检索结果-南通市图书馆

作者：尹文娇中国疾病预防控制中心

学位级别：硕士

目的：了解我国西南地区(西藏藏族自治区、四川省、重庆市、云南省和贵州省)自然人群感染乙肝病毒(HBV)的基因型别、血清型别;了解HBV S基因α抗原决定簇突变情况、基本核心启动子(BCP) A1762T/G1764A双位点突变情况和G1896A突变情况。... 详细信息

目的：了解我国西南地区(西藏藏族自治区、四川省、重庆市、云南省和贵州省)自然人群感染乙肝病毒(HBV)的基因型别、血清型别;了解HBV S基因α抗原决定簇突变情况、基本核心启动子(BCP) A1762T/G1764A双位点突变情况和G1896A突变情况。方法：2009年在西藏藏族自治区、四川省、重庆市、云南省和贵州省对在2006年中国乙肝血清流行病学调查中HBsAg阳性人群以家庭为单位回访并采集血清。采用微粒子酶联免疫技术(Micro-particle Enzyme Immunoassay, MEIA)对血清标本进行乙肝五项指标检测,选择其中HBV血清学标志物阳性的血清(仅anti-HBs阳性的标本除外),利用QIAGEN公司的QIAamp DNA Blood Mini Kit试剂盒提取HBV DNA,采用巢氏PCR方法扩增S基因片段和C基因片段,并进行序列测定。利用MEGA4软件将样本S和C基因片段核苷酸序列与Gene Bank中的HBV基因型别标准参照序列进行核苷酸同源性比对分析,从而确定基因型别;根据S基因片段与HBV各基因亚型标准序列比对结果确定基因亚型;推导出S基因片段氨基酸序列,确定S基因第122位和第160位氨基酸,从而确定血清型别;明确α抗原决定簇氨基酸位点突变情况。将前C区和C区核苷酸序列与标准参照序列进行比对,确定BCP A1762T/G1764A双位点突变情况和前C区G1896A突变情况。利用SAS9.2对数据进行处理和统计分析。结果：本研究共采集血清标本621份,经检测,539份为HBV感染标本。PCR扩增出HBVS基因片段并成功测序379份,前C/C基因片段232份。我国西南地区HBV基因型别流行率由高到低依次为D/C重组型(38.6%)、B型(32.1%)、C型(23.3%)、C/B重组型(4.2%)、B/C重组型(1.4%)以及D/B重组型(0.005%);流行的HBV基因亚型为D4(39.0%)、B2(27.0%)、C1(21.0%)、C2(10.0%)以及少数几例B5(9例)、C3(3例)、B4(1例)、B3(1例)、C5(1例)和D1(1例);流行的HBV血清型别为ayw(39.8%)、adw(30.1%)和adr(30.1%)。 HBV a抗原决定簇突变率为10.3%,乙肝疫苗免疫前、后出生人群α抗原决定簇突变率分别为9.2%和14.1%(χ2=1.739,P=0.19);S基因片段为B型、C型和D型的HBV a抗原决定簇突变率分别为15.2%、2.5%和13.0%(χ2=12.070,P=0.002)。 BCP A1762T/G1764A双突变率为34.1%;S和C基因片段分型为B型、C型和D/C重组型的HBV BCP A1762T/G1764A双突变率分别为21.7%、40.0%和44.6%(Fisher Exact P=0.01);乙肝疫苗免疫前、后出生人群HBV BCP A1762T/G1764A双突变率分别为39.9%和18.8%(χ2=9.215,P=0.002);B型、C型和D/C重组型的HBV BCP A1762T/G1764A双突变率在0-60岁年龄组间呈逐渐上升趋势,在>60岁年龄组又突然下降;BCPA1762T/G1764A双突变组与未突变组HBeAg阳性率分别为31.6%和58.2%(χ2=14.770,P<0.01);BCPA1762T/G1764A双突变组与未突变组HBeAg定量值中位数分别为111.8和260.0(Wilcoxon秩和检验：P<0.01);BCPA1762T/G1764A双突变组与未突变组HBV DNA载量值中位数分别为1.02×107IU/ml和4.50×107IU/ml (Wilcoxon秩和检验：P<0.01)。 G1896A突变率为39.7%;S基因片段和C基因片段分型为B型、C型和D/C重组型HBV G1896A突变率分别为58.0%、32.0%和22.9%(Fisher Exact P<0.01);乙肝疫苗免疫前、后出生人群HBV G1896A突变率分别为50.6%和10.9%(χ2=30.459,P<0.01);B型、C型和D/C重组型的HBV G1896A突变率随年龄增长基本呈上升趋势;G1896A突变组和未突变组的HBeAg阳性率分别为4.3%和78.6%(x2=122.380, P<0.01);G1896A突变组和未突变组的HBV DNA载量中位数分别为1.]7×107IU/ml和5.58×105IU/ml (Wilcoxon秩和检验：P=0.02)。结论：(1)除西藏藏族自治区等地区所特有的D/C重组型HBV外,B型、C型为西南地区的优势HBV基因型别;我国西南地区的HBV优势基因亚型为D4、B2、C1和C2;我国西

