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基于表观基因组数据的乳腺癌预后基因-年龄交互作用研究

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中华流行病学杂志 2024年第7期45卷 1007-1013页

作者：周添霖薛茂杰戴智翔张汝阳陈峰南京医科大学公共卫生学院生物统计学系南京211166 南京医科大学附属常州第二人民医院信息科常州213164 南京医科大学环境与人类健康国际联合研究中心南京211166

目的基于表观基因组数据,探索乳腺癌预后基因-年龄交互作用。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)多个独立乳腺癌表观基因组数据集,进行DNA甲基化的差异表达分析。采用错误发现率(FDR)法进行多重校正,保留q-FDR≤0.0... 详细信息

目的基于表观基因组数据,探索乳腺癌预后基因-年龄交互作用。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合数据库(GEO)多个独立乳腺癌表观基因组数据集,进行DNA甲基化的差异表达分析。采用错误发现率(FDR)法进行多重校正,保留q-FDR≤0.05的差异表达甲基化位点。应用三阶段分析策略,采用多因素Cox比例风险回归模型检验基因-年龄交互作用。发现阶段使用TCGA-BRCA数据库筛选q-FDR≤0.05的信号。验证阶段Ⅰ使用GSE72245数据验证交互作用,标准为P≤0.05且效应方向一致。验证阶段Ⅱ使用GSE37754和GSE75067数据再次验证信号。通过结合临床指标与交互作用信号构建预后预测模型。结果三阶段分析策略鉴定出一个甲基化位点(cg16126280_(EBF1)),其与年龄存在交互作用,共同影响患者的生存时间(交互作用HR=1.0011,95%CI:1.0007~1.0015,P<0.001)。年龄分层分析显示,cg16126280_(EBF1)的高甲基化效应在乳腺癌年轻患者(HR=0.5505,95%CI:0.3838~0.7896,P=0.001)和老年患者中完全相反(HR=2.1665,95%CI:1.2852~3.6522,P=0.004)。结论DNA甲基化位点cg16126280_(EBF1)与年龄存在交互作用,以复杂的关联模式共同影响乳腺癌预后,为年龄特异性靶向药物研发提供了新的人群证据。

关键词：乳腺癌 DNA甲基化年龄交互作用

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论“未发”与“已发”

复旦学报（社会科学版） 2024年第2期66卷 11-26,47页

作者：张汝伦上海科技大学人文学院上海201210

《中庸》“未发已发”的命题涉及中国哲学思想中一些最基本、最深奥的问题,非常重要又高度复杂,从宋儒开始,一直是历代儒家哲学家讨论的重点课题。朱子秉承程子对此一问题的思路,对它进行了创造性的诠释和阐发,朱子对“未发已发”问题... 详细信息

《中庸》“未发已发”的命题涉及中国哲学思想中一些最基本、最深奥的问题,非常重要又高度复杂,从宋儒开始,一直是历代儒家哲学家讨论的重点课题。朱子秉承程子对此一问题的思路,对它进行了创造性的诠释和阐发,朱子对“未发已发”问题的思考,构成了他哲学思想的核心,以至于牟宗三对朱熹思想的批评,主要也是围绕朱子集中体现他这方面思想的“中和新说”展开的。朱子通过对“未发已发”命题的创造性阐释,提出了一系列开创性的思想,首先是他的道统理论。朱熹的道统理论构成了他心之概念的基础和出发点。朱熹又将程子“涵养须用敬”的思想进一步系统发展为他的工夫论,以论证人心与道心实为一心,阐述人心如何能扬弃为道心。然而,朱子终究不免以心该天、以心为天的倾向,又与他对“未发已发”“心统性情”的阐释思路有关。

关键词：未发已发程颐朱熹道统人心道心涵养敬

面向数字化学习与创新的高中信息技术教学设计与实践研究

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面向数字化学习与创新的高中信息技术教学设计与实践研究

作者：张汝露曲阜师范大学

学位级别：硕士

2017年国家颁布了《普通高中信息技术课程标准》(以下简称新课标),新课标制定了高中信息技术课程的学科核心素养,包括“信息意识、计算思维、数字化学习与创新、信息社会责任”四个素养。四个素养相辅相成、相互影响,共同促进学生信息... 详细信息

