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珊瑚菜叶绿体基因组密码子使用偏性分析

植物资源与环境学报 2023年第6期32卷 1-10页

作者：孙月琪李密密周义峰南京林业大学林草学院、水土保持学院江苏南京210037 江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)江苏省植物资源研究与利用重点实验室江苏南京210014

为探究珊瑚菜(Glehnia littoralis *** ex Miq.)叶绿体基因组密码子使用偏性及其影响因子,本研究基于珊瑚菜叶绿体基因组测序数据筛选到51个蛋白质编码基因,并对其密码子使用模式进行分析。结果显示:珊瑚菜叶绿体基因组密码子总GC含量(G... 详细信息

为探究珊瑚菜(Glehnia littoralis *** ex Miq.)叶绿体基因组密码子使用偏性及其影响因子,本研究基于珊瑚菜叶绿体基因组测序数据筛选到51个蛋白质编码基因,并对其密码子使用模式进行分析。结果显示:珊瑚菜叶绿体基因组密码子总GC含量(G_(Call))为38.8%,密码子第3位碱基的GC含量(GC3)最低,仅为29.2%,3个位置碱基的GC含量均小于50%,表明珊瑚菜叶绿体基因组密码子偏好使用A或U。珊瑚菜叶绿体基因组有效密码子数(ENC)为34.6~54.5,密码子适应指数(CAI)为0.100~0.270,密码子偏好指数(CBI)为-0.190~0.226,最优密码子使用频率(FOP)为0.276~0.550,表明珊瑚菜叶绿体基因组密码子使用偏性较弱;相关性分析结果表明珊瑚菜叶绿体基因组密码子第3位碱基的组成对基因表达有很大影响。中性绘图分析、PR2-plot分析、ENC-plot分析和对应性分析结果表明珊瑚菜叶绿体基因组密码子使用偏性受自然选择和突变的共同影响,以自然选择为主;基于相对同义密码子使用度(RSCU)和高、低表达组的RSCU差值(ΔRSCU)共获得16个最优密码子,且大部分以A或U结尾。综合分析结果表明:珊瑚菜叶绿体基因组密码子使用偏性较弱,且主要受自然选择的影响。

关键词：珊瑚菜叶绿体基因组密码子使用偏性最优密码子

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布雷菲德菌素A对蕨类植物卵发育的影响

植物研究 2022年第3期42卷 358-363页

作者：郭严冬曹建国周义峰戴锡玲王全喜张明霞江苏省中国科学院植物研究所南京210014 上海师范大学生命科学学院上海200234

以蕨类模式植物水蕨(Ceratopteris thalictroides ***.)为供试材料,设置不同质量浓度布雷菲德菌素A(BFA)分别处理10、20、30 h,采用光学显微镜和电镜对其树脂切片进行了观察;在此基础上,进行高碘-酸锡夫反应(PAS)和苏丹黑B反应。结果显... 详细信息

以蕨类模式植物水蕨(Ceratopteris thalictroides ***.)为供试材料,设置不同质量浓度布雷菲德菌素A(BFA)分别处理10、20、30 h,采用光学显微镜和电镜对其树脂切片进行了观察;在此基础上,进行高碘-酸锡夫反应(PAS)和苏丹黑B反应。结果显示:对照组(未经BFA处理)发育卵中期的水蕨卵细胞较大,核仁呈圆形,细胞内高尔基体、内质网等细胞器完整;卵细胞和腹沟细胞间的受精孔清晰可见,二者间的分离腔内仅有极少量的泡状分泌物;卵膜较厚,有明显的层次。而处理组卵细胞的受精孔和卵膜不典型,由数量较多、大小不一的囊泡组成;受精孔下方有较多的线粒体和少量的高尔基体分布;高尔基体、内质网等膜性细胞器已断裂;细胞核上方和卵膜下方均分布着大量的嗜锇性囊泡,分离腔中充满了絮状物质。组织定位显示:对照组的分离腔较空,而处理组分离腔内充满着多糖类物质。综上所述,BFA会对卵细胞中的内质网和高尔基体等膜性细胞器造成破坏,影响分泌系统的正常功能,进而影响卵膜及受精孔的形成。本研究结果为进一步探索受精孔形成的机制以及蕨类植物生殖生物学的研究奠定了基础。

