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基于高通量测序技术对浙江传统发酵蔬菜微生物多样性的解析

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食品科学 2021年第6期42卷 178-185页

作者：鲍伟韩姣姣张旨轩芦晨阳周君明庭红李晔苏秀榕宁波大学农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室浙江宁波315211 宁波大学海洋学院浙江宁波315832 宁波大学食品与药学学院浙江宁波315832

以浙江地区传统发酵蔬菜臭冬瓜、臭苋菜梗、酸笋和酸茭白为研究对象,采用Illunina MiSeq高通量测序技术,分别分析浙江传统发酵蔬菜的汁液、固形物和培养物中细菌和真菌微生物群落组成和多样性,探讨“臭”和“酸”类发酵食品的微生物群... 详细信息

以浙江地区传统发酵蔬菜臭冬瓜、臭苋菜梗、酸笋和酸茭白为研究对象,采用Illunina MiSeq高通量测序技术,分别分析浙江传统发酵蔬菜的汁液、固形物和培养物中细菌和真菌微生物群落组成和多样性,探讨“臭”和“酸”类发酵食品的微生物群落组成差异。结果表明:14个样品中细菌和真菌的测序覆盖率分别为0.97和0.99。分析细菌,臭苋菜梗固形物的可操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)最多、Shannon指数最高;而酸笋固形物中的OTU最少,酸笋汁的Shannon指数最低;且臭苋菜梗汁、固形物和培养物以及酸笋固形物和培养物的菌群结构更为接近。分析真菌,臭冬瓜培养物和酸茭白固形物中的真菌OTU最多,臭苋菜梗培养物中的OTU最少,而酸茭白汁中没有检测出真菌;酸笋汁的Shannon指数最高,臭苋菜梗培养物的Shannon指数最低;除卤水、臭苋菜梗汁和酸笋样品外其余样品的真菌群落组成更为接近。在属水平,臭冬瓜培养物、酸笋汁、酸笋固形物和酸茭白汁的优势细菌属分别为脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、埃希菌属(Escherichia)和Caproiciproducens,卤水培养物、酸茭白固形物和培养物的优势细菌属为梭菌属(Clostridium),臭苋菜梗汁、固形物和培养物的优势细菌属为拟杆菌属(Bacteroides),卤水、臭冬瓜汁和固形物的优势细菌属为乳酸杆菌属(Lactobacillus);卤水的优势真菌属为柯达酵母属(Kodamaea),臭苋菜梗汁、固形物和培养物的优势真菌属为假丝酵母属(Candida),而其他样品的优势真菌属为Leptospora。

关键词：传统发酵蔬菜酸笋和酸茭白 16S rDNA高通量测序微生物多样性

丙型病毒性肝炎供者器官在实体器官移植中的应用现状与展望

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器官移植 2024年第3期15卷 390-397页

作者：秦旨文张武浙江中医药大学杭州310000 树兰(杭州)医院肝胆胰外科

丙型病毒性肝炎供者器官作为一种边缘性器官已经被应用于实体器官移植中,在有效缓解器官短缺现况的同时,也面临着一些挑战,如丙型肝炎病毒(HCV)传播。但随着直接抗病毒药物的出现和应用,丙型病毒性肝炎的治愈逐渐成为现实,这也为丙型病... 详细信息

丙型病毒性肝炎供者器官作为一种边缘性器官已经被应用于实体器官移植中,在有效缓解器官短缺现况的同时,也面临着一些挑战,如丙型肝炎病毒(HCV)传播。但随着直接抗病毒药物的出现和应用,丙型病毒性肝炎的治愈逐渐成为现实,这也为丙型病毒性肝炎患者成为器官移植供者奠定了基础。目前,在抗病毒药物的辅助治疗下,丙型病毒性肝炎供者实体器官移植取得了一定的疗效。因此,本文总结丙型病毒性肝炎供者肾脏、心脏、肺脏及肝脏等移植的研究现状,就丙型病毒性肝炎供者在实体器官移植中的应用情况及抗病毒药物辅助治疗的安全有效性做一综述,探究丙型病毒性肝炎供者在实体器官移植中可行性,以期为扩大器官移植供体池提供参考,减少终末期疾病患者器官移植的等待时间。

