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番木瓜果实6个bHLH基因克隆及表达分析

分子植物育种 2022年第22期20卷 7374-7383页

作者：王楠年宇薇邵远志李蕊李雯海南大学园艺学院海南省热带园艺作物品质调控重点实验室海口570228 海南大学生命科学学院海口570228

bHLH转录因子是调控植物生长发育过程的第二大转录因子超家族,在植物生长发育和果实成熟过程中扮演着重要角色。为探究bHLH转录因子在‘日升’番木瓜(Carica papaya ***’SunUp’)果实采后贮藏期间的表达特性,本研究基于番木瓜转录组数... 详细信息

bHLH转录因子是调控植物生长发育过程的第二大转录因子超家族,在植物生长发育和果实成熟过程中扮演着重要角色。为探究bHLH转录因子在‘日升’番木瓜(Carica papaya ***’SunUp’)果实采后贮藏期间的表达特性,本研究基于番木瓜转录组数据,通过TA克隆及RT-PCR技术,克隆得到了6个bHLH基因,命名为CpbHLH4~CpbHLH9。利用生物信息学方法对CpbHLH4~CpbHLH的理化性质,亲缘关系,保守结构域和进行分析。结果表明,6个bHLH基因序列全长663 bp(CpbHLH5)~1965 bp(CpbHLH9),具有完整的开放阅读框,编码221 aa(CpbHLH5)~654 aa(CpbHLH9)个氨基酸,除CpbHLH6表现为疏水性之外,其他5个bHLH蛋白均为亲水性蛋白,并且6个bHLH蛋白不具有跨膜结构和信号肽,预测定位于细胞核中。系统发育树和多序列比对结果显示,6个bHLH转录因子分布于不同的亚族,同时它们也都具有bHLH保守结构域。RT-qPCR结果表明CpbHLH4、CpbHLH5、CpbHLH6、CpbHLH7、CpbHLH8的表达水平在贮藏前期显著上调,而CpbHLH9的表达水平在果实成熟过程中持续降低。本研究鉴定了6个bHLH转录因子,明确了它们在采后番木瓜果实成熟过程中的表达模式,为进一步解析bHLH转录因子在采后番木瓜果实成熟中的功能和调控机制提供基础。

关键词：番木瓜(Carica papaya L.) 果实成熟 bHLH转录因子表达分析

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菠萝LEAFY基因克隆与表达模式研究

分子植物育种 2018年第7期16卷 2107-2115页

作者：年宇薇陈哲胡福初范鸿雁何凡陈惠萍张治礼海南大学热带农林学院海口570228 海南省农业科学院热带果树研究所农业部热带果树实验站海口571100 海南省热带果树生物学重点实验室海口571100

植物LEAFY(LFY)基因可以调控花分生组织和花器官的形成。根据菠萝基因组数据库信息,本研究从菠萝(Ananas comosus(Linn.)Merr.)顶芽中成功克隆了菠萝LFY基因c DNA全长序列。分析结果表明,Ac LFY编码366个氨基酸,含有5'-N端脯氨酸富集区... 详细信息

植物LEAFY(LFY)基因可以调控花分生组织和花器官的形成。根据菠萝基因组数据库信息,本研究从菠萝(Ananas comosus(Linn.)Merr.)顶芽中成功克隆了菠萝LFY基因c DNA全长序列。分析结果表明,Ac LFY编码366个氨基酸,含有5'-N端脯氨酸富集区、亮氨酸重复区以及碱性及酸性结构域,具有FLO/LEAFY家族的典型结构特征。利用实时荧光定量PCR技术分析了Ac LFY基因在菠萝自然成花和乙炔处理成花不同发育阶段的表达情况。结果显示,乙炔处理可以诱导Ac LFY基因表达,处理后40 d即菠萝花序形成时期表达量最高,随后逐渐下降;自然成花过程中,Ac LFY基因的表达在50 d时达到最高峰,此时为花原基发育、花序形成时期。Ac LFY基因在不组织器官中的表达存在明显差异,顶芽中表达量最高,根系中表达量最低。

关键词：菠萝 LFY基因成花过程乙炔处理表达模式

菠萝MADS-box基因家族的生物信息学分析

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基因组学与应用生物学 2017年第8期36卷 3042-3052页

作者：胡加谊陈哲胡福初罗志文年宇薇何凡张治礼海南省农业科学院热带果树研究所农业部海口热带果树科学观测实验站海口571100 海南省热带果树生物学重点实验室海口571100

