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老鹰茶主要基源植物的基因组大小及特征分析

植物遗传资源学报 2022年第4期23卷 1166-1174页

作者：哈登龙石冠红刘争熊彪河南鸡公山国家自然保护区管理局信阳464099 贵州大学茶学院贵阳550025

老鹰茶是一种重要的民族特色类茶饮品和保健茶,在我国民间有着较长的饮用历史。用于制作老鹰茶的基源植物主要为5种樟科植物(毛豹皮樟、狭叶润楠、川黔润楠、红果黄肉楠和香叶子),其遗传学与分子生物学等方面的基础研究十分缺乏,导致老... 详细信息

老鹰茶是一种重要的民族特色类茶饮品和保健茶,在我国民间有着较长的饮用历史。用于制作老鹰茶的基源植物主要为5种樟科植物(毛豹皮樟、狭叶润楠、川黔润楠、红果黄肉楠和香叶子),其遗传学与分子生物学等方面的基础研究十分缺乏,导致老鹰茶树种质资源发掘与利用等工作支撑理论薄弱,制约了产业发展。本研究首次利用流式细胞术和K-mer频数分析2种方法对5种老鹰茶树的基因组大小及基本特征进行了分析。流式细胞术以番茄(929 Mb)和水稻(430 Mb)为对照标品;K-mer频数分析基于5个物种基因组DNA的Illumina测序数据(深度50×以上)进行。主要研究结果如下:(1)通过流式细胞术测定的毛豹皮樟基因组大小约为1150.56 Mb,狭叶润楠约为999.83 Mb,川黔润楠约为1471.99 Mb,红果黄肉楠约为1123.42 Mb,香叶子约为1350.06 Mb;(2)K-mer频数分析估测毛豹皮樟基因组大小为1025.91 Mb,杂合率为1.29%,重复率为49.98%;狭叶润楠基因组大小为1024.79 Mb,杂合率为1.41%,重复率为42.51%;川黔润楠基因组大小为1234.90 Mb,杂合率为1.23%,重复率为50.86%;红果黄肉楠基因组大小为1014.27 Mb,杂合率为1.32%,重复率为41.82%;香叶子基因组大小为1258.00 Mb,杂合率为0.74%,重复率为54.89%;(3)毛豹皮樟、狭叶润楠、川黔润楠和红果黄肉楠4种老鹰茶树属于高杂合基因组,香叶子属于微杂合基因组,而这5个物种的基因组重复度都属于中等。本研究的结果为后续的老鹰茶树单个物种基因组测序策略或泛基因组研究计划等工作提供了可参考的基础数据。

关键词：老鹰茶树基因组调查流式细胞术 K-mer分析

基于三维激光点云与断面轮廓曲线的树干材积计算

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林业科学 2019年第11期55卷 63-72页

作者：尤磊哈登龙谢明坤张晓鹏宋新宇庞勇唐守正信阳师范学院计算机与信息技术学院信阳464000 中国科学院自动化研究所模式识别国家重点实验室北京100190 信阳师范学院河南省教育大数据分析与应用重点实验室信阳464000 河南鸡公山国家级自然保护区管理局信阳464133 信阳师范学院数学与统计学院信阳464000 中国林业科学研究院资源信息研究所北京100091

【目的】利用地面三维激光扫描仪获取的单木树干点云,提出一种基于断面轮廓曲线的树干材积计算方法,为准确测定单木树干材积提供参考。【方法】首先,将树干点云按设定高度thick划分为若干等高垂直分段,对于一个垂直分段,将其树干点云投... 详细信息

