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基于转录组分析的铁线莲花色相关基因挖掘及表达分析

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分子植物育种 2024年

作者：周士家蔡起航易松恒门宇辰孙正海李丽萍西南林业大学园林园艺学院云南省面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地云南省观赏草集成利用国际联合研发中心西南林业大学湿地学院

铁线莲花色丰富多彩、花型多变，花期长且适应性强，是非常优秀的垂直绿化材料，可广泛用于盆栽、切花等领域。本研究基于‘罗曼蒂克’铁线莲花瓣的不同时期的转录组测序开展了转录组分析、及花瓣颜色相关基因表达分析，为控制铁线莲花... 详细信息

铁线莲花色丰富多彩、花型多变，花期长且适应性强，是非常优秀的垂直绿化材料，可广泛用于盆栽、切花等领域。本研究基于‘罗曼蒂克’铁线莲花瓣的不同时期的转录组测序开展了转录组分析、及花瓣颜色相关基因表达分析，为控制铁线莲花色基因的遗传转化奠定了理论基础。旨在更好地对铁线莲种质资源进行保存、开发和利用。研究采用Illumina Novaseq 6000测序平台对不同时期的‘罗曼蒂克’铁线莲花瓣进行转录组测序，使用Trinity软件重新组装获得117 332条unigenes。将所有unigenes与COG、GO和KEGG数据库进行BLAST比对，共有46 406条unigenes获得注释，获得差异基因注释信息，并对其进行富集分析，基于花瓣颜色形成、花青素代谢、花瓣生物活性成分的生物合成途径，共检测到154条unigenes与花青素生物合成途径有关，参与花青素生物合成途径。从中筛选出14个基因进行荧光定量分析，7个基因在样品中的相对表达量存在差异，可作为铁线莲花瓣颜色形成相关的候选基因。

关键词：铁线莲转录组测序花青素代谢荧光定量

喀西茄SaMYB75基因的克隆及生物信息学分析

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分子植物育种 2023年

作者：易松恒蔡起航房佳茹周士家孙正海李丽萍西南林业大学园林园艺学院云南省面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地西南林业大学湿地学院

喀西茄(Solanum khasianum)为茄子的近缘野生种，有较高的药用价值和环境适应力，具备较多其它栽培茄资源所缺乏的生物胁迫和非生物胁迫的抗性基因。皮刺是喀西茄为适应恶劣环境生长而进化出的重要表征。本研究以课题组前期喀西茄转录... 详细信息

喀西茄(Solanum khasianum)为茄子的近缘野生种，有较高的药用价值和环境适应力，具备较多其它栽培茄资源所缺乏的生物胁迫和非生物胁迫的抗性基因。皮刺是喀西茄为适应恶劣环境生长而进化出的重要表征。本研究以课题组前期喀西茄转录组数据得到的茎部皮刺调控基因SaMYB75为研究对象，对其进行克隆并分析相应生物学信息。结果表明，SaMYB75基因的cDNA序列长度为825 bp，共274个氨基酸，分子量31.66 kD，等电点(pI) 8.97，超家族识别位点符合MYB家族特性，蛋白中无信号肽和跨膜结构存在，属于不稳定的亲水性碱性蛋白，蛋白三维结构由无规则卷曲形状所构成，进化树分析显示SaMYB75和茄子(Solanum melongena)同源性最近。研究结果为SaMYB75基因进一步遗传转化提供了科学依据。

关键词：喀西茄皮刺 MYB75基因基因克隆生信分析

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木蝴蝶内生真菌分离鉴定及促生功能初步研究

云南农业大学学报（自然科学版） 2023年第5期38卷 878-885页

作者：许娟娟房佳茹周士家李伟孙正海西南林业大学园林园艺学院云南省面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心云南省观赏草集成利用国际联合研发中心云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地云南昆明650224 云南吉成园林科技股份有限公司云南弥勒652339

【目的】解析木蝴蝶[Oroxylum indicum(L.)Vent.]内生真菌的种类及其促生功能。【方法】以木蝴蝶树皮、种子、果皮和叶片为材料分离鉴定内生真菌,依据生理指标对分离的内生真菌促生活性进行分析;选取部分代表性内生真菌转接到黄豆植株... 详细信息