MADS-box转录因子是植物生长发育过程的重要调控因子。为了解菠萝MADS-box转录因子的序列特征和分类情况,本研究采用生物信息学方法,对菠萝全基因组的MADS-box进行序列分析,包括菠萝MADS-box转录因子的数量、外显子和内含子组成情况、... 详细信息

MADS-box转录因子是植物生长发育过程的重要调控因子。为了解菠萝MADS-box转录因子的序列特征和分类情况,本研究采用生物信息学方法,对菠萝全基因组的MADS-box进行序列分析,包括菠萝MADS-box转录因子的数量、外显子和内含子组成情况、编码蛋白的基本特性及系统进化树的分析。结果表明,菠萝基因组中有40个MADS-box转录因子,且基因结构分析表明8个菠萝MADS-box基因符合植物MADS-box基因的典型结构,具有6个内含子和7个外显子;27个菠萝MADS-box转录因子编码氨基酸在200~300个之间,其中最小的Ac MADS40仅有104个氨基酸组成,最大的Ac MADS08由436个氨基酸组成;40个MADS-box蛋白中有31个偏碱性,4个显酸性,5个呈中性;二级结构分析结果表明,6个MADS-box蛋白无规卷曲所占比例最高,Ac MADS02α-螺旋和无规卷曲都为25个,β-转角为5个;其余33个菠萝MADS-box蛋白均以α-螺旋所占比例最高;亚细胞定位预测结果表明,大多数MADS-box蛋白定位于细胞核,其他零星分布于其他细胞器;保守基序查找分析表明,包含基序1和基序2的MADS-box蛋白所占比率均在85%以上,说明基序1和基序2是菠萝MADS-box蛋白中的重要保守基序;系统进化树分析表明,属于Ⅰ型的菠萝MADS-box基因有14个,属于Ⅱ型的菠萝MADS-box基因有26个,且可细分为11个亚组,除了FLC和AGL15这两个亚组中没有菠萝MADS-box的成员,其他9个亚组均有菠萝MADS-box基因的分布。

关键词：菠萝 MADS-box 生物信息学序列特征系统进化树

乙烯利诱导菠萝成花过程中FT基因的克隆与表达分析

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果树学报 2019年第12期36卷 1648-1657页

作者：阮城城年宇薇胡福初王祥和范鸿雁吴凤芝陈哲张治礼海南大学热带作物学院海口570228 海南省农业科学院热带果树研究所·海南省热带果树生物学重点实验室海口571100 农业部海口热带果树科学观测实验站海口571100 海南大学生命科学与药学院海口570228

【目的】克隆菠萝AcFT基因并研究其表达模式,为深入研究该基因在乙烯利诱导菠萝成花中的功能奠定基础。【方法】从菠萝基因组数据库中获得AcFT基因全长序列,设计全长引物,克隆两个AcFT基因,分别命名为AcFT1和AcFT2,对基因序列进行生物... 详细信息

【目的】克隆菠萝AcFT基因并研究其表达模式,为深入研究该基因在乙烯利诱导菠萝成花中的功能奠定基础。【方法】从菠萝基因组数据库中获得AcFT基因全长序列,设计全长引物,克隆两个AcFT基因,分别命名为AcFT1和AcFT2,对基因序列进行生物信息学分析;通过qRT-PCR探究乙烯利处理后菠萝AcFT基因在不同组织、时间下的表达模式。【结果】AcFT1和AcFT2分别编码178和177个氨基酸,两者均含有PBP结构域,具有PEBP家族典型结构特征。实时荧光定量PCR分析结果显示,AcFT1和AcFT2都具有组织表达特异性,在茎和叶中相对表达量较高;乙烯利处理后,AcFT1和AcFT2在茎和叶中的表达具有相反的趋势,其中AcFT2明显受到乙烯利上调,呈现先上升后下降趋势,AcFT1则显示为先下降后上升。乙烯利处理后1 d,茎尖组织AcFT2的表达水平显著上升,相对表达量约为对照的178倍,而AcFT1则明显下调;乙烯利处理后31 d,AcFT2在茎尖中的表达水平达到最大值,约为对照的408倍,但AcFT1却处于极低水平。【结论】克隆得到2个AcFT基因,AcFT2基因在乙烯利处理后1 d及随后的花芽分化时期高度表达,表明AcFT2在响应外源乙烯利信号诱导菠萝成花过程中发挥重要作用。

