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牦牛MYL7基因克隆及生物信息学分析

中国草食动物科学 2024年

作者：马荣洛桑顿珠平措占堆卓玛次仁尼玛加措成述儒梁春年日喀则市昂仁县农业农村局西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育重点实验室甘肃农业大学

克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7，MYL7)基因CDS区，进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异，为探究该基因功能提供一定的理论依据。以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板，利用PCR技术克隆其CDS区序列，并... 详细信息

克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7，MYL7)基因CDS区，进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异，为探究该基因功能提供一定的理论依据。以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板，利用PCR技术克隆其CDS区序列，并利用多种在线生物软件及工具进行生物信息学分析。结果表明，桑桑牦牛MYL7基因CDS区长447 bp，共编码148个氨基酸，该基因编码的蛋白分子式为C743H1155N187O237S7，原子数为2 329，理论等电点为4.37，不稳定系数和总平均亲水性分别为36.02和﹣0.364，属于稳定亲水性蛋白；具有特异性的磷酸化位点有11个，其中丝氨酸有5个、苏氨酸有5个以及1个酪氨酸。MYL7蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构，属于非分泌性蛋白。通过亚细胞定位发现，桑桑牦牛MYL7基因在线粒体、细胞核、细胞质、细胞膜等中均有所分布。蛋白高级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲。通过构建系统进化树发现，桑桑牦牛与野牦牛亲缘关系最近，符合实际情况，说明MYL7基因在进化过程中相对具有一定的保守性。

关键词：桑桑牦牛 MYL7基因基因克隆生物信息学分析

野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物多样性的比较分析

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黑龙江畜牧兽医 2024年第10期 102-109,116页

作者：洛桑顿珠平措占堆张强孙光明索朗多吉巴多巴桑旺堆西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850004 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000 阿里地区改则县农业农村局西藏改则县859200

为了比较野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物组成的差异,试验选取年龄、体重相近且健康的野血牦牛和家养牦牛各10头(公母各半),分别为野血牦牛组和家养牦牛组,两组屠宰后采集瘤胃液,测定瘤胃发酵参数(氨态氮、尿素氮、总氮、微生... 详细信息

为了比较野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物组成的差异,试验选取年龄、体重相近且健康的野血牦牛和家养牦牛各10头(公母各半),分别为野血牦牛组和家养牦牛组,两组屠宰后采集瘤胃液,测定瘤胃发酵参数(氨态氮、尿素氮、总氮、微生物蛋白和挥发性脂肪酸),并基于细菌16S rDNA基因序列比较分析两组瘤胃微生物组成的差异。结果表明:野血牦牛组瘤胃液中总氮含量、微生物蛋白质量浓度极显著高于家养牦牛组(P0.05);总挥发性脂肪酸浓度和正丁酸摩尔百分比极显著低于家养牦牛组(P0.05)。两组瘤胃共有1 963个核心操作性分类单元(operational taxonomic units,OTUs),野血牦牛组和家养牦牛组特有的OTUs分别为18 542个和16 514个。在门水平上,两组的优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidete)和厚壁菌门(Firmicutes),二者占微生物总数的98%以上。在属水平上,野血牦牛组瘤胃中的优势菌属(相对丰度>2%)包括普氏菌属1(Prevotella_1)、细菌F082(Bacterium F082)、理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae_R-7_group)、拟杆菌目BS11肠道群(Bacteroidales_BS11_gut_group)和瘤胃球菌科NK4A214群(Ruminococcaceae_NK4A214_group),相对丰度分别为24.50%、14.68%、12.88%、6.50%、2.77%和2.70%;家养牦牛组瘤胃中的优势菌属分别为理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae_R-7_group)、瘤胃球菌科NK4A214(Ruminococcaceae_NK4A214_group)、琥珀酸菌(Succiniclasticum)、细菌F082(Bacterium F082)和拟杆菌目RF16群(Bacteroidales_RF16_group),相对丰度分别为22.69%、13.87%、10.46%、6.93%、4.07%和3.96%。在门水平上,野血牦牛组瘤胃中拟杆菌门(Bacteroidete)相对丰度显著高于家养牦牛组(P<0.05),厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、髌骨细菌门(Patescibacteria)、互养菌门(Synergistetes)和疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度显著低于家养牦牛组(P<0.05)。在属水平上,野血牦牛组瘤胃中普氏菌属1(Prevotella_1)相对丰度极显著高于家养牦牛组(P<0.01),细菌F082(Bacterium F082)和拟杆菌目BS11肠道群(Bacteroidales_BS11_gut_group)相对丰度显著高于家养牦牛组(P<0.05),克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae_R-7_group)、瘤胃球菌科NK4A214群(Ruminococcaceae_NK4A214_group)和琥珀酸菌(Succiniclasticum)相对丰度极显著低于家养牦牛组(P<0.01),理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)相对丰度显著低于家养牦牛组(P<0.05)。说明野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物多样性存在明显差异;野血牦牛瘤胃中拟杆菌门相对丰度更高,对非纤维植物多糖和蛋白质的消化能力更强;而家养牦牛瘤胃厚壁菌门相对丰度更高,对纤维类物质的消化能力更强。

