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MinerVa——一种用于实体瘤微小残留病灶检测的高性能检测算法

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生物医学工程学杂志 2023年第2期40卷 313-319页

作者：杨飘张亚晰夏粱梅建东范锐黄宇刘伦旭陈维之无锡臻和生物科技有限公司江苏无锡214000 四川大学华西医院胸外科成都610041

如何提高循环肿瘤DNA(ctDNA)信号的获取能力以及判定低频信号的真实性是肿瘤微小残留病灶(MRD)检测的难点问题。本研究开发了多变异联合置信概率分析的MRD生物信息学算法(MinerVa),并在ctDNA标准品和早期非小细胞肺癌患者血浆DNA样本中... 详细信息

如何提高循环肿瘤DNA(ctDNA)信号的获取能力以及判定低频信号的真实性是肿瘤微小残留病灶(MRD)检测的难点问题。本研究开发了多变异联合置信概率分析的MRD生物信息学算法(MinerVa),并在ctDNA标准品和早期非小细胞肺癌患者血浆DNA样本中对算法效能进行评估。结果显示,MinerVa算法对多变异共追踪的特异性稳定在99.62%~99.70%,当追踪30个变异时,可检测低至6.3×10^(-5)变异丰度的变异信号;进一步对27例非小细胞肺癌患者的数据进行分析,ctDNA-MRD动态监测复发的特异性为100%,灵敏度为78.6%。数据表明MinerVa算法可高效地捕获血液ctDNA信号,在MRD检测中具有较好的准确性。

关键词：循环肿瘤DNA 微小残留病灶多变异联合置信概率分析技术噪音基线单碱基分辨率

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白细胞介素17与肺癌关系的研究进展

中国胸心血管外科临床杂志 2013年第2期20卷 204-208页

作者：夏粱刘伦旭四川大学华西医院胸外科成都610041

白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)是一种主要由CD4+辅助T细胞(helper T cell,Th)分泌的促炎性细胞因子,广泛参与机体的炎症反应和自身免疫性疾病。另外,IL-17在恶性肿瘤中也发挥重要作用。目前的研究发现IL-17能够促进肺癌的生长和转... 详细信息

白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)是一种主要由CD4+辅助T细胞(helper T cell,Th)分泌的促炎性细胞因子,广泛参与机体的炎症反应和自身免疫性疾病。另外,IL-17在恶性肿瘤中也发挥重要作用。目前的研究发现IL-17能够促进肺癌的生长和转移,IL-17高表达提示预后不良。这些研究为探明肺癌的病理机制提供了新的思路,也为寻找更多评估肺癌预后的指标和肺癌治疗的靶点提供了新的方向。

关键词：白细胞介素17 炎症恶性肿瘤肺癌

单侧胸腔镜手术切除跨双侧胸腔巨大哑铃状心包囊肿一例

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中华胸部外科电子杂志 2016年第2期3卷 127-128页

作者：夏粱梅建东刘伦旭四川大学华西医院胸外科成都610041 中国西部肺癌早期诊断与综合治疗协同创新中心

患者女性,49岁,因“心悸10年,剑突下疼痛8个月”入院,不伴有发热、咳嗽、呼吸困难、吞咽困难、体重减轻等症状。患者各项血液检查指标未见异常,超声心动图提示心包周围巨大无回声区。胸部增强CT显示心包周围巨大的哑铃状囊性占位（图1）... 详细信息

患者女性,49岁,因“心悸10年,剑突下疼痛8个月”入院,不伴有发热、咳嗽、呼吸困难、吞咽困难、体重减轻等症状。患者各项血液检查指标未见异常,超声心动图提示心包周围巨大无回声区。胸部增强CT显示心包周围巨大的哑铃状囊性占位（图1）,左右两部分大小分别约7cm×6cm×4cm和10cm×9cm×4cm。

