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广西两家医院社区获得性肺炎病例流行病学特征及病原谱分析

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应用预防医学 2024年第3期 192-195+211页

作者：王晶梁丹燕凌宙贵罗飞闭福银居昱曾竣何弄影韦杰林玫广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室南宁市第二人民医院柳州市工人医院河池市人民医院广西壮族自治区大数据发展局广西壮族自治区信息中心

目的分析社区获得性肺炎（CAP）的流行规律，掌握CAP病原谱，为疾病精准防控和CAP患者的临床治疗提供理论依据。方法收集2021年8月—2022年8月南宁市第二人民医院和柳州市工人医院CAP患者的病例资料，采集肺泡灌洗液标本，分析CAP病... 详细信息

目的分析社区获得性肺炎（CAP）的流行规律，掌握CAP病原谱，为疾病精准防控和CAP患者的临床治疗提供理论依据。方法收集2021年8月—2022年8月南宁市第二人民医院和柳州市工人医院CAP患者的病例资料，采集肺泡灌洗液标本，分析CAP病原谱及流行规律，采用多因素logistic回归模型分析患者死亡的影响因素。结果共纳入999例CAP患者，平均年龄68.2岁。病原检出阳性率为48.3%，其中病毒检出率最高的是EB病毒（20.8%），细菌中检出率最高的为肺炎克雷伯菌（11.1%）。EB病毒、肺炎克雷伯菌和流感嗜血杆菌全年均有发现，冬季检出率较高。182例（18.2%）患者出现合并感染的情况，肺炎克雷伯菌-EB病毒合并感染检出率最高（4.1%）。多因素logistic回归模型显示，高血压（OR=2.409,95%CI:1.371-4.231）、糖尿病（OR=2.361,95%CI:1.268-4.397）、恶性肿瘤（OR=4.861,95%CI:1.526-15.489）和卡他莫拉菌检测阳性（OR=8.823,95%CI:2.007-38.786）会增加CAP患者死亡发生的风险。结论病毒-细菌合并感染是最常见的共感染模式，需要引起临床医生的重视，警惕合并感染，及时改变用药策略，必要时同时考虑抗病毒治疗和抗生素治疗。

关键词：社区获得性肺炎肺泡灌洗液病原谱合并感染

2020-2021年广西Victoria系乙型流感病毒的抗原性及基因特性分析

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疾病监测 2022年第8期37卷 1079-1087页

作者：陈华凤康宁张超王静居昱闭福银广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028 广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室广西南宁530028

目的了解广西壮族自治区(广西)2020—2021年度B/Victoria(Bv)系流感病毒的抗原性及基因特征。方法选取广西2020—2021年分离的36株Bv系流感毒株进行全基因组测序,并对血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进... 详细信息

目的了解广西壮族自治区(广西)2020—2021年度B/Victoria(Bv)系流感病毒的抗原性及基因特征。方法选取广西2020—2021年分离的36株Bv系流感毒株进行全基因组测序,并对血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进行序列拼接和基因特性分析。同时采用血凝抑制实验进行抗原性分析。结果 2020—2021年广西分离的Bv系流感病毒与WHO推荐的疫苗株B/Washington/02/2019相比,HA和NA基因的核苷酸同源性分别为99.1%~100.0%和99.1%~99.9%。系统进化树分析发现这36株Bv系流感毒株均属于1A(?3)B分支,与疫苗株属于同一分支,但广西毒株又进一步分为两个小分支。抗原性分析显示这两个小分支没有明显差异,均为疫苗株的类似株。氨基酸变异位点分析发现,HA蛋白携带R133G、N150K、N197D的氨基酸突变,变异涉及3个抗原决定簇。NA蛋白的酶活位点和神经氨酸酶抑制剂耐药位点均未发生突变。结论 2020—2021年度广西流行的Bv系流感病毒与WHO推荐的北半球疫苗株的组分匹配但存在持续变异,需要密切监测流行株的变异情况。

关键词： B/Victoria系流感病毒神经氨酸酶血凝素基因特性抗原性

2019年广西7份本地感染登革病毒E基因特征分析

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现代预防医学 2022年第18期49卷 3421-3425+3435页

作者：王静闭福银陈华凤居昱康宁广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所

目的了解2019年广西本地感染登革病毒(Dengue virus,DENV)E基因特性，探索可能的输入来源。方法采用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)方法对广西本地感染登革热病例急性期血清样本进行病毒核酸检测... 详细信息