关键词：蕨类植物水蕨卵发育布雷菲德菌素A(BFA) 组织化学

中国植物标本馆数字化发展的缩影——江苏省中国科学院植物研究所标本馆(NAS)

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广西植物 2022年第S01期42卷 71-86页

作者：刘启新褚晓芳董晓宇惠红周义峰江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)标本馆南京210014

江苏省中国科学院植物研究所标本馆(NAS)是中国最早的植物标本馆之一,也是国内最早开展植物标本数字化的标本馆,其标本数字化发展经历了4个阶段:20世纪80年代后期尝试的标本文字信息数字化的起步阶段;20世纪90年代末的标本图像数字化和... 详细信息

江苏省中国科学院植物研究所标本馆(NAS)是中国最早的植物标本馆之一,也是国内最早开展植物标本数字化的标本馆,其标本数字化发展经历了4个阶段:20世纪80年代后期尝试的标本文字信息数字化的起步阶段;20世纪90年代末的标本图像数字化和文字信息数字化规范阶段;2004年以后的标本批量数字化与信息网络共享快速发展阶段;2018年后的标本数字化信息维护与优化阶段。这一过程集中代表和反映了中国植物标本数字化的发展历程。此外,近年来开始了发掘和利用江苏植物标本的数字化信息工作,包括建设江苏省级数字植物标本馆、开发江苏省维管植物标本时空分布可视化系统、开展标本采集-入库过程数字化等。今后,将不断深化标本数字化的工作,以期形成有NAS特色的数字化植物标本馆。

关键词：江苏省植物标本标本图像标本信息数字化数据库

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海金沙卵发生的组织化学研究

植物研究 2022年第3期42卷 352-357页

作者：郭严冬张明霞周义峰戴锡玲王全喜曹建国江苏省中国科学院植物研究所南京210014 上海师范大学生命科学学院上海200234

采用组织化学方法对海金沙(Lygodium japonicum(Thunb.)Sw.)卵发生进行了研究。高碘酸-锡夫反应(PAS反应)结果显示:颈沟和腹沟细胞外产生的黏性物质为多糖类物质;在卵细胞发生早期颈卵器细胞内均含有质体,且淀粉粒含量丰富,随着颈卵器... 详细信息

采用组织化学方法对海金沙(Lygodium japonicum(Thunb.)Sw.)卵发生进行了研究。高碘酸-锡夫反应(PAS反应)结果显示:颈沟和腹沟细胞外产生的黏性物质为多糖类物质;在卵细胞发生早期颈卵器细胞内均含有质体,且淀粉粒含量丰富,随着颈卵器的发育,卵细胞以及颈沟和腹沟细胞内淀粉粒数量和体积均逐渐减少,最后退化消失。苏丹黑B反应结果显示:海金沙颈沟和腹沟细胞外产生的黏性物质也含有脂类物质,而卵细胞内并未有明显脂类物质产生;卵细胞质膜处也并没有糖类或脂类物质的积累。本研究从组织化学角度佐证了海金沙的特殊性,即既有原始蕨类的特征,又有进化蕨类的特征。

关键词：海金沙卵发生组织化学 PAS反应苏丹黑B反应

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白芍的原植物鉴定及药材形态观察

中药材 2005年第10期28卷 18-20页

作者：周义峰杭悦宇陈丙銮江苏省中国科学院植物研究所江苏省植物迁地保护重点实验室南京210014

对我国10个主产区的不同类型白芍原植物及药材,制作标本,进行形态鉴别。结果表明,我国主产区白芍原植物为芍药Paeonia lactifloraPall.和毛果芍药***(Bunge)Stern。前者的药材,呈圆柱形,表面类白色至红棕色,有纵皱纹及细根痕,偶有残存... 详细信息

对我国10个主产区的不同类型白芍原植物及药材,制作标本,进行形态鉴别。结果表明,我国主产区白芍原植物为芍药Paeonia lactifloraPall.和毛果芍药***(Bunge)Stern。前者的药材,呈圆柱形,表面类白色至红棕色,有纵皱纹及细根痕,偶有残存的棕褐色外皮。断面较平坦,类白色或微棕红色,木质部具有放射状纹理,味酸;后者的药材,多呈长条形,外皮棕色,断面粉性足,味甘。

