检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

陕西豌豆种质资源形态性状遗传多样性分析

西北农林科技大学学报（自然科学版） 2014年第10期42卷 70-80页

作者：刘萌娟李鸣雷郭小华王静雅宋卫宁西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100 西北农林科技大学水土保持研究所陕西杨凌712100 连云港市国欣种业有限公司江苏连云港222000

【目的】阐明陕西豌豆种质(含省内及来自省外的资源)的形态特点,揭示其遗传结构、遗传多样性的差异,为陕西豌豆资源的利用和育种提供理论依据。【方法】根据生育期、花色、粒色和粒形的不同选取100份种质,分析陕西豌豆及省外豌豆资源生... 详细信息

【目的】阐明陕西豌豆种质(含省内及来自省外的资源)的形态特点,揭示其遗传结构、遗传多样性的差异,为陕西豌豆资源的利用和育种提供理论依据。【方法】根据生育期、花色、粒色和粒形的不同选取100份种质,分析陕西豌豆及省外豌豆资源生育期、株高、单株荚数、单荚粒数、百粒质量、单株产量、花色、粒形、粒色9个形态性状的分布特点,计算各性状在不同群体中的遗传多样性、遗传距离,并对选取的100份材料进行聚类分析,在主成分分析的基础上绘制品种分布的三维散点图。【结果】陕西豌豆以紫花、麻粒和白粒、圆粒为主,从陕北到陕南皱粒比例增加,粒色类型更加丰富。省外豌豆以白花、白粒、圆粒为主,但皱粒豌豆的比例明显高于陕西豌豆。与陕西豌豆相比,省外资源生育期短,株高低,单株荚数、百粒质量、单株产量高。陕西以及陕南豌豆的平均遗传多样性高于省外群体,省内不同地区间的平均遗传多样性指数以陕南为高,其次是陕北、关中。省外群体的平均遗传距离大于省内群体。省内群体的平均遗传距离以陕南为最大,然后依次是关中、陕北;省内不同群体间的平均遗传距离,以陕南-关中为最大,然后依次是陕南-陕北、关中-陕北。聚类分析将供试100份种质分成2类,第Ⅰ类主要由陕南、省外品种组成,第Ⅱ类主要由关中、陕北组成。聚类和三维散点图结果显示,陕南品种分布最为广泛,其次分别是省外、关中、陕北的品种,不同地区的品种没有形成相对独立的区域,而是相互穿插,界限模糊。【结论】省外资源的农艺性状优于省内资源,是陕西豌豆资源的重要补充。陕西豌豆的遗传多样性以及遗传距离与品种的地理来源相关不明显。

关键词：豌豆种质资源陕西形态标记遗传多样性

65个大麦叶绿体基因组的测序及系统分化分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

65个大麦叶绿体基因组的测序及系统分化分析

第八届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：聂小军崔立操冯克伟宋卫宁西北农林科技大学农学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室

大麦是世界上第四大粮食作物,具有早熟、耐旱、耐盐、耐低温、耐瘠薄等特性。作为新石器时代最早被人类种植的作物之一,大麦的驯化大约发生在一万年前的新月沃土地带。尽管从农艺性状、生理生化及分子群体遗传等角度对大麦的起源和驯化... 详细信息

大麦是世界上第四大粮食作物,具有早熟、耐旱、耐盐、耐低温、耐瘠薄等特性。作为新石器时代最早被人类种植的作物之一,大麦的驯化大约发生在一万年前的新月沃土地带。尽管从农艺性状、生理生化及分子群体遗传等角度对大麦的起源和驯化已开展了较多的研究,但是基于叶绿体全序列从进化基因组(Phylo genomics)角度的大麦起源驯化研究还未见报道。本研究利用高通量测序技术测序、组装获得了65个大麦野生种、农家种及栽培种的叶绿体全基因组序列,共鉴定到232个SNP和115个InDel,且变异主要(SNP:44.75%;InDel:63.95%)分布于基因间隔区,同时还发现了5个栽培品种特异存在的同义突变位点;遗传多样性分析发现野生材料的多样性指数明显高于栽培品种。系统进化、PCA和STRYCTURE分析可将野生大麦和栽培大麦划分为两大类群,而野生大麦又可依据其来源地分为Southern Levant、Northern Levant和Central Asia三大亚群;结合GPS信息,mental-test检验发现野生材料地理位置与遗传距离之间呈显著正相关关系。最后,参照化石年代,通过分子钟检验我们推算出中东和中亚野生大麦的分歧年代大约发生在10万年前。本研究提供了丰富的大麦叶绿体基因组序列资源,为从叶绿体基因组角度揭示野生与栽培大麦的遗传变异、遗传分化和分子进化关系提供了重要的信息。

