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生存资料的二次研究系列之六:多元Meta分析模型在重复测量结局Meta分析中的应用

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中国循证心血管医学杂志 2016年第6期8卷 647-651页

作者：孟详喻田国祥周新雨孙竹李胜曾宪涛武汉大学中南医院循证与转化医学中心武汉430071 武汉大学循证与转化医学中心武汉430071 陆军总医院干四科北京100700 重庆医科大学第一附属医院神经内科重庆400016 陆军总医院心血管病研究所北京100700

目的重复测量资料是医学研究尤其是预后相关研究中重要的资料类型之一。不同时间点重复测量值之间存在相关性,若在二次研究如Meta分析中分开分析的结果可能存在偏倚,采用多元Meta分析模型能够有效避免因分开分析而导致的偏倚。本文介绍... 详细信息

目的重复测量资料是医学研究尤其是预后相关研究中重要的资料类型之一。不同时间点重复测量值之间存在相关性,若在二次研究如Meta分析中分开分析的结果可能存在偏倚,采用多元Meta分析模型能够有效避免因分开分析而导致的偏倚。本文介绍使用多元Meta分析模型合并多个二分类重复测量结局的方法,并通过实例分析演示如何在R软件中实现。

关键词：多元Meta分析模型重复测量结局 Meta分析预后

使用GEO数据集分析驱动蛋白KIF2C在膀胱癌中的表达及临床意义

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转化医学杂志 2019年第1期8卷 15-18页

作者：冯雨嘉蒋佳志晏鑫郭梓鑫李胜孟详喻陈松武汉大学中南医院/武汉大学第二临床学院湖北武汉430071 武汉大学中南医院生物样本库湖北武汉430071 武汉大学中南医院泌尿外科湖北武汉430071

目的通过基因表达汇编公共数据库,探讨驱动蛋白家族成员2C(kinesin family member 2C,KIF2C)在膀胱癌患者中的表达,探索其表达与临床病理特征的联系,评价KIF2C对膀胱癌术后患者预后评估的意义。方法检索并下载美国国立生物技术信息中心... 详细信息

目的通过基因表达汇编公共数据库,探讨驱动蛋白家族成员2C(kinesin family member 2C,KIF2C)在膀胱癌患者中的表达,探索其表达与临床病理特征的联系,评价KIF2C对膀胱癌术后患者预后评估的意义。方法检索并下载美国国立生物技术信息中心的肿瘤公共数据集,对表达谱资料和临床信息进行分析,利用基因集富集分析受KIF2C调控的相关基因集。结果 KIF2C在膀胱癌组织中的表达水平高于其在正常膀胱组织中的表达(P<0.000 1)。膀胱癌患者疾病进展、T分期、N分期和肿瘤分级,KIF2C的高、低表达组之间均有显著性差异(P<0. 05)。KIF2C高表达患者的肿瘤特异性生存期及总生存期显著低于低表达患者(P<0. 05)。KIF2C高表达样本富集了与核糖体蛋白质、多梳蛋白、内源性核糖核酸酶、E2F转录因子、抑癌基因RB有关的基因集。结论 KIF2C与膀胱癌的多个病理指标相关,有作为判断膀胱癌患者预后的标志物和治疗肿瘤的靶标的潜力。

关键词：膀胱癌驱动蛋白家族成员2C 病理预后

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平滑肌肉瘤的最新研究进展

中华临床医师杂志（电子版） 2013年第24期7卷 334-337页

作者：何莉孟详喻李凯莉刘小平刘尚勤马梓武汉大学中南医院血液科 430071 武汉大学中南医院中医科 430071

平滑肌肉瘤(LMS)是起源于平滑肌细胞的间质性恶性肿瘤。发病机制仍不清楚。不同类型的LMS存在染色体核型异常。在LMS可观察到RB1和PTEN表达异常可激活细胞周期和PI3K/AKT信号通路。手术完全切除是治愈本病的惟一方法,不能手术切除的转移... 详细信息

