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辣椒疫霉转录组及效应分子的生物信息学研究

辣椒疫霉转录组及效应分子的生物信息学研究

作者：吴育人南京农业大学

学位级别：硕士

卵菌(Oomycete)是一类与真菌在形态上相似,但亲缘关系甚远的一类真核生物。疫霉属(Phytophthora)作为其中非常重要的一类病原卵菌,能够在全世界范围内对经济作物和装饰作物等不同植物造成巨大的经济损失。从植物病理学诞生以来,对疫霉... 详细信息

卵菌(Oomycete)是一类与真菌在形态上相似,但亲缘关系甚远的一类真核生物。疫霉属(Phytophthora)作为其中非常重要的一类病原卵菌,能够在全世界范围内对经济作物和装饰作物等不同植物造成巨大的经济损失。从植物病理学诞生以来,对疫霉的研究就从未间断。进入21世纪基因组时代,多种重要疫霉的全基因组测序陆续完成,加上转录组测序技术的不断完善与普及,使得疫霉的研究跨入了一个全新的阶段,由此也促进了疫霉生物信息学研究的快速发展。通过生物信息学对海量基因组、转录组数据进行的探索和挖掘,能够为传统的实验研究提供更加准确的基因预测、筛选,为疫霉的致病机理分析指明方向,也为在组学上对疫霉进行整体的研究分析提供了可能,从而能够极大得提高疫霉功能基因组学的研究效率。要研究疫霉的病害防治,关键是要清楚疫霉与植物之间的互作机制。目前,疫霉与植物互作的模型已经建立,并且在疫霉中已经发现了多个基因家族,在互作过程中扮演了重要角色,比如水解酶、毒素等,被通称为效应分子。这些家族中的成员通过相互协作,帮助病原物自身适应寄主植物体内环境,从寄主体内获取营养,进而促进病原物的侵染。而其中许多效应分子也在疫霉与寄主植物的协同进化过程中,参与了“军备竞赛”。近年来发现疫霉中存在一个庞大的名为RxLR的效应分子家族,其成员都包含一个RxLR-dEER的保守序列元件,该序列元件能够介导效应分子进入寄主细胞内部,从而发挥功能。一些效应分子能够被寄主识别并诱导抗病反应,被称为无毒基因,阻碍病原物的侵染。掌握这些效应分子在致病过程中的功能,将有助于对植物中抗病基因的挖掘以及筛选,进而为抗病育种提供依据。主要内容包括：1.辣椒疫霉转录组测序分析.通过对辣椒疫霉Pc35菌株非侵染阶段(菌丝、孢子囊、游动孢子、休止孢、休止孢萌发五个阶段)、侵染前期(侵染拟南芥叶片后1小时到4小时)以及侵染后期(侵染拟南芥叶片后8小时到48小时)三个mRNA样品进行转录组测序,并利用得到的测序结果,在辣椒疫霉参考基因组中发现954个新基因;识别辣椒疫霉中存在的多种可变剪接方式,同时进一步估计了可变剪切对蛋白本身可能产生的影响;估计辣椒疫霉中基因的表达量;分析在转录组测序菌株以及基因组测序菌株之间可能存在的效应分子多态性。2.辣椒疫霉中elicitin的生物信息学分析.对辣椒疫霉中的elicitin进行鉴定,根据序列及结构特征划分为elicitin及elicitin-like,并且将其与之前报道过的其他疫霉中的elicitin进行比较,寻找辣椒疫霉中elicitin的特点。其次根据elicitin的进化特征,发现了elicitin在不同卵菌中经历着基因获得和丢失。此外还根据转录组的表达量预测数值,发现辣椒疫霉中elicitin与此前报道的相同,在侵染过程中起到重要作用,而elicitin-like在侵染过程中则可能扮演了多种不同的角色。3.大豆疫霉中P13K基因的鉴定.通过blast以及蛋白功能域预测等方法,在大豆疫霉中鉴定出5个P13K基因,分别归属于class I知class III.比较发现,这些P13K在进化上与结构上与真菌、植物以及哺乳动物中的P13K存在差异,揭示了一种可能在卵菌中特有的P13K进化路线,及功能分配。此外,对5个P13K的表达量分析结果表明,这些P13K可能在大豆疫霉的侵染过程中发挥了主要的作用。

关键词：辣椒疫霉大豆疫霉转录组生物信息学互作效应分子

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在相互依存中崛起：中国的地区主义战略选择

在相互依存中崛起：中国的地区主义战略选择

作者：廖育人上海外国语大学

学位级别：硕士

1997年亚洲金融危机以来,东亚新地区主义蓬勃兴起。现实使中国参与地区主义的进程和中国实施“和平崛起”的国家大战略的过程恰好发生在了同一时期。中国的崛起是世界性的,但首先是地区性的,可以说中国在21世纪的未来将首先取决于如何... 详细信息

