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海南省2022年emm12型A族链球菌基因组及药物敏感性特征分析

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中国热带医学 2024年第6期24卷 659-663页

作者：孙初阳吴庆梓蔡英桂甘晓婷王素王吉晓张亚淋遇晓杰海南省疾病预防控制中心海南省预防医学科学院海南海口571129

目的了解海南emm12型A族链球菌(group A Streptococcus, GAS)基因组特征及对目前常用抗菌药物的敏感性,为猩红热等GAS相关疾病提供病原学数据。方法基于2022年海南省呼吸道症候群监测获得的咽拭子分离GAS菌株,应用高通量测序技术对所... 详细信息

目的了解海南emm12型A族链球菌(group A Streptococcus, GAS)基因组特征及对目前常用抗菌药物的敏感性,为猩红热等GAS相关疾病提供病原学数据。方法基于2022年海南省呼吸道症候群监测获得的咽拭子分离GAS菌株,应用高通量测序技术对所分离菌株进行基因组测序和emm基因分型、基因多位点序列分型(multi-locus sequence typing, MLST)、耐药基因与毒力基因预测,利用MEGA 10.1.8最大似然法(maximum likelihood, ML)绘制系统进化树。采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration, MIC)进行药敏试验。结果 2022年海南呼吸道症候群监测分离的4株GAS分离株均为emm12/ST36型,毒力基因除emm基因外,共检测到7种超抗原基因speB(100%)、speI(75%)、speH(75%)、speC(100%)、ssa(100%)、sme Z(100%)、speG(100%)。所有菌株均携带大环内酯类耐药基因ermB和ermTM、四环素耐药基因tet(M),均不携带耐药基因mefA,对红霉素、克林霉素、四环素耐药率100%,对青霉素仍保持高度敏感。系统进化树分析显示,海南分离株均集中在同一分支上。结论 2022年海南GAS优势基因型为emm12型,MLST分型与emm分型具有一致性。携带的耐药基因与药敏实验结果一致,海南地区青霉素等β-内酰胺类药物可继续作为GAS临床治疗首选药物,需扩大菌株量进一步监测。

关键词：猩红热 A族溶血性链球菌 emm12型超抗原药物敏感性

城市对海口市南渡江的微生物群落及其毒力因子与抗生素耐药基因组的影响

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中华流行病学杂志 2023年第6期44卷 974-981页

作者：范宇峰李臻鹏遇晓杰李哲周海健张亚淋甘晓婷华德卢昕阚飙中国疾病预防控制中心传染病预防控制所腹泻病室北京102206 海南省疾病预防控制中心检验检测所海口570203 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所/传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的探讨河流流经海口市前后河水中细菌菌群结构、抗生素耐药基因组和病原菌毒力基因组的变化,及其传播扩散模式。方法从流经海口市前的南渡江上游至南渡江入海口划分前、中、后段3个研究区域,每个区域选择3个采样点,每个采样点平行采集... 详细信息

目的探讨河流流经海口市前后河水中细菌菌群结构、抗生素耐药基因组和病原菌毒力基因组的变化,及其传播扩散模式。方法从流经海口市前的南渡江上游至南渡江入海口划分前、中、后段3个研究区域,每个区域选择3个采样点,每个采样点平行采集6份样本并混合为1份,每份3 L。通过宏基因组测序和16S rRNA基因全长测序获得相关生物信息数据,分析前、中、后3段水体中微生物群落结构以及耐药基因、毒力因子和可移动遗传元件信息。运用主坐标分析、普氏分析和曼特尔检测等方法分析样本间菌群分布差异以及传播模式相关性。结果随着河水流经海口市,微生物的α多样性呈现逐渐降低趋势。其中变形菌门在前、中、后段的细菌群落中均占据主导地位,中、后段变形菌门相对丰度高于前段。抗生素耐药基因、毒力因子及可移动遗传元件的多样性和丰度在前段均处于较低水平,流经海口市后,均明显升高。同时,可移动遗传元件介导的水平传播在抗生素耐药基因和毒力因子扩散中发挥较大作用。结论城市化对河流中的微生物及其携带的耐药基因、毒力因子和可移动遗传元件产生显著影响。在海口市南渡江,河流流经城市受纳了人群排出的抗生素耐药菌和病原相关细菌,同时抗生素耐药基因和毒力因子在细菌中的富集,显示了城市人群排出的抗生素耐药菌和病原菌对环境健康和公共卫生的威胁。流经城市前后微生物组和抗生素耐药基因组的比较,也可成为有价值的抗生素耐药扩散监测预警指标。