平滑肌肉瘤(LMS)是起源于平滑肌细胞的间质性恶性肿瘤。发病机制仍不清楚。不同类型的LMS存在染色体核型异常。在LMS可观察到RB1和PTEN表达异常可激活细胞周期和PI3K/AKT信号通路。手术完全切除是治愈本病的惟一方法,不能手术切除的转移性LMS无法治愈。全身性化疗始终是姑息治疗。LMS对联合应用吉西他滨和多西他赛治疗敏感,目前成为本病的标准治疗方案。采用曲贝化疗对在LMS有效,可以使疾病长期稳定。帕唑帕尼是最近批准用于治疗LMS的一种口服多激酶抑制剂。对不同类型的LMS,目前迫切需要进一步了解其生物学特性、提高诊断水平及开发有效和毒性低的治疗药物。

关键词：平滑肌肉瘤药物疗法靶向治疗预后

生存资料的二次研究系列之一:应用R软件实现生存曲线中数据提取与生存曲线的合并

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中国循证心血管医学杂志 2016年第1期8卷 2-6页

作者：孟详喻靳英辉程小柯张永刚曹越曾宪涛武汉大学中南医院循证与转化医学中心武汉430071 天津中医药大学护理学院循证护理中心天津300193 河南大学淮河医院循证医学中心开封475000 四川大学华西医院期刊社成都610041

涉及生存资料的Meta分析最常用的方法是对两组比较的风险比(hazard ratio,HR)进行合并,其数据基础是原始研究的HR及其95%可信区间(95%CI)。然而,原始研究中HR及其95%CI未报道或不完整报道的情况并不少见,这限制了基于HR的Meta分析的开... 详细信息

涉及生存资料的Meta分析最常用的方法是对两组比较的风险比(hazard ratio,HR)进行合并,其数据基础是原始研究的HR及其95%可信区间(95%CI)。然而,原始研究中HR及其95%CI未报道或不完整报道的情况并不少见,这限制了基于HR的Meta分析的开展。绝大多数涉及生存结局的原始研究均提供了生存曲线,通过对生存曲线进行合并能对人群的生存结局进行全面评估。本文介绍利用R软件实现生存曲线数据提取并对其进行合并以生成汇总生存曲线的方法。

关键词：生存资料生存曲线 R软件

TAGLN基因对膀胱癌患者的临床意义:基于GEO数据集的分析

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现代泌尿外科杂志 2017年第11期22卷 818-822页

作者：尹晓红刘小平罗先武孟详喻曾宪涛王行环武汉大学中南医院循证与转化医学中心.武汉大学循证与转化医学中心湖北武汉430071 武汉大学健康学院护理学系湖北武汉430071 武汉大学中南医院泌尿外科湖北武汉430071

目的探讨TAGLN基因在膀胱癌患者中的表达情况及与临床病理特征的关系,评价其对膀胱癌患者临床预后的影响。方法检索并下载GEO膀胱癌基因表达数据集,分析膀胱癌患者基因表达谱数据及临床信息,明确TAGLN基因对膀胱癌患者预后的影响,并通... 详细信息

目的探讨TAGLN基因在膀胱癌患者中的表达情况及与临床病理特征的关系,评价其对膀胱癌患者临床预后的影响。方法检索并下载GEO膀胱癌基因表达数据集,分析膀胱癌患者基因表达谱数据及临床信息,明确TAGLN基因对膀胱癌患者预后的影响,并通过基因富集分析方法进一步探讨TAGLN基因对膀胱癌细胞的具体作用机制。结果膀胱癌患者中TAGLN低表达组膀胱癌患者在肿瘤侵袭程度及T、N、M分期方面明显优于TAGLN高表达组膀胱癌患者(P=0.001,P=0.002,P=0.009,P=0.05);而在年龄、肿瘤恶性等级和肿瘤是否进展的分布方面无明显差异;TAGLN低表达组患者的肿瘤特异性生存期(P<0.000 1)和总生存期(P<0.000 1)亦均优于TAGLN高表达组的患者,提示低表达组患者预后更佳。TAGLN基因高表达组的膀胱癌样本主要富集在Notch信号通路、TGF-β信号通路、上皮-间质转换、缺氧、炎性应答、TNF-αNF-κB信号通路等多种生物学过程。这些通路主要与肿瘤血管细胞生成和肿瘤细胞分化、侵袭和转移相关。结论 TAGLN基因与膀胱癌多个病理指标相关,可以作为潜在的诊疗膀胱癌患者预后的标志物和治疗肿瘤的靶标。