关键词：乙型肝炎病毒基因型别血清型别 BCP A1762T/G1764A双突变 G1896A突变

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乙肝患者HBV感染指标、病毒复制水平与基因分型的关系分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2012年第5期26卷 328-330页

作者：秦望森沈立萍张爽尹文娇王锋河南省人民医院检验科郑州450003 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所肝炎室

目的探讨HBV感染指标、病毒复制水平和基因型之间的关联及对乙肝患者诊断和预后的意义。方法采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测样本的HBV PreS1-Ag、Anti—HBc—IgM和HBV两对半；荧光定量PCR法测HBVDNA水平；巢氏PCR法扩增S片段、测序... 详细信息

目的探讨HBV感染指标、病毒复制水平和基因型之间的关联及对乙肝患者诊断和预后的意义。方法采用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测样本的HBV PreS1-Ag、Anti—HBc—IgM和HBV两对半；荧光定量PCR法测HBVDNA水平；巢氏PCR法扩增S片段、测序并对比分析判定基因型，联合分析指标的关联。结果收集河南地区急、慢性乙肝患者样本355例。模式Ⅰ（HBeAg阳性）的PreS1-Ag阳性率为80．2％、HBV DNA阳性率为73．7％，显著高于其他模式；PreS1-Ag、Anti-HBc-IgM阳性者的ALT、AST异常率显著高于阴性组；HBV基因型结果为B型4例（2．9％），C型76例（55．9％），D型56例（41．2％），C型患者的HBeAg和HBV DNA阳性率显著高于B型和D型。结论PreS1-Ag和Anti—HBc—IgM对乙肝早期诊断、病毒复制监测及预后评估有重要意义；河南地区乙肝患者的HBV基因型以C型和D型为主，C型的HBeAg和HBV DNA阳性率显著高于B和D型。

关键词：肝炎乙型抗原免疫球蛋白M 基因型病毒核心蛋白质类

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草莓中甲型肝炎病毒检测方法的比较

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中华实验和临床病毒学杂志 2023年第1期37卷 83-88页

作者：焦梦琪尹文娇曹经瑗毕胜利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的对草莓中甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)检测的两种检测方法进行优化比较, 以选出最佳的检测方法, 用于草莓中甲肝病毒的检测。方法向已知阴性冷冻草莓标本表面接种不同浓度的HAV, 优化碱性洗脱-PEG浓缩法中的牛肉浸出粉的... 详细信息

目的对草莓中甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)检测的两种检测方法进行优化比较, 以选出最佳的检测方法, 用于草莓中甲肝病毒的检测。方法向已知阴性冷冻草莓标本表面接种不同浓度的HAV, 优化碱性洗脱-PEG浓缩法中的牛肉浸出粉的浓度以及选择最适核酸提取试剂盒, 优化直接裂解法中的最适裂解缓冲液体积, 对草莓标本进行处理, 采用实时荧光定量RT-PCR检测回收的病毒量, 应用SPSS26.0对数据进行统计分析, 并将优化后的两种方法用于实际标本的检测。结果优化后的碱性洗脱-PEG浓缩法的牛肉浸出粉浓度选择3%, 病毒核酸提取试剂盒选择试剂盒B。优化后的直接裂解法的裂解缓冲液体积选择6 ml。对碱性洗脱-PEG浓缩法、直接裂解法在添加HAV不同浓度水平进行比较, 两种方法的HAV病毒回收率分别为21.50±1.06%、5.82±0.01%, 结果表明差异具有统计学意义。同时对四个地区共60份草莓标本进行检测, 结果均为阴性。结论优化后的碱性洗脱-PEG浓缩法灵敏度更高, 更适用于草莓标本中HAV的检测。

关键词：草莓甲型肝炎病毒前处理方法实时荧光定量RT-PCR

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数字RT-PCR与荧光定量RT-PCR法检测草莓中甲型肝炎病毒