1997年亚洲金融危机以来,东亚新地区主义蓬勃兴起。现实使中国参与地区主义的进程和中国实施“和平崛起”的国家大战略的过程恰好发生在了同一时期。中国的崛起是世界性的,但首先是地区性的,可以说中国在21世纪的未来将首先取决于如何处理和亚洲的关系,尤其是东亚的关系;从某种意义上来说,东亚地区主义的走势要比全球化与全球事务对中国的影响更加具体、更加直接,其意义也更加重要和深远。亚洲地区是中国所有的国家利益(安全、政治和经济的)都同时存在的唯一地区。无论是东盟等外部因素的推动,还是自身发展的内在要求,或是出于突破安全困境、消除“中国威胁论”的地缘政治考量,地区主义战略都是中国的现实抉择。地区主义战略有助于中国发挥大国责任,也有助于中国树立地区负责任大国的良好国际形象。中国以参与东亚地区主义进程为实践基础,不断学习和积累经验,逐步构建起自身的地区主义战略。中国的地区主义战略必须走新地区主义的道路。鉴于东盟主导东亚地区主义进程的现实性和东亚地区主义的竞争性特点,中国地区主义战略的重点是,在东盟主导的“10+3”合作机制下,以参与“10+1”机制为核心与东盟合力推动东亚地区主义的发展。中国的地区主义战略并不局限于东亚地区,而是延伸到中亚和俄罗斯,通过主动创立上海合作组织确保北部和西北边陲的安全、加强与中亚、俄罗斯的政治经济合作,是中国构建自身地区主义战略的标志之一。中国的地区主义战略不追求在东亚地区复兴所谓的“朝贡体系”,更不是中国在亚洲的“门罗主义”,而是将亚洲的共同稳定、共同安全和共同发展,即亚洲在世界上的崛起作为最终的目标。

关键词：地区主义中国外交地区合作国际组织关系东盟国家 “中国威胁论” 国际地位国家安全国家利益战略布局

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迈进新世纪的中国人工晶体

人工晶体学报 2001年第1期 3-2页

作者：周育先

Ti基RuO2-CeO2-SnO2涂层阳极的电催化性能

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中国有色金属学报 2003年第6期13卷 1550-1553页

作者：纪红周德瑞周育红哈尔滨工业大学应用化学系哈尔滨工业大学应用化学系哈尔滨150001

利用热分解法制备了不同CeO2 含量的Ti基RuO2 CeO2 SnO2 涂层阳极 ,通过循环伏安曲线和电化学阻抗谱测试了所制备的涂层阳极的电催化性能 ,并用扫描电镜对涂层阳极的表面形貌进行了观察。结果表明 :制备温度对涂层阳极的性能有很大影... 详细信息

利用热分解法制备了不同CeO2 含量的Ti基RuO2 CeO2 SnO2 涂层阳极 ,通过循环伏安曲线和电化学阻抗谱测试了所制备的涂层阳极的电催化性能 ,并用扫描电镜对涂层阳极的表面形貌进行了观察。结果表明 :制备温度对涂层阳极的性能有很大影响 ,在涂层阳极中引入CeO2 可以增加RuO2 CeO2 SnO2 涂层的有效活性表面积 ,从而提高涂层阳极的电催化活性 ,且CeO2 含量的最佳摩尔分数为 0 .4。

关键词：氧化物阳极电催化掺杂 RuO2-CeO2-SnO2涂层

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晚清厘金历年全国总收入的再估计

清史研究 2011年第3期 1-24页

作者：周育民上海师范大学历史系

清代厘金历年全国总收入,始终是一个难以解决的问题。民国时期,罗玉东先生综合清人有关估计和披阅大量档案文献史料,对晚清厘金历年全国总收入作了重新估计,但其结论与清代中外人士的估计相去不远。因此,罗氏关于清代厘金全国岁入大体在... 详细信息

清代厘金历年全国总收入,始终是一个难以解决的问题。民国时期,罗玉东先生综合清人有关估计和披阅大量档案文献史料,对晚清厘金历年全国总收入作了重新估计,但其结论与清代中外人士的估计相去不远。因此,罗氏关于清代厘金全国岁入大体在1400万两至2100万两之间的估计数基本上成为定论。本文拟在罗氏研究的基础上,根据笔者整理的新数据、新材料,提出晚清厘金历年全国总收入的新估计,认为光绪五年以后,清代厘金岁入已常年在2000万两以上,光绪二十九年以后突破3000万两。