关键词：胸腔镜手术心包囊肿双侧胸腔哑铃状电视辅助胸腔镜超声心动图呼吸困难吞咽困难囊性占位腋中线

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平菇水稻轮作技术

食用菌 1990年第3期 27-27页

作者：陆应果陶庄杨兴让夏承粱陆世鹏安徽寿县农业技术推广中心安徽寿县星火食用菌研究所

为了充分利用农业生产下脚料,解决我省部分城效地区传统的一稻一麦相互争肥的矛盾,提高农业生产的经济效益,我们在1985—1986年平菇水稻轮作试验取得较好效果的基础上,1987年10月—1989年5月先后在寿县、淮南和长丰等地区,在15.4亩稻茬... 详细信息

为了充分利用农业生产下脚料,解决我省部分城效地区传统的一稻一麦相互争肥的矛盾,提高农业生产的经济效益,我们在1985—1986年平菇水稻轮作试验取得较好效果的基础上,1987年10月—1989年5月先后在寿县、淮南和长丰等地区,在15.4亩稻茬地上进行了示范推广,实播平菇3088平方米,投料为46320公斤,产鲜菇52943.8公斤,生物学效率达114.3%,其经济效益较传统水稻与小麦轮作提高10—20倍,现将其技术介绍如下:(一)培养料的配制。原料可用新鲜、干燥无霉变和无虫的废棉花或棉籽壳、稻草等,使用前曝晒2—3

关键词：平菇水稻畦床棉籽壳

MQLserve：基于量化的多任务大语言模型服务系统

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计算机学报 2025年

作者：符芳诚夏义扉崔斌北京大学计算机学院

随着大语言模型（LLMs）的不断发展，针对各种各样下游任务进行微调并部署的需求也与日俱增，以LoRA为代表的高效微调技术和以GPTQ、AWQ为代表的模型量化技术发挥着至关重要的作用。然而，尽管这些技术在单任务场景下已经有了众多成熟... 详细信息

随着大语言模型（LLMs）的不断发展，针对各种各样下游任务进行微调并部署的需求也与日俱增，以LoRA为代表的高效微调技术和以GPTQ、AWQ为代表的模型量化技术发挥着至关重要的作用。然而，尽管这些技术在单任务场景下已经有了众多成熟应用，但在多任务场景却鲜有研究。具体来说，由于主流的量化方法会导致基座大模型无法在任务之间共享，现有多任务服务系统难以结合量化进行部署，限制了其在资源受限场景下的可用性。此外，现有多任务服务系统缺乏灵活的动态任务实时添加能力和针对多任务场景的调度算法支持，往往导致其系统的低吞吐、高延迟、低响应时间和极差的灵活性。本文针对现有LLM服务系统在多任务场景下的不足，创新地提出了一个多LoRA任务服务系统MQLserve。一方面，本系统设计了一种灵活高效的动态多任务量化算法，支持多任务的模型联合量化，赋能多任务场景下量化模型的共享，显著降低了模型部署的显存需求；同时支持实时的动态任务添加，提升了线上服务的稳定性和灵活性。另一方面，本系统针对多任务场景，提出了一种新型的基于输出长度预测和聚类的调度算法，有效地解决了传统调度算法在多任务场景下存在的高昂显存开销和频繁显存切换等问题，提升了系统性能。实验结果表明，与现有多任务服务系统相比，MQLserve在不同负载场景下，吞吐提高了7.5%-58.1%，延迟降低了9.6%-43.3%，平均响应时间缩短了84.2%，平均SLO满足率提高了330%。

关键词：多LoRA任务服务系统 LoRA 量化多任务调度

黄瓜CsCuAO家族基因鉴定及其在不定根形成中的作用研究

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园艺学报 2025年

作者：温正阳孙靖博张梦夏张锋董春娟中国农业科学院蔬菜花卉研究所蔬菜生物育种全国重点实验室

利用生物信息方法从黄瓜（Cucumis sativus L.）基因组中克隆到7个铜胺氧化酶（copper amine oxidase，CuAO）基因，其编码蛋白的氨基酸长度在652 ～ 710 aa之间，等电点介于5.41 ～ 8.31之间，系统进化树分析将其分为3个亚族。采用CuA... 详细信息