关键词：菌群结构耐药基因毒力因子城市化

人民币汇率变动对我国电子信息产业进出口贸易影响研究

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人民币汇率变动对我国电子信息产业进出口贸易影响研究

作者：张亚淋重庆师范大学

学位级别：硕士

二十一世纪是信息化的世纪,信息资源和信息技术作为世界各国经济发展最主要的推动力量,是社会扩大再生产的基础。我国电子信息产业抓住全球IT行业分工与跨国转移机遇,发挥比较优势,实现了从新兴产业到支柱产业和国民经济主导产业的历史... 详细信息

二十一世纪是信息化的世纪,信息资源和信息技术作为世界各国经济发展最主要的推动力量,是社会扩大再生产的基础。我国电子信息产业抓住全球IT行业分工与跨国转移机遇,发挥比较优势,实现了从新兴产业到支柱产业和国民经济主导产业的历史性跨越,成为我国国民经济的重要产业之一。2005年-2015年,我国电子信息产业的进出口贸易总额占我国进出口贸易总额的比重均在30%以上,这足以说明电子信息产业在我国进出口贸易中的重要地位。汇率作为调节杠杆,在国际贸易中发挥着非常重要的作用。那么,人民币汇率与我国电子信息产业的进出口贸易之间也必然存在某种联系。2005年7月我国实行汇改以来,我国电子信息产业的进出口贸易总额连年增长。电子信息产业作为我国进出口贸易的重要组成部分,对促进我国经济增长有着举足轻重的作用。因此,了解人民币汇率变动对我国电子信息产业进出口贸易发展的影响具有非常重要的意义。本文首先对我国电子信息产业的结构和现状进行详细的分析,了解我国电子信息产业的发展趋势。其次,通过基础理论分析,了解人民币汇率变动对我国电子信息产业进出口贸易的影响;在实证方面,以2005年-2015年的季度进出口数据为分析样本,同时选取此期间的人民币汇率做为因变量,我国GDP和我国电子信息产业主要出口国GDP之和为控制变量,通过单位根检验、协整分析、VAR模型以及IRF响应函数对数据进行实证分析。本文研究表明:通过对我国电子信息产业的主要贸易方式的贸易额进行统计分析,得出我国电子信息产业进出口贸易中,进料加工贸易和来料加工装配贸易随着人民币的升值,其贸易额逐渐减少,而一般贸易和保税区仓储转口货物的贸易额随着人民币的升值逐渐增加。通过对我国电子信息产业主要进出口产品的贸易额进行统计分析,得出计算机类产品由于高附加值的特性,其贸易额并不随汇率变化有明显的变化趋势。通过对我国电子信息产业总体的进出口额进行计量分析,得出人民币汇率变动对我国电子信息产业出口贸易的影响存在滞后效应。且人民币贬值可使我国电子信息产业进口减少、出口增加,因此人民币贬值可有效改善我国贸易收支状况。此外通过回归模型分析,我国电子信息产业主要出口国GDP加权之和对我国电子信息产业出口额的影响系数为2.86,即主要出口国的GDP之和每增加1%,我国电子信息产业的出口额便会增加2.86%,其影响效果较为显著,说明谋求经济共同发展可以使贸易各国共同受益。通过前文的理论分析和实证检验,最后提出促进我国电子信息产业贸易发展的相关建议。

