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新疆野苹果BAG家族成员分离及BAG7基因的功能分析

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南开大学学报（自然科学版） 2022年第6期55卷 1-6页

作者：杨美玲贺丽霞于玮玮阎国荣宋文芹南开大学生命科学学院天津300071 天津农学院园艺园林学院天津300084

为分离新疆野苹果(Malus sieversii (Ledeb.) Rome)BAG家族候选成员以及探究BAG7在逆境胁迫中的生理功能,采用转录组测序及转基因技术对新疆野苹果进行研究.结果显示,新疆野苹果中有7个MsBAG家族成员,其中MsBAG7可以受干旱、低温及DTT... 详细信息

为分离新疆野苹果(Malus sieversii (Ledeb.) Rome)BAG家族候选成员以及探究BAG7在逆境胁迫中的生理功能,采用转录组测序及转基因技术对新疆野苹果进行研究.结果显示,新疆野苹果中有7个MsBAG家族成员,其中MsBAG7可以受干旱、低温及DTT的诱导表达,而且MsBAG7在拟南芥中的过量表达可以改善植物的抗旱、耐寒及抗DTT能力.

关键词：新疆野苹果 BAG MsBAG7 功能分析

细胞质雄性不育花椰菜保持系特异分子标记的鉴定及序列分析

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分子细胞生物学报 2006年第3期39卷 236-242页

作者：王春国李慧宋文芹南开大学生命科学学院天津300071

以花椰菜细胞质雄性不育系NK-6和相应保持系NK-6B为材料进行RAPD分析,筛选了406条RAPD引物,共获得了2160条清晰可辨的条带,平均每个引物产生5-10条。其中引物S2121在两系的扩增中表现出多态性,在保持系中特异扩增出一条934bp的片段。克... 详细信息

以花椰菜细胞质雄性不育系NK-6和相应保持系NK-6B为材料进行RAPD分析,筛选了406条RAPD引物,共获得了2160条清晰可辨的条带,平均每个引物产生5-10条。其中引物S2121在两系的扩增中表现出多态性,在保持系中特异扩增出一条934bp的片段。克隆、测序,根据测序结果设计特异性引物,将RAPD标记转化成特异PCR标记,命名为S2121900。经Southern点杂交分析及对单株和多份候选材料的检测证实该标记为花椰菜保持系所特有,可用于候选保持系的早期筛查。序列分析表明该片段与油菜、拟南芥线粒体上的序列有较高相似性,因此推测该片段亦可能来源于线粒体基因组。本研究为从另一角度解释花椰菜细胞质雄性不育的分子机制提供了新线索。

关键词：花椰菜细胞质雄性不育 PCR标记线粒体

花椰菜遗传图谱的构建及NBS-LRR类抗性同源基因在图谱中的定位

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遗传 2007年第6期29卷 751-757页

作者：古瑜赵前程孙德岭宋文芹南开大学生命科学学院天津科润蔬菜研究所天津300382 天津科润蔬菜研究所

利用AFLP和NBS profiling技术,以花椰菜自交系“AD白花”与高代自交不亲和系“C-8”杂交得到的F1代自交产生的F2代分离群体为材料,构建了第一个花椰菜遗传连锁图谱。该图谱由234个AFLP标记和21个NBS标记构成了9个连锁群,总图距为668.4cM... 详细信息

利用AFLP和NBS profiling技术,以花椰菜自交系“AD白花”与高代自交不亲和系“C-8”杂交得到的F1代自交产生的F2代分离群体为材料,构建了第一个花椰菜遗传连锁图谱。该图谱由234个AFLP标记和21个NBS标记构成了9个连锁群,总图距为668.4cM,标记间平均距离为2.9cM。每个连锁群包含的位点数从12到47个,相邻两标记之间的距离范围是0～14.9cM。NBS标记分布在8个连锁群中,这些标记大部分聚在一起。本研究为今后的基因定位及重要农艺性状的分析提供框架图。此外,研究NBS profiling方法在花椰菜中的稳定性和有效性以及NBS-LRR类RGA在花椰菜基因组中的分布和特点。

关键词：花椰菜 AFLP NBS profiling 遗传连锁图谱

Annexin V-FITC/PI法检测细胞凋亡实验

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生物学杂志 2023年第2期40卷 119-122页

作者：魏远王宏刚陈成彬王春国宋文芹李登文赵立青南开大学生物国家级实验教学示范中心天津300071

课程组面向本科生开设了利用Annexin V-FITC/PI法检测细胞凋亡的实验项目。该实验加入化疗药物依托泊苷(简称VP-16)诱导Jurkat细胞发生凋亡,使用Annexin V-FITC/PI细胞凋亡检测试剂盒检测细胞凋亡情况,在荧光显微镜下拍照计数。实验结... 详细信息