关键词：牦牛野血牦牛家养牦牛瘤胃发酵参数微生物多样性

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桑桑牦牛MYL7基因克隆及生物信息学分析

中国草食动物科学 2024年第4期44卷 15-21页

作者：马荣洛桑顿珠平措占堆卓玛次仁尼玛加措成述儒梁春年中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室兰州730050 甘肃农业大学兰州730070 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室兰州730050 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850004 日喀则市昂仁县农业农村局昂仁857001

克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7,MYL7)基因CDS区,进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异,为探究该基因功能提供一定的理论依据。以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR技术克隆其CDS区序列,并利用... 详细信息

克隆西藏桑桑牦牛肌球蛋白轻链7(Myosin light chain 7,MYL7)基因CDS区,进行生物信息学分析并检测该基因在各组织中的表达差异,为探究该基因功能提供一定的理论依据。以桑桑牦牛肌肉组织cDNA为模板,利用PCR技术克隆其CDS区序列,并利用多种在线生物软件及工具进行生物信息学分析。结果表明,桑桑牦牛MYL7基因CDS区长447 bp,共编码148个氨基酸,该基因编码的蛋白分子式为C743H1155N187O237S7,原子数为2329个,理论等电点为4.37,不稳定系数和总平均亲水性分别为36.02和-0.364,属于稳定的亲水性蛋白;具有特异性的磷酸化位点11个,其中5个丝氨酸、5个苏氨酸和1个酪氨酸。MYL7蛋白无信号肽和跨膜螺旋结构,属于非分泌性蛋白。通过亚细胞定位发现,桑桑牦牛MYL7基因在线粒体、细胞核、细胞质、细胞膜中均有所分布。蛋白高级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲。通过构建系统进化树发现,桑桑牦牛与野牦牛亲缘关系最近,符合实际情况,说明MYL7基因在进化过程中具有一定的保守性。

关键词：桑桑牦牛 MYL7基因基因克隆生物信息学分析

西藏阿里地区改则县野血牦牛屠宰性能及其肉品质特性研究

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中国畜牧兽医 2024年第4期51卷 1603-1612页

作者：索朗多吉张群英张强平措占堆巴多巴桑旺堆龙瑞军洛桑顿珠西藏阿里改则县农业农村局阿里859200 兰州大学生态学院草地与牦牛实验室兰州730000 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850000

【目的】本试验旨在比较西藏阿里地区改则县不同性别野血牦牛的屠宰性能和牛肉营养成分和组成。【方法】随机选取了阿里改则县区域5~6岁、自然放牧、体况相近且良好的野血牦牛10头,公母各半,体重分别为(299.00±30.50)和(247.00±10.20... 详细信息

【目的】本试验旨在比较西藏阿里地区改则县不同性别野血牦牛的屠宰性能和牛肉营养成分和组成。【方法】随机选取了阿里改则县区域5~6岁、自然放牧、体况相近且良好的野血牦牛10头,公母各半,体重分别为(299.00±30.50)和(247.00±10.20)kg。通过开展屠宰试验研究阿里改则县区域野血牦牛屠宰性能、胴体性状及其肌肉营养品质特性。【结果】阿里野血公牦牛宰前活重、胴体重、净肉重、骨重和管围均显著或极显著高于母牦牛(P0.05)。公牦牛胴体长、胴体宽、胴体深、胴体胸深、后腿围、大腿肉厚和眼肌面积均显著或极显著高于母牦牛(P0.05),氨基酸比例均为理性型优质蛋白质来源。脂肪酸组成上,阿里野血母牦牛肉中十五烷酸、棕榈酸、棕榈油酸、十七烷酸、硬脂酸、油酸、花生酸、饱和脂肪酸(SFA)、单不饱和脂肪酸(MUFA)和总脂肪酸(TFA)均显著或极显著高于公牦牛(P<0.05;P<0.01),公牦牛肌肉中多不饱和脂肪酸/饱和脂肪酸(PUFA/SFA)显著高于母牦牛(P<0.05)。【结论】性别对阿里野血牦牛屠宰性能及其肉品质具有一定影响,其中阿里野血公牦牛胴体性状更为突出;野血母牦牛背最长肌较高的肌内脂肪、优质的氨基酸组成和丰富的UFA含量使其肉质营养价值比公牦牛稍好。本研究结果为阿里野血牦牛新品种定向培育及家牦牛提纯复壮与种业创新发展提供基础数据。

