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基于线粒体细胞色素b基因的黑鳍鳈(Sarcocheilichthys nigripinnis)生物地理学过程分析

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Zoological Research 2013年第5期34卷 437-445页

作者：刘思情唐琼英李小娟刘焕章中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室湖北武汉430072 中国科学院大学北京100049

黑鳍鲸（Sarcocheilichthys nigripinnis）为广泛分布于东亚地区的小型淡水鱼类，是生物地理学研究的良好材料。该研究以线粒体细胞色素b（Cytb）基因序列为分子标记，对中国8个水系20个采样点的黑鳍鲸共142尾个体进行遗传变异及生物地... 详细信息

黑鳍鲸（Sarcocheilichthys nigripinnis）为广泛分布于东亚地区的小型淡水鱼类，是生物地理学研究的良好材料。该研究以线粒体细胞色素b（Cytb）基因序列为分子标记，对中国8个水系20个采样点的黑鳍鲸共142尾个体进行遗传变异及生物地理学过程分析。遗传多样性分析结果表明，142条Cytb基因序列共检测出56个单倍型，总体单倍型多样性较高（h=0．971），而核苷酸多样性较低（a=0．0212），平均遗传距离较小（2．2％）。分子系统发育树结果表明，黑鳍鲸种群分为7个谱系，以秦岭为界可分为南、北两大支系，北方支系分化时间较早（谱系I）而南方支系分化程度较高（谱系II～VII）。该研究结果进一步揭示了克氏鲸（sczerskii）的物种形成过程，估算其祖先在较晚近时期（～1．03Ma）由黄河水系的黑鳍鲸分化而来。谱系生物地理学分析显示，黑鳍鲸的各地理种群表现为由北向南逐渐演化的趋势，地理隔离可能是限制该物种扩散和基因交流的主要原因。分子钟分析显示，分化时间发生于0．95～3．92Ma。种群历史动态结果则推测黑鳍鲸经历过种群扩张，且该过程可能与更新世冰期与间冰期的更迭相关。

关键词：系统谱系生物地理学黑鳍鳈细胞色素b基因更新世冰期地理隔离

刺鲃基于线粒体细胞色素b基因的生物地理学过程

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水生生物学报 2003年第4期27卷 352-356页

作者：唐琼英杨秀平刘焕章中国科学院水生生物研究所武汉430072 华中农业大学水产学院武汉430070

以中华倒刺Spinibarbussinensis为外类群 ,研究了不同地理种群刺Spinibarbuscaldwelli细胞色素b基因序列 (114 0bp)变异 ,以探讨其生物地理学过程。结果表明 :长江下游水系与珠江水系种群的变异值为 1 2 %— 2 3% ,与闽江水系的为 ... 详细信息

以中华倒刺Spinibarbussinensis为外类群 ,研究了不同地理种群刺Spinibarbuscaldwelli细胞色素b基因序列 (114 0bp)变异 ,以探讨其生物地理学过程。结果表明 :长江下游水系与珠江水系种群的变异值为 1 2 %— 2 3% ,与闽江水系的为 2 7%— 3 7% ,与九龙江水系的为 3 1%— 4 2 % ,这些值都远远低于它们与中华倒刺的变异值(13 2 %— 14 6 % )。遗传变异值表明了刺的生物地理学过程 ,首先是东南沿海的水系同内地的水系发生隔离 ,然后珠江水系同长江水系隔离 ,这些变化均发生在第四纪。

关键词：刺鲤细胞色素b 生物地理学过程鲤形目线粒体

斑纹薄鳅(Leptobotia zebra)应该为斑纹沙鳅(Sinibotia zebra)

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Zoological Research 2008年第1期29卷 1-9页

作者：唐琼英俞丹刘焕章中国科学院水生生物研究所湖北武汉430072

斑纹薄鳅(Leptobotia zebra)最初是由Wu(1939)描述的一个新种,当时定名为斑纹沙鳅(Botia zebra),后来Chen(1980)根据眼下刺不分叉将其改归为薄鳅属的物种。本研究通过对线粒体DNA细胞色素b基因序列的测定和分析,发现斑纹薄鳅和薄鳅属(... 详细信息

斑纹薄鳅(Leptobotia zebra)最初是由Wu(1939)描述的一个新种,当时定名为斑纹沙鳅(Botia zebra),后来Chen(1980)根据眼下刺不分叉将其改归为薄鳅属的物种。本研究通过对线粒体DNA细胞色素b基因序列的测定和分析,发现斑纹薄鳅和薄鳅属(除斑纹薄鳅)物种间的平均遗传距离为0.177,和中华沙鳅属物种美丽沙鳅(Sinibotia pulcher)的平均遗传距离仅为0.057。系统发育分析发现斑纹薄鳅并未和薄鳅属的物种聚在一起,而是和中华沙鳅属物种美丽沙鳅聚在一起形成姐妹群。进一步对斑纹薄鳅进行形态学特征检视,发现该物种具有颊部裸露无鳞、颏部具一对纽状突起等中华沙鳅属鱼类的特征,但又具有眼下刺简单不分叉的薄鳅属鱼类的特征。结合分子数据分析的结果,将斑纹薄鳅订正为中华沙鳅属的物种,其命名为斑纹沙鳅(Sinibotia zebra)。另外,对沙鳅科鱼类属的划分标准及形态特征的演化也进行了讨论。