【目的】解析木蝴蝶[Oroxylum indicum(L.)Vent.]内生真菌的种类及其促生功能。【方法】以木蝴蝶树皮、种子、果皮和叶片为材料分离鉴定内生真菌,依据生理指标对分离的内生真菌促生活性进行分析;选取部分代表性内生真菌转接到黄豆植株进行培养,以黄豆产量指标验证其实际促生效果。【结果】从木蝴蝶树皮、种子、果皮和叶片中分离得到50株内生真菌,隶属于13属23种,其中果皮部位分离菌株最多,炭疽属(Colletotrichum)为优势菌属;9株代表性真菌均具有产吲哚乙酸和固氮的能力,其中6株真菌还具有溶磷和解钾特性。转接栽培试验结果表明:9株菌处理后黄豆果荚数增加5%~75%,产量提高37%~231%;其中壳青霉(Penicillium crustosum)促生效果最好。【结论】本研究首次开展了木蝴蝶内生真菌的分离研究,并对其功能进行了验证,其中壳青霉促生效果最好,转接黄豆后可提高其果荚数和产量,具有开发为微生物菌肥的潜力。

关键词：木蝴蝶内生真菌纯培养分离促生功能

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基于转录组分析技术的喀西茄叶刺形成相关基因挖掘

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分子植物育种 2023年

作者：蔡起航杨艳波李娇珍丁慕溪周士家孙正海李丽萍西南林业大学园林园艺学院云南省面向南亚东南亚经济林全产业链联合研发中心云南省高效经济林培育示范型国际科技合作基地西南林业大学地理与生态旅游学院西南林业大学湿地学院

喀西茄在提高食用茄抗性和药用成分开发领域具有重要研究价值，其地上部密布尖锐皮刺，皮刺是植物的重要性状，与植物抗性和实际生产相关。为探索喀西茄叶刺形成机理及发掘叶刺形成调控基因，本研究以喀西茄叶刺缺失个体及野生型个体作... 详细信息

喀西茄在提高食用茄抗性和药用成分开发领域具有重要研究价值，其地上部密布尖锐皮刺，皮刺是植物的重要性状，与植物抗性和实际生产相关。为探索喀西茄叶刺形成机理及发掘叶刺形成调控基因，本研究以喀西茄叶刺缺失个体及野生型个体作为材料，分别提取生长叶总RNA，通过二代测序Illumina TruseqTM平台进行转录组测序，获得37.5 Gb原始数据，质控得到30.2 Gb高质量Clean Reads后组装获得Unigene库。筛选得到7 481条表达显著差异基因，对转录组进行可变剪切及单核苷酸多态性分析，发现存在2种可变剪切类型和2种单核苷酸多态性类型，GO、KEGG数据库注释，获得差异基因注释信息，并对其进行富集分析，基于植物表层蜡质、植物激素、类黄酮生物合成三个方面对喀西茄叶刺合成相关基因进行挖掘，首次得到9条喀西茄叶刺形成相关基因，分别调控表层蜡质合成、表皮毛形成、生长素功能等方面，本研究为植物叶刺和抗性相关性以及无刺个体育种提供理论依据。

关键词：喀西茄叶刺转录组分析表达差异

激光诱导荧光技术与地下水重金属原位检测应用进展

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岩矿测试 2025年第1期44卷 19-34页

作者：毛康薛家奇陈卓张华中国科学院地球化学研究所环境地球化学国家重点实验室贵州贵阳550081

对地下水重金属污染进行现场检测,是快速识别重金属种类和评价污染程度的重要手段。激光诱导荧光技术(LIF)利用特定荧光探针,在目标重金属存在下,通过激光诱导荧光探针产生/猝灭荧光,从而完成对重金属的识别和检测,具有快速甄别地下水... 详细信息

对地下水重金属污染进行现场检测,是快速识别重金属种类和评价污染程度的重要手段。激光诱导荧光技术(LIF)利用特定荧光探针,在目标重金属存在下,通过激光诱导荧光探针产生/猝灭荧光,从而完成对重金属的识别和检测,具有快速甄别地下水重金属污染特性和无损获取其价态的优势。本文在简述LIF检测重金属原理和LIF原位检测地下水重金属装备基础上,重点从荧光探针合成及其在重金属传感检测方法的构建上总结了基于不同荧光探针的LIF现场检测重金属的研究进展。目前可用于重金属检测的荧光探针包括以小分子探针、有机大分子和聚集诱导发光为主的有机荧光探针和以金纳米簇、量子点和金属有机框架材料为代表的纳米荧光探针。这些探针的合成及其对应的传感检测方法的构建表明LIF技术在地下水重金属检测中具有巨大优势。而针对地下水重金属检测的LIF设备研发方面的成果虽不如荧光传感检测方法丰富,但已研制出部分重金属的传感器和检测装备,表现出良好的应用前景。未来研究将会聚焦在地下水重金属主控因子识别和抗干扰技术研发、荧光探针合成与LIF检测方法构建、重金属传感部件和检测装备集成研制,以及检测技术标准化,为后续场地地下水典型重金属LIF检测技术的研究提供参考。

