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基于Iso-seq的黄瓜野生种和栽培种的转录本比较分析

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基于Iso-seq的黄瓜野生种和栽培种的转录本比较分析

作者：张梦卓郑州大学

学位级别：硕士

黄瓜(Cucumis sativus L.)属于葫芦科甜瓜属,是世界十大蔬菜之一,具有重要的生产价值。黄瓜种植历史悠久,品种繁多,野生种和栽培种之间差异巨大。转录是中心法则过程中的枢纽环节,转录本的结构和表达调控基因的功能。因此解析野生种和... 详细信息

黄瓜(Cucumis sativus L.)属于葫芦科甜瓜属,是世界十大蔬菜之一,具有重要的生产价值。黄瓜种植历史悠久,品种繁多,野生种和栽培种之间差异巨大。转录是中心法则过程中的枢纽环节,转录本的结构和表达调控基因的功能。因此解析野生种和栽培种之间的转录本的差异,对研究黄瓜野生种和栽培种之间性状差异具有重要作用。本研究通过对来自新泰密刺(栽培种)和Cucumis sativus var.hardwickii(野生种)中的8个组织(根、早期顶芽、雄花、雌花、侧芽、果皮、胎座、后期顶芽)进行二代和三代转录组测序,对野生种和栽培种的转录本进行了详细的比较分析,主要结果如下:(1)在hardwickii中共鉴定到48,301个全长转录本,在新泰密刺中共鉴定到51,906个全长转录本。通过与黄瓜参考基因组比较,鉴定到基因组中未注释出来的转录异构体,并对这些转录异构体进行了详细的分类,丰富了黄瓜基因组的注释。(2)鉴定比较了存在于各组织中的选择性剪切事件,内含子保留的剪接类型占比最高,并使用RT-PCR验证了选择性剪切事件的真实性。在hardwickii和新泰密刺中分别鉴定到294个和362个lncRNA,其中85对lncRNA在两个材料中保守存在。通过与黄瓜lncRNA数据库进行比对分析,发现hardwickii和新泰密刺中各有101和153个特有的lncRNA,丰富了黄瓜lncRNA数据。在hardwickii和新泰密刺中分别鉴定到58个和36个融合基因,为黄瓜在融合基因方面的研究提供了数据支持。(3)对99303的参考基因组中的基因注释错误进行纠正。对101个需要拆分的基因和730个需要合并的基因的注释进行了纠正,并鉴定出60个新基因,对当前现有的黄瓜基因组注释进行了补充。(4)对在hardwickii和新泰密刺中的相同组织鉴定到的相同转录本进行了差异表达分析,并比较了差异表达转录本的功能富集,发现不同种质的相同组织在相同发育阶段侧重的功能存在差异,对从转录层面挖掘两个种质的内在转录差异具有重要作用。综上所述,本研究对黄瓜当前现有的基因注释进行了补充,揭示了黄瓜转录本结构的复杂性,为黄瓜重要农艺性状的功能基因的挖掘提供了数据支撑,同时也为其他物种不同品种间的转录的差异比较提供了分析思路。

关键词：黄瓜野生种栽培种全长转录本选择性剪切 LncRNA 结构注释

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河南省绿色经济发展水平评价及优化路径研究

营销界 2023年第3期 29-31页

作者：张梦卓郑州财经学院

绿色低碳循环发展是现代化经济体系建设的重要任务，河南省作为中部大省更应承担绿色发展的责任。文章从“三生”即生产、生活、生态三个层面构建绿色经济发展的指标体系，从东西南北各取一省和河南省进行对比，基于2016—2020年的数据... 详细信息

绿色低碳循环发展是现代化经济体系建设的重要任务，河南省作为中部大省更应承担绿色发展的责任。文章从“三生”即生产、生活、生态三个层面构建绿色经济发展的指标体系，从东西南北各取一省和河南省进行对比，基于2016—2020年的数据，对河南省绿色经济发展的水平测度后发现：整体上，河南省绿色经济水平处于第三梯度，但处于上升趋势，生产发展、社会生活建设、清洁能源的使用和废弃物的排放是主要瓶颈，并从开发文旅优势、重视保供和公共管理以及绿色创新的落实等角度提出优化路径，以期助力河南省绿色经济的发展建设。

