检索结果-南通市图书馆

广西农业科学 2000年第3期31卷 161-162页

作者：张步娴平南县环城兽医站平南537300

新城疫病毒和传染性支气管炎病毒双重荧光定量RT-PCR检测方法的建立

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中国预防兽医学报 2014年第11期36卷 867-871页

作者：屈素洁施开创邹联斌张步娴梁媛莫胜兰粟艳琼胡杰李军广西区动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为建立鸡新城疫病毒(NDV)和鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的快速鉴别检测方法,本研究根据NDV和IBV的基因保守序列,设计了2对特异性引物和2条用不同荧光基团标记的Taq Man探针;经过对反应条件的优化,建立了能够同时检测NDV和IBV的双重荧光定... 详细信息

为建立鸡新城疫病毒(NDV)和鸡传染性支气管炎病毒(IBV)的快速鉴别检测方法,本研究根据NDV和IBV的基因保守序列,设计了2对特异性引物和2条用不同荧光基团标记的Taq Man探针;经过对反应条件的优化,建立了能够同时检测NDV和IBV的双重荧光定量RT-PCR方法。该方法对NDV和IBV的检测灵敏度均为10拷贝/μL,比常规RT-PCR敏感性高100倍;该方法对禽流感病毒、传染性喉气管病病毒、鸡白血病病毒、禽呼肠弧病毒检测结果均为阴性,表明其具有良好的特异性;批内和批间重复变异系数均小于2%。利用所建立的双重荧光定量RT-PCR方法及常规RT-PCR,对185份组织样品进行检测,符合率为100%。该方法可以用于NDV和IBV的快速定量检测。

关键词：新城疫病毒传染性支气管炎病毒双重荧光定量RT-PCR

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广西鸭圆环病毒的流行病学调查

黑龙江畜牧兽医 2016年第9期 166-168页

作者：粟艳琼郑敏曹慧慧梁晟张步娴屈素洁莫胜兰广西动物疫病预防控制中心南宁530001 广西大学南宁530000

为了解广西鸭圆环病毒(Du CV)流行情况,试验采用PCR技术对2010—2014年间采自南宁、柳州、桂林等10个城市活禽市场的2 897份临床健康鸭内脏组织样品进行检测,同时对采自83个鸭群的187份发病或死亡鸭组织样品分别进行Du CV、大肠杆菌(E.c... 详细信息

为了解广西鸭圆环病毒(Du CV)流行情况,试验采用PCR技术对2010—2014年间采自南宁、柳州、桂林等10个城市活禽市场的2 897份临床健康鸭内脏组织样品进行检测,同时对采自83个鸭群的187份发病或死亡鸭组织样品分别进行Du CV、大肠杆菌(E.coli)、鸭疫里氏杆菌(RA)、禽流感病毒(AIV)、鸭肝炎病毒(DHV)、副黏病毒(AMPV)、鸭坦布苏病毒(DTUMV)检测。结果表明:10个城市均检测出Du CV阳性样品,其平均检出率为8.01%(232/2 897);187份鸭组织样品中Du CV样品阳性率为20.32%(38/187),其中Du CV单纯感染仅占18.42%(7/38),而二重感染和三重感染的比率分别为50.00%(19/38)和31.58%(12/38)。说明Du CV在广西大部分地区鸭群中呈不同程度的流行,感染率逐年升高,且Du CV感染往往造成其他病原继发感染而引起鸭群发病甚至死亡。

关键词：鸭圆环病毒(DuCV) PCR 流行病学调查阳性率混合感染

美洲型与欧洲型PRRSV多重TaqMan荧光定量RT-PCR鉴别检测方法的建立及应用

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中国兽医科学 2014年第4期44卷 412-418页

作者：官家明施开创李凤梅张步娴陈汉忠邹联斌李军广西大学动物科学技术学院广西南宁530005 广西动物疫病预防控制中心广西南宁530001

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型经典毒株、高致病性变异毒株以及欧洲型毒株基因组的序列差异,设计2对特异性引物和3条TaqMan探针,经过反应条件的优化,建立了能同时检测并区分PRRSV美洲型经典毒株、变异毒株以及欧洲型毒株的... 详细信息

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)美洲型经典毒株、高致病性变异毒株以及欧洲型毒株基因组的序列差异,设计2对特异性引物和3条TaqMan探针,经过反应条件的优化,建立了能同时检测并区分PRRSV美洲型经典毒株、变异毒株以及欧洲型毒株的多重荧光定量RT-PCR方法。该方法线性关系好,标准曲线的相关系数均达到0.999以上;特异性强,只有PRRSV出现阳性反应,而与口蹄疫病毒、猪瘟病毒、猪伪狂犬病病毒、猪细小病毒、猪圆环病毒2型均无交叉反应;敏感性高,经典毒株、变异毒株、欧洲型毒株的检出下限分别为1.13、1.37、1.39copies/μL,均比普通RT-PCR敏感100倍;重复性好,组内及组间变异系数均小于1.5%。应用所建立的方法对采集的282份临床病料进行检测,结果 PRRSV阳性101份,其中95份为变异毒株、6份为经典毒株、4份为变异毒株和经典毒株混合感染,未检测到欧洲型毒株。结果表明,本研究建立的多重TaqMan荧光定量RT-PCR方法可为PRRSV的快速鉴别诊断及流行病学调查提供有效的技术手段。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒美洲型毒株欧洲型毒株多重TaqMan荧光定量RT-PCR