目的了解2019年广西本地感染登革病毒(Dengue virus,DENV)E基因特性，探索可能的输入来源。方法采用实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)方法对广西本地感染登革热病例急性期血清样本进行病毒核酸检测并分型，扩增登革病毒E基因后测序，测序结果与不同地区和国家的参考株进行同源性比较和系统进化分析。结果 53份登革热病例血清标本经RT-qPCR分型，结果 42份（79.2%,42/53）登革病毒核酸阳性，其中南宁9份、梧州10份、玉林17份、崇左6份，均为DENV-1型，其余11份为登革病毒核酸阴性，42份DENV-1型阳性核酸样本经过E基因扩增共得到7份，其中南宁市1份、梧州市1份、玉林市2份、崇左市3份，进化分析结果显示7份样本均为DENV-1型GenotypeⅠ基因型，其中DENV1/GXNN/007/2019、DENV1/GXWZ/009/2019、DENV1/GXYL/011/2019、DENV1/GXYL/012/2019与2019年广东株（序列号：MN921500）同源性99.94%～100.00%,DENV1/GXCZ/015/2019、DENV1/GXCZ/016/2019、DENV1/GXCZ/017/2019与2015年印度尼西亚株（序列号：MG894852）同源性达99.60%，与1945年夏威夷参考株（序列号：AF425619）比较存在12处氨基酸位点变异。结论2019年广西登革病毒是GenotypeⅠ基因型，推测病毒从广东和东南亚国家输入导致的本地流行，应加强登革热跨省、跨境传播的防控。

关键词：登革病毒 E基因序列分析系统进化分析

IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎疫苗免疫应答水平的关联

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中华预防医学杂志 2022年第7期56卷 926-931页

作者：李嘉铃苏永健董柏青吴琪俊杨庆利陈钦艳陈世艺谭超居昱李海广西中医药大学公共卫生与管理学院流行病学教研室南宁530200 广西中医药大学广西高发传染病中西医结合转化医学重点实验室南宁530200 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西病毒性肝炎防治研究重点实验室南宁530028 桂林医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室桂林541000 广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所南宁530028

目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<100 ... 详细信息

目的分析广西汉族儿童IFNG基因DNA甲基化与乙型肝炎(乙肝)疫苗(HepB)免疫应答水平的关联性。方法采用非匹配病例对照方法,招募广西3家医院就诊的263名已完成HepB免疫程序的8~9月龄汉族儿童作为研究对象,将乙肝表面抗体浓度(抗-HBs)<100 mIU/ml设为病例组,≥100 mIU/ml设为对照组。采用多重PCR技术、重亚硫酸盐测序、使用Illumina平台对IFNG基因目标区域及其CpG位点进行DNA甲基化高通量测序。采用非条件logistic回归模型分析IFNG基因18个位点胞嘧啶-磷酸-鸟苷酸 DNA甲基化情况与HepB免疫应答水平的关联。结果病例组(104名)和对照组(159名)抗-HBs[M(Q1,Q3)]分别为62.34(30.06,98.88)mIU/ml和1 089.10(710.35,1 233.45)mIU/ml。病例组IFNG_(1)基因44和93位点甲基化水平差异高于对照组(P<0.05),非条件logistic回归模型显示,IFNG_(1)基因44位点(OR=1.18,95%CI:1.03~1.35)和93位点(OR=1.21,95%CI:1.07~1.38)DNA甲基化水平与HepB应答水平具有相关性。结论 IFNG_(1)基因44和93位点DNA甲基化水平改变可能是影响广西汉族儿童HepB应答水平的相关因素。

关键词：乙型肝炎疫苗 DNA甲基化表观遗传学免疫应答水平

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基于微博的情感分析关键技术研究

基于微博的情感分析关键技术研究

作者：居昱东南大学

学位级别：硕士

随着移动互联网时代的到来,人们更有意愿在网络上分享自己的生活、情感等,促使微博等社交网络中涌现出大量主观信息。从中可以挖掘用户的情感、观点,为政府、商家提供决策支持,因此基于微博进行情感分析具有重要的社会及商业意义。本文... 详细信息

