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一株产红色素沙雷氏菌基因表达谱差异分析

生物学杂志 2022年第5期39卷 38-44页

作者：李靖宇张肖冲李艳楠袁存霞刘建利金多马志山北方民族大学生物科学与工程学院银川750021 宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室银川750021

利用转录组测序技术对分离纯化获得的一株产红色素沙雷氏菌在不同生长阶段(产色素和不产色素)中基因表达谱差异特征进行分析,该菌株不同生长阶段基因表达谱共获得显著差异基因2512个,其中:显著上调基因1317个,基于该基因集的KEGG Pathwa... 详细信息

利用转录组测序技术对分离纯化获得的一株产红色素沙雷氏菌在不同生长阶段(产色素和不产色素)中基因表达谱差异特征进行分析,该菌株不同生长阶段基因表达谱共获得显著差异基因2512个,其中:显著上调基因1317个,基于该基因集的KEGG Pathway富集分析表明,参与群体感应功能的基因存在显著富集趋势,产色素阶段高表达自诱导物AI-2激酶lsrK以及LuxR家族转录调节因子sdiA;显著下调基因1195个,基于该基因集的KEGG Pathway富集分析表明,参与核糖体、鞭毛组装、TCA循环、肽聚糖生物合成、氨酰tRNA生物合成、原核生物碳固定、阳离子抗菌肽耐药性、细菌趋化性、细菌分泌系统、氧化磷酸化,以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等功能的基因存在显著富集趋势。

关键词：红色素沙雷氏菌转录组基因表达谱差异群体感应

压砂地硒砂瓜自根苗/嫁接苗不同连作方式土壤微生物群落结构比较

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生态学杂志 2021年第11期40卷 3608-3619页

作者：李靖宇张肖冲田兴国张琇北方民族大学生物科学与工程学院银川750021 宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室银川750021

干旱半干旱区农业可持续发展不仅面临干旱胁迫,还面临连作障碍带来的负面影响。压砂方式为宁夏中部旱区硒砂瓜种植提供了有利条件。然而,长时间连作导致自根苗硒砂瓜大面积死亡,只能通过嫁接方式缓解连作障碍。对于不同连作方式(连作自... 详细信息

干旱半干旱区农业可持续发展不仅面临干旱胁迫,还面临连作障碍带来的负面影响。压砂方式为宁夏中部旱区硒砂瓜种植提供了有利条件。然而,长时间连作导致自根苗硒砂瓜大面积死亡,只能通过嫁接方式缓解连作障碍。对于不同连作方式(连作自根苗后直接连作嫁接苗以及连作自根苗后换砂处理后连作嫁接苗)对压砂地土壤微生物群落结构的影响缺乏深入认识。本文采用Illumina Miseq测序技术对不同连作方式压砂层土壤和土壤层细菌群落结构和真菌群落结构进行了分析。结果表明,连作方式和不同土层对细菌群落结构和真菌群落结构都有显著影响。连作方式S3(自根苗连作11年+换砂2年+嫁接苗连作3年)和S4(自根苗连作12年+嫁接苗连作4年)土壤层细菌群落结构发生显著变化的属主要包括Streptomyces、Gaiella、Ensifer、Nordella、Mesorhizobium;真菌群落结构发生显著变化的属主要包括Fusarium、Mortierella、Neocosmospora、Setophoma、Cladosporium、Chrysosporium、Periconia、Penicillium、Sarocladium等。而连作方式S4土壤层大量富集了Neocosmospora、Chrysosporium、Lectera,特别是Fusarium和Paracylindrocarpon真菌类群,其中Fusarium的相对多度显著高于连作方式S3。这些结果为评价不同连作方式导致土壤微生物群落结构失衡提供科学数据。

关键词：干旱区农业可持续发展连作障碍细菌群落结构真菌群落结构

腾格里沙漠东南缘不同生物土壤结皮细菌多样性及其季节动态特征

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生物多样性 2020年第6期28卷 718-726页

作者：靳新影张肖冲金多陈韵李靖宇北方民族大学生物科学与工程学院银川750021 宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室银川750021