2017年国家颁布了《普通高中信息技术课程标准》(以下简称新课标),新课标制定了高中信息技术课程的学科核心素养,包括“信息意识、计算思维、数字化学习与创新、信息社会责任”四个素养。四个素养相辅相成、相互影响,共同促进学生信息技术学科核心素养的提升。作为核心素养之一,数字化学习与创新素养是指学习者在数字化环境下通过分析问题选择合适的数字化工具,以及通过对数字化学习资源的学习,建构知识和掌握技能,在创造性解决问题的过程中,利用数字化工具管理学习过程和学习资源,同时创作出富有创意的作品,完成学习任务。随着数字化技术的深入发展和广泛应用,青少年面临着日益复杂的数字化环境。在这样的背景下,利用数字化工具进行学习、协作、问题解决以及创新,已经成为当代青少年不可或缺的核心素养。本研究采用文献研究法、问卷调查法、访谈法、行动研究法等研究方法,开展了面向数字化学习与创新素养的教学设计和实践研究。首先,运用文献研究法梳理国内外数字化学习与创新的研究综述,了解其研究现状,并对信息技术学科核心素养、数字化学习与创新的核心概念进行界定,以建构主义学习理论、情境认知理论和发现学习理论为本研究的理论支持。其次,通过对教师进行访谈了解当前高中信息技术课程的教学现状以及关于数字化学习与创新培养的问题,并且对学生的数字化学习与创新素养水平展开问卷调查,收集并分析数据,为后续的研究提供现实依据。再次,研究以提升学生数字化学习与创新素养为目标,采用项目式教学方法,参照项目式教学流程,初步提出高中信息技术课程教学中学生数字化学习与创新素养培养的教学设计。最后开展教学实践,教学实践以笔者所在高中某班学生为研究对象,进行三轮教学行动研究,每一轮教学实践后,通过课堂观察和作品分析,进行反思与修改,最终完善教学设计。教学实践之后通过对学生进行问卷调查和访谈,分析行动研究的效果,验证面向数字化学习与创新的教学设计的科学有效性。本研究开展的面向数字化学习与素养的高中信息技术教学设计,能够使学生在完成知识建构的过程中提升数字化学习与创新素养,并能够为信息技术教师的教学实践提供一定的参考与借鉴。

关键词：数字化学习与创新高中信息技术教学设计

并行技术在B/S架构的无网格化油藏数模系统中的应用研究

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并行技术在B/S架构的无网格化油藏数模系统中的应用研究

作者：张汝童长江大学

学位级别：硕士

基于核心素养下的初中语文红色文化阅读教学策略研究

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基于核心素养下的初中语文红色文化阅读教学策略研究

作者：张汝奇长江大学

学位级别：硕士

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中华肿瘤杂志 2024年第2期46卷 108-117页

作者：马刚梁寒张汝鹏孙意国家恶性肿瘤临床医学研究中心、天津市肿瘤防治重点实验室、天津市恶性肿瘤临床医学研究中心、天津医科大学肿瘤医院胃部肿瘤科天津300060 北京大学医学部基础医学院北京100191

目的探讨Ras相关结合蛋白23(RAB23)在食管鳞状细胞癌(简称食管鳞癌)细胞侵袭和迁移中的作用和机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应检测16例配对食管鳞癌及癌旁正常组织中RAB23 mRNA的表达。比较基因表达综合(GEO)数据库的GSE20347... 详细信息