关键词：河南省绿色经济绿色发展

干旱胁迫对番茄叶片蜡质合成相关非特异性脂质转运蛋白的影响

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分子植物育种 2022年第11期20卷 3611-3622页

作者：王宇李俊佑何艳张梦卓史学群孟兰环海南大学食品科学与工程学院海口570000

非特异性脂质转运蛋白(non-specific lipid transfer proteins, nsLTPs)是一类分子量较小的碱性蛋白质,参与胞外脂质性物质转运沉积。本研究目的在于探究nsLTPs在应对非生物胁迫时的生理功能。以Micro-Tom番茄为实验材料,花蕾期进行干... 详细信息

非特异性脂质转运蛋白(non-specific lipid transfer proteins, nsLTPs)是一类分子量较小的碱性蛋白质,参与胞外脂质性物质转运沉积。本研究目的在于探究nsLTPs在应对非生物胁迫时的生理功能。以Micro-Tom番茄为实验材料,花蕾期进行干旱胁迫,植株出现明显缺水症状后分别采集第1~5叶位的叶片,以同期种植的正常浇水番茄为对照。采用气相色谱-质谱联用(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)对蜡质成分进行了定性和定量分析,通过扫描电镜观察叶片表皮超微结构的差异,实时荧光定量PCR (RT-qPCR)分析与脂质转运蛋白基因SlLTPG1和蜡质、角质合成相关基因SlCER6、SlGDSL1、SlGPAT4的表达量。结果表明:干旱胁迫后的番茄叶片表皮超微结构与对照组相比存在更多蜡质晶体覆盖,叶片表面细胞突起增多,褶皱减少。GC-MS和GC-FID (Gas chromatography-flame ionization detector)分析发现,番茄不同叶位间的蜡质含量存在差异,以烷烃类成份为主,干旱胁迫能够极显著地增加酯醛类化合物和烷烃类物质的增加。此外,nsLTP相关基因,蜡质合成相关基因SlCER6,SlGPAT4的表达水平均显著上升,SlGDSL1的表达水平下降,在抵御非生物胁迫过程中,本研究推测番茄非特异性脂质转运蛋白SlLTPG1能促进角质层蜡质的合成,并沉积在果皮表层,角质层结构和化学组成改变,角质层透性降低,从而有利于延缓叶片的蒸腾失水,这为提高果蔬的抗逆性和采后耐贮性具有重要借鉴意义。

关键词：番茄干旱胁迫非特异性脂质转运蛋白 GC-MS 蜡质

“271”教学模式在初中英语课堂中的实践与反思 ——以哈尔滨市香坊中学校为例

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“271”教学模式在初中英语课堂中的实践与反思 ...

作者：张梦卓哈尔滨师范大学

学位级别：硕士

新一轮的初中英语课程改革已进行十余年,期间各地各类学校也都相继进行课程改革,努力做到将课堂归于学生,经过不断的探索和实践,以学生为中心和主体的教学模式不断地出现在国内许多的学校并得以实施,但是随着不断地应用,其缺点也展现出... 详细信息

