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黑果枸杞MSAP技术体系的构建

青海大学学报 2024年第2期42卷 35-42页

作者：刘晓雯张得芳王占林青海大学农林科学院青海省高原林木遗传育种重点实验室青海西宁810016

为利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)构建黑果枸杞MSAP技术反应体系,本试验采用CTAB法提取黑果枸杞DNA,通过双酶切、预扩增和选择性扩增对16对引物的多态性进行初步筛选并构建MSAP技术体系。结果表明:双酶切进行12 h,DNA模板能够酶切... 详细信息

为利用甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP)构建黑果枸杞MSAP技术反应体系,本试验采用CTAB法提取黑果枸杞DNA,通过双酶切、预扩增和选择性扩增对16对引物的多态性进行初步筛选并构建MSAP技术体系。结果表明:双酶切进行12 h,DNA模板能够酶切完全;预扩增反应产物条带集中在250~1000 bp处,选择性扩增可筛选出6对引物组合,条带明显。本研究为后续黑果枸杞DNA甲基化水平的相关分析研究奠定了基础。

关键词：黑果枸杞甲基化敏感多态性扩增技术(MSAP) DNA甲基化引物组合

不同浓度K^(+)处理下枸杞K^(+)通道相关基因表达水平分析

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中南林业科技大学学报 2022年第6期42卷 55-64页

作者：于倩张得芳青海大学农林科学院青海西宁810016 青海大学青海省高原林木遗传育种重点实验室青海西宁810016

【目的】利用不同浓度的KCl溶液对‘青杞1号’的组培幼苗进行处理,对处理后的根部组织进行实验研究,研究并分析与钾离子通道相关的基因在宁夏枸杞中的表达模式。【方法】对不同浓度KCl处理后的宁夏枸杞幼苗根部进行RNA提取,采用实时荧... 详细信息

【目的】利用不同浓度的KCl溶液对‘青杞1号’的组培幼苗进行处理,对处理后的根部组织进行实验研究,研究并分析与钾离子通道相关的基因在宁夏枸杞中的表达模式。【方法】对不同浓度KCl处理后的宁夏枸杞幼苗根部进行RNA提取,采用实时荧光定量PCR等方法,分析在不同浓度钾离子处理条件下,枸杞中钾离子通道相关基因表达量的变化情况。【结果】随着KCl处理浓度的增加,‘青杞1号’中KCO1B、TPK1、KT1、Cluster-17443.10870、Cluster-17443.69422和Cluster-17443.15033基因总体都为先上升再下降最后上升的趋势,其中,Cluster-17443.10870基因在K^(+)处理浓度变化至100 mmol/L时有一定程度的下降。KCO1B基因在150 mmol/L时表达量达到最大;KT1基因和Cluster-17443.69422基因在200 mmol/L时表达量达到最大;TPK1基因、Cluster-17443.10870基因和Cluster-17443.15033基因在350 mmol/L时表达量才达到最大。350 mmol/L K^(+)处理条件下各组基因的表达量都出现突然上升状态,预测此时钾通道活性已达到过饱和状态;在100 mmol/L K^(+)处理时,有多数基因的表达量低于对照组,预测此浓度下钾通道功能受抑制。其他浓度下各组基因的表达量都在中间处理浓度(150、200、250 mmol/L)时达到最大值,在最低(100 mmol/L)或最高(300 mmol/L)浓度处理时基因的表达量达到最小值。【结论】盐胁迫浓度的增加使宁夏枸杞钾离子通道相关基因的表达量总体呈现出先升后降再升和先升后降的变化趋势。本研究为今后研究枸杞钾盐胁迫调节机制提供了部分理论基础,为柴达木地区枸杞产业提质增效和盐碱地造林等工作提供理论支持,对促进绿色化、生态化枸杞种植产业的发展具有潜在意义。

关键词：宁夏枸杞 K^(+)通道基因相对表达量表达水平分析

不同浓度盐胁迫下枸杞实时荧光定量PCR内参基因的筛选

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沈阳农业大学学报 2022年第5期53卷 581-589页

作者：张得芳于倩史文君青海大学农林科学院西宁810016

合适的内参基因是实时荧光定量PCR反应准确与否的重要前提。选择茄科植物常用的5个内参基因(GAPDH、Actin、EF1α、UBI、18S)为候选基因,以不同浓度NaCl胁迫后的宁夏枸杞(Lycium barbarum)和黑果枸杞(Lycium ruthenicum)幼苗叶片为试验... 详细信息