关键词：丙型病毒性肝炎丙型肝炎病毒边缘供者实体器官移植直接抗病毒药物持续病毒学应答病毒血症供者短缺

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多层六方氮化硼中铁电调控的力电耦合

中国科学：物理学、力学、天文学 2024年第5期54卷 170-179页

作者：郭瀚泽轩啸宇张助华南京航空航天大学航空航天结构力学及控制全国重点实验室纳智能材料器件教育部重点实验室国际前沿科学研究院南京210016

近期在范德华材料中发现的滑移铁电性因其具备在原子厚度上实现微型功能器件的潜力而引起了广泛的兴趣.然而,由于元件层间的范德华耦合相对较弱,导致固有的电极化强度较低,在很大程度上制约了该性质的实际应用.我们以多层六方氮化硼(h-... 详细信息

近期在范德华材料中发现的滑移铁电性因其具备在原子厚度上实现微型功能器件的潜力而引起了广泛的兴趣.然而,由于元件层间的范德华耦合相对较弱,导致固有的电极化强度较低,在很大程度上制约了该性质的实际应用.我们以多层六方氮化硼(h-BN)为例,采用从头算方法,发现施加垂直压力可以显著增强滑移铁电性.在4.63 GPa的中等压力下,双层和三层h-BN的极化强度分别提高了125.58%和104.79%.此外,当弯曲多层h-BN材料时,铁电可以与挠曲电进一步耦合,从而产生更大的电极化.值得注意的是,这一具有的压力增强电极化效应的铁电性可以在无需外加电场的情况下调节弯曲双层h-BN的带隙.这些结果凸显了滑移铁电性可作为一种新的自由度来调控范德华材料中的力电耦合.

关键词：滑移铁电垂直压力多层六方氮化硼力电耦合

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基于多源数据的智慧养老服务供需匹配研究

上海理工大学学报 2024年第2期46卷 214-224页

作者：张语轩耿秀丽潘飞上海理工大学管理学院上海200093

针对智慧养老服务中供需双方评价信息的表达存在不确定性和模糊性以及供需不匹配的问题,提出了一种基于多源数据的模块化双边匹配决策方法。该方法无需将信息统一,减少了信息处理损失。考虑老年群体存在需求差异的情况,利用两步聚类法... 详细信息

针对智慧养老服务中供需双方评价信息的表达存在不确定性和模糊性以及供需不匹配的问题,提出了一种基于多源数据的模块化双边匹配决策方法。该方法无需将信息统一,减少了信息处理损失。考虑老年群体存在需求差异的情况,利用两步聚类法对其进行分类;针对智慧养老服务评价属性异质性特点,采用概率语言术语、直觉模糊数处理定性评价信息,用精确数处理定量评价信息;通过改进离差最大化法计算属性权重;运用折衷解决方法得到双边效用满意度,构建双边匹配模型。最后通过上海市老年群体智慧养老供需匹配仿真实验对方法的可行性和合理性进行验证。结果表明,所提方法识别出了5类老年群体,可以为不同特征的老年群体匹配不同的智慧养老服务。

关键词：多源数据两步聚类双边匹配智慧养老折衷解决方法

结合夜光遥感的成渝城市群城市经济发展特征变化分析

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自然资源遥感 2024年

作者：牛振生杨鑫陈超廖祥张小轩河南工程学院土木工程学院成都理工大学地球科学学院成都理工大学地球勘探与信息技术教育部重点实验室

为解决传统经济数据缺乏空间信息、难以反映区域经济发展的空间差异性及动态变化特征等问题,利用夜间灯光数据结合土地利用数据、社会经济数据,构建成渝地区国内生产总值(gross domestic product,GDP)空间化模型,使用趋势分析、修正引... 详细信息