关键词：地下水重金属激光诱导荧光荧光探针现场检测

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玉米免耕播种机振动特性分析与优化

农机化研究 2025年第4期47卷 122-126页

作者：何俊艺何家盼湖南汽车工程职业学院湖南株洲412001

玉米免耕播种机在作业时会产生振动,影响播种机的工作效率和生产质量,故对其振动特性进行分析和优化非常重要。为此,对玉米免耕播种机振动特性进行了分析与优化。首先,通过试验测试和有限元模拟确定了播种机的振动特性,包括自然频率、... 详细信息

玉米免耕播种机在作业时会产生振动,影响播种机的工作效率和生产质量,故对其振动特性进行分析和优化非常重要。为此,对玉米免耕播种机振动特性进行了分析与优化。首先,通过试验测试和有限元模拟确定了播种机的振动特性,包括自然频率、振型等;然后,针对振动特性中存在的问题,采用了多种优化方法(如结构优化、材料优化等),以改善播种机的振动性能;最后,通过试验和仿真模拟验证了优化后的播种机性能。研究结果表明:通过优化设计,可以有效地降低播种机的振动幅值,提高工作效率和生产质量。

关键词：玉米免耕播种机振动特性自然频率振型振幅结构优化

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基于细节增强和多颜色空间学习的联合监督水下图像增强算法

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现代电子技术 2025年第1期48卷 23-28页

作者：胡锐程家亮胡伏原苏州科技大学信息化建设与管理中心江苏苏州215009 苏州科技大学电子与信息工程学院江苏苏州215009

由于水下特殊的成像环境,水下图像往往具有严重的色偏雾化等现象。因此文中根据水下光学成像模型设计了一种新的增强算法,即基于细节增强和多颜色空间学习的无监督水下图像增强算法(UUIE-DEMCSL)。该算法设计了一种基于多颜色空间的增... 详细信息

由于水下特殊的成像环境,水下图像往往具有严重的色偏雾化等现象。因此文中根据水下光学成像模型设计了一种新的增强算法,即基于细节增强和多颜色空间学习的无监督水下图像增强算法(UUIE-DEMCSL)。该算法设计了一种基于多颜色空间的增强网络,将输入转换为多个颜色空间(HSV、RGB、LAB)进行特征提取,并将提取到的特征融合,使得网络能学习到更多的图像特征信息,从而对输入图像进行更为精确的增强。最后,UUIE-DEMCSL根据水下光学成像模型和联合监督学习框架进行设计,使其更适合水下图像增强任务的应用场景。在不同数据集上大量的实验结果表明,文中提出的UUIE-DEMCSL算法能生成视觉质量良好的水下增强图像,且各项指标具有显著的优势。

关键词：水下图像增强多颜色空间学习无监督学习细节增强特征提取特征融合

肉苁蓉苷A通过JNK/MAPK通路抑制破骨细胞活性

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中国组织工程研究 2025年第6期29卷 1144-1151页

作者：李岳尧张民杨家驹山西中医药大学山西省晋中市030619 山西医科大学第二医院山西省太原市030001

背景:研究证实肉苁蓉苷A具有抗炎、抗氧化和抗骨质疏松的作用,但其对破骨细胞分化和功能的影响及潜在的机制尚缺少研究。目的:探讨肉苁蓉苷A对核因子κB受体活化因子配体诱导的体外破骨细胞分化和骨吸收功能的影响及作用机制。方法:提... 详细信息

