检索结果-南通市图书馆

结核分枝杆菌Phage蛋白的抗原表位预测及生物信息学分析

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医学理论与实践 2025年第1期38卷 14-19页

作者：黄和明张娟李高驰周海金广东省深圳市龙岗区妇幼保健院检验科 518000 广东省深圳市龙岗区妇幼保健院中心实验室 518000 深圳市妇幼保健院

目的:应用生物信息学软件对结核分枝杆菌Rv1579c基因编码的Phage蛋白结构和功能进行预测分析。方法:从NCBI Gene数据库中获取Rv1579c编码的氨基酸序列;通过ProtParam、ProtScale、NetPhos、TMHMM、SOPMA、SWISS-MODEL在线网站分别对Phag... 详细信息

目的:应用生物信息学软件对结核分枝杆菌Rv1579c基因编码的Phage蛋白结构和功能进行预测分析。方法:从NCBI Gene数据库中获取Rv1579c编码的氨基酸序列;通过ProtParam、ProtScale、NetPhos、TMHMM、SOPMA、SWISS-MODEL在线网站分别对Phage蛋白的理化性质、亲疏水性、磷酸化位点、跨膜螺旋结构、二级结构以及三级结构建模进行预测分析;利用IEDB、ABCpred、SYFPEITHI等软件预测Phage蛋白的细胞抗原表位;使用NCBI中BLAST数据库、UniProt数据库、MEGA-X软件分析Phage蛋白同源性及进化树的构建;STRING数据库预测其相互作用蛋白。结果:Phage蛋白共含有104个氨基酸,分子式为C_(480)H_(750)N_(140)O_(164)S_(4),原子总数1538,为亲水性蛋白,第22、23位氨基酸疏水性得分最高为-1.433;第94位氨基酸亲水性得分最高为-2.511。该蛋白不稳定指数42.81,为不稳定蛋白;无糖基化位点,含有12个磷酸化位点,无跨膜螺旋结构。另外,Phage蛋白共获得多个优势细胞抗原表位。结论:生物信息学分析Phage蛋白为结核分枝杆菌胞膜亲水性不稳定蛋白,介导结核分枝杆菌焦亡和耐药的发生。同时,该蛋白的多个优势细胞抗原表位,可成为未来结核诊断治疗的新靶标。

关键词：结核分枝杆菌焦亡 Phage 生物信息学

SLC22A8表达下调促进肾透明细胞癌代谢紊乱

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安徽医药 2025年第1期29卷 74-78,I0003,I0004,I0005页

作者：陈尚金钟双泽林汉胜何京伟广东医科大学第一临床医学院广东湛江524000 广东医科大学附属阳江人民医院泌尿外二科广东阳江529500

目的探索肾透明细胞癌(ccRCC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值。方法该研究于2022年11月始通过CEO2R在线分析工具对GEO数据库中的GSE6344和GSE53757进行差异表达基因(DEGs)的筛选并取交集得到共同差异表达基因... 详细信息

目的探索肾透明细胞癌(ccRCC)发生和进展的相关关键基因,研究其潜在的作用机制及预后价值。方法该研究于2022年11月始通过CEO2R在线分析工具对GEO数据库中的GSE6344和GSE53757进行差异表达基因(DEGs)的筛选并取交集得到共同差异表达基因,并在STRING数据库上构建蛋白质关系网络并应用Cytohubba插件取蛋白质作用关系程度TOP5的基因作为关键基因,之后通过生存分析得出与ccRCC预后相关的关键基因;应用cBioportal数据库进行基因改变分析得出显著突变的关键基因,DAVID数据库对显著突变关键基因进行功能富集与通路分析,UALCAN数据库和HPA数据库验证显著突变关键基因蛋白的差异表达,以上分析过程于2022年12月完成。结果GSE6344和GSE53757分别筛选出198个DEGs和183个DEGs并通过取交集获得63个共同差异表达基因(上调DEGs41个,下调DEGs22个);Cytohubba程序分析该63个基因的蛋白质关系网络得到五个关键基因:SMIM5、TMEM213、SLC12A3、SLC22A8、SLC13A3,均为下调基因;生存分析显示:SLC12A3、SLC22A8、SLC13A3、TMEM213与ccRCC预后相关;基因改变分析提示SLC22A8为显著突变的关键基因;富集分析主要与碳水化合物的代谢、线粒体功能以及过氧化物酶、氧化还原酶活性等多种调节过程相关。结论SLC22A8与肾透明细胞癌的预后密切相关,并通过代谢紊乱影响ccRCC的发生和进展,具有作为ccRCC治疗靶点的潜力。