为解决传统经济数据缺乏空间信息、难以反映区域经济发展的空间差异性及动态变化特征等问题,利用夜间灯光数据结合土地利用数据、社会经济数据,构建成渝地区国内生产总值(gross domestic product,GDP)空间化模型,使用趋势分析、修正引力模型等方法,在像元尺度和经济关联性上对成渝地区经济发展特征进行分析。结果表明:基于多源数据所构建的GDP空间化模型精度较高,其误差均不超过1.1%;成渝地区GDP密度快速增长的区域主要位于成都市和重庆市主城区周围,其占比约为73.9%,且经济集聚特征较明显的地区仍主要分布于该区域;成渝地区城市间的经济关联强度不断加深,城市综合发展质量稳步提升,成都市与其周边城市的经济联系最为密切。综合来看,成渝地区区域内经济呈现出“双核驱动发展”的空间特征,经济关联强度逐渐增强。研究可为成渝城市群经济高质量发展提供数据支持和方法依据。

关键词： NPP/VIIRS夜间灯光数据 GDP空间化成渝城市群修正引力模型经济发展

产三峡肽素的草酸青霉SG-4的全基因组测序

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生物学杂志 2024年

作者：张极峰白晓轩刘超李婧李奥刘士平三峡大学生物与制药学院

为充分解析草酸青霉SG-4的遗传信息,利用二代Illumina测序和三代PacBio测序相结合的方法对SG-4的全基因组进行测序,经过基因组组装、基因预测和功能注释后,对全基因组进行共线性分析和次级代谢产物合成基因簇预测。结果表明,草酸青霉SG-... 详细信息

为充分解析草酸青霉SG-4的遗传信息,利用二代Illumina测序和三代PacBio测序相结合的方法对SG-4的全基因组进行测序,经过基因组组装、基因预测和功能注释后,对全基因组进行共线性分析和次级代谢产物合成基因簇预测。结果表明,草酸青霉SG-4基因组全长为31.17 Mb,GC含量为50.5%,包括线粒体基因组在内,共由9条Scaffold组成,含有8 430个蛋白质编码基因、175个tRNA和50个rRNA基因。与swiss-prot、Pfam、NR、GO和KEGG等数据库相比,COG数据库注释的基因数最多,可达7483个。共线性分析结果表明,SG-4与数据库中报道的其他草酸青霉的同源性有一定差异,且存在多处异位重排现象。通过生物信息学分析发现,SG-4基因组中有28个次级代谢产物生物合成基因簇,其中,14个基因簇的功能未见报道,将NRPS相关基因簇与转录组数据进行对应的同时,分析与三峡肽素合成趋势的相关性,得到9条基因簇,经前期实验验证其中有一条可能是负责三峡肽素合成的候选基因簇。研究丰富了草酸青霉的基因组信息,为全面了解草酸青霉的基因组信息、揭示三峡肽素的生物合成途径奠定基础。

关键词：草酸青霉 SG-4 基因组基因注释三峡肽素

丝状真菌转录因子调控非核糖体肽合成酶介导的次级代谢产物合成研究进展

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食品工业科技 2024年第17期45卷 445-453页

作者：白晓轩张极峰李婧李奥刘士平三峡大学生物与制药学院湖北宜昌443002

丝状真菌(Filamentous fungi)产生的次级代谢产物(Secondary Metabolites,SM)广泛应用于生物医药、生物防治及食品等领域。大多数SM的生物合成与非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptide synthetase,NRPS)的催化密切相关,故NRPS的表达调... 详细信息