微生物多样性对于生物土壤结皮在沙漠生态系统中改善局部环境以及提升生态功能具有重要作用。本研究对腾格里沙漠东南缘沙坡头地区藻结皮、藓结皮及其下层的四季样品进行了16S rDNA高通量测序,以期阐明细菌多样性及其在生物土壤结皮演... 详细信息

微生物多样性对于生物土壤结皮在沙漠生态系统中改善局部环境以及提升生态功能具有重要作用。本研究对腾格里沙漠东南缘沙坡头地区藻结皮、藓结皮及其下层的四季样品进行了16S rDNA高通量测序,以期阐明细菌多样性及其在生物土壤结皮演替过程中的季节变化规律。结果表明4种类型样品的细菌丰富度在夏季显著低于其他3个季节。4种类型样品中主要的细菌类群为变形菌门、放线菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、蓝细菌门等,其中变形菌门和放线菌门为优势类群,夏季时变形菌门的相对多度显著高于春季、秋季、冬季,且在结皮层中相对多度显著高于结皮下层。放线菌门的相对多度在春季、夏季显著高于秋季、冬季,且结皮下层相对多度高于结皮层。生物土壤结皮演替过程中细菌多样性及其相对多度季节动态变化表明其对沙漠土壤局部环境的变化作出了响应,这为深入理解生物土壤结皮在沙漠生态系统中的生态功能提供了微生物多样性数据。

关键词：生物土壤结皮季节动态高通量测序细菌多样性

腾格里沙漠东南缘藻结皮与藓结皮放线菌多样性及其潜在代谢功能

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生态学报 2020年第5期40卷 1590-1601页

作者：李靖宇张肖冲陈韵靳新影马志山金多苏亮文北方民族大学生物科学与工程学院银川750021

放线菌作为干旱、半干旱环境中生物土壤结皮(Biological Soil Crusts,BSCs)组成的重要生命存在形式之一,不仅是潜在临床有用天然产物化学多样性的重要来源,也是该生态系统物质循环与能量流动的重要参与者。以腾格里沙漠东南缘广泛分布... 详细信息

放线菌作为干旱、半干旱环境中生物土壤结皮(Biological Soil Crusts,BSCs)组成的重要生命存在形式之一,不仅是潜在临床有用天然产物化学多样性的重要来源,也是该生态系统物质循环与能量流动的重要参与者。以腾格里沙漠东南缘广泛分布的藻结皮和藓结皮为研究对象,通过宏基因组测序比较分析两种BSCs放线菌种群的分布特征、组成及其潜在代谢功能。结果表明,腾格里沙漠东南缘藻结皮与藓结皮土壤微生物组主要形成以地嗜皮菌属、红色杆菌属、类诺卡氏菌属、游动放线菌属、芽生球菌属、链霉菌属、贫养杆菌属、糖丝菌属、土壤红杆菌属、假诺卡氏菌属、小单孢子菌属、康奈斯氏杆菌属、大理石雕菌属、小月菌属以及弗兰克氏菌属等为主要类群的放线菌群落结构,在两种BSCs类型之间各属分布存在差异。藓结皮中放线菌参与的氨基糖与核苷酸糖代谢、原核生物中的碳固定途径、丁酸代谢、丙酸代谢、丙氨酸/天门冬氨酸和谷氨酸代谢、甲烷代谢、2-羰基羧酸代谢、肽聚糖生物合成、淀粉与蔗糖代谢以及缬氨酸/亮氨酸与异亮氨酸降解显著高于藻结皮。藓结皮中地嗜皮菌属和红色杆菌属对相对丰度前10的代谢功能分类的贡献度显著低于藻结皮,而类诺卡氏菌属、芽生球菌属、贫养杆菌属、游动放线菌属、链霉菌属、假诺卡氏菌属和糖丝菌属等对这些功能的相对贡献在藓结皮中具有重要作用。这些结果可为全面、深入理解腾格里沙漠东南缘藻结皮与藓结皮放线菌资源多样性及其潜在功能多样性提供科学数据,也为理解放线菌在不同类型BSCs中的生态功能提供参考。