随着移动互联网时代的到来,人们更有意愿在网络上分享自己的生活、情感等,促使微博等社交网络中涌现出大量主观信息。从中可以挖掘用户的情感、观点,为政府、商家提供决策支持,因此基于微博进行情感分析具有重要的社会及商业意义。本文基于微博文本进行情感分析关键技术的研究,从未登录词识别、微博语料预处理、情感词典扩展、情感分析的半监督与无监督算法四个方面展开研究工作。提高了分词系统对微博词汇的识别率,构建了适用于微博文本情感分析的情感词典。设计并实现了微博热门话题情感分析原型系统,针对特定话题进行情感极性分析,挖掘话题参与者的观点,为舆情分析提供辅助。文章首先对情感分析做了简要的介绍,阐述微博情感分析的社会及商业意义,针对微博文本的口语化、网络化的语言特点进行数据预处理与微博情感分析算法的研究。数据预处理部分,本文提出了基于共现频率的未登录词识别算法,可以有效识别未登录词尤其是微博词汇,提升了分词性能;并结合分词系统对微博语料进行清洗,使数据更为规整,便于存储及处理;基于微博语料对情感词典进行扩展,比较了基于微博语料与SO-PMI两种情感词典扩展算法的性能及优缺点。微博情感分析算法研究部分,在综合比较特征提取多种方法的基础上,选择基于卡方统计量进行特征选择,以布尔权重作为特征权重进行特征提取,进而训练Self-training模型对微博语料进行情感分类。此外本文研究了无监督算法,讨论了基于词典的情感分析算法,同时提出了基于二分谱聚类的决策算法。基于上述技术,本文设计并实现了微博热门话题情感分析原型,该系统集成了微博热门话题数据获取、数据预处理和话题情感分析功能。实现了话题情感极性的分析,同时利用LDA主题模型提取话题关键词,从关键词的情感倾向中挖掘用户的观点。实验结果表明,本文能够有效地挖掘出微博数据中的用户情感,具有一定的学术意义及实用价值,进而为人文或商业研究领域提供价值导向分析和辅助决策。

关键词：情感分析微博情感词典未登陆词识别 SO-PMI 二分谱聚类

2016—2020年广西诺如病毒所致感染性腹泻疫情流行病学分析

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现代预防医学 2022年第12期49卷 2271-2275+2280页

作者：罗飞蒋丽娜居昱黄君廖和壮曾竣王晶林玫广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室广西壮族自治区疾病预防控制中心

目的分析广西壮族自治区(简称广西)诺如病毒感染引起腹泻疫情的流行病学特征及其影响因素，为疫情防控提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法，对2016—2020年广西诺如病毒聚集和暴发疫情报告及个案数据资料整理，分析比较罹患率... 详细信息

目的分析广西壮族自治区(简称广西)诺如病毒感染引起腹泻疫情的流行病学特征及其影响因素，为疫情防控提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法，对2016—2020年广西诺如病毒聚集和暴发疫情报告及个案数据资料整理，分析比较罹患率、报告及时性、建立病例地理分布等指标。结果 2016—2020年广西共发生诺如病毒疫情50起，累计病例数2 707例，疫情整体呈上升的趋势，年平均增长率33.75%;50起疫情发生于城市29起,农村地区21起，罹患率城市高于农村，差异有统计学意义(趋势χ~2=58.863,P<0.001)，疫情主要发生场所在托幼机构和学校共38起，占总报告数的76.00%(38/50)；发病年龄主要集中在0～20岁年龄组，占74.17%(2 008/2 707)；疫情分布有明显季节性，主要集中春季(3—5月)和秋季(9—11月)；在一个潜伏期(1～2d)内疫情报告率为74.00%；对50起诺如病毒疫情进行基因分型，诺如病毒GII型感染占86.00%(43/50)，其次混合型GⅠ和GⅡ基因型并存占8.00%(4/50)。采集病例肛拭子664份和外环境标本361份，检出率分别为51.66%(343/664)和9.44%(42/361)。结论广西诺如病毒疫情呈逐年上升趋势，疾控中心在监测的基础上做好疫情防控技术指导加强疫情防控相关措施，提高集体单位应对疫情能力及报告意识。

关键词：诺如病毒疾病暴发流行流行病学

广西境外输入性COVID-19感染者流行病学及病毒基因特征

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中华疾病控制杂志 2023年第7期27卷 844-849页

作者：王晶陈华凤陈春茂李志强居昱宫晨张超黄航邓革红钟革曾竣广西壮族自治区疾病预防控制中心急性传染病防制所南宁530028 广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室南宁530028 广西壮族自治区疾病预防控制中心信息科南宁530028 凭祥市疾病预防控制中心凭祥532600

目的分析广西壮族自治区(广西)境外输入性COVID-19感染者的流行病学特点及病毒基因特征,为境外输入疫情防控提供依据。方法收集2020年3月1日―2022年3月31日广西境外输入性COVID-19感染者的相关信息,使用CLC Genomics Workbench软件进... 详细信息

