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生物样本库建设中的低温生物学

中国科学：生命科学 2023年第7期53卷 1021-1034页

作者：胥义郭宁杨国梁占太杰韩恒鑫程跃赵刚魏强周学迅刘宝林上海理工大学生物系统热科学研究所上海200093 上海市生物资源低温保存技术服务平台上海200093 安徽医科大学生物医学工程系合肥230032 中国科学技术大学电子工程与信息科学系合肥230027 中国疾病预防控制中心国家病原微生物资源库北京102206 中国医药生物技术协会组织生物样本库分会低温生物学组上海200093

生物样本库作为精准医疗、动植物优良育种以及生物安全的重要基石,已经取得了长足进步,但高质量生物样本库建设的需求愈发迫切.低温是实现活性生物样本高质量保存的重要技术手段,而低温生物学在生物样本活库建设应用中仍面临着诸多挑战... 详细信息

生物样本库作为精准医疗、动植物优良育种以及生物安全的重要基石,已经取得了长足进步,但高质量生物样本库建设的需求愈发迫切.低温是实现活性生物样本高质量保存的重要技术手段,而低温生物学在生物样本活库建设应用中仍面临着诸多挑战,例如多层级低温损伤机制、低毒绿色低温保护剂开发、玻璃化保存工艺优化、复温损伤避免以及自动化低温存储技术等.这就亟需临床医学、细胞生物学、动植物学、微生物学与低温生物学等多学科融合来突破现有瓶颈,为生物样本资源的高质量保藏和应用提供重要保障.

关键词：生物样本库低温生物学低温保存低温损伤

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生物样本活库发展现状及伦理问题探讨

中国科学：生命科学 2020年第12期50卷 1464-1474页

作者：乐晶晶周学迅姚海嵩刘世建马永慧厦门大学医学院生命伦理中心厦门361100 上海冰奥生物科技有限公司上海201400 上海市天华律师事务所上海201112 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心上海200127

生物样本活库(living biobank)(以下简称活库)是在样本存储条件不断改善、生物医学研究持续深入的背景下逐渐形成的一类活样本存储体系.相比于传统样本库,活库样本资源对生物医学研究有更大的价值,特别是在模型建立、药物疗效与毒理测... 详细信息

生物样本活库(living biobank)(以下简称活库)是在样本存储条件不断改善、生物医学研究持续深入的背景下逐渐形成的一类活样本存储体系.相比于传统样本库,活库样本资源对生物医学研究有更大的价值,特别是在模型建立、药物疗效与毒理测试、组织器官再生等需要生理活性的基础研究或临床试验上更胜一筹.然而活库之"活"也使其面临许多管理和应用的新问题,比如,长久存活的样本如何保障捐赠者对未来研究的知情权?

关键词：生物样本存储体系捐赠者管理和应用伦理问题临床试验样本库存储条件

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自动化在生物样本库中的应用现状

中国医药生物技术 2015年第6期10卷 498-500页

作者：明星周学迅哈尔滨医科大学附属二院心肌缺血教育部重点实验室 150086 上海万格科学器材有限公司 201204

为了将基础医学研究的成果充分应用到临床疾病诊治中，近年来，转化医学和精准医学的概念逐渐兴起，作为有望成为跨越这个鸿沟的桥梁，生物样本库如雨后春笋般地出现在全国各地，科研工作者也把目光投向生物样本库的标准化建设以及随之... 详细信息

为了将基础医学研究的成果充分应用到临床疾病诊治中，近年来，转化医学和精准医学的概念逐渐兴起，作为有望成为跨越这个鸿沟的桥梁，生物样本库如雨后春笋般地出现在全国各地，科研工作者也把目光投向生物样本库的标准化建设以及随之而来的价值发掘上[1]。然而，生物样本库普遍存在样本数量少、样本数据不完整、质量不达标等现象，严重地影响了相关研究结果的可靠性[2-3]。因此，高效地获取和存储质量合格、数据完整的生物样本，并更有效地为医学研究服务，便成为生物样本库行业发展的关键。随着技术的不断革新，解决上述问题的方法不断被探索出来，这其中最重要之一就是“自动化”。“自动化”能最大效率地提高样本制备质量，降低交叉污染，提高样本准备和处理速度，可追踪溯源从而降低出错风险[4]。“自动化”因其更统一、规范、高效的特点，成为了生物样本库的下一个发展方向。本文旨在介绍自动化在生物样本库中的应用现状，希望能为同行起到借鉴作用。

