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铂配合物与DNA碱基对间相互作用的理论研究(英文)

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物理化学学报 2005年第8期21卷 846-851页

作者：和芹周立新福州大学化学系福州350002 暨南大学化学系广州510632

用量子化学方法研究一系列Pt(II)配合物作用于嘌呤碱基N7位点后对Watson-Crick碱基对AT、GC的影响.计算结果显示铂配体与碱基对AT、GC的作用以静电作用为主,同时极化作用也是影响GC碱基对的重要因素.静电作用极大地增强了铂化嘌呤碱基... 详细信息

用量子化学方法研究一系列Pt(II)配合物作用于嘌呤碱基N7位点后对Watson-Crick碱基对AT、GC的影响.计算结果显示铂配体与碱基对AT、GC的作用以静电作用为主,同时极化作用也是影响GC碱基对的重要因素.静电作用极大地增强了铂化嘌呤碱基与嘧啶碱基间的相互作用,而嘌呤碱基与嘧啶碱基间作用与未铂化碱基对作用相近.Pd(II)和Ni(II)的相关研究得到类似的结果.碱基对间氢键作“用二阶微扰能”分析结果与氢键强弱变化一致.

关键词： Pt(Ⅱ)配合食物 Pd(Ⅱ)配合物 Ni(Ⅱ)配合物碱基对氢键 HF方法密度泛函理论(DFT)

新型N-杂环双卡宾与MF(M=Cu^+、Ag^+、Au^+)配位作用特点的理论研究

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南开大学学报（自然科学版） 2013年第4期46卷 12-17页

作者：和芹唐山师范学院化学系河北唐山063000

采用DFT/B3LYP方法系统研究新型N-杂环双卡宾与MF(M=Cu+、Ag+、Au+)的配位作用特点.计算结果表明,C2、C4位点配合物稳定性顺序为:C2/C4-AuF>C2/C4-CuF>C2/C4-AgF,并且C2、C4位点均是很好的金属作用位点,易与金属离子形成稳定配合物.采用... 详细信息

采用DFT/B3LYP方法系统研究新型N-杂环双卡宾与MF(M=Cu+、Ag+、Au+)的配位作用特点.计算结果表明,C2、C4位点配合物稳定性顺序为:C2/C4-AuF>C2/C4-CuF>C2/C4-AgF,并且C2、C4位点均是很好的金属作用位点,易与金属离子形成稳定配合物.采用DFT活性指数讨论金属配合物稳定性特点及亲核性的变化特点,并且利用配合物前线轨道分析配离子与配体间共价作用特点.进一步系统研究极性溶剂对配合物作用的影响,发现在极性溶剂中,金属离子选择性规律与气相一致,但配合物的稳定性显著降低.

关键词： DFT N-杂环双卡宾金属配合物 DFT活性指数

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NCO与HF氢键选择性的理论研究

南开大学学报（自然科学版） 2011年第3期44卷 104-108页

作者：和芹唐山师范学院化学系河北唐山063000

在MP2(full)/6-311++G(2d,2p)、MP2(full)/6-311++G(2df,2p)、MP2(full)/6-311++G(3df,3p)与MP2(full)/6-311++G(3df,3pd)水平上优化单体及二聚物结构,进一步在MP2(full)/6-311++G(3df,3pd)水平上探讨氢键作用特征.综合分析二聚物几何结构、能量,采用自然键轨道NBO分析氢键成键特征,发现氢键形成导致F-H键长增长,振动频率红移,属于典型红移型氢键,NRT分析表明氢键以静电作用为主.进一步引入静电势分析氢键选择性原因,发现N周围静电势更负,因而氢键选择性强.

关键词： MP2 NCO NBO 氢键静电势

磁性海藻酸钠三互穿网络水凝胶对亚甲基蓝的吸附

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化学通报 2023年第12期86卷 1523-1529页

作者：和芹舒世立唐山师范学院化学系唐山市绿色专用化学品实验室唐山063000 河北省可降解聚合物重点实验室唐山063000

以海藻酸钠为水凝胶骨架材料,以羧甲基纤维素钠(CMC)和质子化壳聚糖(CTS)为强度增强材料,制备磁性水凝胶球吸附剂Fe3O4@SA@CMC@CTS,研究其对水溶液中亚甲基蓝(MB)的吸附特性,引入吸附动力学和热力学模型对吸附过程进行分析,并采用傅里... 详细信息

以海藻酸钠为水凝胶骨架材料,以羧甲基纤维素钠(CMC)和质子化壳聚糖(CTS)为强度增强材料,制备磁性水凝胶球吸附剂Fe3O4@SA@CMC@CTS,研究其对水溶液中亚甲基蓝(MB)的吸附特性,引入吸附动力学和热力学模型对吸附过程进行分析,并采用傅里叶变换红外光谱(FT-IR)、磁滞回线和X射线光电子能谱(XPS)对凝胶球特征及吸附机理进行综合分析。结果表明,在25℃、MB溶液浓度700mg/L、凝胶球用量0.2g/L的条件下,平衡吸附量为2143.0mg/g;该吸附过程更符合准一级动力学模型和Freundlich吸附等温方程。