关键词：西藏阿里地区野血牦牛屠宰性能肉品质

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阿里野血牦牛与家养牦牛血液代谢组比较分析

西藏农业科技 2024年第1期46卷 44-49页

作者：洛桑顿珠俄广鑫张强平措占堆王洪壮次旦央吉巴桑旺堆省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850000 西南大学动物科学技术学院重庆400417

本研究旨在利用质谱技术鉴定野血牦牛与家养牦牛血清中化学衍生物的差异,以明确长期受到高原生态环境自然选择下,野血牦牛更优环境适应性的代谢机制。本研究利用串联质谱技术对西藏阿里改则县的5头野血牦牛和5头家养牦牛的血清进行代谢... 详细信息

本研究旨在利用质谱技术鉴定野血牦牛与家养牦牛血清中化学衍生物的差异,以明确长期受到高原生态环境自然选择下,野血牦牛更优环境适应性的代谢机制。本研究利用串联质谱技术对西藏阿里改则县的5头野血牦牛和5头家养牦牛的血清进行代谢组功能分析,共鉴定到574个代谢相关化学衍生物质,其中比例最高的是有机酸及其衍生物和氨基酸及其衍生物,21种代谢物质差异显著,较家养牦牛,野血牦牛有7类化学代谢物(邻甲氧基苯甲酸、9,12-十八碳二烯酸、3,4,5-三甲氧基肉桂酸等)显著上调,14类化学代谢物(前列腺素E2、氧化三甲胺、羟基二十碳五烯酸等)显著下调。其中7类化学衍生物(5-羟基吲哚-3-乙酸、鸟苷、尿素、前列腺素E2、皮质醇、5-甲氧基色胺、3-甲基吲哚)富集于31个KEGG信号通路,包括组织系统(Organismal Sysyems)、代谢(Metabolism)、人类疾病(Human Disease)、环境信息过程(Environmental Information Processing)。本研究通过代谢组比较分析,进一步明确了野血牦牛优异的环境适应性代谢基础,同时鉴定到野血牦牛中富含一系列(鸟苷、5-甲基-2-脱氧饱苷、邻甲基苯甲酸等)已明确与心脑血管疾病相关药的化学衍生物,为今后开发抗高原病相关药物开发提供借鉴参考。

关键词：牦牛代谢组化学衍生物高原适应性质谱技术

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桑桑牦牛乳品质特性分析

中国草食动物科学 2024年第1期44卷 52-56页

作者：张梦帆洛桑顿珠喇永福任稳稳马晓明张强卓玛次仁尼玛加措平措占堆梁春年中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所甘肃省牦牛繁育工程重点实验室兰州730050 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室兰州730050 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850004 日喀则市昂仁县农业农村局日喀则857001

桑桑牦牛是西藏自治区日喀则市昂仁县的特色牛种,已被列为全国农产品地理标志。为深入开发利用桑桑牦牛乳产品,2023年8月份采集了10头桑桑牦牛的乳样,依据国家标准对其营养成分、氨基酸及脂肪酸含量进行了检测,同时与奶牛乳及不同品种... 详细信息

桑桑牦牛是西藏自治区日喀则市昂仁县的特色牛种,已被列为全国农产品地理标志。为深入开发利用桑桑牦牛乳产品,2023年8月份采集了10头桑桑牦牛的乳样,依据国家标准对其营养成分、氨基酸及脂肪酸含量进行了检测,同时与奶牛乳及不同品种的牦牛乳进行了营养成分对比。结果表明,桑桑牦牛乳的蛋白质含量为4.78%,脂肪含量为5.20%,非乳脂固体含量为11.71%,乳糖含量为5.17%,其营养成分含量远高于奶牛乳。与其他牦牛品种相比,桑桑牦牛乳的蛋白质及乳糖含量也比较高。桑桑牦牛乳的氨基酸总量(TAA)为4.88 g/100 g,谷氨酸的含量最高,为1.21 g/100 g,半胱氨酸的含量最少,为0.05 g/100 g。其中必需氨基酸(EAA)为1.90 g/100 g,非必需氨基酸(NEAA)为2.98 g/100 g,EAA/TAA为38.93%,EAA/NEAA为63.76%。与奶牛及其他品种牦牛相比,桑桑牦牛乳是氨基酸含量最高的牛乳。桑桑牦牛乳中共检出14种脂肪酸,主要以不饱和脂肪酸为主,占89.63%;多不饱和脂肪酸有反亚油酸和γ-亚油酸,分别为0.84%和1.03%。综上说明,桑桑牦牛乳含有丰富的营养物质,有着极高的开发利用潜力以及研究价值。