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中华实验和临床病毒学杂志 2023年第4期37卷 443-448页

作者：焦梦琪石峰尹文娇曹经瑗毕胜利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的建立甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)数字芯片式RT-PCR(dRT-PCR)方法并与real time RT-PCR(RT-qPCR)方法进行比较,选出适用于检测草莓中HAV的最佳方法。方法提取HAV疫苗RNA,优化dRT-PCR的反应条件,评价其特异性;碱性洗脱-PEG... 详细信息

目的建立甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)数字芯片式RT-PCR(dRT-PCR)方法并与real time RT-PCR(RT-qPCR)方法进行比较,选出适用于检测草莓中HAV的最佳方法。方法提取HAV疫苗RNA,优化dRT-PCR的反应条件,评价其特异性;碱性洗脱-PEG浓缩法对草莓标本进行前处理后提取核酸,同时采用dRT-PCR与RT-qPCR方法,检测纯水或草莓基质中HAV疫苗RNA的敏感性、抑制率;比较人工污染草莓中HAV的回收率,并应用于市售标本中的检测。结果确立了dRT-PCR反应的最适退火温度为60℃,最佳引物、探针浓度为0.4μmol/L、0.4μmol/L、0.2μmol/L,特异度良好;两种检测方法检测HAV疫苗RNA在纯水或草莓基质中的敏感性没有明显差异,dRT-PCR的抑制率较低。dRT-PCR与RT-qRCR在检测较高浓度HAV污染草莓标本时的回收率分别为12.90±0.006%、30.12±0.02%;在检测较低浓度HAV污染草莓标本时的回收率分别为18.27±0.07%、10.85±0.03%,差异均具有统计学意义(P<0.05)。对市售标本进行检测,两种方法检测结果均为阴性。结论本研究建立的dRT-PCR法,与RT-qPCR检测不同基质中的HAV RNA敏感性没有明显差异,但dRT-PCR对PCR反应抑制物有较好的耐受能力,在检测低浓度HAV时回收率较高。两种检测方法均可用于草莓中甲型肝炎病毒的定量检测,可根据具体实际情况进行选择。

关键词：草莓甲型肝炎病毒数字RT-PCR 实时荧光定量RT-PCR

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河北省某“献血村”人群乙型病毒性肝炎流行现状及危险因素分析

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中国疫苗和免疫 2015年第2期21卷 154-158页

作者：尹文娇韩碧华邱丰张勇周吉坤王锋毕胜利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206 河北医科大学石家庄050017 石家庄市疾病预防控制中心河北石家庄050019

目的了解单采血浆还输血球的有偿献血20年后,河北省某＂献血村＂人群乙型病毒性肝炎（乙肝）的流行现状,探讨乙肝传播的危险因素,为预防控制乙肝在该人群传播提供参考。方法以河北省某＂献血村＂常住村民为研究对象,进行问卷调查、采集... 详细信息

目的了解单采血浆还输血球的有偿献血20年后,河北省某＂献血村＂人群乙型病毒性肝炎（乙肝）的流行现状,探讨乙肝传播的危险因素,为预防控制乙肝在该人群传播提供参考。方法以河北省某＂献血村＂常住村民为研究对象,进行问卷调查、采集静脉血,利用酶联免疫吸附试验检测乙肝病毒（Hepatitis B Virus,HBV）血清学标志物,采用统计分析系统9.2软件对数据进行统计分析。结果河北省某＂献血村＂人群乙肝病毒表面抗原（HBV Surface Antigen,HBs Ag）和抗乙肝病毒核心抗原抗体（Antibody to HBV Core Antigen,Anti-HBc）流行率分别为4.46%（22/493）和33.87%（167/493）,均接近河北省自然人群水平。母婴传播是导致HBs Ag阳性的主要因素[母亲HBs Ag阳性组vs阴性组：比值比（Odds Ratio,OR）=13.177,95%可信区间（Confidence Interval,CI）：2.457-70.669];接种乙肝疫苗（Hepatitis B Vaccine,Hep B）是Anti-HBc阳性的保护因素（接种组vs未接种组：OR=0.014,95%CI：0.003-0.058）。结论 HBV在河北省某＂献血村＂人群主要通过母婴传播。目前预防控制乙肝的策略应放在发现HBs Ag阳性的孕产妇,阻断母婴传播,以及提高成年人群Hep B的接种率。

关键词：乙型病毒性肝炎单采血浆还输血球母婴传播

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广义线性混合模型在传染病流行病学研究中的应用

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中国疫苗和免疫 2011年第4期17卷 373-377页