丝状真菌(Filamentous fungi)产生的次级代谢产物(Secondary Metabolites,SM)广泛应用于生物医药、生物防治及食品等领域。大多数SM的生物合成与非核糖体肽合成酶(Nonribosomal peptide synthetase,NRPS)的催化密切相关,故NRPS的表达调控对SM的生物合成至关重要。为了深入了解丝状真菌NRPS基因簇的表达调控模式,本文就通路特异性和全局性两种转录因子调控丝状真菌NRPS介导SM生成的研究进展进行了综述,以期深化对丝状真菌中转录因子调控NRPS介导的SM生成机制的认识,为丝状真菌天然产物的开发提供参考依据。

关键词：转录因子丝状真菌非核糖体肽合成酶(NRPS) 次级代谢产物生物合成

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我国餐厨废弃油脂回收利用现状及产业化分析

中国油脂 2024年

作者：敬加强丁庆薇罗双子依吴承轩张少冬四川省油气消防重点实验室西南石油大学石油与天然气工程学院西南财经大学国际商学院

据估计，我国每年产生的餐厨废弃油脂可达500万吨以上，资源利用价值相当高。但当前废弃油脂有效利用率不足10%，废弃油脂一方面回流餐桌可能带来食品安全问题，另一方面随意排放可能造成环境污染。因此，为保障公众饮食安全和促进废弃... 详细信息

据估计，我国每年产生的餐厨废弃油脂可达500万吨以上，资源利用价值相当高。但当前废弃油脂有效利用率不足10%，废弃油脂一方面回流餐桌可能带来食品安全问题，另一方面随意排放可能造成环境污染。因此，为保障公众饮食安全和促进废弃油脂资源的合理利用，通过相关文献的系统调研与全面分析，结合专家咨询与实地考察，系统分析其回收技术发展现状及其产业化瓶颈，研究提出其技术与产业化的竞争优势及相关政策支持建议。结果表明，废弃油脂回收利用产业化具有市场规模大、能源转型与环保需求高、国家政策支持等竞争优势，但我国废弃油脂回收利用目前仍存在规模较小、产业化不足、保障体系不健全等问题，亟待政府、高校、企业及公众应共同努力推动废弃油脂回收利用的产业化发展。

关键词：废弃油脂回收利用发展现状竞争优势产业化建议

污水处理厂化学品环境归趋模型研究现状及展望

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环境化学 2024年

作者：司鸿德张少轩张冰范科文王通张嘉之北京市市政工程设计研究总院有限公司北京大学环境科学与工程学院环境模拟与污染控制国家重点联合实验室生态环境部南京环境科学研究所

污水处理厂化学品环境归趋模型是化学品末端管控的重要工具.当前针对污水处理厂中化学品迁移、转化和分布预测的模型开发及应用逐渐增加，但相关模型种类较多、适用性各具特点，尚缺乏污水处理厂化学品环境归趋模型的综合比较和应用清... 详细信息

污水处理厂化学品环境归趋模型是化学品末端管控的重要工具.当前针对污水处理厂中化学品迁移、转化和分布预测的模型开发及应用逐渐增加，但相关模型种类较多、适用性各具特点，尚缺乏污水处理厂化学品环境归趋模型的综合比较和应用清单报道.本文汇总了目前已用于污水处理厂内化学品环境归趋模拟的模型与化学品适用清单，根据模型建模机理，将其分为三类：基于逸度原理（STP）、基于质量浓度（SimpleTreat、WW-TREAT、WATER9、TOXCHEM和WEST等）以及基于活度原理（Activity SimpleTreat）的污水处理厂化学品环境归趋模型.本文系统性介绍了相关模型的基本结构、原理和不同场景下化学品归趋研究的应用情况，概述其在表达形式、输入参数、输出结果以及适用案例等方面的局限性和优点，结合数百个模拟/监测数据集进一步验证各类模型的准确性，并探讨其不确定性重要来源.文章为目前污水处理厂化学品环境归趋模拟研究提供了更清晰的现状分析，为新污染物末端治理工具的选择提供了参考依据，并总结了该领域的发展趋势和前景.

关键词：化学品环境归趋污水处理模型