目的探讨Ras相关结合蛋白23(RAB23)在食管鳞状细胞癌(简称食管鳞癌)细胞侵袭和迁移中的作用和机制。方法采用实时荧光定量聚合酶链反应检测16例配对食管鳞癌及癌旁正常组织中RAB23 mRNA的表达。比较基因表达综合(GEO)数据库的GSE20347数据集中食管鳞癌和配对癌旁正常组织RAB23 mRNA的表达水平。免疫组织化学检测106例配对食管鳞癌和癌旁正常组织、33例淋巴结阳性与10例淋巴结阴性患者原发灶与淋巴结组织中RAB23蛋白含量。在食管鳞癌KYSE30和KYSE150细胞中瞬时敲降RAB23表达(转染si-RAB23-1和si-RAB23-9)或者稳定敲降RAB23表达(转染sh-RAB23), 采用Western blot法验证RAB23敲降效率, 采用细胞计数试剂盒8法和裸鼠皮下成瘤实验检测食管鳞癌细胞的增殖能力, 采用Transwell实验和裸鼠尾静脉-肺转移实验检测食管鳞癌细胞的侵袭和迁移能力, 采用细胞黏附实验检测食管鳞癌细胞的黏附能力, 采用转录组测序技术分析RAB23敲降后对细胞转录谱的影响, 并通过Western blot检测验证相关信号通路。结果 16例食管鳞癌组织中RAB23 mRNA表达水平为0.009 7±0.008 9, 高于癌旁正常组织[0.003 2±0.003 7, P=0.006]。对GEO数据库GSE20347数据集中食管鳞癌和配对癌旁正常组织表达谱的生信分析显示, 食管鳞癌组织中RAB23 mRNA表达水平为4.30±0.25, 高于癌旁正常组织(4.10±0.17, P=0.037)。106例食管鳞癌组织中, 51例RAB23低表达, 55例RAB23高表达;而配对癌旁正常组织中, 82例RAB23低表达, 24例RAB23高表达, 食管鳞癌组织中RAB23表达水平高于配对癌旁正常组织(P<0.001)。33例淋巴结阳性食管鳞癌组织中, 1例RAB23低表达, 32例RAB23高表达;10例淋巴结阴性的食管鳞癌组织中, 3例RAB23低表达, 7例RAB23高表达。淋巴结阳性食管鳞癌组织中RAB23表达水平高于淋巴结阴性食管鳞癌组织(P=0.024)。33例阳性淋巴结组织中, 1例RAB23低表达, 32例RAB23高表达, 而10例阴性淋巴结组织中均为RAB23低表达。阳性淋巴结组织中RAB23表达水平高于阴性淋巴结组织(P<0.001)。瞬时或稳定敲降RAB23后, KYSE30细胞体外和体内的增殖能力无明显变化, KYSE30细胞的细胞侵袭和迁移能力下降, 而KYSE150细胞仅侵袭能力下降, 迁移能力无明显变化。sh-RAB23组KYSE30细胞黏附细胞的数量为(313.75±89.34)个, 少于sh-NC组[(1 030.75±134.29)个, P<0.001]。sh-RAB23组KYSE150细胞的黏附细胞数为(710.5±31.74)个, 也少于sh-NC组[(1 005.75±61.09)个, P<0.001]。转录组测序分析显示, 敲降RAB23后, si-RAB23-1组和si-RAB23-9组KYSE30细胞中黏着斑相关信号通路均被削弱, sh-RAB23组KYSE30和KYSE150细胞中p-FAK和p-paxillin表达水平降低。结论 RAB23在食管鳞癌组织中高表达, 与淋巴结转移有关。敲低RAB23表达后能够削弱黏着斑相关信号通路, 进而抑制食管鳞癌细胞的侵袭、迁移和黏附。

关键词：食管鳞状细胞癌 Ras相关结合蛋白23 黏着斑侵袭迁移

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近年来南极磷虾捕捞活动的时空变化特征分析

极地研究 2024年

作者：凌家俊艾松涛丁曦张汝诚曾韬国家卫星海洋应用中心武汉大学中国南极测绘研究中心武汉大学极地环境监测与公共治理教育部重点实验室湖北珞珈实验室

南极磷虾资源量巨大且营养价值丰富，已越来越受到世界各国的重视。本文基于国产海洋卫星获取的船舶自动识别系统(Automatic Identification System， AIS)数据，采用地理信息系统(Geographic Information System， GIS)工具软件综合... 详细信息