关键词：生物样本自动化应用医学研究样本数量科研工作者疾病诊治转化医学

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我国生物样本库运营规划现状

协和医学杂志 2018年第3期9卷 271-276页

作者：李倩金莉萍周学迅同济大学附属第一妇婴保健院转化医学中心生物样本库上海200040 eBiobank生物样本科学兴趣小组上海200040 上海万格生物科技有限公司上海200040

目的评估我国生物样本库的运营规划现状。方法对国内63个主要生物样本库展开问卷调查。问卷内容包括生物样本库基本信息、运营规划、样本利用率、用户/客户群体、市场推广/广告、成本回收和业绩指标等6个类别,对6个类别的调查数据进行... 详细信息

目的评估我国生物样本库的运营规划现状。方法对国内63个主要生物样本库展开问卷调查。问卷内容包括生物样本库基本信息、运营规划、样本利用率、用户/客户群体、市场推广/广告、成本回收和业绩指标等6个类别,对6个类别的调查数据进行描述性分析。结果 63个生物样本库中,96.8%(61/63)属于学术机构或公立医院;19.0%(12/63)已有运营规划,39.7%(25/63)正在筹备运营规划,41.3%(26/63)尚无运营规划;85.0%(34/40)实际利用率低于20%,且97.5%(39/40)低于目标利用率;88.6%(1084/1223)的样本仅用于样本库或所属机构内部使用,不对外共享。结论本次调查结果初步反映,我国生物样本库运营规划情况不容乐观,样本实际利用率较低,且普遍低于其目标利用率,对外共享不足,未来应进一步加强国内生物样本库的合作和共享。

关键词：生物样本库运营规划可持续发展

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江苏省重大传染病研究生物样本库的构建研究

中国全科医学 2013年第13期16卷 1566-1568页

作者：朱叶飞周学迅朱乃文朱立国翟祥军卞倩彭红鲍倡俊许卫国羊海涛汪华江苏省疾病预防控制中心江苏省南京市210009 上海万格科学器材有限公司南京谛州电子科技有限公司

目的建立大规模人群的重大传染病研究生物样本库,为重大传染病前瞻性研究做储备。方法研发有效的样本管理系统,将样本条形码和采集对象居民身份证关联,运用数据库接口技术将生物样本库管理系统和实验室信息系统及居民健康管理系统对接... 详细信息

目的建立大规模人群的重大传染病研究生物样本库,为重大传染病前瞻性研究做储备。方法研发有效的样本管理系统,将样本条形码和采集对象居民身份证关联,运用数据库接口技术将生物样本库管理系统和实验室信息系统及居民健康管理系统对接。结果建立起可容纳150 000人队列研究的多中心生物样本库,并同步收集研究对象的问卷调查及体格检查信息。结论传染病研究生物样本库收集的样本和相关信息为传染病研究提供了有益的资源。涵盖样本的采集、运输、处理及存储、查询等全流程的传染病生物样本库管理标准操作规范的制订,对生物医学发展有着深远影响。

关键词：重大传染病生物样本库生物样本管理系统实验室信息系统居民健康管理系统

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生物样本库的安全管理措施

转化医学杂志 2013年第2期2卷 103-105页

作者：余永国周学迅郭爱华马蓓颖张翠傅启华江帆王伟刘世建上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心儿科转化医学研究所生物样本库上海200127 万格科学器材有限公司上海200127

针对我国样本库建设中存在的诸多安全隐患和不足,结合上海儿童医学中心生物样本库在安全方面实施的实际情况,分别从样本库的人员安全、设施和设备安全、操作安全、样本数据安全、样本转运安全、生物安全和化学安全等多个方面进行介绍,... 详细信息

针对我国样本库建设中存在的诸多安全隐患和不足,结合上海儿童医学中心生物样本库在安全方面实施的实际情况,分别从样本库的人员安全、设施和设备安全、操作安全、样本数据安全、样本转运安全、生物安全和化学安全等多个方面进行介绍,对建设中存在的不足进行分析。

关键词：生物样本库样本库安全样本安全生物安全

自动化存储管理系统在生物样本库领域的应用及展望

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中华临床实验室管理电子杂志 2017年第1期5卷 46-50页