关键词：厘金总收入再估计

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为加快建设世界一流企业再建新功

红旗文稿 2023年第14期 8-11页

作者：周育先中国建材集团党委

在全党深入开展学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想主题教育,是党中央为全面贯彻党的二十大精神、动员全党同志为完成党的中心任务而团结奋斗所作的重大部署。中国建材集团党委深入开展主题教育,牢牢把握主题教育根本任务,坚定... 详细信息

在全党深入开展学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想主题教育,是党中央为全面贯彻党的二十大精神、动员全党同志为完成党的中心任务而团结奋斗所作的重大部署。中国建材集团党委深入开展主题教育,牢牢把握主题教育根本任务,坚定不移用习近平新时代中国特色社会主义思想凝心铸魂,加快建设世界一流材料产业投资集团,坚决扛起产业报国、材料强国的责任担当。

关键词：习近平新时代中国特色社会主义思想世界一流企业产业报国中国建材集团主题教育责任担当全面贯彻把握主题

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基于RS和SVM的汽轮机组故障诊断方法

武汉理工大学学报 2010年第6期32卷 115-118,148页

作者：盛步云周育洋武汉理工大学机电工程学院武汉430070

为了提高汽轮机组故障诊断的效率,设计并实现了基于粗糙集和多类支持向量机的融合算法。把粗糙集作为数据的前处理器,对条件属性进行知识约简和去除冗余属性以达到降低数据维数的目的。然后构造多类支持向量机分类器并用约简后的新样本... 详细信息

为了提高汽轮机组故障诊断的效率,设计并实现了基于粗糙集和多类支持向量机的融合算法。把粗糙集作为数据的前处理器,对条件属性进行知识约简和去除冗余属性以达到降低数据维数的目的。然后构造多类支持向量机分类器并用约简后的新样本数据训练。测试结果表明,基于粗糙集和支持向量机融合算法的故障诊断方法诊断速度快,推广能力强。

关键词：粗糙集支持向量机数据融合汽轮机组故障诊断

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鸦片战争以后的五口开埠问题

清史研究 2014年第3期95卷 115-120页

作者：周育民上海师范大学人文学院

鸦片战争以后的五口通商问题，虽然在《南京条约》中白纸黑字写得清清楚楚，但五口何时开始“通商”？开埠的具体过程如何，有关历史论著记载有所歧异和舛误，尤其是福州的开埠时间，实际上是一个尚未完全解决的问题。本文拟就“开埠通... 详细信息

鸦片战争以后的五口通商问题，虽然在《南京条约》中白纸黑字写得清清楚楚，但五口何时开始“通商”？开埠的具体过程如何，有关历史论著记载有所歧异和舛误，尤其是福州的开埠时间，实际上是一个尚未完全解决的问题。本文拟就“开埠通商”的标志以及各口正式开埠通商的具体时间和过程进行探讨和订正。

关键词：开埠通商鸦片战争《南京条约》五口通商时间

辛亥革命时期的“江苏统一＂——兼论辛亥革命时期的苏沪行政关系

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史林 2002年第B6期 22-28,57页

作者：周育民上海师范大学历史系教授

革命党人只推翻清政府而不争权利的政治信念，清帝退位前后“江苏统一”、“南北统一”的舆论环境，“江苏都督”的行省首长意识，江苏省内部的地缘政治关系以及袁世凯坚持原有行省制度的强硬政策，都促成了江苏境内的“革命”迅速地被... 详细信息

革命党人只推翻清政府而不争权利的政治信念，清帝退位前后“江苏统一”、“南北统一”的舆论环境，“江苏都督”的行省首长意识，江苏省内部的地缘政治关系以及袁世凯坚持原有行省制度的强硬政策，都促成了江苏境内的“革命”迅速地被结束了。沪军都督府虽在辛亥革命中具有重要地位，但地处江苏“下邑”的行政地位，使它在清帝退位之时，陷入了“事实当去”的窘境。主张分省的江北都督虽得到江北议会的支持，但是在袁世凯的严令和程德全的安抚下，亦不得不宣告取消。将兵权分别移交陆军部和江苏都督后，南京留守府亦告取消。原作为苏松太道驻地的上海在道台撤销之后，行政地位反而下降了，自治机构上海市政厅要求按西方自由都市办法直隶省政府，市、县分治、市辖县的新行政体制由此开始萌发。

关键词：辛亥革命江苏统一行政关系