关键词： TAGLN基因膀胱癌临床预后 GSEA分析 GEO数据库

基于加权基因共表达网络的膀胱尿路上皮癌预后及疗效相关基因筛选

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转化医学杂志 2020年第6期9卷 340-344页

作者：李佳丽曾梓航刘嘉彬张冉李硕孟详喻李胜李伟武汉大学第二临床学院湖北武汉430071 武汉大学中南医院泌尿外科湖北省人类遗传资源保藏中心湖北天门市第一人民医院肿瘤科湖北天门431700

目的构建加权基因共表达网络分析(weighed gene co-expression network analysis,WGCNA),鉴定出膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)中与预后及治疗效果相关的基因,并分析其在肿瘤相关通路中的活性。方法在癌症基因组图... 详细信息

目的构建加权基因共表达网络分析(weighed gene co-expression network analysis,WGCNA),鉴定出膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)中与预后及治疗效果相关的基因,并分析其在肿瘤相关通路中的活性。方法在癌症基因组图谱数据库获取膀胱尿路上皮癌的转录组测序及相应临床数据;选择年龄、性别、身高、体重、人种、生存时间、吸烟年数、治疗效果、病理分级、TNM分期及淋巴结浸润为临床表型进行加权基因共表达网络分析;利用R语言进行生存分析;利用GSCALite工具进行肿瘤相关的通路活性分析;利用基因表达汇编数据库中的GSE13507和GSE3167数据集进行验证。结果本研究鉴定出与预后及治疗效果均显著相关的基因模块及模块关键基因GPHN、CPSF2、PRMT5、EIF2S1、KLC1、SLC39A9、SRP54及CNIH,上述8个基因在肿瘤相关通路中有一定活性。结论GPHN、CPSF2、PRMT5、EIF2S1、KLC1、SLC39A9、SRP54及CNIH基因在BLCA中与预后及治疗效果均显著相关,并且参与了肿瘤相关通路,可能成为BLCA的生物标志物或潜在治疗靶点。

关键词：膀胱尿路上皮癌生物信息学加权基因共表达网络生物标志物

应用病友交流会对老年多发性骨髓瘤患者行延续护理的效果

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护理管理杂志 2018年第9期18卷 670-673页

作者：李洁莉刘尚勤阮晓岚熊亚芬刘小平孟详喻李胜武汉大学中南医院血液内科武汉市430071 武汉大学人民医院血液内科武汉市430000 武汉大学循证与转化医学中心武汉市430071 武汉大学中南医院生物样本库武汉市430071

目的探讨应用病友交流会对老年多发性骨髓瘤患者进行延续护理后患者的遵医行为和疗效变化。方法选取2014年1月至2016年12月老年多发性骨髓瘤患者100例作为研究对象,根据患者是否参与病友交流会分成观察组与对照组,每组各50例。对照组给... 详细信息

目的探讨应用病友交流会对老年多发性骨髓瘤患者进行延续护理后患者的遵医行为和疗效变化。方法选取2014年1月至2016年12月老年多发性骨髓瘤患者100例作为研究对象,根据患者是否参与病友交流会分成观察组与对照组,每组各50例。对照组给予患者常规的疾病护理和出院指导,观察组在此基础上每月按时参加病友交流会,进行认知、饮食、行为干预和病友交流,连续3个月及以上。结果观察组患者的总遵医率、治疗有效率、满意度均高于对照组(P<0.01或P<0.05)。结论在老年多发性骨髓瘤患者中应用病友交流会延续护理模式能够有效提高患者的遵医行为、治疗效果及患者满意度。

