布于叶绿体和细胞质内,其余均定位于叶绿体.转录组测序分析表明,33个JsTPS基因只在茎中表达,11个JsTPS基因只在叶中表达,JsTPS基因家族表达具有组织特异性.JsTPS66、JsTPS24、JsTPS30、JsTPS3、JsTPS31、JsTPS1基因只在环剥处理试验株的叶中高表达,JsTPS10、JsTPS7只在结果老树的茎、叶中表达,JsTPS70同时在环剥植株的茎和结果老树的叶中表达,且前者表达量高于后者.推测JsTPS70可能参与茎条防御相关生理活动,JsTPS66可能参与叶片防御相关生理活动.

关键词：深纹核桃转录因子萜烯合成酶表达分析

深纹核桃WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析

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分子植物育种 2022年第23期20卷 7737-7750页

作者：徐令文王毅王丽娟郝佳波张雨李贤忠陆斌西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

WRKY是一类存在于植物中的转录因子,参与激素调节通路,与植物生长发育有关。基于深纹核桃转录组测序数据,本研究利用NCBI在线工具筛选蛋白结构域,获得深纹核桃WRKY转录因子基因序列。通过生物信息学方法进行分析,结果表明,共发掘88个JsW... 详细信息

WRKY是一类存在于植物中的转录因子,参与激素调节通路,与植物生长发育有关。基于深纹核桃转录组测序数据,本研究利用NCBI在线工具筛选蛋白结构域,获得深纹核桃WRKY转录因子基因序列。通过生物信息学方法进行分析,结果表明,共发掘88个JsWRKY转录因子,根据结构域数目和锌指结构可以分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类型,氨基酸大小为104~981 aa,平均分子质量为45 503.23,平均理论等电点(pI)值为7.334 5,其中88个转录因子脂肪系数(Aliphatic index)均小于100,均不具有信号肽和跨膜结构;87个WRKY转录因子为不稳定蛋白,除了JsWRKY7定位于细胞核和细胞质,其余87个JsWRKY转录因子均定位于细胞核。转录组测序分析显示JsWRKY转录因子在6年生的Juglans sigillata cv. Xixiang嫁接树进行环剥与不进行无环剥、结果的老树3种条件下,除了3个基因(JsWRKY19, Js WRKY75, JsWRKY84)不表达,其余基因在茎、叶中的表达均有变化,其中JsWRKY42、JsWRKY18、JsWRKY55、JsWRKY34、JsWRKY88、JsWRKY59、JsWRKY43、JsWRKY78基因只在结果的老树叶片中高表达;JsWRKY32、JsWRKY47、JsWRKY67、JsWRKY51、JsWRKY61、JsWRKY79、JsWRKY9、JsWRKY63、JsWRKY73、JsWRKY44、JsWRKY33、JsWRKY7、JsWRKY68、JsWRKY45仅于无环剥处理的茎中高表达;JsWRKY27、JsWRKY77、JsWRKY86、JsWRKY80只在环剥处理的茎中高表达;JsWRKY20、JsWRKY21、JsWRKY58只在老树的茎、叶中表达;JsWRKY46、JsWRKY65、JsWRKY56只在有环剥、无环剥处理下茎、叶中表达。本研究结果为进一步挖掘JsWRKY转录因子功能及其分子生物学研究奠定了基础,同时为进一步研究其他植物WRKY转录因子的家族特征提供理论依据。

关键词：深纹核桃(Juglans sigillata) 基因组 WRKY转录因子表达分析

油橄榄AP2/ERF转录因子鉴定及水胁迫表达分析

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广西植物 2022年第12期42卷 2032-2043页

作者：王丽娟王毅陆斌罗玛妮娅徐令文原晓龙李贤忠西南林业大学林学院昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为探究油橄榄AP2/ERF基因家族对水胁迫的响应机制,该研究对受干旱及水淹胁迫的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个品种的根和叶进行转录组测序,并对油橄榄中AP2/ERF转录因子的蛋白理化性质、基因结构及系统进化进行分析,同时分析与水胁迫相关的AP... 详细信息