关键词：汇率变动电子信息产业进出口贸易

2020年海南省人源沙门菌耐药性及携带耐药基因分析

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疾病监测 2023年第6期38卷 722-728页

作者：华德王鲁彦邝仕壮吴清波甘晓婷张亚淋遇晓杰吴庆梓海南省疾病预防控制中心海南海口570203 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的了解海南省人源沙门菌耐药性及携带耐药基因情况,并对耐药基因与耐药表型一致性关系进行初步评价。方法对2020年收集自海南省腹泻患者粪便中分离的63株沙门菌,开展血清学鉴定、药物敏感性检测以及全基因组测序,使用ResFinder数据库... 详细信息

目的了解海南省人源沙门菌耐药性及携带耐药基因情况,并对耐药基因与耐药表型一致性关系进行初步评价。方法对2020年收集自海南省腹泻患者粪便中分离的63株沙门菌,开展血清学鉴定、药物敏感性检测以及全基因组测序,使用ResFinder数据库对耐药基因进行注释和分析,并对耐药表型及耐药基因进行关联分析。结果63株沙门菌对氨苄西林、复方新诺明的耐药率较高,达50.00%以上,对三代头孢的耐药率达15.00%以上,多重耐药现象明显,多重耐药率达44.44%。菌株携带多种类型的耐药基因,特别是氨基糖苷类耐药基因,携带率达100.00%。耐药基因与耐药表型关联分析发现:β-内酰胺类药物耐药基因与氨苄西林和头孢噻肟耐药表型一致好,耐药基因预测耐药表型的准确率分别为88.89%和98.41%。在去除单独parC基因突变的情况下,喹诺酮类耐药基因预测结果与表型一致性较好,Kappa值达0.50以上。结论海南省人源沙门菌对多种抗菌药物耐药水平高,存在多重耐药现象。菌株携带多种类型的耐药基因,其中,β-内酰胺类药物耐药基因的存在能准确地预测耐药表型,而喹诺酮类耐药基因的预测准确性相对较弱。本研究为这两类药物耐药基因检测替代药敏实验提供了初步依据,但尚需扩大菌株数量进行更准确细致的关联研究。

关键词：沙门菌耐药全基因组测序耐药基因

2015年湖南省郴州市重点人群碘营养水平调查分析

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中华地方病学杂志 2017年第9期36卷 667-670页

作者：朱韩武邓安平张亚淋李成华段良松湖南省郴州市疾病预防控制中心地方病防治科郴州423000 湖南省郴州市疾病预防控制中心理化检验科郴州423000

目的了解分析湖南省郴州市重点人群碘营养水平，为科学调控碘缺乏病防治策略提供依据。方法2015年按照《湖南省碘缺乏病监测方案（试行）》要求，抽取郴州市全部11个县（市、区），每个县（市、区）按东、西、南、北、中各抽取1个乡镇... 详细信息

目的了解分析湖南省郴州市重点人群碘营养水平，为科学调控碘缺乏病防治策略提供依据。方法2015年按照《湖南省碘缺乏病监测方案（试行）》要求，抽取郴州市全部11个县（市、区），每个县（市、区）按东、西、南、北、中各抽取1个乡镇，每个乡镇抽取4个行政村，每个行政村抽取15户居民采集食用盐样；每个乡镇抽取1所小学。每所小学抽取40名8～10岁儿童（男、女各半）采集尿样，并检查甲状腺肿大情况；每个乡镇抽取20名孕妇采集尿样。分别采用直接滴定法和砷铈催化分光光度法测定盐碘和尿碘含量，采用触诊法检查甲状腺肿大情况。结果2015年全市共监测居民食用盐3300份，盐碘中位数为25．2mg／kg。碘盐覆盖率、合格碘盐食用率分别为99．61％（3287／3300），95．30％（3145／3300），均达到碘缺乏病消除标准。共检测2200份8～10岁儿童尿样，尿碘含量中位数为238．98μg／L，各县（市、区）儿童尿碘含量比较差异有统计学意义（H=32．25，P〈0．01）。共检查2200名8-10岁儿童，未发现甲状腺肿大情况。共检测1100份孕妇尿样，尿碘含量中位数为204．25μg／L，各县（市、区）孕妇尿碘含量比较差异有统计学意义（H=117．47，P〈0．01）。结论郴州市重点人群碘营养水平总体处于适宜水平，但仍需持续加强碘缺乏病防治监测和健康教育。