新一轮的初中英语课程改革已进行十余年,期间各地各类学校也都相继进行课程改革,努力做到将课堂归于学生,经过不断的探索和实践,以学生为中心和主体的教学模式不断地出现在国内许多的学校并得以实施,但是随着不断地应用,其缺点也展现出来,比如打着新教学模式但是依旧走老路,或者是学生三分钟热度等等,本文以哈尔滨市香坊中学校的“271”教学模式为例,论述“271”教学模式在初中英语课堂下的使用和实践情况以及不足之处,并针对不足之处提出笔者的改进措施和建议。通过本文的研究,让大家更加地了解“271”教学模式,并对“271”教学模式有更深的认识,并且结合初中英语的学科特点,阐述“271”教学模式在初中英语课堂上实践的效果,同时也提出其不足之处,并提出相关的改进意见,力求将问题研究地更加透彻,更加高效,在以后的运用和实践中不断地完善。文章总共分为六个部分:一、引言;二、“271”教学模式的定义;三、理论基础;四、研究设计;五、研究数据整理分析;六、结语。论文的第一部分主要介绍了“271”教学模式的背景、“271”教学模式的意义以及“271”教学模式的国内外研究现状分析。本研究的意义从有利于贯彻初中英语新课程改革的理念、有利于转变传统英语课堂中师生角色的定位、有利于改变初中英语课堂的现状、有利于促进英语教师的成长与发展、有利于提高学校整体的教育水平五个方面来说明。论文的第二部分主要介绍了“271”教学模式的定义,其中包括“271”教学模式的涵义、“271”教学模式的组成因素以及“271”教学模式的准绳三个方面。论文的第三部分笔者着重介绍了“271”教学模式的理论基础。论文的第四部分阐述了“271”教学模式在初中英语课堂教学中的实施情况,具体阐述了初中英语课程特点及教学现状、“271”教学模式在初中英语课堂的运用情况、“271”教学模式具体实施效果。论文的第五部分主要介绍了在初中英语课堂教学中实行“271”教学模式的反映,从取得的成效、存在的短板、存在短板的原因以及建议四个方面进行了透彻地分析。论文的最后主要是对此研究的总结,得出本研究的初步结论、需改进的地方以及对本研究将来发展的瞻望。

关键词： “271”教学模式初中英语课堂实践与反思

核心素养视角下基于教材的高中生文化意识培养研究

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核心素养视角下基于教材的高中生文化意识培养研究

作者：张梦卓哈尔滨师范大学

学位级别：硕士

随着全球化时代的到来,我国与世界各国的文化交流日益密切,培养学生的多元文化意识,树立文化自信是时代发展的需要,《普通高中英语课程标准（2017年版）》也明确指出文化意识培养的目标与要求。高中英语教材是高中英语课程实施和实现课... 详细信息

随着全球化时代的到来,我国与世界各国的文化交流日益密切,培养学生的多元文化意识,树立文化自信是时代发展的需要,《普通高中英语课程标准（2017年版）》也明确指出文化意识培养的目标与要求。高中英语教材是高中英语课程实施和实现课程目标的重要载体,对于学生文化意识的培养有着重要意义。本研究以程晓堂的英语教材评价理论为基础,采用内部评价与外部评价相结合的方式来开展研究。内部评价选取《2019版外研社版高中英语必修教材》1-3册阅读部分的文化知识内容,参考Cortazzi＆Jin等学者的文化分类原则,将文化地域分为:目的语文化、本族语文化、世界文化、对比文化四大地域,对照《普通高中英语课程标准（2017年版）》中文化知识目标要求进行文本分析。同时对使用过该套必修教材的两省四市的6所高中的教师和学生进行问卷调查和访谈,作为对该套必修教材文化知识内容的外部分析,旨在研究以下三个问题:1.《2019版外研社版高中英语必修教材》是否体现《高中英语课程标准（2017年版）》中规定的文化知识内容要求?具体是如何体现的?2.该教材是否体现了文化的多样性?具体是如何体现的?3.该教材能否满足核心素养视角下学生的文化意识培养需求?需要关注哪些问题?研究发现:1.《2019版外研社版高中英语必修教材》较为全面的体现了《新课标（2017）》对必修教材的文化知识内容要求,且文化知识的渗透是由浅及深的,但是在对比中西方文化习俗方面涉及的不够全面;2.《2019版外研社版高中英语必修教材》阅读部分所包含的文化知识内容较为丰富,较好地体现了文化多样性,内容上基本涉及到了多领域、多地区的文化。但相对而言,对比文化所占比例较小,哲学和教育等方面内容涉及较少;3.根据调查问卷和访谈结果反映出,大部分教师和学生认为《2019版外研社版高中英语必修教材》所包含的文化知识内容能够满足学生的文化意识培养的需要,但对比文化涉及不够全面,同时由于课堂容量和时长的限制以及应试需要,课堂上开展文化对比活动的机会较少,文化教学形式不够丰富多彩。根据研究发现对教材编写者及教师提出了相关建议,相信随着未来研究范围的扩大,研究将会继续深入。