关键词：桑桑牦牛乳乳品质氨基酸脂肪酸

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中国牦牛资源开发利用研究进展

动物营养学报 2023年第12期35卷 7492-7518页

作者：张强俄广鑫平措占堆巴桑旺堆省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850000 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室拉萨850000 西南大学动物科学技术学院重庆400417

我国青藏高原拥有世界牦牛最大存栏量,且牦牛养殖业是我国高原牧区最重要的畜牧支柱产业。我国地方牦牛品种资源丰富,其不仅具有优异的高原适应性优势,而且在鲜肉品质、乳制品、毛皮品质等方面的经济性能优势突出。然而,由于高原地区自... 详细信息

我国青藏高原拥有世界牦牛最大存栏量,且牦牛养殖业是我国高原牧区最重要的畜牧支柱产业。我国地方牦牛品种资源丰富,其不仅具有优异的高原适应性优势,而且在鲜肉品质、乳制品、毛皮品质等方面的经济性能优势突出。然而,由于高原地区自然条件恶劣、科技水平及饲养管理水平落后等多种因素,致使当前我国固有牦牛资源品种遗传改良进程缓慢、生产力低下。本文全面综述了我国当前牦牛种质资源保护概况、主要牦牛品种生产性能特征、牦牛群体遗传多样性与种群系统发育关系研究成果以及牦牛重要经济及适应性性状相关候选基因与遗传标记筛选的研究进展。这可为我国牦牛遗传资源保护与利用、牦牛新品种(系)的培育以及我国牦牛产业良性发展提供参考。

关键词：牦牛遗传资源保护经济性状适应性状

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西藏农民后藏班觉伦布村的调查报告

西藏农民后藏班觉伦布村的调查报告

1998年

作者：平措占堆

西藏人居住在“世界屋脊”的青藏高原，在平均海拔4000米、气候寒冷千燥的严酷自然环境里，不仅生存了下来，而且创造了悠久灿烂的文明，为世人所惊奇！然而，西藏人究竟是如何生活的，是占人口绝大多数的西藏农民，是如何在本不适应人... 详细信息

西藏人居住在“世界屋脊”的青藏高原，在平均海拔4000米、气候寒冷千燥的严酷自然环境里，不仅生存了下来，而且创造了悠久灿烂的文明，为世人所惊奇！然而，西藏人究竟是如何生活的，是占人口绝大多数的西藏农民，是如何在本不适应人类生存的地方生生不息的他们如何走过沉重的昨天、又是如何创造着今天美好的生活为此，我们课题组于1995年6-10月，选择了后藏的班觉伦布村进行了为期四个多月的实地调查研究。

关键词：历史、地理大洋洲史澳、新、巴地区

来源：汇雅图书（南通市图书馆... 评论

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查吾拉牦牛遗传资源概况与保护利用现状

中国畜禽种业 2023年第6期19卷 3-10页

作者：巴桑旺堆平措占堆鲜莉莉洛桑顿珠王登云俄广鑫张强省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850009 聂荣县农业科技服务站西藏那曲853500 西南大学动物科学技术学院重庆北碚400715

查吾拉牦牛现主要分布于青藏高原腹地的西藏那曲市聂荣县,产区平均海拔4700m,截至2020年,存栏7万余头。查吾拉牦牛体格健壮、体型较大,平均屠宰率为约50%;役用能力突出,繁殖力优异。当前,该品种种群遗传多样性丰富,分子系统发育关系与... 详细信息

查吾拉牦牛现主要分布于青藏高原腹地的西藏那曲市聂荣县,产区平均海拔4700m,截至2020年,存栏7万余头。查吾拉牦牛体格健壮、体型较大,平均屠宰率为约50%;役用能力突出,繁殖力优异。当前,该品种种群遗传多样性丰富,分子系统发育关系与西藏自治区内现有国家牦牛遗传资源存在显著遗传分歧,具有独立遗传背景。2021年查吾拉牦牛通过国家畜禽资源委员会审定,正式跻身为国家遗传资源。该文拟对查吾拉牦牛资源形成及保护利用现状进行阐述,以期为今后查吾拉牦牛遗传资源深度开发与利用提供参考。

关键词：查吾拉牦牛畜禽遗传资源遗传多样性保护与利用