关键词：儿童孕妇碘缺乏症盐类尿

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病毒学报 2022年第6期38卷 1281-1288页

作者：孙初阳遇晓杰蔡英桂李丹丹黄涵曾祥洁王如敏陈海云曾云婷潘正帆邝仕壮甘晓婷张亚淋吴庆梓陈言海南省疾病预防控制中心海口570203

本文对2021年海南省2例感染引起本土轻型新冠肺炎病例的新冠病毒进行全基因组测定和序列分析,研究该病毒的分子特征和分子进化规律。通过荧光定量RT-PCR法检测ORF1ab和N靶基因,应用Illumina公司的MiSeq深度测序平台进行全基因组序列测定... 详细信息

本文对2021年海南省2例感染引起本土轻型新冠肺炎病例的新冠病毒进行全基因组测定和序列分析,研究该病毒的分子特征和分子进化规律。通过荧光定量RT-PCR法检测ORF1ab和N靶基因,应用Illumina公司的MiSeq深度测序平台进行全基因组序列测定,使用MEGA 10.1.8和DNASTAR 7.0.1生物信息学软件进行多序列比对和分析,并采用邻位归并法(Neighbour-joining)绘制系统进化树。2例新冠病毒(HN0801和HN0802)均属于德尔塔变异株,与武汉参考序列(NC_045512)基因序列相似性分别为99.7%和99.8%,系统进化树显示它们位于同一进化分支(B.1.617.2)的不同簇上,共有45个核苷酸突变位点,引起38个氨基酸位点改变,其中34个错义突变、6个同义突变、4个氨基酸位点缺失;刺突(S)糖蛋白发现B.1.617.2谱系共同突变特征L452R、T478K,以及T19R、G142D、D614G、P681R、D950N、R158G关键变异位点。HN0801同2021年7月江苏省南京市代表株基因序列100%相似,而HN0802与南京市疫情代表株基因组相似性较低。结合流行病学调查和基因组序列分析,这2例新冠病毒均属于新冠病毒德尔塔变异株,2例确诊病例之间没有明确的流行病学关联,为两条不同的传播链引起的相互独立的散发病例。本研究为海南省新冠病毒变异株的监测和新冠疫情防控提供了基础数据。

关键词：新型冠状病毒德尔塔全基因组变异株

2022年海南省新型冠状病毒奥密克戎(BA.1.1)变异株基因特征分析

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病毒学报 2023年第6期39卷 1642-1649页

作者：孙初阳邱丽李丹丹苏林梁蔡英桂邝仕壮陈海云吴庆梓甘晓婷王如敏曾云婷张亚淋潘正帆崔蕾遇晓杰马焱海南省疾病预防控制中心海口570203

为进一步积累和完善海南省新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株病原学特点的认识,本研究对2022年海南省14例感染奥密克戎(BA.1.1)变异株病例进行新冠病毒基因特征分析。... 详细信息

为进一步积累和完善海南省新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)奥密克戎(Omicron)变异株病原学特点的认识,本研究对2022年海南省14例感染奥密克戎(BA.1.1)变异株病例进行新冠病毒基因特征分析。应用Illumina公司MiSeqDX深度测序平台进行全基因组序列测定,Nextclade在线分析平台和DNASTAR 7.0.1生物信息学软件进行多序列比对和基因组特征分析,采用MEGA 10.1.8邻位归并法(Neighbour-joining)绘制系统进化树,结合流行病学调查进行回顾性溯源分析。海南省14例病例感染的奥密克戎(BA.1.1)变异株基因组高度相似,同武汉参考序列(GenBank No.NC_045512)相比,存在63或64个核苷酸突变位点,39个核苷酸位点缺失,22204位点有9个核苷酸插入,引起43个氨基酸突变和16个氨基酸位点缺失。刺突(Spike,S)蛋白存在32个氨基酸突变位点,S1蛋白RBD区R346K是VOC/Omicron(BA.1.1)变异株特征性突变位点。14例病例分布在三亚市及外溢到周边陵水、儋州等市县,均为外省来琼感染者引发后续本地传播。海南省因输入病例引起本土新冠疫情的风险较大,应继续加强新冠病毒重要流行变异株的研究,持续开展新冠病毒基因型变异监测。