【目的】利用地面三维激光扫描仪获取的单木树干点云,提出一种基于断面轮廓曲线的树干材积计算方法,为准确测定单木树干材积提供参考。【方法】首先,将树干点云按设定高度thick划分为若干等高垂直分段,对于一个垂直分段,将其树干点云投影至下断面得到一个平面点集,以该点集凸包点形成闭合凸多边形的质心为中心点,以角度参数θ对该平面点集角度分区,一个角度分区中所有点的重心点为该角度分区的轮廓点,根据角度分区在上下垂直分段上的相邻性和连续性修复无轮廓点的角度分区;然后,以当前垂直分段所有角度分区的轮廓点为插值点,构建一条闭合连续光滑的三次B样条曲线(称之为垂直分段的断面轮廓曲线),该曲线所围面积为断面积,断面积与高度thick之积为垂直分段体积,所有垂直分段体积累加得到树干材积。分别以可准确计算体积的圆柱体、圆台体和抛物线体的模拟点云与地面三维激光扫描仪获取的来自7个树种183个长度为1 m的树干点云为实测数据,开展模拟试验和实测试验。【结果】模拟试验结果表明,对于圆台体和抛物线体的体积计算,断面轮廓曲线法在合适的thick与θ参数下计算精度高于拟合圆、拟合圆柱体和Bézier凸曲线法的计算精度。实测试验结果表明,与断面轮廓曲线法计算的材积(thick=2 cm,θ=2°)相比,拟合圆、拟合圆柱体和Bézier凸曲线法计算材积的平均绝对百分比误差(MAPE)分别为0.64%、433.65 cm^3和0.54%,均方根误差(RMSE)分别为0.63%、429.06 cm^3和0.53%,总相对误差(TRE)分别为11.88%、3361.36 cm^3和9.51%。【结论】断面轮廓曲线法计算的树干断面积和材积最为精确,传统以横断面是圆为理论计算的树干断面积和材积均大于其真值。

关键词：三维激光扫描技术树干材积树干断面断面面积轮廓曲线

荧光显微技术在土壤微生物可视化研究中的应用

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安徽农业科学 2011年第2期39卷 1113-1115,1198页

作者：张涛李培学戴慧堂哈登龙单燕祥河南鸡公山国家级自然保护区管理局河南信阳464133 河南省信阳市林业科学研究所河南信阳464000

对近年来荧光显微技术在土壤微生物可视化研究中的应用进行了综述,介绍了荧光显微镜技术、激光共聚焦技术、荧光原位杂交技术,并综合分析了各项技术的优缺点。

关键词：荧光显微技术土壤微生物可视化

杉科植物栽培制度的基本特征及其可持续发展初探

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青海农林科技 2004年第2期 27-29页

作者：哈登龙陈锋河南鸡公山国家级自然保护区河南信阳464133

阐述了杉科植物栽培制度的基本特征,即整体性与层次性、目的性与相关性、适应性与动态性,论述了可持续发展中应妥善解决的三个关系问题,即人、地、树的辩证关系,杉科植物栽培制度继承和改革的关系,经济效益与生态、社会效益的关系。

关键词：杉科植物栽培制度可持续发展整体性层次性目的性相关性适应性动态性综合效益

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珍稀濒危物种秃杉繁殖技术研究

信阳师范学院学报（自然科学版） 2006年第1期19卷 77-79,85页

作者：张学顺戴慧堂哈登龙鸡公山国家级自然保护区管理局河南信阳464133

鸡公山自然保护区1987年从贵州雷公山引进秃杉,经过几年的试验,引种繁殖获得成功.本文对秃杉繁殖技术研究进行了全面总结,细致地论述了秃杉繁殖各个环节的技术要点,对秃杉面积扩大具有指导意义.结果表明:秃杉在豫南显示了广泛的生态适... 详细信息

鸡公山自然保护区1987年从贵州雷公山引进秃杉,经过几年的试验,引种繁殖获得成功.本文对秃杉繁殖技术研究进行了全面总结,细致地论述了秃杉繁殖各个环节的技术要点,对秃杉面积扩大具有指导意义.结果表明:秃杉在豫南显示了广泛的生态适应性和引种潜力.