关键词：白芍原植物鉴定药材形态

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四川省甘孜州林火分布格局及预测模型研究

四川省甘孜州林火分布格局及预测模型研究

作者：周义峰成都理工大学

学位级别：硕士

近年来,随着全球气候变暖,世界多地出现炎热和干旱的极端天气,异常的气候变化导致森林火灾频发,加剧了地球生态环境的恶化。而大量事实表明,这些年的气候变化跟人类的生产生活密不可分,现代工业化在给人类带来福音的同时也排放了大量的... 详细信息

近年来,随着全球气候变暖,世界多地出现炎热和干旱的极端天气,异常的气候变化导致森林火灾频发,加剧了地球生态环境的恶化。而大量事实表明,这些年的气候变化跟人类的生产生活密不可分,现代工业化在给人类带来福音的同时也排放了大量的二氧化碳、氟,使温室效应日益严重。如何有效地开展森林火灾分析和预测研究,最大程度地减少林火带来的损失已经成为国内外学者关注的热点。甘孜州位于四川省西部,森林资源丰富,植被覆盖多样化,但受其独特的地理和气候条件影响,也是森林火灾的高发区。本研究基于甘孜州2005-2019年MODIS火产品数据、地形数据、林区植被数据和气象数据等,在Arc GIS、SPSS、R语言等软件的基础上,利用数理统计和空间自相关分析方法,深入探讨了甘孜州林火时空分布规律,并将森林火点分别与地形、植被、人为、气象数据叠加分析,研究不同驱动因素对林火的影响力。同时采用国际普遍使用的二项式逻辑斯蒂回归、泊松回归、负二项回归模型以及精度检验方法,对甘孜州分别从年尺度和月尺度进行不同角度的林火预测,为林火预测预报提供了科学依据和理论参考,具有重要的研究意义。本文的研究结论如下:（1）甘孜州近15年森林火灾次数年际变化整体上波动起伏,2012和2013年这两年发生较多,此后随年份增加呈缓慢下降的趋势,春冬两季是甘孜州林火的高发期,1月到4月火灾发生的次数要远大于其余月份。从地域分布上看,甘孜州各个县市均有林火发生且具有一定的聚集性,九龙县和康定县是发生次数较多的地区。甘孜州的林火大多是由人为因素导致,道路和河流在一定程度上能影响林火的分布。海拔为4010-4560m的林区是火灾高发区,林火在各个坡向上的分布较为均匀,但主要集中在0-18°的缓坡地段。甘孜州林火的可燃物植被类型主要是针叶林和灌丛,不同的气候环境在一定程度上也影响着林火风险的大小。（2）基于火点与随机非火点1:1.5的比例,采用二项式逻辑斯蒂回归模型在SPSS中对赋予0和1的甘孜州林火发生结果与气象因子、地形因子、植被因子、人为因子等13种因子进行建模分析,结果表明年降水量、年均日照时数、年均气温、年均风速、年均气压、高程以及人口密度与甘孜州林火发生有显著的相关性,其中气象因素占主导地位,模型精度为72.3%,预测效果较好。根据预测结果实现了甘孜州森林火险等级区划,结果表明甘孜州的北部为低风险区,中高风险区主要集中在南部以及东南部。（3）考虑到林火发生具有聚集性、部分县市林火次数0值过多、整体离散程度较大的特点,采用Poisson回归、负二项回归、零膨胀Poisson回归、零膨胀负二项回归模型在R语言中从月尺度上分析甘孜州林火发生次数与气象因子的关系,并运用Vuong检验、AIC准则两种方法检验模型精度。结果显示,零膨胀负二项模型预测效果较另外三个更好,是甘孜州林火次数的最优预测模型。

关键词：森林火灾甘孜州预测模型林火分布格局驱动因素

盾叶薯蓣航天诱变种子实生苗的生物学特性和有效成分测定

同方学位论文库评论

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同方学位论文库

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中国中药杂志 2009年第14期34卷 1773-1777页