关键词：新型冠状病毒奥密克戎变异株基因特征

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8-羟基喹啉-5-磺酸共振光散射法测定铅

应用化工 2013年第1期42卷 168-170页

作者：钱秋梅汤晓霞张亚淋王永生南华大学公共卫生学院湖南衡阳421001

在pH 5.0 BR缓冲液及阳离子表面活性剂CTMAB存在下,8-羟基喹啉-5-磺酸与Pb2+相互作用形成配合物,导致体系的共振光散射(RLS)强度增强,且在8.01×10-8～1.2×10-5mol/L范围内,体系ΔI强度与Pb2+的浓度有良好的线性关系,其回归方程为:ΔF=... 详细信息

在pH 5.0 BR缓冲液及阳离子表面活性剂CTMAB存在下,8-羟基喹啉-5-磺酸与Pb2+相互作用形成配合物,导致体系的共振光散射(RLS)强度增强,且在8.01×10-8～1.2×10-5mol/L范围内,体系ΔI强度与Pb2+的浓度有良好的线性关系,其回归方程为:ΔF=–91.23+61.21c(×10-6mol/L),相关系数r=0.997 6,检出限为2.40×10-8mol/L,相对标准偏差(RSD)在2.15%～4.01%。用于环境中水样的测定,回收率在96.3%～99.6%。该方法简单、快速、灵敏度高。

关键词：铅 8-羟基喹啉-5-磺酸(HQS) 十六烷基三甲基溴化铵(CTMAB) 共振光散射

2006-2020年美国沙门菌跨州暴发案例分析

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疾病监测 2021年第8期36卷 837-844页

作者：张婧萱黄美恋刘玥顾桂敏杨红霞华德张亚淋裴迎新许学斌贵港市疾病预防控制中心微生物检验科广西贵港537100 厦门市儿童医院临床微生物实验室福建厦门361006 上海市疾病预防控制中心病原生物检定所上海200336 广西壮族自治区产品质量检验研究院化工所微生物实验室广西南宁530021 山西省疾病预防控制中心病原微生物实验室山西太原030000 海南省疾病预防控制中心检验检测所海南海口570203 中国疾病预防控制中心现场流行病学培训项目北京100050

食源和宠物源沙门菌感染造成的疾病负担已成为美国重大公共卫生问题。本文通过分析2006—2020年美国153件食源性沙门菌跨州暴发(SMSFBD)和34件宠物源沙门菌跨州暴发(SMSPBD)案例的病原血清型分布、疾病负担、食物归因和处置结果等指标,... 详细信息

食源和宠物源沙门菌感染造成的疾病负担已成为美国重大公共卫生问题。本文通过分析2006—2020年美国153件食源性沙门菌跨州暴发(SMSFBD)和34件宠物源沙门菌跨州暴发(SMSPBD)案例的病原血清型分布、疾病负担、食物归因和处置结果等指标,描述美国不同群体在不同社会经济发展阶段对加工食品消费特征的变化。同时,观察到在新型冠状病毒肺炎疫情大流行期间,随着社交活动和食品采购频次的减少,导致被动降低了食源暴露风险;随着居家生活时间增加等一系列生活方式的改变,导致原本流行于2018年新型庭院养殖活禽,却于2020年引发美国暴发史上波及范围最广、病例数最多、菌型最复杂的SMSPBD。该结果提示,其他国家和地区防控食源和宠物源沙门菌暴发,可借鉴发达国家跨部门主动监测的策略,建立和运行与其疾病流行特征、疾病预防控制能力以及经济社会发展水平相匹配的食品与养殖生态安全预警体系,以应对各种新型食源性和生态型的沙门菌病不断变化的挑战。

关键词：食源性沙门菌跨州暴发宠物源沙门菌跨州暴发新型冠状病毒肺炎主动监测