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鮸鱼转铁蛋白基因的克隆及进化分析

鮸鱼转铁蛋白基因的克隆及进化分析

作者：孙悦燕浙江海洋学院

学位级别：硕士

鱼类是兼具特异性免疫和非特异性免疫的低等脊椎动物。相比哺乳动物来说，鱼类的特异性免疫机制并不是特别完善，水生生物中存在品种数目众多和大量的致病性微生物以及强大的生存压力，使得鱼类的免疫系统在面临病原微生物的入侵过程中... 详细信息

鱼类是兼具特异性免疫和非特异性免疫的低等脊椎动物。相比哺乳动物来说，鱼类的特异性免疫机制并不是特别完善，水生生物中存在品种数目众多和大量的致病性微生物以及强大的生存压力，使得鱼类的免疫系统在面临病原微生物的入侵过程中，非特异性免疫系统在抵御外源微生物中发挥相当重要的作用。转铁蛋白(Transferrin，TF)是一种非血红素结合的β-球蛋白，它具有两个铁离子(Fe)结合位点，可以结合两个铁离子(Fe)。转铁蛋白功能广泛,不仅在运输机体内铁离子以及铁在体内的代谢起重要作用，而且还在细胞呼吸、细胞生长和增殖中也扮演重要角色。另外它还具有抗菌杀菌的功能，参与机体的先天性免疫功能。在这项研究中，鉴定和分离出鮸鱼的TF基因(MIMI-TF)。鮸鱼转铁蛋白cDNA全长2070bp，编码689个氨基酸。鮸鱼的TF基因全长为6757bp，基因结构由17个外显子和16个内含子组成，此结构与其他多种脊椎动物的TF基因结构相似，揭示了鮸鱼的TF基因在结构上的保守性。鮸鱼转铁蛋白基因编码的蛋白质N-端存在由18个氨基酸残基编码的信号肽。鮸鱼转铁蛋白基因与其他物种转铁蛋白基因的同源性为45.7%-94%。系统发生树结果显示鮸鱼的转铁蛋白基因与大黄鱼转铁蛋白基因的亲缘关系最近。另外荧光定量PCR结果显示，在健康的鮸鱼肝脏、肠、肾脏、脾脏、心脏、肌肉、鳃、鳍条，眼和脑这10种组织中，鮸鱼转铁蛋白基因在肝脏中的表达量最高,在肌肉、眼睛和脾脏的表达量次之,在鳍条和心脏中有痕量表达。鮸鱼经过人工感染鳗弧菌后的荧光定量结果显示，在感染初期，TF基因在其肝脏、脾脏组织中的表达量均有上调的趋势，随后表达量有一定程度的下降，并在一定范围内波动。在肾脏组织中，感染初期未发生明显变化，在感染中期时，表达量明显上调。对鮸鱼转铁蛋白进行了进化枝-模型(branch-site model)和位点-模型(sitemodel)的分子进化分析。其中，对进化枝模型的分析可知，在本研究中所有脊椎动物祖先进化枝和哺乳类动物的祖先进化枝中，分别检测到了45和3个正选择作用位点，而在硬骨鱼类的祖先进化枝中则没有检测到正选择作用位点。在对位点模型的分析可知，在所有硬骨鱼类的转铁蛋白基因中，总共发现了9个正选择位点，而在哺乳动物的转铁蛋白基因中，却未检测到正选择位点，由此可能推断哺乳类和鱼类的转铁蛋白基因在适应自然环境的过程中有不同的进化模式，哺乳类转铁蛋白基因在进化过程中经历着纯化选择，而鱼类转铁蛋白基因在进化过程中则经历着正选择作用，这可能与鱼类的生存环境有关，在水生环境中强大的生存压力下带来的自然选择的影响，由此我们推测鱼类的转铁蛋白基因在其适应水生环境的过程中发挥着重要作用。我们的结果可用于进一步研究TF的功能和防御机制。

关键词：鮸鱼转铁蛋白基因表达模式分子进化

干旱胁迫下华北落叶松幼苗接种木霉的生理变化

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应用生态学报 2021年第3期32卷 853-859页

作者：孙悦燕王秀丽高润梅李进山西农业大学林学院山西晋中030801

水分匮缺显著影响林木更新,根际接种木霉可减缓林木所受干旱胁迫的影响。本研究通过人工控水试验,分析了根际接种木霉对干旱条件下(轻度、中度和重度干旱,培养基质相对含水量分别为50%~60%、35%~50%、20%~35%)华北落叶松幼苗针叶抗氧化... 详细信息