合适的内参基因是实时荧光定量PCR反应准确与否的重要前提。选择茄科植物常用的5个内参基因(GAPDH、Actin、EF1α、UBI、18S)为候选基因,以不同浓度NaCl胁迫后的宁夏枸杞(Lycium barbarum)和黑果枸杞(Lycium ruthenicum)幼苗叶片为试验材料进行qRT-PCR反应,通过GeNorm、Normfinder和BestKeeper软件对这些内参基因的稳定性进行分析排序,从而筛选出最适合枸杞试验研究的内参基因。结果表明:利用GeNorm软件分析荧光定量结果后发现宁夏枸杞和黑果枸杞中都是Actin和GAPDH基因作为内参基因的表达较稳定;NormFinder软件分析结果发现宁夏枸杞中UBI稳定性最好,而在黑果枸杞中Actin基因最稳定;BestKeeper软件分析得出,在宁夏枸杞和黑果枸杞中均为Actin基因的稳定性最好。综合以上结果,在不同浓度的盐胁迫处理条件下,Actin基因的表达稳定性最好,是最适合用于钠离子胁迫下宁夏枸杞、黑果枸杞qRT-PCR分析研究的内参基因,有利于保证后续试验结果的准确性和可靠性。

关键词：宁夏枸杞黑果枸杞内参基因 qRT-PCR 盐胁迫

土壤含水量和光照对沙地柏光合生理指标的影响

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生态科学 2022年第1期41卷 77-83页

作者：崔英王占林张得芳樊光辉青海大学西宁810016 青海省农林科学院西宁810016 青海高原林木遗传育种重点实验室西宁810016

试验采用人工控制土壤水分的方法,测定不同土壤含水量条件及有效辐射强度下沙地柏苗木的蒸腾速率、净光合速率、水分利用效率等指标,分析沙地柏在不同土壤含水量和光照条件下影响的光合生理响应特征及其变化规律。土壤含水量(SWC)用称... 详细信息

试验采用人工控制土壤水分的方法,测定不同土壤含水量条件及有效辐射强度下沙地柏苗木的蒸腾速率、净光合速率、水分利用效率等指标,分析沙地柏在不同土壤含水量和光照条件下影响的光合生理响应特征及其变化规律。土壤含水量(SWC)用称重法测定,将硬塑盆中的土壤水分含量设置为7.5%,10%,12.5%,15%,17.5%,20%等6个不同的处理,每天进行称重,瞬时土壤水分含量用TDR100土壤水分测速仪(上海赛弗生物公司)测定,用Li-6400光合测定仪(美国LI-COR公司)测定沙地柏在不同土壤水分条件下光合生理指标。研究表明沙地柏的蒸腾速率、净光合速率均随着土壤含水量的增加呈先上升后下降的趋势。光合有效辐射在400—2000μmol·m^(-2)·s^(-1)范围内,沙地柏的净光合速率、蒸腾速率和水分利用率均呈现最高值。土壤水分含量在18.71%,17.99%和12.44%时,沙地柏的净光合速率、蒸腾速率和水分利用率达到最高值。土壤含水量12.44%—18.71%是沙地柏生长最适宜的土壤水分区间。在实践中利用沙地柏最适宜的土壤水分区间对沙地柏的栽植和生长可以进行有效地指导。

关键词：沙地柏光合生理指标土壤含水量光照

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基于转录组的唐古特白刺密码子偏好性分析

干旱区资源与环境 2021年第12期35卷 163-170页

作者：张得芳夏涛青海大学农林科学院西宁810016 青海之也科技咨询有限公司西宁810012

通过分析唐古特白刺转录组测序数据,从中筛选出28614条高质量序列为研究对象,利用CodonW、Excel等软件分析密码子偏好性使用规律。结果表明:唐古特白刺有效密码子数值分布在23.71-61之间,小于35的有94条,密码子的偏好性较弱,GC3_(S)的... 详细信息

通过分析唐古特白刺转录组测序数据,从中筛选出28614条高质量序列为研究对象,利用CodonW、Excel等软件分析密码子偏好性使用规律。结果表明:唐古特白刺有效密码子数值分布在23.71-61之间,小于35的有94条,密码子的偏好性较弱,GC3_(S)的平均含量为37.53%,说明唐古特白刺密码子第3位主要以A、T结尾。中性绘图、ENc-GC3_(S)分析、偏倚分析结果表明,唐古特白刺转录组密码子偏好性主要受突变压力的影响;以ENc值和RSCU值为参考标准,最终确定28个高频密码子(RSCU>1),其中以AU结尾的有25个,以G结尾的有3个,10个最优密码子中,9个以AU结尾,说明唐古特白刺转录组偏好以A/U结尾的密码子。经过对25种植物最优密码子的偏好性分析,真菌类以G/C结尾,双子叶植物多数以A/U结尾,密码子偏好性没有明显的规律性;15种植物的叶绿体基因组最优密码子的GC3_(S)数值在27-29之间,均以A/U结尾,呈现明显选择限制。研究结果为深入了解白刺转录组编码序列的碱基含量、密码子偏向性等基因序列特征提供信息,为有效的利用野生唐古特白刺资源提供理论基础。

关键词：唐古特白刺转录组密码子使用模式高频密码子

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染色体重排与物种分化

分子植物育种 2017年第1期15卷 279-289页

作者：张得芳青海大学农林科学院林业研究所青海高原林木遗传育种实验室西宁810016 青海大学三江源生态与高原农牧业国家重点实验室西宁810016

染色体重排和人类的一些遗传性疾病有很大的关系,同时也是一些动植物的物种形成和分化的重要原因。随着近年来在二代测序技术基础上的比较基因组学的发展,近缘物种间的染色体重排的研究越来越受到关注。本评述总结了染色体重排产生的方... 详细信息