关键词：菠萝 FT基因基因克隆表达分析

无核荔枝ABA生物合成关键酶LcNCED基因克隆及其在生理落果阶段中的表达分析

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热带作物学报 2018年第2期39卷 300-307页

作者：陈哲胡福初年宇薇吴凤芝范鸿雁陈业光王祥和海南省农业科学院热带果树研究所海南省热带果树生物学重点实验室农业部海口热带果树科学观测实验站海南海口571100

9-顺-环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoids dioxygenase,NCED)是ABA生物合成途径的关键限速酶,本研究利用RT-PCR技术从A4无核荔枝中分离得到NCED的3条c DNA序列(命名为LcNCED1、LcNCED2和LcNCED3)。通过同源比对和系统进化树分析,LcNCED基因编码的氨基酸序列与拟南芥等30个物种中的NCED氨基酸序列同源性都在65%以上,从而确定LcNCED属于NCED家族;通过与7条拟南芥及5条苹果NCED家族基因进行系统进化树分析,LcNCED2与调控苹果花瓣脱落MdNCED2、MdNCED4基因具有较高的同源性。Real-Time PCR表达分析发现,3个LcNCED基因在不同样品间表达存在显著差异,其中LcNCED2在各样品间的表达水平显著高于LcNCED1和LcNCED3,且LcNCED2表现出显著的组织特异性表达特点,花后15~75 d,LcNCED2在离区(果柄离层部位上下0.2 cm)中的表达量均高于种脐和果皮中,在花后45 d达到峰值,花后75 d稍有下降,基因表达的峰值略早于A4无核荔枝落果高峰期。而LcNCED1和LcNCED3在各组织样品中基因表达变化趋势规律不明显。上述结果表明,LcNCED2在离区中表达量变化比较符合A4无核荔枝生理落果趋势,推断LcNCED2基因可能与无核荔枝采前落果关系密切。

关键词：荔枝 9-顺-环氧类胡萝卜素双加氧酶基因克隆基因表达采前落果

基于政务微博的自然灾害知识图谱构建——以森林火灾为例

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现代情报 2024年第3期44卷 47-58,119页

作者：王志宇刘雨薇辽宁大学信息资源管理学院辽宁沈阳110136

[目的/意义]利用政务微博信息构建自然灾害知识图谱,旨在为相关部门加强自然灾害事件的管理提供知识层面的参考价值。[方法/过程]以森林火灾事件为例,选取政务微博信息资源,首先使用LDA主题模型划分微博资源主题;其次构建自然灾害知识... 详细信息

[目的/意义]利用政务微博信息构建自然灾害知识图谱,旨在为相关部门加强自然灾害事件的管理提供知识层面的参考价值。[方法/过程]以森林火灾事件为例,选取政务微博信息资源,首先使用LDA主题模型划分微博资源主题;其次构建自然灾害知识图谱的模式层和数据层,包括本体构建、实体抽取、关系抽取和数据融合等环节;最后使用Neo4j图数据库实现自然灾害知识图谱的存储与检索,实现自然灾害信息的组织与可视化。[结果/结论]构建了基于主题划分的自然灾害知识图谱,实现了自然灾害信息的主题知识关联与规范化处理,对提升政府部门防范与管理自然灾害的科学决策水平具有积极作用。

关键词：政务微博自然灾害 LDA主题模型知识图谱知识可视化

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王智薇油画

文艺研究 2024年第2期 166-167页

作者：王智薇西南民族大学艺术学院

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预期视野下的“‘既然’+反问句”研究

汉语学习 2024年第1期 64-72页

作者：干薇陈振宇上海立信会计金融学院外国语学院上海201620 复旦大学中国语言文学系上海200433

从预期理论角度看,“既然”复句的前件为条件部分,后件为预期部分时,表示推断;当后件为当前信息部分时,表示预期与当前信息的关系,此时常用于反预期语篇。“既然”复句表示“言者在特定的事实条件下进行的主观选择”;“如果”复句表示... 详细信息

从预期理论角度看,“既然”复句的前件为条件部分,后件为预期部分时,表示推断;当后件为当前信息部分时,表示预期与当前信息的关系,此时常用于反预期语篇。“既然”复句表示“言者在特定的事实条件下进行的主观选择”;“如果”复句表示“言者在特定的非事实或反事实条件下进行的主观选择”;“因为……,所以……”因果句表示“全概率或大概率推理的特殊选择”。

关键词： “既然”复句反问句预期理论选择

解第二类线性与非线性模糊Fredholm积分方程的混合方法

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解第二类线性与非线性模糊Fredholm积分方程的混合方法

作者：陆薇宇电子科技大学

学位级别：硕士