关键词：肾肿瘤差异基因表达基因改变关键基因代谢紊乱 HPA数据库

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激光熔覆FeCoCrNiNb高熵合金涂层组织及耐磨性能

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稀有金属材料与工程 2023年第4期52卷 1483-1489页

作者：王石王琳尹晓伟沈阳工程学院机械学院辽宁沈阳110870

采用激光熔覆技术在304不锈钢表面制备了FeCoCrNi、FeCoCrNiNb等摩尔比高熵合金熔覆层,研究了Nb元素对熔覆层组织及性能的影响。采用XRD、SEM、EDS、纳米压痕测试和干滑动摩擦磨损实验等方法,详细分析了2种高熵合金熔覆层的相组成、组... 详细信息

采用激光熔覆技术在304不锈钢表面制备了FeCoCrNi、FeCoCrNiNb等摩尔比高熵合金熔覆层,研究了Nb元素对熔覆层组织及性能的影响。采用XRD、SEM、EDS、纳米压痕测试和干滑动摩擦磨损实验等方法,详细分析了2种高熵合金熔覆层的相组成、组织演变、纳米硬度及耐磨性能。结果表明:FeCoCrNiNb高熵合金熔覆层相组成为fcc固溶体及富Nb-Laves相。FeCoCrNiNb熔覆层的纳米硬度(H)、弹性模量(E)、H/E和H^(3)/E^(2)分别为6.066 GPa、231.54 GPa、0.0262和0.0042,远高于FeCoCr Ni熔覆层的3.456 GPa、209.48 GPa、0.0165和0.00094。随着纳米硬度的增加,FeCoCrNiNb熔覆层的摩擦系数和比磨损率也随之降低,分别为0.519和2.54×10^(-6)mm^(3)/(N·m)。综上所述,FeCoCrNiNb高熵合金熔覆层具有良好的纳米硬度和耐磨性。

关键词：高熵合金激光熔覆 Laves相纳米压痕耐磨性

重组日本血吸虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂可通过调节炎症微环境对“二次打击”脓毒症小鼠发挥治疗作用

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南方医科大学学报 2025年

作者：多文娟王怡祥王家兴许鑫龙李林献杨栋臣申启利杨立春刘晓静金启旺褚亮杨小迪蚌埠医科大学基础医学院安徽省感染与免疫重点实验室南京紫金医院蚌埠医科大学第二附属医院普外科

目的探讨重组日本血吸虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂（r Sj-Cystatin）对“二次打击”脓毒症小鼠的干预作用。方法 64只C57BL/6雄性小鼠随机分为假手术组（A组）、蛋白组（B组）“、二次打击”造模组（C组）、蛋白干预组（D组），每组16只。... 详细信息