南极磷虾资源量巨大且营养价值丰富，已越来越受到世界各国的重视。本文基于国产海洋卫星获取的船舶自动识别系统(Automatic Identification System， AIS)数据，采用地理信息系统(Geographic Information System， GIS)工具软件综合分析了近年来(2019—2021年)南极磷虾渔船捕捞活动的时空分布变化特征，同时探索了国产海洋卫星AIS数据用于南极渔业监测的方法。研究结果表明: (1)南极磷虾的捕捞区域主要集中在48.1， 48.2和48.3三个分区内，呈现“西南—东北”方向上分布的空间特征; (2)南极磷虾捕捞的热门时间段仍为每年的3—6月， 48.1， 48.2和48.3分区均为传统上的磷虾作业渔场，其中48.2分区内磷虾渔场呈现扩张的趋势，而48.3分区内捕捞热点区域分布较少且随年份出现震荡变化; (3)本研究同时表明了国产海洋卫星AIS数据可以有效地应用于南极磷虾捕捞活动的时空变化研究，可为南极海洋生物资源监测、保护和可持续利用提供重要的数据支持。

关键词：南极磷虾 AIS数据 GIS 磷虾捕捞时空变化

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南极航空网络现状及展望

极地研究 2024年

作者：肖紫寒艾松涛张汝诚武汉大学极地环境监测与公共治理教育部重点实验室湖北珞珈实验室武汉大学中国南极测绘研究中心

自从20世纪人类开展南极航空活动以来,航空一直是快速高效进出南极的交通手段。目前南极地区的航空网络信息,与其他大陆的洲际航线相比还不够完备,未能形成一个较为完整的南极航空网络。当前往返南极主要有4条洲际航线:智利/阿根廷—南... 详细信息

自从20世纪人类开展南极航空活动以来,航空一直是快速高效进出南极的交通手段。目前南极地区的航空网络信息,与其他大陆的洲际航线相比还不够完备,未能形成一个较为完整的南极航空网络。当前往返南极主要有4条洲际航线:智利/阿根廷—南极半岛,新西兰基督城—麦克默多站/马里奥·祖切利站,澳大利亚霍巴特—凯西站以及南非开普敦—毛德皇后地。本文利用2018年12月至2022年12月的南极飞行器轨迹数据,研发了自动提取航线算法,分析了不同航段的起降点、相关航段频次和相关国家南极活动的空间区域概貌,评估了各国南极航空活动的发展态势。这些成果可为我国制定南极的飞行活动方案和安全措施提供了参考。

关键词：南极飞行器南极机场航空网络极地考察

改进的密集视频描述Transformer译码算法

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计算机工程与应用 2024年第17期60卷 89-97页

作者：杨大伟盘晓芳毛琳张汝波大连民族大学机电工程学院辽宁大连116650

当Transformer应用于密集视频描述时,历史文本特征会对后续文本生成产生干扰,难以捕捉视频动态信息从而影响描述的连贯性和准确性。为保持上下文一致性的同时又能缓解历史文本干扰,提出改进的密集视频描述Transformer译码算法(D-Uformer... 详细信息

当Transformer应用于密集视频描述时,历史文本特征会对后续文本生成产生干扰,难以捕捉视频动态信息从而影响描述的连贯性和准确性。为保持上下文一致性的同时又能缓解历史文本干扰,提出改进的密集视频描述Transformer译码算法(D-Uformer)。该算法利用前馈神经网络(FNN)增强历史文本特征表达,通过跳跃连接构建删除冗余支路和增强补足支路,利用减法降低历史文本特征过度聚焦导致描述不准确的影响,提高模型对输入视频特征的关注度;同时,利用加法弥补特征传递过程中丢失的上下文信息,生成准确且连贯表达当前视频内容的描述语句。在ActivityNet和Charades数据集上的实验结果表明,D-Uformer算法的描述性能提升明显,与视频多样性描述网络(TDPC)相比,准确性最高提升4.816%,多样性最高提升4.167%,生成的描述不仅更贴合视频内容,且更符合人类语言习惯。

关键词：密集视频描述 Transformer网络译码前馈神经网络跳跃连接