关键词：病友交流会延续护理遵医行为多发性骨髓瘤

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临床病例讨论课在CPPT课程中的应用评价

中华医学教育探索杂志 2021年第1期20卷 58-62页

作者：左娜周珍雷红叶燕青孟详喻周芙玲陈志桥蔡红兵何莉武汉大学中南医院妇瘤科 430071 武汉大学中南医院/武汉大学第二临床学院教学办公室 430071 武汉大学中南医院循证与转化医学中心 430071 武汉大学中南医院血液内科 430071

目的探索和优化以临床病理病生治疗学(clinical pathophysiology and therapy,CPPT)为基础的临床病例讨论课的教学内容,提高该课程的教学质量。方法自编带教教师评价表,对2016至2017学年参加该课程的全体学生进行调查,评价教学满意度及... 详细信息

目的探索和优化以临床病理病生治疗学(clinical pathophysiology and therapy,CPPT)为基础的临床病例讨论课的教学内容,提高该课程的教学质量。方法自编带教教师评价表,对2016至2017学年参加该课程的全体学生进行调查,评价教学满意度及教学特点。比较不同学制的学生或针对不同年资的教师评价结果的差异,分析评价结果与教师资历的相关性。结果学生对目前该课程整体有较高的评价,但不同学制的学生对启发思维、鼓励发言、引导提问、关注进程和有效反馈等方面的评价,以及掌握程度的自评差异具有统计学意义。针对不同资历的教师,除发言鼓励以外的各方面得分均存在统计学差异,但掌握程度差异无明显统计学意义。Spearman分析显示,得分与教师资历存在一定的相关性。结论CPPT病例讨论课整体情况值得肯定,但还需要在许多方面继续改进。

关键词：临床病理病生治疗学病例讨论课教学评价分析

桥蛋白基因对膀胱尿路上皮癌预后评估的意义及功能研究

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临床内科杂志 2019年第1期36卷 19-22页

作者：曾梓航李佳丽刘嘉彬李硕张冉孟详喻李胜杜雪晴武汉大学中南医院武汉大学第二临床学院 430071 武汉大学中南医院泌尿外科武汉大学中南医院生物样本库湖北省人类遗传资源保藏中心

目的通过生物信息学方法对桥蛋白基因(GPHN)进行功能探讨,分析其药物敏感性,并通过生存分析判断其在膀胱尿路上皮癌(BLCA)预后评估中的意义.方法在TCGA数据库获取BLCA的mRNA测序(mRNA-seq)及相应临床数据;利用R语言Survival程序包对G... 详细信息

目的通过生物信息学方法对桥蛋白基因(GPHN)进行功能探讨,分析其药物敏感性,并通过生存分析判断其在膀胱尿路上皮癌(BLCA)预后评估中的意义.方法在TCGA数据库获取BLCA的mRNA测序(mRNA-seq)及相应临床数据;利用R语言Survival程序包对GPHN表达运用Kaplan-Meier法及Cox回归进行生存分析;联合基因表达文库数据库(GEO)多数据集对不同GPHN表达的BLCA患者进行Meta分析;对GPHN差异表达基因(DEGs)进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;利用GSCALite工具获取基因与药物敏感的相关性信息.结果生存分析显示GPHN表达对BLCA患者生存有显著影响(Kaplan-Meier法HR=1.735,P=0.004;Cox回归HR=1.002,P=0.002);富集出有关GO的生物功能条目172个,KEGG通路1条,均与肿瘤相关;GPHN对TGX221、AZD6482、XMD8-85、Salubrinal、Cyclopamine、A-770041药物敏感.结论 GPHN与BLCA的预后显著相关,其在BLCA中具有重要功能,可能作为其预后判断的生物标记物.

关键词：膀胱尿路上皮癌生物信息学 TCGA GEO GPHN 富集分析