关键词：腾格里沙漠放线菌多样性代谢功能

不同生物土壤结皮微生物组跨膜转运蛋白基因多样性及差异

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微生物学通报 2020年第5期47卷 1388-1403页

作者：张肖冲靳新影王静陈韵金多马志山刘建利李靖宇北方民族大学生物科学与工程学院宁夏银川750021 宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室宁夏银川750021

【背景】跨膜转运蛋白在微生物转运各种物质的过程中具有重要作用。【目的】通过比较原核微生物组磷酸转移酶(phosphotransferasesystem,PTS)系统和腺苷三磷酸结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白编码基因在两种不同生物土壤结皮... 详细信息

【背景】跨膜转运蛋白在微生物转运各种物质的过程中具有重要作用。【目的】通过比较原核微生物组磷酸转移酶(phosphotransferasesystem,PTS)系统和腺苷三磷酸结合盒(ATP-binding cassette,ABC)转运蛋白编码基因在两种不同生物土壤结皮中(藻结皮与藓结皮)的差异,以期揭示随着生物土壤结皮的发育演替,微生物组跨膜转运物质的生物学过程中的潜在变化趋势。【方法】对腾格里沙漠东南缘的藻结皮和藓结皮12个样品进行宏基因组测序,参照KEGG数据库PTS系统,与ABC转运蛋白代谢通路进行比较并筛选相关基因,分析其差异显著性。【结果】藻结皮和藓结皮PTS系统和ABC转运蛋白编码基因的多样性一致。在生物土壤结皮中共检测到16种PTS系统的转运蛋白的编码基因,具有显著性差异的有5种;检测到106种ABC转运蛋白的编码基因,具有显著性差异的有46种,并对这46种转运蛋白结合的底物以及变化趋势进行了详细的描述。【结论】生物土壤结皮发育演替过程中,微生物组从环境中摄取能够增加渗透势物质的潜力总体呈现降低趋势,转运氨基酸、细胞膜和细胞壁组分的潜力总体呈现增加趋势,对于矿物离子、辅助因子、糖类和碳酸氢盐等的转运潜力总体无明显变化。需要注意的是这些转运蛋白编码基因多样性及差异与生物土壤结皮的关系还有待实验证明与解释。

关键词：生物土壤结皮宏基因组测序 PTS系统 ABC转运蛋白

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耐多种重金属细菌的筛选、鉴定和酶活测定

环境科学与技术 2021年第10期44卷 44-52页

作者：李艳楠袁存霞张肖冲杨瑞何艳婷程欣怡刘建利刘秉儒李靖宇北方民族大学生物科学与工程学院宁夏银川750021 宁夏特殊生境微生物资源开发与利用重点实验室宁夏银川750021

重金属污染严重危害土壤生态环境质量。通过筛选耐多种金属离子的细菌可为复合型重金属污染地区的生态环境修复提供微生物菌种资源。该研究从腾格里沙漠生物土壤结皮中进行菌种初筛,并在重金属(W^(6+)、Mn^(2+)、As^(3+)、Ni^(2+)、Mg^(... 详细信息

重金属污染严重危害土壤生态环境质量。通过筛选耐多种金属离子的细菌可为复合型重金属污染地区的生态环境修复提供微生物菌种资源。该研究从腾格里沙漠生物土壤结皮中进行菌种初筛,并在重金属(W^(6+)、Mn^(2+)、As^(3+)、Ni^(2+)、Mg^(2+))最低胁迫浓度下进行复筛。根据细菌在培养基上的生长状况,得到能够耐受5种重金属的2个菌株,16S rRNA序列比对结果表明分别为炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis L3)和贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis L11)。菌株L3和L11对Mn^(2+)、Ni^(2+)、As^(3+)、Mg^(2+)、W^(6+)5种重金属的耐受范围分别为200~2000 mg/L、10~40 mg/L、100~300 mg/L、10~800 mmoL/L、10~400 mmol/L和200~2000 mg/L、10~40 mg/L、100~200 mg/L、10~700 mmoL/L、10~180 mmol/L,且均对Pb^(2+)、Fe^(3+)、K^(+)、Na^(+)具有耐受性。在不同重金属高浓度胁迫下,扫描电镜结果表明L3菌体对不同重金属胁迫呈现出不同的形态变化。在As^(3+)的胁迫下,L11的菌体表面由粗糙变得饱满光滑,L3和L11菌体的黏附性和聚集性有所提高,可能是由于分泌了胞外聚合物。生长曲线测定结果表明2株菌的生长在不同重金属高浓度胁迫下均受到抑制,且L3和L11对Mg^(2+)的耐受性显著高于其他离子。酶活测定结果表明2株菌的MDA酶活性均与对照组无显著性差异,仅有Ni^(2+)胁迫下L3和Mn^(2+)胁迫下的L11的SOD酶活性与对照组有显著性差异。不同浓度梯度重金属胁迫条件下,株菌L3和L11对不同重金属的适应性和稳定性有差异。该研究获得的L3和L11均具有优良的修复土壤重金属污染的潜在价值,但对不同重金属的解毒机制还需深入研究。