关键词：学科核心素养高中英语教材文化意识教材评价

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黄瓜株型性状的QTL定位分析

中国蔬菜 2023年第8期 38-45页

作者：郭江怡辛同旭张梦卓王帅王深浩杨学勇青岛农业大学园艺学院山东青岛266109 中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜生物育种全国重点实验室北京100081

株型是影响作物产量和成本投入的重要因素,挖掘株型相关的QTLs将为黄瓜株型改良提供重要参考。以野生黄瓜PI183967为母本,以新泰密刺纯系为父本构建了含129个株系的重组自交系群体,对黄瓜株型的相关性状进行表型调查;同时基于亲本和重... 详细信息

株型是影响作物产量和成本投入的重要因素,挖掘株型相关的QTLs将为黄瓜株型改良提供重要参考。以野生黄瓜PI183967为母本,以新泰密刺纯系为父本构建了含129个株系的重组自交系群体,对黄瓜株型的相关性状进行表型调查;同时基于亲本和重组自交系群体的重测序数据构建遗传连锁图谱,进而对黄瓜株型相关性状进行QTL定位分析。结果表明:基于重测序数据构建了包含598个bin标记的遗传连锁图谱,该图谱的遗传总长为1353 cM,标记间物理距离为352.8 kb;对株高、节间长度、节位数、侧枝数量和茎粗进行QTL分析,共定位到7个株型相关的QTLs,其中株高、节间长度各2个,节位数、侧枝数量、茎粗各1个;通过参考注释信息和查阅文献,初步筛选到9个可能与黄瓜株型相关的候选基因。

关键词：黄瓜株型重组自交系 QTL

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固体表面液滴定向运动行为研究进展

材料导报 2020年第13期34卷 13175-13193页

作者：胡海豹曹刚张梦卓杜鹏黄潇西北工业大学航海学院西安710072

液滴在固体表面定向运动极具研究价值,目前被广泛应用于水收集、油水分离、微流控、自清洁等领域,已成为表界面领域的研究热点。同时,液滴定向运动行为研究对理解液体与固体表面之间的作用机制具有重要意义。然而,目前对液滴定向运动的... 详细信息

液滴在固体表面定向运动极具研究价值,目前被广泛应用于水收集、油水分离、微流控、自清洁等领域,已成为表界面领域的研究热点。同时,液滴定向运动行为研究对理解液体与固体表面之间的作用机制具有重要意义。然而,目前对液滴定向运动的研究主要集中在宏观尺度观测与分析方面,缺乏对基本原理的深入探索,并且对实现液滴定向运动的基本条件认识不足。同时,人造仿生材料存在工艺复杂、成本高昂,以及运动距离相对较短、运动速度相对较小等缺点,限制了其适用范围。另外,虽然广大学者在液滴定向运动行为研究方面已经取得了较多成果,比如制得微型混合器、流体二极管等,但这些研究仅局限在实验室阶段,如何将其广泛应用于日常生活仍有待进一步研究。目前,学者们从液滴润湿性基本原理出发,发现仙人掌、猪笼草、瓶子草、蜘蛛丝、蝴蝶等天然材料表面可以实现液滴定向运动,其中,瓶子草绒毛表面液滴定向运动速度高达(11738±715)μm·s-1。在此基础上,广大学者通过静电纺丝、电化学腐蚀、光刻法、浸涂法等方式对仙人掌刺、猪笼草口缘、瓶子草绒毛、蜘蛛丝等做了进一步的仿生研究,其中仿蜘蛛丝实现了液滴的可逆运动和高效水收集。此外,受天然材料表面液滴定向运动启发,有学者研制了可实现液滴快速、长距离、方向可控运动的拓扑流体二极管,而结构简单的箭头状微结构更是为实际应用提供了可能。本文全面综述了近10年国内外学者在仙人掌、猪笼草、瓶子草、蜘蛛丝及蝴蝶等天然材料表面液滴定向运动行为方面的研究进展,从表面能梯度、Laplace压力梯度及毛细力等角度分析了固体表面液滴定向运动的基本原理,同时展示了国内外在仿生定向运动表面的典型研究实例。最后,对该领域未来的研究工作提出了一些建议。