为探究油橄榄AP2/ERF基因家族对水胁迫的响应机制,该研究对受干旱及水淹胁迫的‘佛奥’和‘TYZ-1号’2个品种的根和叶进行转录组测序,并对油橄榄中AP2/ERF转录因子的蛋白理化性质、基因结构及系统进化进行分析,同时分析与水胁迫相关的AP2/ERF转录因子在2个油橄榄品种中的基因表达差异且进行RT-qPCR验证。结果表明:(1)在油橄榄中鉴定得到110个AP2/ERF基因家族成员,该110个蛋白质所含氨基酸大小为173~717 bp,均不存在信号肽,为非分泌蛋白。将油橄榄AP2/ERF与模式植物拟南芥AP2/ERF蛋白构建进化树发现,油橄榄AP2/ERF蛋白分为AP2、RAV、ERF和Solosist 4大类,其中ERF分为ERF和DREB 2个亚类,ERF包含ERF B1~ERF B66个子亚类,DREB包含DREB A1~DREB A66个子亚类,这与模式植物拟南芥AP2/ERF的分类一致,每个亚家族同时包含了油橄榄和拟南芥AP2/ERF蛋白,说明拟南芥和油橄榄的AP2/ERF家族在进化水平上有一定的相似性。(2)油橄榄AP2/ERF同一亚家族蛋白具有相同的基因结构及保守元件,结合基因表达和进化树中已知水分调控功能的基因初步推测OeAP2-75、OeAP2-97、OeAP2-101、OeAP2-23、OeAP2-13与油橄榄水分调节密切相关,OeAP2-13、OeAP2-28、OeAP2-104、OeAP2-75、OeAP2-80、OeAP2-50在2个品种中都有不同的表达量,推测可能是‘佛奥’和‘TYZ-1号’抗性不同的原因。(3)利用RT-qPCR技术检测油橄榄AP2/ERF基因在不同胁迫下的表达变化,OeAP2-101、OeAP2-28、OeAP2-42受水胁迫诱导显著上调,这与转录组分析结果一致。该研究结果为油橄榄AP2/ERF家族基因的抗逆性表达及基因功能研究奠定了基础,为油橄榄选育抗旱和耐涝砧木品种提供了方法和理论依据。

关键词：油橄榄 AP2/ERF转录因子生物信息学基因表达谱水分胁迫

肝炎病毒感染导致肝细胞癌发生的免疫机制研究进展

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浙江大学学报（医学版） 2024年第1期53卷 64-72页

作者：徐令东徐逸帆张飞徐平龙汪洌浙江大学实验动物中心浙江杭州310058 浙江大学医学院浙江杭州310058 浙江大学生命科学研究院浙江杭州310058 浙江大学杭州国际科创中心智能医药研究所浙江杭州311200 浙江大学生命系统稳态与保护教育部重点实验室、浙江省癌症分子细胞生物学重点实验室浙江杭州310058 浙江大学癌症研究院浙江杭州310058

肝炎病毒感染是肝细胞癌的主要致病因素之一。甲型肝炎病毒(HAV)通常引起急性感染,临床病理长期追踪结果显示HAV感染与肝细胞癌发生有一定联系。乙型肝炎病毒(HBV)或丙型肝炎病毒(HCV)的慢性感染可导致长期肝脏炎症和肝硬化,影响多条细... 详细信息

肝炎病毒感染是肝细胞癌的主要致病因素之一。甲型肝炎病毒(HAV)通常引起急性感染,临床病理长期追踪结果显示HAV感染与肝细胞癌发生有一定联系。乙型肝炎病毒(HBV)或丙型肝炎病毒(HCV)的慢性感染可导致长期肝脏炎症和肝硬化,影响多条细胞凋亡和增殖相关信号通路,是病毒感染导致肝细胞癌的最常见诱因。HBV X蛋白(HBx)基因突变与肝细胞癌发病率密切相关,HCV核心蛋白的表达可导致肝细胞脂质积累,促进肿瘤发生。临床丁型肝炎病毒(HDV)感染常伴随HBV的共感染,从而增加慢性肝炎风险。戊型肝炎病毒(HEV)感染通常呈急性,近年HEV在器官移植和免疫缺陷患者中慢性感染增多。HEV慢性感染易导致肝硬化而增加肝细胞癌风险。本文概述了近年来肝炎病毒感染导致肝脏免疫应答异常和肝细胞癌发生的研究进展,以期有助于寻找病毒感染的早期检测、有效干预和疫苗接种的措施。

关键词：肝细胞癌肝炎病毒病毒性肝炎肝硬化慢性感染综述

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电动汽车助力绿色未来 010

电动汽车助力绿色未来