关键词：重金属耐受性芽孢杆菌酶活性

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薯蓣皂苷元提取方法及研究进展

吉林农业 2018年第4期 68-69页

作者：张肖冲李明慧高岩宋鑫徐阳孙海明赵桂云北华大学化学与生物学院吉林吉林132013

本文对薯蓣皂苷元的提取方法中的酸水解法、酶解法、微生物转化法进行了综述,并对其发展前景进行了展望。

关键词：薯蓣皂苷元提取方法展望基金项目:吉林省科技计划项目(20180101259JC),吉林省高等学校大学生创新创业训练计划项目资助(201610301016)

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薯蓣皂苷元菌株的筛选及条件优化

北华大学学报（自然科学版） 2018年第5期19卷 625-629页

作者：赵桂云张肖冲高岩李明慧高琳楠杜茜孙海明北华大学理学院吉林吉林132013

目的从穿龙薯蓣中提取薯蓣皂苷元,进行条件优化并测得转化率.方法微生物转化法从穿龙薯蓣中转化薯蓣皂苷元,利用薄层层析法获得有效转化穿龙薯蓣的菌株C7,然后采用高效液相色谱法测定薯蓣皂苷元含量.结果利用单因素实验对其转化条件进... 详细信息

目的从穿龙薯蓣中提取薯蓣皂苷元,进行条件优化并测得转化率.方法微生物转化法从穿龙薯蓣中转化薯蓣皂苷元,利用薄层层析法获得有效转化穿龙薯蓣的菌株C7,然后采用高效液相色谱法测定薯蓣皂苷元含量.结果利用单因素实验对其转化条件进行优化,最终确定最佳转化条件为菌株接种量2%,转化温度25℃,底物浓度5%.经计算得转化率为7.37%.结论该方法稳定可靠,可用于薯蓣皂苷元的大规模生产.

关键词：薯蓣皂苷元微生物转化菌种筛选条件优化

隐秘建构与无声反抗:青年离婚污名的形成机制与主体应对

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中国青年研究 2024年第4期 61-68,104页

作者：张肖蒙华东理工大学社会与公共管理学院

近年来,青年离婚率逐年增高,但对青年面临的离婚污名研究阙如。本文基于对16位城市青年的离婚污名体验和应对方式进行的深度访谈,归纳青年离婚污名的形成机制与主体应对策略。研究发现,离异青年面临着公众污名、亲友污名和自我污名,污... 详细信息

近年来,青年离婚率逐年增高,但对青年面临的离婚污名研究阙如。本文基于对16位城市青年的离婚污名体验和应对方式进行的深度访谈,归纳青年离婚污名的形成机制与主体应对策略。研究发现,离异青年面临着公众污名、亲友污名和自我污名,污名感知具有情境化和波浪化双重交互的特征。离婚污名是由制度、文化和他者共同建构的,婚姻登记制度的贴标签、普遍婚文化规范的区隔和自我认同的消极刻板印象,是污名形成的主要机制。面对离婚污名,青年发挥主体能动性,采取伪装隐瞒、差序宣告和程度降级三种策略进行应对。本研究澄清了青年面临的离婚污名,丰富了污名研究的谱系。

关键词：青年离婚污名形成机制主体应对