作者：吴宝成周义峰杭悦宇江苏省中国科学院植物研究所江苏省植物迁地保护重点实验室江苏南京210014

目的:筛选优质盾叶薯蓣种质资源,探讨卫星搭载对盾叶薯蓣变异效应。方法:利用返回式卫星搭载盾叶薯蓣种子进行空间诱变处理,对空间诱变后的2个居群盾叶薯蓣的种子活力、植株生长、染色体以及薯蓣皂苷元含量进行研究。结果:空间诱变后种... 详细信息

目的:筛选优质盾叶薯蓣种质资源,探讨卫星搭载对盾叶薯蓣变异效应。方法:利用返回式卫星搭载盾叶薯蓣种子进行空间诱变处理,对空间诱变后的2个居群盾叶薯蓣的种子活力、植株生长、染色体以及薯蓣皂苷元含量进行研究。结果:空间诱变后种子表现为萌发提前,但对种子发芽率影响不明显,出现非整倍体和染色体加倍现象,二年生根状茎鲜重和薯蓣皂苷元含量显著高于对照,但三年生根状茎增重变缓,同时薯蓣皂苷元含量均有不同程度下降。结论:卫星搭载对盾叶薯蓣的种子活力有一定的促进作用,同时改变了染色体结构,二年生根状茎鲜重和薯蓣皂苷元含量显著高于对照,提供了良好的选育材料,但三年生的根状茎鲜重增长变缓,薯蓣皂苷元有下降趋势,有待进一步研究。

关键词：盾叶薯蓣空间诱变变异薯蓣皂苷元

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薯蓣属马肠薯蓣的分类修订

植物资源与环境学报 2018年第3期27卷 118-120页

作者：周义峰陈闽孙小芹杭悦宇江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园) 江苏南京210014 江苏省农业种质资源保护与利用平台江苏南京210014

马肠薯蓣（Dioscorea simulans Prain et Burkill）隶属于薯蓣科（Dioscoreaceae）薯蓣属（Dioscorea Linn.）根状茎组（*** Uline）^（[1]）278。Prain等^（[2]）根据1928年秦仁昌采自广西罗城县大林山的标本（秦仁昌5319,5335）命名马肠薯蓣,并建立*** Prain et Burkill^（[3]）,将马肠薯蓣归入该组。该组地上茎几乎不分枝,左旋;叶3裂,无毛;雄花簇生成小伞状或总状,花被片呈轮状排列;花药6枚,3大、3小;雌花花被片呈轮状排列,总状花序。

关键词：马肠薯蓣 Sect.Illigerestrum Prain et Burkill 分类修订

双溶剂浸渍法制备VO_x/MCF催化剂及丙烷选择氧化

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分子催化 2012年第2期26卷 127-134页

作者：裴素朋周义峰岳斌钱林平叶林贺鹤勇上海应用技术学院化学与环境工程学院上海200235 复旦大学化学系上海200433

采用双溶剂法制备了负载型氧化钒类催化剂(VOx/MCF),N2物理吸附、X射线衍射、透射电镜、拉曼光谱、程序升温脱附、程序升温还原等系统研究了催化剂的物化性质并测试了其在丙烷选择氧化反应中的催化性能.结果表明,由双溶剂法制备的VOx/MC... 详细信息

采用双溶剂法制备了负载型氧化钒类催化剂(VOx/MCF),N2物理吸附、X射线衍射、透射电镜、拉曼光谱、程序升温脱附、程序升温还原等系统研究了催化剂的物化性质并测试了其在丙烷选择氧化反应中的催化性能.结果表明,由双溶剂法制备的VOx/MCF催化剂具有较好的催化活性,且在氧化钒负载量基本一致的前提下,双溶剂法制备的VOx/MCF催化剂比普通浸渍法制备的VOx/MCF具有更高的催化活性,这与双溶剂法的制备过程可以使得钒物种尽可能进入载体内表面,有利于氧化钒的较好分散有关,而高度分散的氧化钒物种,正是丙烷选择氧化反应的活性中心.

关键词：双溶剂 VOx/MCF 高分散丙烷选择性氧化