关键词：海藻酸钠羧甲基纤维素钠壳聚糖吸附亚甲基蓝

5-氟尿嘧啶与甲酸及甲酰胺氢键作用的理论研究

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南开大学学报（自然科学版） 2010年第2期43卷 60-66页

作者：和芹孙建武唐山师范学院化学系河北唐山063000 唐山市开滦一中河北唐山063000

在B3LYP/6-31+G~*水平上对5-氟尿嘧啶分别与甲酸和甲酰胺氢键作用的几何结构、电子结构等性质进行了研究,并在B3LYP/6-311++G^(**)水平上做单点能计算.得到5-氟尿嘧啶与甲酸和甲酰胺氢键作用二聚物稳定性顺序为:Ⅱ>Ⅳ>Ⅰ>Ⅲ.自然键轨道(... 详细信息

在B3LYP/6-31+G~*水平上对5-氟尿嘧啶分别与甲酸和甲酰胺氢键作用的几何结构、电子结构等性质进行了研究,并在B3LYP/6-311++G^(**)水平上做单点能计算.得到5-氟尿嘧啶与甲酸和甲酰胺氢键作用二聚物稳定性顺序为:Ⅱ>Ⅳ>Ⅰ>Ⅲ.自然键轨道(NBO)分析表明,氢键强弱主要与质子给体的给质子能力有关.AIM电子密度拓扑分析表明,Y…H间存在键鞍点,且电子密度和Laplacian量都落在氢键建议范围之内.

关键词： B3LYP 氢键 5-氟尿嘧啶甲酸甲酰胺电子密度拓扑分析

Pt（Ⅱ）配合物与DNA及甘氨酸与二价金属离子相互作用的理论研究

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Pt（Ⅱ）配合物与DNA及甘氨酸与二价金属离子相互作用的理论研究

作者：和芹福州大学

学位级别：硕士

本文第一部分用量子化学从头算方法对一系列铂配合物与核酸大分子活性片断的作用进行研究,以期研究铂抗癌药物的作用实质。碱基对间氢键在维持DNA 双螺旋稳定结构的稳定性有十分重要的作用。第二章在B3LYP/6-31G*水平上,研究一系列铂... 详细信息

本文第一部分用量子化学从头算方法对一系列铂配合物与核酸大分子活性片断的作用进行研究,以期研究铂抗癌药物的作用实质。碱基对间氢键在维持DNA 双螺旋稳定结构的稳定性有十分重要的作用。第二章在B3LYP/6-31G*水平上,研究一系列铂配合物作用于嘌呤碱基N7 位点对相应碱基对AT、GC 的影响。计算结果显示Pt(II)与AT、GC 碱基对间的作用以静电作用为主。Pd(II)和Ni(II)的相关研究与上述情况一致。实验研究认为反铂具有较强的抗肿瘤活性。第三章第一部分在B3LYP/6-31G* 水平上,对噻唑取代的反铂与嘌呤碱基的作用体系进行研究。得出反铂更易于与鸟嘌呤配位。同时对相应。pd2+、Ni2+配合物及其交联产物的分析进一步证明反铂与鸟嘌呤配位能力更强。第二部分在同等计算水平上对喹啉取代的反铂作用机理的热力学性质进行初步研究。同时在气相计算基础上,采用PCM 模型,选取一系列极性溶剂,综合考环境影响。计算结果表明气相中与含氮配体作用更强,综合考虑极性溶剂影响,所得结论与气相中计算结果一致。研究发现金属离子对腺嘌呤质子化存在较大影响。用量子化学从头算HF 和密度泛函B3LYP/6-31G*方法研究一系列Pt(II)配合物作用于腺嘌呤碱基对其质子化的影响。选用PCM 模型,综合考虑极性溶剂水影响。同时对相应Pd(II)和Ni(II) 进行研究。计算结果显示气相中静电效应对质子化能力影响为主,不同金属离子对质子化能力影响较小。极性溶剂极大地消除了静电效应影响。NBO 电荷布居分析进一步表明气相中静电效应对质子化影响为主。在B3LYP/6-3 1+G*和B3LYP/6-3 1 1+G*水平上,研究二价金属离子与甘氨酸的相互作用。计算结果表明,同种金属离子的双齿配合物相互作周能和稳定化能大于相应单齿配合物。双齿配位盐桥式构象中各金属离子与甘氨酸相互作用能最大, 其配合物稳定性最高;同类构象中不同金属离子相互作用能顺序是: Cu> Cu>Ni>Zn>Mn>Mg>Ca。稳定化能与相互作用能变化趋势一致,变形能对稳定化能有一定的“微调”作用。

关键词：从头算密度泛函铂、钯、镍相互作用子化