作者：戴涵清俞磊李艺陆胜职庭帆杨光周学迅王雪琦上海长征医院生物样本库转化医学办公室 200003 上海长征医院信息科 200003 上海万格生物科技有限公司

生物样本库是实现转化医学、精准医学的重要保证。生物样本库自动化存储系统具有保障样本质量、操作自动便捷、存储集约高效、节省运行成本等特点,在国际生物样本库中的应用十分广泛。中国第一家百万级全自动生物样本库于2016年12月在... 详细信息

生物样本库是实现转化医学、精准医学的重要保证。生物样本库自动化存储系统具有保障样本质量、操作自动便捷、存储集约高效、节省运行成本等特点,在国际生物样本库中的应用十分广泛。中国第一家百万级全自动生物样本库于2016年12月在上海长征医院建成并启用,其采用的自动化存储管理系统能对实体样本存储使用全过程及相关电子信息进行完善的自动化管理,且实现与医院信息系统的无缝衔接。自动化存储系统将是未来生物样本库建设的优先选择,越来越多的生物样本库将会完成人工存储向自动化存储的转变。

关键词：生物样本库自动化存储管理

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样本分析前变量在生物样本库中的应用探讨

转化医学杂志 2015年第5期4卷 270-272页

作者：马蓓颖陈畅郭爱华周学迅唐中华何毅王伟江帆刘世建上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心儿科转化医学研究所生物样本库上海200127 上海万格科学器材有限公司上海200127 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心信息科上海200127

样本分析前变量(standard PREanalytical code,SPREC)可有效管理和追溯生物样本分析前的影响因素,促进不同生物样本库之间的沟通和交流,提高样本的质量,提升实验结果的准确性。作者从样本库的质控及相关流程、不同临床类型样本的收集和S... 详细信息

样本分析前变量(standard PREanalytical code,SPREC)可有效管理和追溯生物样本分析前的影响因素,促进不同生物样本库之间的沟通和交流,提高样本的质量,提升实验结果的准确性。作者从样本库的质控及相关流程、不同临床类型样本的收集和SPREC记录、SPREC的使用3个部分入手,结合上海儿童医学中心生物样本库的实际情况,对SPREC在生物样本库中的应用进行分析探讨。

关键词：样本库分析前变量质控

从自噬角度研究雷公藤甲素引起HepG2细胞肝毒性的机制

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中国实验方剂学杂志 2017年第10期23卷 99-103页

作者：刘春晖周玲玲马可迅王婧冯哲周学平南京中医药大学南京210023

目的:探讨雷公藤甲素(TP)对HepG2细胞的过氧化损伤及对自噬的调控作用。方法:将质量浓度为0.003 2,0.016,0.08,0.4,2 g·L^(-1)的TP作用于体外培养的HepG2细胞48 h,另设空白组做对比,采用噻唑蓝(MTT)法检测细胞生长活性,采用酶联免疫吸... 详细信息

目的:探讨雷公藤甲素(TP)对HepG2细胞的过氧化损伤及对自噬的调控作用。方法:将质量浓度为0.003 2,0.016,0.08,0.4,2 g·L^(-1)的TP作用于体外培养的HepG2细胞48 h,另设空白组做对比,采用噻唑蓝(MTT)法检测细胞生长活性,采用酶联免疫吸附测定(ELISA)法检测超氧化物歧化酶(SOD),谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)的活性,采用蛋白质免疫印迹(Western blot)法检测自噬相关蛋白微管相关蛋白轻链3(LC3Ⅱ)与Beclin1蛋白的表达情况,用免疫荧光法检测自噬相关蛋白LC3的表达情况。结果:与空白组比较,随着TP质量浓度的增加,HepG2活性下降(P<0.05,P<0.01);检测细胞上清中SOD,GSH-Px的活性,均较空白组降低(P<0.05,P<0.01);Western blot表明TP可上调LC3Ⅱ与Beclin1蛋白水平的表达(P<0.05,P<0.01),免疫荧光法同样表明TP能够引起自噬相关蛋白LC3表达的增多(P<0.05,P<0.01),均具有一定的浓度依赖性。结论:一定质量浓度的TP可造成肝细胞损伤,其损伤机制可能与过氧化损伤以及过氧化损伤导致的自噬过度激活有关。

关键词：雷公藤甲素 HepG2细胞自噬肝毒性过氧化损伤