作者：尹文娇赵守军张勇中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 University of California San Francisco USA 94143

现代统计学的重要模型--广义线性混合模型(Generalized Linear Mixed Models,GLMM),在传染病流行病学研究中应用广泛,可用于分析重复测量、簇群聚集以及空间聚集分布等资料,如队列研究、多中心临床试验、传染病的横断面调查等。现介绍G... 详细信息

现代统计学的重要模型--广义线性混合模型(Generalized Linear Mixed Models,GLMM),在传染病流行病学研究中应用广泛,可用于分析重复测量、簇群聚集以及空间聚集分布等资料,如队列研究、多中心临床试验、传染病的横断面调查等。现介绍GLMM的原理,并用统计分析系统软件进行实例模拟。与传统固定效应广义线性模型相比,GLMM拟合模型简单、结果稳定可靠,更适合在传染病流行病学研究中应用。

关键词：广义线性混合模型传染病流行病学纵向数据簇群聚集数据

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16条甲型肝炎病毒流行株基因型及全基因组特征分析

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病毒学报 2022年第6期38卷 1397-1404页

作者：杜凤雪周文亭邱丰尹文娇曹经瑗毕胜利国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

为分析具有相同VP1-2A区基因序列的甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株全基因组序列特征,收集我国6个省市不同年份同一起或不同起甲型肝炎(甲肝)暴发中,部分甲肝病例急性期血清标本,提取HAV RNA,进行VP1-2A区基因分型,RT-PCR分... 详细信息

为分析具有相同VP1-2A区基因序列的甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株全基因组序列特征,收集我国6个省市不同年份同一起或不同起甲型肝炎(甲肝)暴发中,部分甲肝病例急性期血清标本,提取HAV RNA,进行VP1-2A区基因分型,RT-PCR分段扩增HAV近全基因组序列,构建系统进化树,分析基因组特征。本研究获得16条HAV近全基因组序列,均属于基因IA亚型,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.81%~100%和99.23%~100%。与GenBank中HAV序列比较,15条序列与Man12-001(蒙古国株)最接近,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.87%~99.81%和99.55%~99.95%;1条序列与HAJEF-K12(日本株)最接近,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为99.37%和99.91%。本文中VP1-2A区序列完全相同的HAV流行株,来源于同一起甲肝暴发时,HAV近全基因组核苷酸序列差异为0%~0.03%;来源于不同起暴发时,核苷酸序列差异为0.18%~0.99%。16条HAV序列在已发表的中和抗原表位未发现变异,编码区氨基酸序列处于负向选择压力,16条序列间及与参考序列间未发现基因重组。本研究表明我国存在多株HAV流行株,主要为基因IA亚型;VP1-2A区序列完全相同的HAV流行株,来源于同一起甲肝暴发的HAV全基因组核苷酸序列同源性高于不同起暴发的HAV序列同源性。HAV基因分型及全基因序列分析与现场流行病学调查结果相结合,更有利于HAV溯源分析。

关键词：甲型肝炎病毒基因分型全基因组序列

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2019年青岛市3例有摩洛哥旅行史甲型肝炎病例感染甲型肝炎病毒株基因特征

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中国疫苗和免疫 2024年第3期30卷 269-277页

作者：韩雅琳周文亭尹文娇姜法春曹经瑗毕胜利青岛市疾病预防控制中心青岛市预防医学研究院山东青岛266033 国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的分析2019年青岛市从3例有摩洛哥旅行史甲型肝炎(甲肝)病例中检测到的甲肝病毒(Hepatitis A virus,HAV)株基因特征和感染来源。方法对甲肝病例进行流行病学调查,采集急性期血清标本并提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增和/或拼接HAV VP1... 详细信息

目的分析2019年青岛市从3例有摩洛哥旅行史甲型肝炎(甲肝)病例中检测到的甲肝病毒(Hepatitis A virus,HAV)株基因特征和感染来源。方法对甲肝病例进行流行病学调查,采集急性期血清标本并提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增和/或拼接HAV VP1-2A区和近全基因组核苷酸序列并构建系统进化树,分析本研究HAV与GenBank中参考株的核苷酸和氨基酸同源性以确定基因型,分析主要中和抗原表位关键氨基酸位点突变和基因重组。结果3例甲肝病例在发病潜伏期内有摩洛哥旅行史和半生食贝类海产品史,并检测到HAV核酸。3株HAV均位于系统进化树的ⅠA基因亚型欧洲分支,且在VP1-2A区与ⅠA亚型参考株的核苷酸和氨基酸差异分别仅为0.29%-7.45%和0.00%-2.59%;病例1感染的HAV与2018年爱尔兰分离株18IRL89195近全基因组的核苷酸序列同源性最高(98.41%),仅在编码区的3D区第80位(V/L)和第372位(K/R)氨基酸不同。病例2和病例3感染的HAV近全基因组序列完全相同,与2016年法国污水分离株G22-029的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为99.85%和100%。未发现3株HAV存在主要中和抗原表位关键氨基酸位点突变和基因重组。结论本研究HAV毒株属于ⅠA基因亚型,推测为境外感染且可能与半生食贝类海产品有关。