水分匮缺显著影响林木更新,根际接种木霉可减缓林木所受干旱胁迫的影响。本研究通过人工控水试验,分析了根际接种木霉对干旱条件下(轻度、中度和重度干旱,培养基质相对含水量分别为50%~60%、35%~50%、20%~35%)华北落叶松幼苗针叶抗氧化系统和渗透物质的生理影响。结果表明:随着干旱胁迫加剧,幼苗针叶的超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性显著增强,丙二醛和脯氨酸含量持续上升,可溶性蛋白质和淀粉含量呈现下降的趋势。接种木霉后,干旱胁迫下幼苗针叶的SOD和POD活性增幅更大,丙二醛含量上升幅度减小。中度干旱条件下,接菌苗的POD活性是未接菌苗的1.8倍,丙二醛含量是未接菌苗的62.9%。接菌后,干旱胁迫下幼苗针叶的脯氨酸、可溶性蛋白质、可溶性糖和淀粉含量均高于未接菌幼苗。根际接种木霉后,受干旱胁迫的华北落叶松幼苗的抗氧化系统和渗透物质调节能力增强,幼苗对干旱胁迫的耐受性增强。在华北地区气候日趋暖干化的趋势下,可将根际接种木霉技术推广用于华北落叶松人工造林或林下抚育。

关键词：华北落叶松木霉干旱生理变化

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山西省南方红豆杉自然分布与群落生态学特征

应用生态学报 2016年第6期27卷 1820-1828页

作者：高润梅石晓东樊兰英孙悦燕郭孝红山西农业大学林学院山西太谷030801 山西省林业科学研究院太原030012

南方红豆杉为国家Ⅰ级重点保护植物,山西省东南部为其自然分布最北界.本文调查了南方红豆杉在山西省的野生分布,对其进行了群落划分、物种多样性、结构特征和竞争特性的研究.结果表明：山西省南方红豆杉主要形成南方红豆杉＋鹅耳枥群落... 详细信息

南方红豆杉为国家Ⅰ级重点保护植物,山西省东南部为其自然分布最北界.本文调查了南方红豆杉在山西省的野生分布,对其进行了群落划分、物种多样性、结构特征和竞争特性的研究.结果表明：山西省南方红豆杉主要形成南方红豆杉＋鹅耳枥群落、南方红豆杉-荆条群落、南方红豆杉-海州常山群落和南方红豆杉＋栓皮栎群落,集中分布于陵川县磨河和阳城县蟒河自然保护区,其他地区均为散生;群落垂直结构明显,南方红豆杉已进入主林层,混交林林冠层高8-10 m,纯林高5-6 m;群落间的总体物种多样性指数和均匀度指数存在显著差异.南方红豆杉植株矮小,平均高5.16 m,乔木层、演替层分别占43.4%和56.6%,更新层缺乏;胸径〈16 cm的个体占67.6%,胸径32-40 cm的个体占4.0%,幼苗稀少,仅发现4株幼苗;大量的小径级个体虽可保证南方红豆杉在一定时间内维持稳定的种群结构,但幼苗缺失必将引起未来种群的衰退.山西省野生南方红豆杉分布相对集中,多数是小径级个体,导致其种内竞争激烈,种内竞争强度占61.8%;鹅耳枥和栓皮栎是研究地区的主要组成树种,对南方红豆杉造成的种间竞争压力最大.

关键词：南方红豆杉物种多样性群落结构更新竞争

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招远市海水养殖虹鳟鱼血液学的初步研究

中文科技期刊数据库（全文版）自然科学 2021年第11期 69-71页

作者：孙悦燕招远市海洋与渔业发展服务中心山东烟台265400

本文测定了虹鳟鱼在目前我市渔业饲养管理环境中,血液学各项的指标:包括红血球细胞数量,红血球比容、血红蛋白、红血球细胞直径、血糖、血清总蛋白质含量,胆固酵、尿素氮和谷丙转氨酶的正常值及其各项指标变异的情况,为其诊断鱼病的原... 详细信息

本文测定了虹鳟鱼在目前我市渔业饲养管理环境中,血液学各项的指标:包括红血球细胞数量,红血球比容、血红蛋白、红血球细胞直径、血糖、血清总蛋白质含量,胆固酵、尿素氮和谷丙转氨酶的正常值及其各项指标变异的情况,为其诊断鱼病的原因提供了依据。

关键词：虹鳟鱼血液海水养殖

招远市五大水库叶绿素a及生态因子的垂直分布特征研究

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中文科技期刊数据库（全文版）自然科学 2021年第10期 91-93页

作者：孙悦燕招远市海洋与渔业发展服务中心山东烟台265400

在所有水库富营养化的影响因素中,叶绿素a是的一项重要的影响因素,于是我于2021年夏季、秋季对招远市的五个中型水库—城子水库、勾山水库、金岭水库、侯家水库、龙王水库的PH值、溶氧度、透明度以及叶绿素浓度及其相关性进行了分析。... 详细信息

在所有水库富营养化的影响因素中,叶绿素a是的一项重要的影响因素,于是我于2021年夏季、秋季对招远市的五个中型水库—城子水库、勾山水库、金岭水库、侯家水库、龙王水库的PH值、溶氧度、透明度以及叶绿素浓度及其相关性进行了分析。城子水库于1958年8月建成并投入使用。初建时它的作用主要是防洪,其次是灌溉,最后才是是发电和水产养殖等。随着社会经济的不断发展,目前水库已在原有功能的基础上发展成为集城市工业与生活供水、水利旅游等综合利用的水利工程,作为饮用水,必须要为了解决水源的富营养化问题而采取有效的措施。