染色体重排和人类的一些遗传性疾病有很大的关系,同时也是一些动植物的物种形成和分化的重要原因。随着近年来在二代测序技术基础上的比较基因组学的发展,近缘物种间的染色体重排的研究越来越受到关注。本评述总结了染色体重排产生的方式,基本类型及各自的细胞学和遗传学效应,举例说明了染色体重排在物种分化和新物种形成中的作用并介绍了染色体重排事件的研究方法和进展。通过这些信息,我们想为物种进化和分子标记辅助育种方面的研究人员提供参考和借鉴。

关键词：染色体重排物种分化遗传学效应细胞学效应

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香茶藨子果实与叶片成分测定与分析

中国野生植物资源 2023年第S1期42卷 12-20页

作者：马云婷张得芳史文君王志涛青海大学农林科学院青海西宁810016 青藏高原种质资源研究与利用实验室青海西宁810006

通过对香茶藨子的果实内含物质与叶片组成成分(多糖、总糖、总黄酮、多酚、维生素C、花青素、水分、粗纤维、蛋白质和17种氨基酸含量等)的测定分析,并通过与糖茶藨、青藏茶藨、门源茶藨,以及长刺茶藨4种青海野生茶藨子的研究比较证明,... 详细信息

通过对香茶藨子的果实内含物质与叶片组成成分(多糖、总糖、总黄酮、多酚、维生素C、花青素、水分、粗纤维、蛋白质和17种氨基酸含量等)的测定分析,并通过与糖茶藨、青藏茶藨、门源茶藨,以及长刺茶藨4种青海野生茶藨子的研究比较证明,香茶藨子果实的总糖、维生素C和维生素E的含量均超过了其他4种茶藨子,而花青素的含量也仅低于糖茶藨。与枸杞、白刺和沙棘比较发现,香茶藨子果实的总糖含量远优于白刺和沙棘,维生素C、维生素E的含量也远优于白刺和枸杞。香茶藨子果实中总黄酮、蛋白质与游离氨基酸的含量低于叶片。香茶藨子叶片的蛋白质与游离氨基酸含量高于枸杞和白刺叶片。结果表明:香茶藨子果实内含物具有高Vc、高VE、高总糖以及氨基酸种类丰富的特点,叶片也具有高蛋白质、高总黄酮和游离氨基酸丰富的特点,香茶藨子可做为发展高原新浆果与茶叶的补充产物;研究结果可为对未来香茶藨子资源的开发研究和利用提供理论依据。

关键词：香茶藨子内含物成分高原浆果叶片

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气候变化背景下花叶海棠的适生区分析和预测

青海大学学报 2023年第6期41卷 24-31,47页

作者：史文君张得芳郭旭栋青海大学农林科学院青海西宁810016 青海高原种质资源研究与利用实验室青海西宁810016

为保护我国特有种花叶海棠[Malustransitoria(Batalin)C.K.Schneider],并选择合适的人工栽培区域,本研究基于86个花叶海棠精确分布点和13个气候因子,利用MaxEnt建立最大熵模型,计算花叶海棠在过去3个气候时期、当前气候条件下及未来气... 详细信息

为保护我国特有种花叶海棠[Malustransitoria(Batalin)C.K.Schneider],并选择合适的人工栽培区域,本研究基于86个花叶海棠精确分布点和13个气候因子,利用MaxEnt建立最大熵模型,计算花叶海棠在过去3个气候时期、当前气候条件下及未来气候条件下潜在的分布区,预测气候变化条件下花叶海棠潜在的分布变化趋势及可能的质心迁移路线。根据模型分析发现,影响花叶海棠在我国分布的最主要气候因子为最冷季度平均温度,其次为最冷月最低温度和最干季度平均温度,3个因子的贡献率分别为13.05%、12.08%和11.36%。当前气候下花叶海棠适生区占我国国土面积的26.82%,高适生区以甘肃南部与宁夏南部为中心,主要分布在青海东部、陕西北部、四川北部和西藏东南部地区。随着气候变化,花叶海棠分布区域也在不断迁移,其在我国的潜在分布区会随着温度的增加而增加,同时适生区也在不断北移,未来气候条件下分布质心可能会迁移至内蒙古南部。该结果为其种质资源发掘和保护、人工驯化和栽培方面提供基础数据和科学依据。

关键词：花叶海棠 MaxEnt模型适生区气候变化地理分布

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林木核心种质构建研究进展

青海农林科技 2023年第4期 37-41页

作者：马云婷史文君张得芳青海大学农林科学院青海西宁810016 青海高原种质资源研究与利用实验室青海西宁810016 国家林草局青海高原林木遗传育种重点实验室青海西宁810016

本文主要综述了构建林木核心种质资源的重要性、方法,分子标记在构建核心种质资源中的应用及未来发展展望。这将为林木种质资源的有效利用和保护提供参考。

关键词：林木资源核心种质构建