关键词：沙鳅科薄鳅属斑纹薄鳅细胞色素b基因特征演化

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犁头鳅属鱼类物种地理分化过程

Zoological Research 2010年第3期31卷 230-238页

作者：唐琼英俞丹杨金权刘焕章中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室湖北武汉430072 上海海洋大学鱼类研究室上海201306

犁头鳅属为中国的特有属,包括犁头鳅和长鳍犁头鳅两个物种。犁头鳅广泛分布于长江中上游,而长鳍犁头鳅则局限分布于闽江水系。该研究对采自长江中上游的犁头鳅20个个体和闽江水系的长鳍犁头鳅8个个体的线粒体细胞色素b(cytb)基因序列进... 详细信息

犁头鳅属为中国的特有属,包括犁头鳅和长鳍犁头鳅两个物种。犁头鳅广泛分布于长江中上游,而长鳍犁头鳅则局限分布于闽江水系。该研究对采自长江中上游的犁头鳅20个个体和闽江水系的长鳍犁头鳅8个个体的线粒体细胞色素b(cytb)基因序列进行分析,以期对犁头鳅属鱼类的物种地理分化过程进行研究。结果显示,犁头鳅不同单倍型之间的遗传变异水平为0.1%～1.8%,平均为0.7%;长鳍犁头鳅各单倍型之间的遗传变异水平为0.6%～1.3%,平均为0.7%;犁头鳅和长鳍犁头鳅单倍型之间的遗传差异也较小,仅为0.2%～1.8%,平均为0.9%。采用邻接(NJ)法和贝叶斯(BI)法构建的分子系统发育树都一致显示,该研究中的犁头鳅属鱼类构成一个单系;所有长鳍犁头鳅样本构成一个单系,位于系统发育树的顶部位置;犁头鳅的样本不构成单系,而是形成并系。从形态上看,犁头鳅和长鳍犁头鳅均为有效种。由此推测,在第四纪冰期,长江中下游的犁头鳅沿东海大陆架向南扩散到东南沿海水系,长鳍犁头鳅可能是犁头鳅的一个种群扩散到闽江水系后,由于适应新的环境条件而分化成的一个新物种,剩下的长江流域的犁头鳅种群则构成一个并系类群。该文对于类似的地理物种形成方式也进行了讨论。

关键词：犁头鳅属物种地理分化东海大陆架长江水系闽江水系

赤水河两种荷马条鳅属鱼类的遗传多样性及谱系生物地理学过程分析

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水生生物学报 2017年第2期41卷 356-362页

作者：王雪唐琼英刘飞刘焕章中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室中国科学院大学

研究以线粒体Cyt b基因为分子标记,对赤水河两种荷马条鳅属(Homatula)鱼类(红尾荷马条鳅和短体荷马条鳅)的遗传多样性及种群结构进行了分析;同时,结合了对在长江上游其他几个水系分布的同种鱼类进行比较,分析其生物地理学过程。遗传多... 详细信息

研究以线粒体Cyt b基因为分子标记,对赤水河两种荷马条鳅属(Homatula)鱼类(红尾荷马条鳅和短体荷马条鳅)的遗传多样性及种群结构进行了分析;同时,结合了对在长江上游其他几个水系分布的同种鱼类进行比较,分析其生物地理学过程。遗传多样性分析结果表明,5个水系135尾红尾荷马条鳅Cyt b基因序列共检测出42个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.936和0.00493;其中,赤水河种群的分别为0.891和0.00208。3个水系52尾短体荷马条鳅Cyt b基因序列共检测出12个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别0.821和0.01105;赤水河种群的分别为0.646和0.00390。基于ML和BI法构建的单倍型分子系统发育树结果表明,两物种各自构成单系,且得到较强支持。红尾荷马条鳅各种群地理格局分布明显,赤水河种群为并系类群位于分支基部。在短体荷马条鳅支系中,岷江与沱江两个水系的个体相互聚类在一起,而赤水河群体聚成一个分支。赤水河与其他水系不存在共享单倍型,表现了明显的隔离和差异性的地理分布格局。由于这些水系之间地理位置相距较远,推测这种格局的形成不是地质运动造成的水系隔离,而是历史时期水位的高低变化造成鱼类种群的扩散和隔离。错配分析支持赤水河两物种种群扩张的推断,但中性检验却并非全部支持,显示种群历史相对复杂。

关键词：赤水河荷马条鳅属 Cyt b 遗传多样性谱系生物地理学种群历史

细菌鞭毛蛋白与Toll样受体5的互作关系研究进展

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动物营养学报 2020年第9期32卷 3979-3985页