目的探讨重组日本血吸虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂（r Sj-Cystatin）对“二次打击”脓毒症小鼠的干预作用。方法 64只C57BL/6雄性小鼠随机分为假手术组（A组）、蛋白组（B组）“、二次打击”造模组（C组）、蛋白干预组（D组），每组16只。A组和B组小鼠首先腹腔注射PBS（100μL/只），24 h后开腹探查盲肠，但不进行盲肠结扎和穿刺（CLP），术后30 min，分别腹腔注射PBS（100μL/只）或含25μg r Sj-Cystatin蛋白的PBS（100μL/只）；C组和D组小鼠首先腹腔注射含LPS（5 mg/kg）的PBS（100μL/只），24 h后行CLP手术，术后30 min，分别腹腔注射PBS（100μL/只）或含25μg r Sj-Cystatin蛋白的PBS（100μL/只）。每组随机抽取6只，造模12 h后取小鼠血清、脾、肝、肺和肾组织。肝、肺和肾组织HE染色观察其病理损伤并进行评分；酶联免疫吸附实验（ELISA）检验血清和肝、肺、肾组织匀浆中肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-10（IL-10）和转化生长因子-β（TGF-β）水平以及组织中巨噬细胞极化标志物iNOS和Arg-1水平；流式细胞术检测脾脏CD3+CD4+CD25+Foxp3+T的比例变化；剩余小鼠造模后记录72 h生存率并观察小鼠状态。结果与A组和B组（100%）相比，C组（0%）72 h生存率降低，经r Sj-Cystatin蛋白治疗后，D组生存率较C组增高（20%）。与A、B两组相比，C组肝、肺、肾组织切片病理损伤加重，血清和组织匀浆中TNF-α、IL-6水平明显升高（P<0.05）；经蛋白治疗后，病理损伤程度减轻，血清和组织匀浆中TNF-α、IL-6水平降低（P<0.05），调节因子IL-10、TGF-β水平明显升高（P<0.05）同时CD3+CD4+CD25+Foxp3+T比例升高（P<0.05）；与A、B两组相比，C组各器官组织中iNOS水平均升高，而Arg-1水平呈差异性，仅在肾中呈下降趋势（P<0.01）；与C组相比，D组iNOS水平下降（P<0.05）,Arg-1水平升高（P<0.001）。结论 r SjCystatin可通过调节炎症微环境进而对“二次打击”脓毒症起到明显的治疗作用。

关键词：重组日本血吸虫半胱氨酸蛋白酶抑制剂脂多糖盲肠结扎穿刺脓毒症免疫调节因子

转炉用变截面自平衡式扭力杆扭转变形的理论计算

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工程力学 2012年第6期29卷 47-51页

作者：吴林峰尹晓春南京理工大学力学与工程科学系南京210094 华北水利水电学院机械学院郑州450008

扭力杆通过弹性扭转变形储备能量的大小对氧气顶吹转炉大型设备工作的可靠性有着重要影响,研究其扭转变形成为关键的技术问题之一。该文基于圆柱弹性扭转初等理论,推导了由等截面圆杆、变截面锥杆和过渡圆角三部分共同组成的自平衡式扭... 详细信息

扭力杆通过弹性扭转变形储备能量的大小对氧气顶吹转炉大型设备工作的可靠性有着重要影响,研究其扭转变形成为关键的技术问题之一。该文基于圆柱弹性扭转初等理论,推导了由等截面圆杆、变截面锥杆和过渡圆角三部分共同组成的自平衡式扭力杆的扭转变形的理论计算公式,并以150t转炉用自平衡式扭力杆为例,对其正确性采用有限元方法进行了验证,两种方法的计算结果吻合。该自平衡式扭力杆的实际应用也表明该文两种研究方法都是可行的,但是解析法比有限元法简单方便,更适合工程设计人员直接使用。

关键词：自平衡式扭力杆变截面扭转变形解析解有限元解

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柔性杆多次撞击过程的瞬态动力学分析

机械工程学报 2008年第2期44卷 43-48页

作者：田阿利尹晓春南京理工大学力学与工程科学系南京210094

对双柔性杆多次撞击过程,采用***杆波动理论,提出应用瞬态波函数特征值展开法,分别求解多次撞击和分离过程瞬态波响应理论解。应用该理论解,由撞击过程中两杆组合结构的撞击界面应力,计算多次撞击力响应,从而实现了对多次撞击问题的分... 详细信息

对双柔性杆多次撞击过程,采用***杆波动理论,提出应用瞬态波函数特征值展开法,分别求解多次撞击和分离过程瞬态波响应理论解。应用该理论解,由撞击过程中两杆组合结构的撞击界面应力,计算多次撞击力响应,从而实现了对多次撞击问题的分析。数值计算表明,该方法可以合理的分析多次撞击过程,较精确的计算多次撞击力响应和结构瞬态波响应,并可进一步研究'次撞击'和瞬态波传播等物理现象,以及研究系统参数对多次撞击过程的影响。研究结果可为柔性结构多次撞击过程的瞬态响应分析和结构安全评估提供参考。