鸡传染性支气管炎病毒广西株N、M基因的克隆与序列分析

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中国畜牧兽医 2015年第12期42卷 3119-3125页

作者：屈素洁施开创粟艳琼胡杰莫胜兰张步娴李军邹联斌广西动物疫病预防控制中心南宁530001

为研究鸡传染性支气管炎病毒（IBV）广西流行株的遗传变异情况,本研究从广西发病鸡中分离鉴定了1株IBV。参照GenBank中IBV的核苷酸序列设计2对引物,利用RT-PCR技术对分离毒株的N、M基因进行了克隆、序列测定,并与GenBank中发表的国内外... 详细信息

为研究鸡传染性支气管炎病毒（IBV）广西流行株的遗传变异情况,本研究从广西发病鸡中分离鉴定了1株IBV。参照GenBank中IBV的核苷酸序列设计2对引物,利用RT-PCR技术对分离毒株的N、M基因进行了克隆、序列测定,并与GenBank中发表的国内外参考毒株进行比对分析。结果显示,N基因序列全长为1 230bp,编码409个氨基酸,M基因序列全长为678bp,编码225个氨基酸。与参考毒株相比,分离株的N基因核苷酸序列同源性为87.2%~93.3%,推导的氨基酸序列同源性为90.0%~94.4%;M基因的核苷酸序列同源性为83.6%~91.0%,推导的氨基酸序列同源性为82.7%~92.9%。在遗传进化树中,本试验分离株Guangxi156株与BJ株和LX4株两个参考株位于同一个分支上,亲缘关系较近,而与其他参考株属于不同的分支,亲缘关系较远。结果表明,本试验分离株是一株新的IBV变异株。

关键词：鸡传染性支气管炎病毒 N基因 M基因基因克隆序列分析

广西H6亚型禽流感病毒HA基因的遗传变异分析

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基因组学与应用生物学 2015年第9期34卷 1907-1911页

作者：粟艳琼邹联斌胡杰张步娴屈素洁莫胜兰广西壮族自治区动物疫病预防控制中心南宁530001

本研究于2009至2014年间在广西南宁、防城港和梧州三市活禽交易市场中分离获得12株H6亚型禽流感病毒(AIV)毒株。通过RT-PCR、序列测定及基因序列分析,结果表明,扩增获得的12株毒株基因大小均为1 701 bp,与Gen Bank中所登录的HA基因大小... 详细信息

本研究于2009至2014年间在广西南宁、防城港和梧州三市活禽交易市场中分离获得12株H6亚型禽流感病毒(AIV)毒株。通过RT-PCR、序列测定及基因序列分析,结果表明,扩增获得的12株毒株基因大小均为1 701 bp,与Gen Bank中所登录的HA基因大小一致;其氨基酸序列推导结果发现12株分离毒株裂解位点氨基酸序列均为PQIETRG,只含有一个碱性氨基酸,符合低致病禽流感病毒的特点;对糖基化位点进行分析,结果发现HA基因中存在8个潜在糖基化位点,其中只有毒株GX2161的182~184 aa处发生了交替,其氨基酸序列为R-N-T,这与高致病力毒株的R-X-R/K-R的分子特征不同,推测GX6121毒株可能为典型的低致病力毒株。12个分离毒株与Gen Bank中公开登录的其它20个H6亚型AIV毒株的遗传进化树分析表明,防城港的4株毒株与越南株LC050583处于同一分支上,梧州的3株毒株与越南株LC042081处于同一分支,表现出较明显的地域性,而由于地理位置的影响,南宁的5株毒株则与越南株LC050583、广西株HQ599858、JX304770形成三个分支,表现出较近亲缘性,这表明AIV中HA存在一定的遗传变异性。本研究在分子水平上为有效防控广西活禽市场中H6亚型AIV的感染提供参考。

关键词：禽流感 HA基因 H6亚型遗传变异

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广西鸭圆环病毒流行毒株遗传变异分析

动物医学进展 2015年第10期36卷 20-25页

作者：粟艳琼郑敏张步娴屈素洁莫胜兰广西壮族自治区动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为了解广西鸭圆环病毒(DuCV)流行毒株的遗传变异情况,进一步为研制鉴别诊断DuCV方法和制定科学防控措施奠定基础。采用PCR方法对采自广西不同地区的阳性鸭组织样品进行了全基因组扩增和测序,共获得14个完整的DuCV全基因组序列。与GenBan... 详细信息