目的分析广西壮族自治区(广西)境外输入性COVID-19感染者的流行病学特点及病毒基因特征,为境外输入疫情防控提供依据。方法收集2020年3月1日―2022年3月31日广西境外输入性COVID-19感染者的相关信息,使用CLC Genomics Workbench软件进行序列拼接,MEGA软件构建系统进化树。结果广西累计报告输入性感染者1662例,纳入分析1643例,平均年龄为37.4岁,男女比例为6.4∶1,68.4%接种过疫苗。输入性感染者来源国以越南为主(92.5%),入境口岸以凭祥友谊关为主(87.4%)。2020年输入性感染者主要为B.1.351和B.1.1分支,2021年主要为Delta分支,2022年主要为Omicron分支。结论广西持续存在从东南亚疫情高风险国家通过口岸输入疫情的风险,输入感染者的病毒主要为当年的关切变异株(variants of concern,VOC),口岸疫情防控形势严峻,需要持续关注输入性病例。

关键词： COVID-19 境外输入疫情全基因组测序

2014-2019年广西手足口病重症病例流行特征

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医学动物防制 2022年第6期38卷 594-597页

作者：张超曾竣王晶居昱陈加贵何为涛康宁闭福银谭毅广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530028

目的了解2014—2019年广西重症手足口病病例流行特征,为科学防治重症手足口病提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对2014—2019年广西手足口病重症病例个案信息进行分析。结果2014—2019年广西重症手足口病发病主要集中在2014年、... 详细信息

目的了解2014—2019年广西重症手足口病病例流行特征,为科学防治重症手足口病提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对2014—2019年广西手足口病重症病例个案信息进行分析。结果2014—2019年广西重症手足口病发病主要集中在2014年、2016年和2017年,分别为3939、3538、3738例,合计占重症病例总数的85.87%。梧州市、南宁市、钦州市、百色市和桂林市重症病例数居广西前5位,分别为4298、3541、1200、1105和896例,占重症病例总数的84.53%;季节分布主要集中在每年的4—7月和9—10月;发病年龄主要集中在<5岁儿童(12907例,98.82%),男女病例数之比为1.70∶1,<3岁儿童占91.09%、散居儿童占90.38%;对11611例重症手足口病病例进行实验室检测,阳性9288例(79.99%),其中EV 71阳性4508例(48.54%),Cox A16阳性767例(8.26%),其他肠道病毒阳性4013例(43.21%);2757例重症确诊病例中无接种史2634例(95.54%),有接种史123例(5例为EV 71导致)。结论2014—2019年广西手足口重症病例优势血清型为EV 71,2017年后重症手足口病EV 71血清型占比降低,个别县区重症发生率远超全区平均水平,提示需进一步探索重症危险因素。

关键词：手足口病重症病例流行特征病原学 EV 71 Cox A16 其他肠道病毒 EV 71疫苗

2018~2020年广西边境地区手足口病流行特征及病原学分析

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病毒学报 2022年第3期38卷 591-599页

作者：冀天娇居昱程文隽陈敏玫张勇肖金波张珂艺刘宏图许文波国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530028 国家病毒相关肿瘤室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种由肠道病毒引起的儿童常见传染病,近年来在亚太地区尤其是东南亚地区发生了多起HFMD的大暴发,而我国广西壮族自治区与越南接壤,往来密切。为了解其边境地区HFMD的流行概况和病原学构成... 详细信息

手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种由肠道病毒引起的儿童常见传染病,近年来在亚太地区尤其是东南亚地区发生了多起HFMD的大暴发,而我国广西壮族自治区与越南接壤,往来密切。为了解其边境地区HFMD的流行概况和病原学构成,比较该地区病原优势基因型与相邻地区的变异与进化关系。本研究选取与越南接壤的百色、崇左、防城港作为研究对象,收集其2018-2020年HFMD疫情资料进行流行病学分析,并随机采集这三个地市的375份手足口病患儿的临床标本进行荧光定量PCR鉴定,对阳性毒株进行VP1编码区基因扩增及测定,获得的序列与GenBank上下载的各基因型/亚型的代表序列构建系统发生树。结果显示2018-2020年,广西边境地区的报告发病数、重症数、重症比例(重症/发病)和重症率均呈下降趋势,5岁以下儿童为主要发病人群,除2020年以外,其发病流行曲线呈典型的双峰分布。病原谱分析显示,整体上以其他EV为优势循环血清型,且CVA6、CVA16、CVA10和EVA71为该地区的优势病原。同时,2018-2020年期间广西边境流行的EVA71、CVA16、CVA6和CVA10的优势基因亚型分别为C4a、B1b、D3a和C2,且与东南亚临近国家同基因型的流行株具有较近的亲缘关系,提示病毒共同循环进化。而边境地区环境复杂、人员往来密切,因此加强边境地区手足口病的监测及预警系统的建设是西南边境地区手足口病防控的关键。

关键词：手足口病边境地区流行特征病原学特点