关键词：大麦叶绿体进化基因组分歧年代分子进化

30份引进大麦品种(系)苗期耐盐性综合分析

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

草业科学 2010年第4期27卷 127-133页

作者：解松峰 Kansaye Aly 杜向红聂小军方桂英杨建涛李康张保军宋卫宁西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100 国家小麦改良中心杨凌分中心陕西杨凌712100 陕西省农业分子生物学重点实验室陕西杨凌712100

在不同浓度NaCl胁迫下,通过光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)、叶绿素(Chl)、丙二醛(MDA)、游离脯氨酸(Pro)、超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的测定,运用主成分分析法和模糊隶属函数法对30份国外引进... 详细信息

在不同浓度NaCl胁迫下,通过光合速率(Pn)、蒸腾速率(Tr)、气孔导度(Gs)、胞间CO2浓度(Ci)、叶绿素(Chl)、丙二醛(MDA)、游离脯氨酸(Pro)、超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化氢酶(CAT)的测定,运用主成分分析法和模糊隶属函数法对30份国外引进的大麦Hordeumvulgare品种(系)耐盐性进行综合分析。结果表明:随着NaCl浓度增大,引进大麦品种(系)除SOD、CAT和Pro外,其他指标与对照相比均有所下降。根据综合评价值可知,其耐盐性由强到弱为:22-25>22-30>DH-116>Tabigha>Modaba>22-55>DH-55>22-28>Tarpgolbor>KoRv>KHEMUS>Steptoe>Harrington>Clipper>Jrbid>Cpyrus>DH-66>Prior>Morex>22-43>TObarley>Barbican>22-42>DH-40>Schooner>DH-127>Kerab>Sloop>Yahudiya>DH-126。

关键词：大麦品种(系) 苗期耐盐性综合评价

紫茎泽兰叶绿体基因RNA编辑位点的鉴定及分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

西北农业学报 2015年第2期24卷 127-133页

作者：吕萌荔王梦醒贾晓鸥邓平川聂小军宋卫宁西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100

RNA编辑是陆生植物叶绿体转录后基因表达调控的一种重要方式。本试验以紫茎泽兰为材料,利用生物信息学预测结合分子克隆及测序方法对其叶绿体的RNA编辑位点进行预测和分析。结果共预测到分布于19个基因的42个编辑位点,所有位点均为C到U... 详细信息

RNA编辑是陆生植物叶绿体转录后基因表达调控的一种重要方式。本试验以紫茎泽兰为材料,利用生物信息学预测结合分子克隆及测序方法对其叶绿体的RNA编辑位点进行预测和分析。结果共预测到分布于19个基因的42个编辑位点,所有位点均为C到U的转换。编辑位点的发生位置分析发现,8个位于密码子第1位,34个位于密码子第2位,而密码子第3位未发现RNA编辑事件。同时,利用RT-PCR方法对其中4个基因的编辑位点进行验证,鉴定发现10个真实发生的编辑位点。进一步分析这10个位点发生编辑后对其编码蛋白质跨膜结构域和二级结构的影响,结果表明,ndhB-467的编辑会引起蛋白质跨膜结构的增加,ndhB-149的编辑会引起蛋白质二级结构的改变。

关键词：紫茎泽兰叶绿体 RNA编辑鉴定分析

小麦穗部病毒诱导基因沉默体系的建立及籽粒大小相关基因TaCYP78A3的功能研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

小麦穗部病毒诱导基因沉默体系的建立及籽粒大小相关基因TaCYP78A...

第六届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：马猛李赵杰宋卫宁赵惠贤西北农林科技大学生命科学学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室西北农林科技大学农学院

尽管籽粒大小相关基因的分离和功能研究对未来小麦分子育种至关重要;但调控小麦籽粒大小的功能基因研究报道鲜有报道,调控小麦籽粒大小的分子机制尚不清楚。本研究以报告基因八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase,PDS)基因为靶标,首... 详细信息