为了解广西鸭圆环病毒(DuCV)流行毒株的遗传变异情况,进一步为研制鉴别诊断DuCV方法和制定科学防控措施奠定基础。采用PCR方法对采自广西不同地区的阳性鸭组织样品进行了全基因组扩增和测序,共获得14个完整的DuCV全基因组序列。与GenBank中登录的52个国内外DuCV毒株进行遗传进化分析及同源性比较。结果表明,当前广西同时存在基因1.1亚型、基因1.2亚型和基因2.1亚型3种不同的DuCV毒株在流行,其中基因1.1亚型和1.2亚型为优势流行毒株。

关键词：鸭圆环病毒流行毒株遗传变异

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鸭圆环病毒Cap蛋白的原核表达

动物医学进展 2014年第3期35卷 19-23页

作者：粟艳琼郑敏莫胜兰屈素洁张步娴梁媛广西壮族自治区动物疫病预防控制中心广西南宁530001

为表达鸭圆环病毒(DuCV)Cap蛋白,通过Gene Designer 2.0软件对DuCV Cap基因进行分析和密码子优化,构建DuCV Cap基因重组表达质粒pET-32a-Cap,转化BL21(DH3)株感受态细胞。用终浓度为0.1mmol/L的IPTG进行诱导表达。SDS-PAGE电泳分析显示... 详细信息

为表达鸭圆环病毒(DuCV)Cap蛋白,通过Gene Designer 2.0软件对DuCV Cap基因进行分析和密码子优化,构建DuCV Cap基因重组表达质粒pET-32a-Cap,转化BL21(DH3)株感受态细胞。用终浓度为0.1mmol/L的IPTG进行诱导表达。SDS-PAGE电泳分析显示Cap融合蛋白的分子质量约为48ku,表达的重组蛋白占菌体总蛋白的43.1%。Western blot检测显示该融合蛋白可以被针对His标签蛋白的抗体所识别。利用镍离子亲和纯化株对重组蛋白进行了纯化,纯度为92.3%。为进一步建立DuCV血清学检测方法奠定了基础。

关键词：鸭圆环病毒 Cap蛋白原核表达

鸡传染性支气管炎病毒广西株M基因的克隆与序列分析

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中国畜牧兽医 2016年第2期43卷 377-382页

作者：屈素洁施开创邹联斌胡杰莫胜兰尹彦文张步娴李军梁媛广西区动物疫病预防控制中心南宁530001

参照GenBank中鸡传染性支气管炎病毒（IBV）的核苷酸序列设计1对引物,利用PCR扩增IBV广西株的M基因片段,将其克隆到pMD18-T载体中。序列分析结果表明,M基因全长为678bp,编码225个氨基酸,近N端含有2个潜在的N-糖基化位点,3个跨膜区位于23... 详细信息

参照GenBank中鸡传染性支气管炎病毒（IBV）的核苷酸序列设计1对引物,利用PCR扩增IBV广西株的M基因片段,将其克隆到pMD18-T载体中。序列分析结果表明,M基因全长为678bp,编码225个氨基酸,近N端含有2个潜在的N-糖基化位点,3个跨膜区位于23—98肽段区,亲水区较疏水区更易变异。IBV广西株与国内外IBV参考毒株相比,核苷酸序列同源性为83.6%-92.5%,氨基酸序列同源性为82.7%-95.1%。系统进化分析结果显示IBV广西株与SAIB20和LX4两参考株位于同一个分支上,它们的亲缘关系较近,而与其他参考株属于不同的分支,亲缘关系较远。结果表明IBV广西株是1株新的IBV变异株。

关键词：鸡传染性支气管炎病毒 M基因基因克隆序列分析

鸡马立克氏病病毒广西株Meq基因的克隆与序列分析

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中国畜牧兽医 2016年第1期43卷 45-49页

作者：屈素洁邹联斌胡杰粟艳琼莫胜兰施开创尹彦文李军张步娴广西动物疫病预防控制中心南宁530001

为研究鸡马立克氏病病毒（MDV）广西流行株的遗传变异情况,本研究从广西发病鸡中分离鉴定了3株MDV。参照GenBank中MDV的核苷酸序列设计1对引物,利用PCR技术对分离毒株的Meq基因进行了克隆、序列测定,并与GenBank中发表的国内外参考毒株... 详细信息

为研究鸡马立克氏病病毒（MDV）广西流行株的遗传变异情况,本研究从广西发病鸡中分离鉴定了3株MDV。参照GenBank中MDV的核苷酸序列设计1对引物,利用PCR技术对分离毒株的Meq基因进行了克隆、序列测定,并与GenBank中发表的国内外参考毒株进行比对分析。结果显示,Meq基因序列全长为1 020bp,编码一条由339个氨基酸组成的多肽,分离株与国内外MDV参考毒株相比,不同MDV株的Meq基因序列相对较保守,它们之间核苷酸同源性为83.8%~99.9%,氨基酸同源性为88.4%~99.6%。3株MDV分离株Meq基因在相关报道中提到的与毒力相关的脯氨酸重复区存在点突变。3株分离株与国内参考株YL、GXY2关系较近,与参考株RB1B、GA、Md5、648A及疫苗株亲缘关系较远。该研究为中国MDV的流行、遗传变异及防控研究提供了材料。

关键词：马立克氏病病毒 Meq基因基因克隆序列分析

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