关键词：液滴固体表面定向运动仿生

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连续吹喷-抽吸控制方法对圆柱尾流的影响

兵工学报 2021年第5期42卷 1016-1022页

作者：任刘珍李霖张梦卓冯家兴胡海豹西北工业大学航海学院陕西西安710072

钝体后方的流动分离会诱发阻力大幅增加、升力上下波动等严重后果,有效控制钝体的流动分离对提升其力学性能至关重要。采用美国TSI公司出厂IFA300恒温热线风速仪,在小型低速风洞中较系统地研究了连续吹喷-抽吸控制方法对圆柱尾流的影响... 详细信息

钝体后方的流动分离会诱发阻力大幅增加、升力上下波动等严重后果,有效控制钝体的流动分离对提升其力学性能至关重要。采用美国TSI公司出厂IFA300恒温热线风速仪,在小型低速风洞中较系统地研究了连续吹喷-抽吸控制方法对圆柱尾流的影响规律。测试结果表明:前缘连续抽吸与后缘连续吹喷联合的方法可大幅削弱圆柱的流动分离,减小尾流区范围,显著抑制尾流区的湍流度;而且在测试范围内,前缘连续抽吸和后缘连续吹喷的速度及角度增加均可提高流动控制效果,例如,在抽吸-吹喷角度分别为50°和70°、抽吸-吹喷速度为3倍来流速度时,圆柱尾部低速区基本消失,湍流度大幅降低,甚至不足未施加控制时湍流度的5%。通过对比单独前缘连续抽吸、单独后缘连续吹喷的控制效果发现,连续吹喷-抽吸控制方法中,后缘吹喷的贡献大于前缘抽吸,是实现圆柱尾部流场高效控制的关键。

关键词：圆柱尾流流动分离主动控制连续吹喷-抽吸控制

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超疏水表面水下电解补气方法研究

实验流体力学 2020年第1期34卷 67-71页

作者：张梦卓胡海豹杜鹏黄潇西北工业大学航海学院机械与动力工程系西安710072

利用石墨电极电解装置,研究了人工海水电解过程中电流随电极极距和数目的变化规律,并观察了矩形管道中电解装置在不同工作电压下超疏水表面的气膜状态,验证了超疏水表面电解补气的可行性。结果表明:电解装置工作过程中电压与电流呈线性... 详细信息

利用石墨电极电解装置,研究了人工海水电解过程中电流随电极极距和数目的变化规律,并观察了矩形管道中电解装置在不同工作电压下超疏水表面的气膜状态,验证了超疏水表面电解补气的可行性。结果表明:电解装置工作过程中电压与电流呈线性关系,在电压一定的条件下,电流随电极数目的增加而增加,随极距的增加而减小。计算电解效率后发现,增加电极数目虽然有利于提高电流,但是电解效率却有所下降。在湍流流动中,观测到超疏水表面气膜在水流冲刷下破坏消失,当电解装置在低电压下工作时,产气量较小,补气装置呈间歇工作状态,并只能使部分超疏水表面气液界面恢复;当增加电压后,电解装置产气量增加,可以观察到更加明显的镜面现象,证明了超疏水电解补气装置的可行性。

关键词：超疏水表面气膜补气海水电解