作者：高权新邢钱钱唐琼英杨国梁湖州师范学院浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室中国水产科学研究院水生动物繁育与营养重点实验室湖州中心医院湖州313000

鞭毛蛋白是细菌鞭毛的主成分,亦是Toll样受体5(TLR5)的特异性配体,在动物宿主识别肠道细菌的过程中发挥着重要的作用。迄今为止,有关鞭毛蛋白与TLR5互作关系的研究涉及医学、营养学、生物学和免疫学等领域,并且已经成为各学科的研究热... 详细信息

鞭毛蛋白是细菌鞭毛的主成分,亦是Toll样受体5(TLR5)的特异性配体,在动物宿主识别肠道细菌的过程中发挥着重要的作用。迄今为止,有关鞭毛蛋白与TLR5互作关系的研究涉及医学、营养学、生物学和免疫学等领域,并且已经成为各学科的研究热点。本文主要就鞭毛蛋白的功能结构、菌体运动中的作用、免疫特性及其与肠道健康的关系、黏膜表皮细胞的免疫特征和药物研发展开了较为详细的综述,旨在为鞭毛蛋白与TLR5的功能研究与机理探索提供参考信息。

关键词：鞭毛蛋白 TLR5 肠道菌群功能结构疫苗

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探索基于“专业模块化”的钳工实训教学体系

职业技术 2012年第5期 86-87页

作者：唐琼英四川信息职业技术学院

按传统的教学方法传授的钳工知识已经不再适应企业需求,钳工实训课没能起到很好服务于专业、服务于行业的作用,我院根据高职教育的使命探索出基于"专业模块化"钳工实训教学体系,文中详细介绍了整个体系的设计和规划实施过程。

关键词：钳工实训专业模块化教学体系

基于ND4和ND5基因序列分析的鳅超科鱼类系统发育关系

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Zoological Research 2010年第3期31卷 221-229页

作者：刘思情张家波唐琼英刘焕章华中农业大学湖北武汉430070 中国科学院水生生物研究所湖北武汉430072

ND4和ND5是线粒体基因组中编码NADH脱氢酶亚基4和亚基5的两个蛋白质编码基因。该研究以鳅超科鱼类为研究对象,新测定了10个物种的ND4和ND5基因全序列以及中间的3个tRNA基因共212bp的序列,结合从GenBank下载的15个物种的15条序列进行序... 详细信息

ND4和ND5是线粒体基因组中编码NADH脱氢酶亚基4和亚基5的两个蛋白质编码基因。该研究以鳅超科鱼类为研究对象,新测定了10个物种的ND4和ND5基因全序列以及中间的3个tRNA基因共212bp的序列,结合从GenBank下载的15个物种的15条序列进行序列比较和系统发育关系分析。结果显示:鳅超科鱼类ND4基因全长1380～1387bp,以ATG为起始密码子,终止密码子为不完全终止信号;ND5基因全长1821～1839bp,同样起始密码子为ATG,终止密码子为TAA或TAG;ND4和ND5基因之间插入了3个tRNA基因,分别编码携带组氨酸、丝氨酸、亮氨酸的tRNA。ND4和ND5基因(包含3个tRNA基因)中A、T、G、C的平均含量分别为30.4%、27.3%、14.2%、28.1%,A+T(57.7%)的含量高于G+C(42.3%)的含量。转换与颠换比(Ti/Tv)平均值为1.586。选取斑马鱼和鲤鱼作为外类群,采用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)进行系统发育树的重建。三种方法的系统发育分析结果都显示:花鳅亚科、条鳅亚科、沙鳅亚科、平鳍鳅科及Vaillantellidae分别构成单系;它们的系统发育关系为:(Vaillantellidae+(沙鳅亚科+(花鳅亚科+(条鳅亚科+平鳍鳅科)。这与线粒体全基因组和某些核基因(如RAG1基因)的研究结果类似,且支持率较高,表明ND4和ND5基因用于鳅超科鱼类的系统发育分析是可行的;但是该研究的结果有别于其他线粒体基因的分析结果,如基于cytb和D-loop基因进行的系统发育分析表明,条鳅亚科和花鳅亚科聚为姐妹群,再和平鳍鳅科聚在一起。这种差异可能是由于使用的基因长度差异造成的,长度越长,信息量越大,所反映的系统发育结果可能更加接近真实情况。

关键词：鳅超科 ND4/ND5基因序列分析系统发育

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互锁型矩形软波导组合式压缩模设计

模具制造 2015年第8期15卷 60-63页

作者：唐琼英四川信息职业技术学院四川广元628040

软波导压胶是软波导制造工艺中关键,为软波导压胶的模具结构就尤为重要,为了减少浪费,将其结构设计为组合式,可以满足不同长度的该类波导的压胶,文中详细介绍了此种模具的结构设计。

关键词：互锁型软波导组合式压缩模设计