背景:研究证实肉苁蓉苷A具有抗炎、抗氧化和抗骨质疏松的作用,但其对破骨细胞分化和功能的影响及潜在的机制尚缺少研究。目的:探讨肉苁蓉苷A对核因子κB受体活化因子配体诱导的体外破骨细胞分化和骨吸收功能的影响及作用机制。方法:提取与培养4-6周龄C57BL/6小鼠股骨和胫骨中的骨髓巨噬细胞,采用CCK-8毒性实验检验不同浓度的肉苁蓉苷A(5,10,20,40,80,160μmol/L)对骨髓巨噬细胞的毒性,抗酒石酸酸性磷酸酶染色观察不同浓度的肉苁蓉苷A干预破骨细胞的分化情况,确定药物的有效干预浓度。将实验分为阳性对照组、肉苁蓉苷A低、中、高剂量组(40,80,160μmol/L),细胞贴壁后各组均加入50 ng/mL的核因子κB受体活化因子配体诱导破骨细胞分化,肉苁蓉苷A低、中、高剂量组分别加入相应剂量的肉苁蓉苷A进行干预。采用肌动蛋白环鬼笔环肽染色和DAPI染色检测肉苁蓉苷A对破骨细胞形成的影响;骨磨片甲苯胺蓝染色观察肉苁蓉苷A对破骨细胞骨吸收功能的影响;Western blot检测JNK/MAPK通路上下游蛋白的表达情况;RT-qPCR检测抗酒石酸酸性磷酸酶、DC-STAMP、Nfatc-1、Ctsk和c-Fos等破骨细胞分化和骨吸收功能相关基因的表达情况。结果与结论:①抗酒石酸酸性磷酸酶染色、肌动蛋白环染色和骨陷窝甲苯胺蓝染色结果表明,与阳性对照组相比,肉苁蓉苷A对核因子κB受体活化因子配体诱导的体外破骨细胞的分化和骨吸收功能具有呈剂量依赖性的显著抑制作用;②RT-qPCR结果表明,与阳性对照组相比,肉苁蓉苷A高剂量组和低剂量组的抗酒石酸酸性磷酸酶、DC-STAMP、Nfatc-1、Ctsk和c-Fos等的mRNA表达量均显著降低,且肉苁蓉苷A高剂量组的降低效果更加显著;③Western blot结果显示,高剂量肉苁蓉苷A干预10,20,30和60 min时显著抑制p-JNK蛋白的表达;与阳性对照组相比,肉苁蓉苷A低、中、高剂量组显著抑制Nfatc1和c-Fos蛋白的表达,且呈剂量依赖性;④结果说明,肉苁蓉苷A能够通过降低p-JNK蛋白水平,抑制MAPK通路的激活和破骨细胞关键基因的表达,进而抑制破骨细胞的形成和骨吸收功能。

关键词：肉苁蓉苷A 破骨细胞 MAPK JNK RANKL RANK 骨质疏松苯乙醇苷

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基于RHT本构模型的连续装药预裂爆破孔距优化研究

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高压物理学报 2025年第1期39卷 109-118页

作者：张伟王建国王勉陶家龙昆明理工大学国土资源工程学院云南昆明650093 云南省教育厅爆破新技术工程研究中心云南昆明650093

为解决北衙金矿在使用预裂爆破技术时整体爆破效果不佳的问题,基于RHT损伤本构模型,利用ANSYS/LS-DYNA数值模拟软件,开展了不同孔距下预裂爆破的数值模拟研究。结果表明:当预裂孔炮孔间距为120 cm时,孔间裂纹存在较为明显的分叉,且裂纹... 详细信息

为解决北衙金矿在使用预裂爆破技术时整体爆破效果不佳的问题,基于RHT损伤本构模型,利用ANSYS/LS-DYNA数值模拟软件,开展了不同孔距下预裂爆破的数值模拟研究。结果表明:当预裂孔炮孔间距为120 cm时,孔间裂纹存在较为明显的分叉,且裂纹扩展范围较大;当炮孔间距为130 cm时,裂纹向四周扩展的范围减小,且炮孔周围岩石的损伤程度明显降低;当炮孔间距增加至140 cm时,相邻预裂孔连线上的裂纹仅在局部连通,无法实现孔间贯穿。上述结果说明,130 cm的炮孔间距在降低预裂爆破自身对岩体的扰动与实现有效爆破成缝之间达到了平衡。基于数值模拟试验结果开展了现场试验,爆破效果良好。研究结果可为矿山的预裂爆破设计和施工提供参考。

关键词：预裂爆破连续装药孔距优化 RHT本构模型

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