课程组面向本科生开设了利用Annexin V-FITC/PI法检测细胞凋亡的实验项目。该实验加入化疗药物依托泊苷(简称VP-16)诱导Jurkat细胞发生凋亡,使用Annexin V-FITC/PI细胞凋亡检测试剂盒检测细胞凋亡情况,在荧光显微镜下拍照计数。实验结果表明:紫外光激发下,早期凋亡细胞呈现绿色荧光,而晚期凋亡细胞和坏死细胞呈现红色荧光;对细胞计数可知,对照组各时期细胞数符合正常范围,经药物处理后,各时期细胞凋亡率随药物浓度升高而升高,其中早期和晚期凋亡细胞占比最高;在高浓度药物处理后,细胞被大幅度杀伤,仅剩余几个早期凋亡细胞。实验将Annexin V-FITC/PI试剂盒与荧光显微镜结合使用,突破了教学经费、规模和仪器等条件局限,实验成本相对较低,适于大班教学,实验结果直观便捷,能够让学生深入、系统地掌握细胞凋亡的实验原理和检测方法,符合本科生实验项目的综合性高、设计性强和研究性佳的特点,切实提升细胞生物学实验课程的质量和水平。

关键词：细胞凋亡实验教学 Annexin V-FITC/PI检测法荧光显微镜药物诱导

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植物杂种优势及基因组多倍化机制研究概述

林业科学研究 2013年第F10期26卷 96-102页

作者：王春国陈成彬宋文芹南开大学生命科学学院天津300071

在植物进化及物种形成过程中，通过2个亲本的杂交可以使后代表现出速生、高产、高抗逆等优于亲本的性状，形成杂种优势；而通过同源或异源基因组加倍，也可使植物表现出明显优于亲本的生长发育性状或环境适应力，形成多倍体优势。因此... 详细信息

在植物进化及物种形成过程中，通过2个亲本的杂交可以使后代表现出速生、高产、高抗逆等优于亲本的性状，形成杂种优势；而通过同源或异源基因组加倍，也可使植物表现出明显优于亲本的生长发育性状或环境适应力，形成多倍体优势。因此，杂交及基因组多倍化被认为是推动植物进化和物种形成的2个主要驱动力。杂种优势及基因组多倍体优势已在农业生产实践中得到广泛应用，并产生巨大价值。基于此，探究植物杂交优势、基因组多倍体优势具有重大理论意义和应用价值，历来受到研究者的高度关注。目前，这方面的研究特别是有关杂种优势及基因组多倍化分子机制方面的研究已取得若干重大进展，本文旨在对这些研究成果进行概述，并对今后在木本植物中开展相关研究进行展望。

关键词：杂种优势多倍化木本植物

宫颈癌患者血浆和组织中FHIT基因5′端CpG岛甲基化状态的研究

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遗传 2006年第9期28卷 1061-1066页

作者：任晨春苗绪红杨斌赵磊孙蕊宋文芹天津市中心妇产科医院遗传室天津300052 南开大学生命科学院天津300074

为了检测宫颈癌患者血浆和组织中FHIT基因5′端CpG岛甲基化状态,以找到无创伤性诊断宫颈癌的新指标,选取151例宫颈癌患者的血浆和30例患者的宫颈癌组织为研究对象,用MSP的方法检测FHIT基因5′端CpG岛甲基化状态,并对MSP产物进行克隆和... 详细信息

为了检测宫颈癌患者血浆和组织中FHIT基因5′端CpG岛甲基化状态,以找到无创伤性诊断宫颈癌的新指标,选取151例宫颈癌患者的血浆和30例患者的宫颈癌组织为研究对象,用MSP的方法检测FHIT基因5′端CpG岛甲基化状态,并对MSP产物进行克隆和测序。结果在宫颈癌患者血浆和组织中,FHIT基因5′端CpG岛甲基化率为30.46%和53.33%,血浆和组织的总体符合率为80%。而对照中均未检测到甲基化状态。随着患者临床分期和组织学分级的增加,FHIT基因甲基化的检出率也在逐渐的增加。表明宫颈癌患者的血浆和肿瘤组织中FHIT基因5′端CpG岛甲基化的发生是高频事件,使用FHIT基因作为标记可以对宫颈癌患者进行无创伤诊断和预后的评估。