关键词：鸡公山自然保护区秃杉繁殖技术

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鸡公山国家级自然保护区植被类型调查研究

青海农林科技 2005年第1期 12-15页

作者：哈登龙陈锋河南鸡公山国家级自然保护区管理局信阳464133

鸡公山自然保护区位于我国亚热带向暖温带过渡地带,由于地形复杂,水热条件充足,区内具有丰富的植被类型。据调查,植被类型有针叶林、阔叶林、针阔混交林、竹林、落叶灌丛和草丛。

关键词：植被类型针阔混交林落叶国家级自然保护区阔叶林灌丛竹林草丛暖温带亚热带

基于SuperMap Objects的鸡公山地理信息系统设计与实现

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青海农林科技 2016年第4期 46-51页

作者：哈登龙方成良河南鸡公山国家级自然保护区管理局河南信阳464133

结合RS、GPS技术,以SuperMap为开发平台构建鸡公山自然保护区地理信息系统,该系统实现了空间量算、地图浏览、专题图制作、巡护监控、数据查询与管理等功能。经过测试表明:系统安全可靠,界面友好,操作简单易行,可以满足不同层次用户要求。

关键词：鸡公山地理信息系统 Super Map Objects

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河南鸡公山自然保护区蛇类资源调查

信阳师范学院学报（自然科学版） 2004年第3期17卷 300-301,307页

作者：哈登龙陈锋茹永强河南鸡公山国家级自然保护区管理局河南信阳464133

从2000年至2003年对鸡公山自然保护区的蛇类资源进行了调查,共发现蛇类25种,其中有毒蛇5种,无毒蛇20种.调查结果表明,鸡公山境内的蛇类种类和种群数量有增加的趋势.

关键词：河南鸡公山自然保护区蛇类资源调查地理位置

基于SSR分子标记的野生山胡椒(Lindera glauca)核心种质的构建

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分子植物育种 2018年第19期16卷 6380-6389页

作者：熊彪张莉梅哈登龙琚煜熙张志翔北京林业大学树木系统进化与生物地理学研究室北京100083 河南鸡公山国家级自然保护区管理局信阳464000

为深入发掘和筛选中国野生山胡椒种质资源,本研究利用18对SSR引物(5叶绿体SSR和13核SSR),以基本涵盖中国大陆自然分布区的22个自然群体共303份野生山胡椒种质为材料,进行SSR基因分型分析,并绘制出原始种质的亲缘关系图。结果表明,18对... 详细信息

为深入发掘和筛选中国野生山胡椒种质资源,本研究利用18对SSR引物(5叶绿体SSR和13核SSR),以基本涵盖中国大陆自然分布区的22个自然群体共303份野生山胡椒种质为材料,进行SSR基因分型分析,并绘制出原始种质的亲缘关系图。结果表明,18对引物共检测到Na=88,Ne为1.18～3.76,He为0.14～0.74,Ho为0～0.58,I为0.30～1.52,以及PIC为0.13～0.70。STRUCTURE分析和UPGMA聚类的结果都显示出22个自然群体适合被划分为三个亚类群。利用等位基因最大化(M策略)和遗传距离最大化(SAGD)法分别至少要在25%(71份种质)、15%取样比例下(45份种质)构建的核心种质才能够在所有遗传多样性指标上代表原始种质的遗传多样性(t检验不显著),并符合核心种质构建的标准。结合核心种质构建工作的同类研究,确定SAGD法(15%取样比例)是较适宜于构建山胡椒核心种质的方法。基于nSSR标记,SAGD法15%比例下构建的核心种质在Na、Ne和I指标参数上的保留率分别达到了原始种质的93.24%、104.67%和100.85%;基于cpSSR标记,与之对应的保留率分别为85.14%、107.45%和108.82%。通过此法筛选出的45份核心种质材料能够一定程度地代表中国整个野生山胡椒种质资源的遗传多样性。研究结果可为其他对非作物型木本植物的核心种质构建,尤其是兼有无性与有性繁殖的物种提供参考。

关键词：山胡椒 SSR标记核心种质聚类分析