尽管籽粒大小相关基因的分离和功能研究对未来小麦分子育种至关重要;但调控小麦籽粒大小的功能基因研究报道鲜有报道,调控小麦籽粒大小的分子机制尚不清楚。本研究以报告基因八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase,PDS)基因为靶标,首先在小麦穗部建立了基于大麦条斑花叶病毒(Barley stripe mosaic virus,BSMV)诱导的基因沉默(Virus induced gene silencing,VIGS)技术体系;并通过抑制已知功能小麦高分子量麦谷蛋白(HMW-GS)1Bx14基因的表达,证实了该体系可有效应用于小麦穗部基因功能研究。然后,在大粒小麦品种陕512中克隆CYP78A家族功能未知的新成员TaCYP78A3基因,该基因位于小麦第7同源群染色体短臂上,在幼穗和种子发育初期高表达。利用BSMV-VIGS技术沉默TaCYP78A3基因在小麦籽粒中的表达,导致小麦种子大小降低11%和(P<0.01);通过转基因拟南芥过表达靶基因,导致拟南芥种子增大11%-47%(P<0.01)。通过细胞学观察和分子水平检测发现TaCYP78A3主要通过促进胚珠和种子表皮细胞增殖来影响种子大小;其表达水平与胚珠和种子表皮细胞增殖程度呈正相关。本研究结果为小麦及其近缘属穗部功能基因研究提供了一个快速有效的工具;揭示了小麦TaCYP78A3基因表达影响种子大小及其细胞学和分子机制。

关键词：小麦 BSMV-VIGS 籽粒大小 TaCYP78A3 细胞增殖

大麦MAPK cascade基因家族的全基因组鉴定、进化与共表达网络分析

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

大麦MAPK cascade基因家族的全基因组鉴定、进化与共表达网络分析

第八届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：崔立操冯克伟聂小军宋卫宁西北农林科技大学农学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室

丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联途径是由MAPK/MAPKK/MAPK KK/MAPKKKK 4个蛋白磷酸化激酶家族构成的一类保守的信号传递通路,其在植物生长发育、器官形成及逆境响应等过程中发挥着重要作用。本研究利用最新公布的大麦基因组信息,通过生物... 详细信息

丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联途径是由MAPK/MAPKK/MAPK KK/MAPKKKK 4个蛋白磷酸化激酶家族构成的一类保守的信号传递通路,其在植物生长发育、器官形成及逆境响应等过程中发挥着重要作用。本研究利用最新公布的大麦基因组信息,通过生物信息学方法对大麦全基因组MAPK级联通路相关基因进行了鉴定。结果共鉴定到20个HvMAPKs,6个HvMAPKKs,152个HvMAPKKKs和4个HvMAPKKKKs;系统进化分析将所有大麦MAPK基因分成4大类群,各个家族成员聚成一类并且系统进化关系较近的家族成员拥有更相似的蛋白保守结构域组成及内含子/外显子结构;基因复制分析发现大麦MAPK家族共经历了5次片段复制和8次随机串联复制事件,使得其家族成员显著扩张,同时这些复制事件均发生在单子叶与双子叶分歧之后,Ka/Ks分析表明复制的基因受到纯性选择。此外,利用转录组数据对大麦MAPK各家族成员在不同组织和发育时期以及冷、旱、盐、热、创伤、重金属离子等生物非生物胁迫下的表达模式进行了研究,结合启动子顺式原件分析,发现了多个发育或逆境特异表达的候选基因,表明MAPK基因家族在大麦生长发育和逆境胁迫下发挥了重要调控作用。最后,基于可获得的232个大麦转录组数据,利用WGCNAG工具,构建了大麦MAPK级联通路的共表达网络并鉴定到62条可能的MAPK级联通路途径。本研究首次对大麦MAPK基因家族的组成、结构、进化和表达特性进行了鉴定和系统分析,为后续大麦及其他麦类作物MAPK基因的生物学功能及代谢调控网络研究提供了有益信息。

关键词：大麦 MAPK 基因家族进化共表达网络

野生二粒小麦叶绿体基因RNA编辑位点的预测、鉴定与分析

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

麦类作物学报 2015年第12期35卷 1609-1616页

作者：刘思妍冯克伟卞建新王萌杨智凯聂小军宋卫宁西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100

RNA编辑是高等植物叶绿体基因转录后表达调控的一种重要方式。为了解野生二粒小麦叶绿体基因RNA编辑的组成及其与其他麦类作物的异同,通过生物信息学预测结合RT-PCR的方法,对野生二粒小麦叶绿体基因的RNA编辑位点进行了预测和鉴定。生... 详细信息