利用生物信息方法从黄瓜（Cucumis sativus L.）基因组中克隆到7个铜胺氧化酶（copper amine oxidase，CuAO）基因，其编码蛋白的氨基酸长度在652 ～ 710 aa之间，等电点介于5.41 ～ 8.31之间，系统进化树分析将其分为3个亚族。采用CuAO底物腐胺处理后，黄瓜下胚轴不定根数量增加，而CuAO特异抑制剂氨基胍处理后，不定根数量显著减少；将CuAO的催化产物H2O2与氨基胍复配处理可有效消除氨基胍的抑制效应。qRT-PCR分析发现CsCuAOβ和CsCuAOζ在不定根形成的早期（24 h）高表达，CsCuAOγ1在不定根形成的后期（72 ～ 120 h）高表达；进一步分析不同外源生长调节剂和H2O2信号对CsCuAOβ、CsCuAOζ和CsCuAOγ1的表达调控，发现生长素（IAA）抑制CsCuAOβ和CsCuAOζ的表达，而乙烯合成前体氨基环丙烷羧酸（ACC）促进二者的表达，IAA和ACC对CsCuAOγ1的表达无显著影响，H2O2对三者的表达均有不同程度的诱导作用。将CsCuAOβ、CsCuAOζ、CsCuAOγ1在黄瓜子叶中瞬时表达，发现3个基因均可使子叶中CuAO活性升高，H2O2积累量增加，CsCuAOβ过量表达可促进子叶柄部位不定根形成，而CsCuAOγ1和CsCuAOζ过量表达对不定根形成无显著影响。试验结果表明，黄瓜CsCuAOβ响应乙烯信号，通过产生H2O2信号促进黄瓜不定根形成。

关键词：黄瓜铜胺氧化酶不定根过氧化氢基因鉴定

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川西北生态源地识别与生态网络构建

昆明理工大学学报(自然科学版) 2025年

作者：夏山林骆训杨显华于慧罗勇成都理工大学四川省国土整治中心四川省地质大数据中心中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所

近年来我国城镇化加速推进，生态用地不断被占用，生态区域割裂现象日趋严重，阿坝州是我国青藏高原生态屏障的重要区域，有若尔盖大草原、红原草原、若尔盖生态湿地等重要保护区。识别区域内生态源地分布，构建生态网络，对阿坝州建设... 详细信息

近年来我国城镇化加速推进，生态用地不断被占用，生态区域割裂现象日趋严重，阿坝州是我国青藏高原生态屏障的重要区域，有若尔盖大草原、红原草原、若尔盖生态湿地等重要保护区。识别区域内生态源地分布，构建生态网络，对阿坝州建设生态屏障、保护核心生态区具有重要意义。本次研究结合“形态学空间格局分析方法（MSPA）”和“生态服务与生态敏感评价”两种方式识别阿坝州生态源地，并比较了两者的差异；结合MCR模型，利用高程、坡度、道路、河流、植被覆盖度、土地利用六个因子构建综合阻力面，识别阿坝州生态廊道与生态断裂点；最后利用整体连通性指数（IIC）和可能连通性指数（PC）对生态源地、生态廊道进行分级，旨在打通生态廊道，减少物种迁移的阻碍，维护生物多样性。

关键词：阿坝州 MSPA 生态服务生态廊道连通性

基于质量源于设计理念优化葡萄籽低聚原花青素制备工艺及体外抗氧化活性分析

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南方农业学报 2025年

作者：宋旭超夏梓铭李敏陈立田瑛王林广东药科大学药学院军事科学院军事医学研究院

【目的】突破葡萄籽低聚原花青素（GS-OPC）制备的关键技术，建立科学、完善的质量控制体系，并进一步评价其抗氧化活性。【方法】引入质量源于设计（QbD）理念，通过风险因素分析、单因素试验以及试验设计的综合运用获得制备工艺的操... 详细信息