关键词：多次撞击瞬态响应撞击力

拟塑性流体中单气泡生成及上升周围液相流场的测量

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光电子．激光 2012年第6期23卷 1135-1139页

作者：范文元尹晓红天津理工大学化学化工学院天津300384

采用激光影像技术,对羧甲基纤维素(CMC)水溶液中气泡生成过程中的形状演变进行了实时观测。利用激光多普勒测速仪(LDV)对气泡生成和上升过程中周围液相流场进行了测定,得到了气泡周围的液相时均速度分布以及在测试截面上的速度等值图。... 详细信息

采用激光影像技术,对羧甲基纤维素(CMC)水溶液中气泡生成过程中的形状演变进行了实时观测。利用激光多普勒测速仪(LDV)对气泡生成和上升过程中周围液相流场进行了测定,得到了气泡周围的液相时均速度分布以及在测试截面上的速度等值图。结果表明,在气泡生成初期,由于表面张力占主导作用,气泡呈球形增长;随后在浮力和和剪切稀化共同作用下,气泡逐渐被拉伸呈泪滴状;液相轴向时均速度对喷嘴中心垂线呈高斯分布,径向时均速度随着与喷嘴中心垂线距离的增加,先增加后减小。在实验范围内,轴向时均速度随高度的增加先减小后增大,其等值图则逐渐发散;而径向时均速度随高度的增加逐步减小,其等值图中极大值缓慢向两边偏移直到消失,整体沿喷嘴中心垂线呈蝴蝶"前翅膀"状。

关键词：拟塑性流体气泡生成激光多普勒测速仪(LDV) 流场

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非均质柔性杆撞击瞬态动力学动态子结构法

工程力学 2008年第11期25卷 42-47页

作者：沈煜年尹晓春南京理工大学力学与工程科学系江苏南京210094

该文运用固定界面模态综合动态子结构法,研究非均质变截面杆受刚性质量轴向撞击问题,导出了用模态坐标表示的瞬态动力学方程,并讨论了撞击初始条件确定的两种方法。数值仿真表明:该方法能够计算非均质变截面杆轴向撞击的复杂撞击力变化... 详细信息

该文运用固定界面模态综合动态子结构法,研究非均质变截面杆受刚性质量轴向撞击问题,导出了用模态坐标表示的瞬态动力学方程,并讨论了撞击初始条件确定的两种方法。数值仿真表明:该方法能够计算非均质变截面杆轴向撞击的复杂撞击力变化形式、撞击瞬态波在杆中的传播过程以及撞击瞬态动力响应。算例的数值计算结果表明:当单元总数为180个,且仅保留2阶固定界面主模态时,计算结果已经收敛,与理论解相比,计算精度较高。因此,当选取更多单元总数和更高的主模态时,该方法有可能被应用于复杂的柔性结构撞击瞬态动力学的研究中。

关键词：非均质杆动态子结构法碰撞应力波碰撞力

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自由飞行杆撞击过程中的二次撞击区

振动与冲击 2008年第1期27卷 19-24页

作者：田阿利尹晓春南京理工大学力学与工程科学系南京210094

应用瞬态波效应法,研究了自由飞行杆与固支杆共轴多次撞击问题。采用瞬态波传播理论研究撞击瞬态波的传播,应用撞击接触面内力求解撞击力响应,给出了杆多次撞击瞬态问题的理论解。通过分析杆的瞬态变形和撞击力,发现自由飞行杆与固支杆... 详细信息

应用瞬态波效应法,研究了自由飞行杆与固支杆共轴多次撞击问题。采用瞬态波传播理论研究撞击瞬态波的传播,应用撞击接触面内力求解撞击力响应,给出了杆多次撞击瞬态问题的理论解。通过分析杆的瞬态变形和撞击力,发现自由飞行杆与固支杆共轴撞击最多会发生二次撞击,并发现二次撞击现象并非偶然。对发生二次撞击现象的条件以及分布规律进行了研究,数值计算表明,二次撞击相当规则地分布于时间-杆长比平面内。在一定条件下,二次撞击过程具有与单次撞击过程相当的撞击力幅值,因此,对杆二次撞击问题的研究具有重要的价值。

关键词：二次撞击瞬态波杆