关键词：宫颈癌甲基化状态 FHIT基因血浆组织

玉米B染色体特异RAPD分子标记的染色体定位(英文)

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Acta Botanica Sinica 2002年第4期44卷 499-501页

作者：祁仲夏李秀兰陈成彬宋文芹陈瑞阳南开大学生命科学学院天津300071

B染色体存在于多种动植物中 ,具有很多独特的性状。B染色体与正常染色体在DNA组成方面十分相似 ,寻找B染色体特异序列一直是B染色体研究的难点和热点。通过对含有和不含有B染色体的两种玉米 (ZeamaysL .)基因组进行了RAPD分析 ,筛选到一... 详细信息

B染色体存在于多种动植物中 ,具有很多独特的性状。B染色体与正常染色体在DNA组成方面十分相似 ,寻找B染色体特异序列一直是B染色体研究的难点和热点。通过对含有和不含有B染色体的两种玉米 (ZeamaysL .)基因组进行了RAPD分析 ,筛选到一个B染色体特异性分子标记B480。该标记与玉米的自主复制起始序列ARS1和ARS2同源 ,特别是该序列中的 2 5bp出现在多种模式生物基因组中。FISH的结果显示。

关键词：玉米 B染色体 RAPD 荧光原位杂交 FISH 自主复制起始序列分子标记染色体定位

日本落叶松UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析

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林业科学研究 2013年第F10期26卷 76-81页

作者：王菁李爱王春国宋文芹陈成彬南开大学生命科学学院天津300071

以日本落叶松杂交Solexa转录组测序获得的数据为依据，经拼接后获得尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶（UDPGDH）原序列，以该序列两端设计引物，在落叶松亲代和子代幼嫩针叶中成功克隆了UDPGDH基因cDNA序列，序列长1443bp，编码480个氨基酸。qRT... 详细信息

以日本落叶松杂交Solexa转录组测序获得的数据为依据，经拼接后获得尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶（UDPGDH）原序列，以该序列两端设计引物，在落叶松亲代和子代幼嫩针叶中成功克隆了UDPGDH基因cDNA序列，序列长1443bp，编码480个氨基酸。qRT—PCR结果分析表明：UDPGDH基因的表达量在落叶松杂交子代中远远高于亲本，正交子代的表达比反交子代高，说明UDPGDH在形成细胞壁半纤维素前体物过程中起着非常重要的作用，暗示UDPGDH在子代的高表达有利于杂种优势的形成。

关键词：日本落叶松尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶 cDNA克隆表达分析

花椰菜苯丙氨酸解氨酶基因的克隆及黑腐病菌胁迫下的表达分析

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南开大学学报（自然科学版） 2012年第4期45卷 87-92,98页

作者：江汉民王楠赵换孙德岭宋文芹南开大学生命科学学院天津300071 天津科润蔬菜研究所天津300384

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL,EC 4.***.1.5)是催化苯丙烷类代谢第一步反应的酶,也是苯丙烷途径的关键酶,与植物的抗病性密切相关.利用1对简并引物,从花椰菜中克隆得到PAL基因的cDNA片段,命名为BoPAL,GenBank登录号为H... 详细信息

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL,EC 4.***.1.5)是催化苯丙烷类代谢第一步反应的酶,也是苯丙烷途径的关键酶,与植物的抗病性密切相关.利用1对简并引物,从花椰菜中克隆得到PAL基因的cDNA片段,命名为BoPAL,GenBank登录号为HM623311.BoPAL长2 172 bp,编码723个氨基酸.其推导的氨基酸序列包含PAL-HAL和PAL 2个功能结构域以及酶活性中心序列GTITASGDLVPLSYIA.核苷酸和蛋白质序列多重比较结果表明BoPAL与其它芸薹属植物的PAL基因高度同源.系统进化树分析表明,BoPAL与芸薹属植物的PAL蛋白聚类关系最近.实时荧光定量PCR结果表明,在Xcc胁迫后抗、感病花椰菜接种叶片PAL基因表达均上调,但变化快慢和幅度有所不同,抗性材料PAL基因表达上调要早于感病材料,表达量也明显高于感病材料,说明花椰菜PAL基因的表达与对黑腐病的抗性反应有关.本试验为进一步研究PAL基因在花椰菜抗黑腐病过程中的功能奠定了基础.

关键词：花椰菜苯丙氨酸解氨酶黑腐病实时荧光定量PCR