【目的】突破葡萄籽低聚原花青素（GS-OPC）制备的关键技术，建立科学、完善的质量控制体系，并进一步评价其抗氧化活性。【方法】引入质量源于设计（QbD）理念，通过风险因素分析、单因素试验以及试验设计的综合运用获得制备工艺的操作空间。通过1，1-二苯基-2-三硝基苯肼（DPPH）法、铁离子还原抗氧化能力（FRAP）法、2，2-联氮-二(3-乙基-苯并噻唑-6-磺酸)二铵盐（ABTS）法以及过氧化氢、Erastin和谷氨酸诱导的PC12细胞氧化应激损伤试验，考察GS-OPC的抗氧化活性。【结果】GS-OPC的制备工艺涉及乙醇提取、树脂富集和乙酸乙酯萃取3个步骤，建立的乙醇提取工艺操作空间为提取次数2次，乙醇浓度64%～81%，提取温度30～36 ℃；树脂富集工艺操作空间为上样量6:1（mL/g），乙醇浓度60%～80%，洗脱体积3.5～4 BV；目标产品GS-OPC中原花青素含量高达109.15%，低聚原花青素含量为92.05%；相较于葡萄籽提取物（GSE）和葡萄籽原花青素富集物（GSF），GS-OPC显示出最优异的抗氧化能力，其DPPH自由基清除能力、FRAP总抗氧能力和ABTS自由基清除能力分别为404.8、543.5和617.6 mg/g；GS-OPC还可通过调节活性氧（ROS）和脂质过氧化物（LPO）水平，有效地保护细胞免受过氧化氢、Erastin和谷氨酸引起的氧化应激损伤，在100 μg/mL剂量下，细胞存活率分别为89.03%、83.01%和92.85%，较模型组分别提高34.55%、47.70%和31.08%。【结论】本研究以QbD理念科学指导了GS-OPC的开发，获得的终产品具有制备可及、质量可控、活性优良的特征。

关键词：葡萄籽低聚原花青素质量源于设计制备工艺操作空间抗氧化

基于Wnt信号通路探讨烙灸对脊髓损伤大鼠结构及功能的影响

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辽宁中医药大学学报 2025年

作者：王英夏铂宁夏医科大学

目的基于Wnt信号通路探讨烙灸对脊髓损伤大鼠结构及功能影响。方法采用Allen’s法制备脊髓损伤大鼠模型，将110只SD大鼠随机分为5组：假手术组、模型组、Wnt抑制剂组、烙灸组、烙灸联合Wnt抑制剂组。其中50只SD大鼠进行改良Tarlov运... 详细信息

目的基于Wnt信号通路探讨烙灸对脊髓损伤大鼠结构及功能影响。方法采用Allen’s法制备脊髓损伤大鼠模型，将110只SD大鼠随机分为5组：假手术组、模型组、Wnt抑制剂组、烙灸组、烙灸联合Wnt抑制剂组。其中50只SD大鼠进行改良Tarlov运动功能评分、皮层体感诱发电位CSEP检测；从剩余60只SD大鼠中取脊髓损伤组织样本，尼氏染色来观察脊髓损伤后的病理学变化、电镜下观察损伤脊髓的组织结构的变化并进行Kaptanoglu脊髓超微结构评分、采用免疫荧光染色法检测各组大鼠损伤脊髓中的内源性神经干细胞标记物—神经丝巢蛋白（Nestin）和神经元分化相关标志物—神经元特异性烯醇化酶（NSE）的表达情况。结果 Tarlov运动功能评分、CSEP检测、尼氏染色、电镜观察、Kaptanoglu脊髓超微结构评分、免疫荧光法检测均表明：烙灸组、烙灸联合Wnt抑制剂组治疗效果优于模型组和Wnt抑制剂组，且烙灸组治疗效果最显著（P＜0.05）。结论证实烙灸激活脊髓损伤大鼠的Wnt信号通路，促进脊髓损伤区周围神经干细胞向神经元增殖分化，对脊髓损伤大鼠的结构及功能的恢复具有促进作用。

关键词：烙灸 Wnt信号通路脊髓损伤大鼠结构及功能机制研究