关键词：叶绿素a浓度 PH值含氧度透明度

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当前水产养殖技术推广面临的问题及解决对策

中文科技期刊数据库（全文版）自然科学 2021年第12期 9-10页

作者：孙悦燕招远市海洋与渔业发展服务中心山东烟台265400

水产养殖技术推广是水产养殖技术发展趋势全过程中不可缺少的关键组成部分。对我国水产养殖领域的发展趋势具有深远的影响。通过对水产养殖技术营销和推广,可以合理提高我国水产养殖养殖户的整体素质和水平,推动我国水产养殖领域的发展... 详细信息

水产养殖技术推广是水产养殖技术发展趋势全过程中不可缺少的关键组成部分。对我国水产养殖领域的发展趋势具有深远的影响。通过对水产养殖技术营销和推广,可以合理提高我国水产养殖养殖户的整体素质和水平,推动我国水产养殖领域的发展趋势和发展。对水产养殖推广应用中遇到的问题进行简要分析,然后从四个层面探讨水产养殖推广应用中遇到的问题的处理和预防措施,期待提高帮助全市水产养殖养殖现状水产养殖推广应用提供基础理论。

关键词：水产养殖推广应用遇到困难处理和预防措施

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林隙与森林更新研究进展

山西林业科技 2010年第4期39卷 31-34页

作者：孙悦燕郭芳芳刘宁山西农业大学林学院山西太谷030801

森林更新是生态系统动态中森林资源再生产的一个自然的生物学过程,是一个重要的生态学过程,关于林下更新的研究大多从林隙更新开始。笔者从林隙的大小、环境因子、空间格局等三个方面总结了林隙更新中的主要影响因素,为今后森林更新的... 详细信息

森林更新是生态系统动态中森林资源再生产的一个自然的生物学过程,是一个重要的生态学过程,关于林下更新的研究大多从林隙更新开始。笔者从林隙的大小、环境因子、空间格局等三个方面总结了林隙更新中的主要影响因素,为今后森林更新的研究奠定了基础并指明了方向。

关键词：森林更新林隙环境因子空间格局

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文峪河中游主要森林类型水文效应比较研究

山西农业大学学报（自然科学版） 2010年第4期30卷 340-345页

作者：郭跃东孙悦燕郭晋平山西农业大学林学院山西太谷030801

通过对山西文峪河中游三道川林场油松天然林、油松封育林、山杨天然林、白桦天然林、灌木林、华北落叶松人工林等6种主要森林类型枯落物层和土壤层的野外调查与室内实验,比较分析了6种林分的枯落物层和土壤层水文效应,并就6类水源涵养... 详细信息

通过对山西文峪河中游三道川林场油松天然林、油松封育林、山杨天然林、白桦天然林、灌木林、华北落叶松人工林等6种主要森林类型枯落物层和土壤层的野外调查与室内实验,比较分析了6种林分的枯落物层和土壤层水文效应,并就6类水源涵养林水文效应影响因素进行了分析。研究表明:(1)针叶林枯落物层持水能力较阔叶林和灌木林强,人工林枯落物层持水能力较天然林强;(2)各林分土壤最大持水量从大到小的顺序为:华北落叶松人工林>灌木林>山杨天然林>白桦天然林>油松天然林>油松封山育林;(3)白桦和山杨天然林土壤持水特性指标在各层之间差异表现显著,而其他林分各土壤层之间并没有表现出较大的差异;(4)6种林分类型枯落物及土壤的水文效应表现为:华北落叶松人工林最大,其次为灌木林,山杨天然林,白桦天然林和油松天然林,而油松封山育林最小。(5)处于不同演替时期的林分枯落物层和土壤层具有不同的水文效应不同,营造演替中期的混交林群落将有助于提高林分的水文效应。

关键词：水源涵养林枯落物土壤最大持水量演替

生态学专业野外课程综合实习管理模式探讨——以山西农业大学为例

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安徽农学通报 2016年第1期22卷 100-104页

作者：孙悦燕韩有志郭跃东白晋华杨三红山西农业大学林学院山西太谷030801

野外课程综合实习是高等农林院校生态学专业本科学习的必修环节,是培养创新性理论联系实际的综合性应用型人才的重要途径。该文以山西农业大学林学院生态学专业2012年专业综合实习为例,主要从实习安排、组织、准备、管理及存在的问题与... 详细信息

野外课程综合实习是高等农林院校生态学专业本科学习的必修环节,是培养创新性理论联系实际的综合性应用型人才的重要途径。该文以山西农业大学林学院生态学专业2012年专业综合实习为例,主要从实习安排、组织、准备、管理及存在的问题与解决措施等方面进行探讨,为完善该专业野外课程综合实习提供理论指导。

关键词：生态学专业野外课程综合实习管理模式