关键词：甲型肝炎病毒基因型基因亚型基因特征

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模拟水样中戊型肝炎病毒检测方法的比较

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第1期38卷 93-98页

作者：张瑞婷王秋媛尹文娇曹经瑗毕胜利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的对模拟水样中戊型肝炎病毒(HEV)的检测方法进行比较, 为水中HEV的检测提供参考。方法自来水或蒸馏水模拟水样中人工污染HEV粪便悬液, 用正电荷滤膜-有机洗脱液洗脱法(方法1)进行前处理, 比较A、B和C三种核酸提取试剂盒提取效果;对... 详细信息

目的对模拟水样中戊型肝炎病毒(HEV)的检测方法进行比较, 为水中HEV的检测提供参考。方法自来水或蒸馏水模拟水样中人工污染HEV粪便悬液, 用正电荷滤膜-有机洗脱液洗脱法(方法1)进行前处理, 比较A、B和C三种核酸提取试剂盒提取效果;对模拟水样用方法1、方法2(正电荷滤膜-直接裂解法)、方法3(切向流超滤膜-无机洗脱液洗脱法)、方法4(切向流超滤膜-直接裂解法)进行前处理, A试剂盒进行核酸提取, Real time RT-PCR方法检测, 比较回收率;对模拟水样中不同浓度HEV回收率进行比较;比较自来水样中的抑制物对Real time RT-PCR的抑制作用;对不同批次自来水标本的HEV进行检测。结果试剂盒A核酸提取效果更好;方法1、2、3和4的回收率分别为7.31%、39.88%、6.85%和64.88%, 结果显示回收率具有统计学差异(F=114.069, P<0.001)。方法4添加高、中、低浓度HEV的回收率分别为65.26%、42.76%、32.79%。四种前处理方法抑制率均小于75%, 符合ISO(15216-2∶2019)要求。对20份自来水标本进行HEV检测, 结果均为阴性。结论本研究表明两种滤膜分别结合直接裂解法回收效果更好;方法4在小体积蒸馏水或自来水的HEV的检测中回收率较高, 但受水样体积、浊度等限制。对不同的水质及实验室条件可选择合适的方法进行检测。

关键词：戊型肝炎病毒浓缩前处理方法 Real time RT-PCR

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并联检测抗-HCV和HCV-RNA可提高HCV感染检出率

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中华实验和临床病毒学杂志 2017年第2期31卷 131-133页

作者：李乃哲尹文娇尹文娇周文亭黄昌红王锋贾志远张勇毕胜利中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 开封市疾病预防控制中心 475000

目的探讨提高HCV感染检出率的方法.方法利用整群抽样的方法收集河北省某村487份血清样品,使用抗-HCV（ELISA法）及HCV-RNA（荧光定量PCR法）两种检测方法平行检测血清样品,比较两种试验单独使用、并联使用所得结果差异;分析样品HCV-RN... 详细信息

目的探讨提高HCV感染检出率的方法.方法利用整群抽样的方法收集河北省某村487份血清样品,使用抗-HCV（ELISA法）及HCV-RNA（荧光定量PCR法）两种检测方法平行检测血清样品,比较两种试验单独使用、并联使用所得结果差异;分析样品HCV-RNA载量与其抗-HCV测量值s/n值相关性.结果单独使用抗-HCV、HCV-RNA检测法,其检出率分别为22.1%、14.2%,均低于并联使用两种方法的检出率22.8%（x2=4.0000,P=0.0455;x2=42.0000,P〈0.0001）;样品HCV-RNA载量与抗-HCV测量值s/n值呈正相关,随样品中RNA载量升高,抗-HCV测量值s/n值升高（P 〈0.0001）. 结论并联使用抗-HCV与HCV-RNA试验可提高HCV检出率.

关键词：肝炎,丙型聚合酶链反应筛查

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