RNA编辑是高等植物叶绿体基因转录后表达调控的一种重要方式。为了解野生二粒小麦叶绿体基因RNA编辑的组成及其与其他麦类作物的异同,通过生物信息学预测结合RT-PCR的方法,对野生二粒小麦叶绿体基因的RNA编辑位点进行了预测和鉴定。生物信息学预测共发现了分布于15个基因上的35个编辑位点,均为C到U的转换,其中ndhB基因包含的编辑位点数量最多,达9个;在此基础上,随机选取5个基因对其编辑位点进行了测序验证,结果共鉴定了18个C→U的编辑位点;进一步对编辑后编码蛋白的二级结构和跨膜结构域进行了预测,发现编辑后所有基因均发生了二级结构的改变,但只有ndhB基因的跨膜结构域发生了改变;最后,将确定的野生二粒小麦叶绿体基因RNA编辑位点与7个禾本科物种的RNA编辑位点进行比较,共发现17个编辑位点在这些种间具有保守性,相比于其他物种,野生二粒小麦与普通小麦和粗山羊草具有更相似的编辑位点组成。

关键词：野生二粒小麦叶绿体 RNA编辑 RT-PCR

大麦基因表达水平与基因家族扩张间的效应分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

大麦基因表达水平与基因家族扩张间的效应分析

第八届全国小麦基因组学及分子育种大会

作者：冯克伟崔立操聂小军宋卫宁西北农林科技大学农学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室

探究物种间表型差异的分子机制有着重要的生物学意义,而表型的功能性分化往往源自基因表达的改变。本研究以最新公布的大麦参考序列为基础,在全基因组水平探究了基因的表达水平、密码子偏性、序列分歧率、氨基酸组成、内含子/外显子结... 详细信息

探究物种间表型差异的分子机制有着重要的生物学意义,而表型的功能性分化往往源自基因表达的改变。本研究以最新公布的大麦参考序列为基础,在全基因组水平探究了基因的表达水平、密码子偏性、序列分歧率、氨基酸组成、内含子/外显子结构以及基因家族大小之间的相互关系。结果表明基因表达与序列进化速率和密码子偏性指数呈显著相关,表明大麦蛋白编码基因的翻译效率受自然选择效应;同时,基因表达水平、序列进化速率以及密码子偏性与基因家族的大小呈显著相关,与单拷贝基因家族相比,多拷贝基因家族倾向于低丰度的表达水平,较低的密码子偏性以及较高的进化速率。多拷贝基因家族的基因表达组织特异性指数显著低于单拷贝基因家族。此外,近期扩张的家族基因,其表达水平较高和组织特异表达差异程度均较大,表明大麦的多成员基因家族为快速适应环境胁迫而急剧扩张。该研究表明基因表达和自然选择在大麦蛋白质编码基因的进化中发挥重要作用,这为进一步研究探究麦类乃至所有植物中基因家族的演变奠定了基础。

关键词：大麦基因家族分子进化

普通小麦及其近缘种NCED基因的克隆及表达分析

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

西北农业学报 2010年第6期19卷 55-59页

作者：李康聂小军方桂英王乐岳华佘奎军宋卫宁西北农林科技大学农学院陕西杨凌712100 陕西省农业分子生物学重点实验室陕西杨凌712100

利用已知的大麦NCED基因(dbj|BAF02837.1)保守区域设计引物,在野生一粒小麦、硬粒小麦、野生二粒小麦、普通小麦和粗山羊草中分别扩增出长度为782、782、782、7837、83 bp的目的片断,生物信息学分析结果表明,均含有一个开放阅读框,编码... 详细信息

利用已知的大麦NCED基因(dbj|BAF02837.1)保守区域设计引物,在野生一粒小麦、硬粒小麦、野生二粒小麦、普通小麦和粗山羊草中分别扩增出长度为782、782、782、7837、83 bp的目的片断,生物信息学分析结果表明,均含有一个开放阅读框,编码242个氨基酸残基组成的蛋白,具有典型的9-顺式-新黄素加双氧酶蛋白的结构域。同源性比对结果表明,普通小麦与大麦的NCED序列具有高度同源性(97%);普通小麦及其近缘种在该区内NCED基因片段的同源性在95%以上。半定量RT-PCR表达分析表明,NCED基因参与了普通小麦及其近缘种对非生物胁迫高渗、高盐的应答反应,但在不同物种或胁迫处理下的表达模式不同,其中粗山羊草和普通小麦在高渗和高盐胁迫下分别表现出了较快的应答反应。

关键词：普通小麦 9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧合酶基因克隆序列比较表达分析