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高黏性肺炎克雷伯菌毒力血清型、毒力基因以及耐药性研究

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中国卫生检验杂志 2022年第13期32卷 1571-1574页

作者：吴翰欣张静郑春梅汉中市中心医院检验科陕西汉中723000 汉中市中心医院精准医学诊断中心陕西汉中723000

目的分析某地区高黏性肺炎克雷伯菌(hm KP)毒力基因、血清分型、耐药性特征,为肺炎克雷伯菌的临床诊断以及治疗提供参考依据。方法收集本院2020年-2021年被鉴定为肺炎克雷伯菌的临床细菌样本,通过拉丝实验初步筛选出hm KP样本,利用PC... 详细信息

目的分析某地区高黏性肺炎克雷伯菌(hm KP)毒力基因、血清分型、耐药性特征,为肺炎克雷伯菌的临床诊断以及治疗提供参考依据。方法收集本院2020年-2021年被鉴定为肺炎克雷伯菌的临床细菌样本,通过拉丝实验初步筛选出hm KP样本,利用PCR技术对其毒力基因peg344、iro B、iuc A、prmp A和prmp A2以及血清分型K1、K2型进行扩增检测,并统计相关临床耐药数据进行分析。结果 K1型检出率为31%(15/49),K2型检出率为18%(9/49)。毒力基因iro B以及peg344检出率为96%(47/49),iuc A检出率为90%(44/49),rmp A检出率为83%(41/49),rmp A2检出率为57%(28/49),其中5种毒力基因均表达hm KP为38%(19/49)。毒力基因rpm A以及rpm A2在高毒力肺炎克雷伯菌检出高于高黏性肺炎克雷伯菌(P 0.05)。高毒力肺炎克雷伯菌中1例出现对头孢吡肟耐药;1例对环丙沙星耐药;1例对阿莫西林、头孢唑林、头孢噻肟、氨曲南以及氯霉素多重耐药,其余菌株均对大多数抗生素敏感;高黏性肺炎克雷伯菌出现1例对复方新诺明耐药。结论 2020年-2021年本院肺炎克雷伯菌血清型主要为K1型,高毒力肺炎克雷伯菌中毒力基因rpm A以及rpm A2检出率更高,对临床常用的抗菌药耐药率较低。

关键词：肺炎克雷伯菌高毒力高黏性流行病学

hsa-miR-22-3p和hsa-miR-671-5p靶标基因的预测及其与癌症患者生存率的相关性

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中国生物制品学杂志 2018年第6期31卷 591-597页

作者：李明阳马春霞吴翰欣吴小海俞建昆马千里中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所中心实验室云南昆明650118 昆明医科大学附属第二医院检验科云南昆明650000 昆明医科大学第三附属医院/云南省肿瘤医院胸外科云南昆明650118

目的通过生物信息学方法预测在m6A去甲基化酶FTO敲低处理后,存在m6A修饰并显著下调的mi RNA(hsa-mi R-22-3p和hsa-mi R-671-5p)的靶标基因,并分析它们与癌症患者生存率的相关性。方法利用在线数据库寻找目标mi RNAs的靶基因,并通过基因... 详细信息

目的通过生物信息学方法预测在m6A去甲基化酶FTO敲低处理后,存在m6A修饰并显著下调的mi RNA(hsa-mi R-22-3p和hsa-mi R-671-5p)的靶标基因,并分析它们与癌症患者生存率的相关性。方法利用在线数据库寻找目标mi RNAs的靶基因,并通过基因功能(gene ontology,GO)和信号通路数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对这些靶基因的分子功能(molecular function,MF)、生物过程(biological processes,BP)、细胞组分(cell component,CC)定位以及参与的信号通路进行分析;通过蛋白质互作网络(protein-protein interaction,PPI)筛选出核心基因,并分析它们与癌症患者生存率之间的相关性。结果 hsa-mi R-22-3p和hsa-mi R-671-5p共有198个相同的靶标基因;GO分析结果表明,这些靶基因在生物过程中显著丰富,包括肌动蛋白细胞骨架组织、神经元干细胞群维持、对尼古丁的行为反应;对于分子功能,这些靶点富含锌离子结合、蛋白质结构域特异性结合、核心启动子序列特异性DNA结合;细胞成分定位分析还显示,这些靶标在高尔基体的早期内体,细胞连接和整体成分中显著丰富;KEGG通路分析显示,这些交叉基因靶点在非小细胞肺癌、癌症中的胆碱代谢和粘蛋白型聚糖生物合成途径中富集;基于网络的工具分析显示,hsa-mi R-22-3p和hsa-mi R-671-5p已经它们的核心靶标基因RHOU和UNC5B与肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma,KIRC)、肝癌(liver hepatocellular carcinoma,LIHC)、肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)、低级胶质瘤(low-grade gliomas,LGG)、胃癌(stomach adenocarcinoma,STAD)、卵巢癌(ovarian serous cystadenocarcinoma,OV)、肉瘤(sarcoma,SARC)、膀胱癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)、皮肤癌(skin cutaneous melanoma,SKCM)、乳头状肾细胞癌(kidney renal papillary cell carcinoma,KIRP)和乳腺癌(breast invasive carcinoma,BRCA)等11种癌症有关。结论当去甲基化酶FTO被敲低或处于低活动水平时,一些mi RNA和基因可能在癌症中发挥不同的作用,也有可能成为治疗癌症的新的核酸靶点。

关键词： m6A去甲基化酶微小RNA 生物信息学分析癌症生存率

PI-RADS评分诊断不同PSA水平前列腺癌的准确率分析

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海军军医大学学报 2024年

作者：吴翰昌刘芳马超汪剑海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院放射诊断科

目的探讨在不同前列腺特异性抗原（PSA）水平基础上，PI-RADS评分诊断前列腺癌（PCa）的准确性。方法选择2017年1月至2023年6月于海军军医大学（第二军医大学）第一附属医院行多参数磁共振（mp-MRI）扫描并行前列腺穿刺活检术取得病... 详细信息

目的探讨在不同前列腺特异性抗原（PSA）水平基础上，PI-RADS评分诊断前列腺癌（PCa）的准确性。方法选择2017年1月至2023年6月于海军军医大学（第二军医大学）第一附属医院行多参数磁共振（mp-MRI）扫描并行前列腺穿刺活检术取得病理证实的患者，对所有患者的血清总PSA（t-PSA）、游离PSA（f-PSA）、f-PSA与t-PSA比值（f/tPSA）及PI-RADS评分进行汇总。以穿刺病理作为金标准，在不同PSA水平，分析PI-RADS评分在PCa诊断中的准确率。结果共计纳入2 526例患者，根据PSA水平将患者分为≤4 ng/mL、4 ng/mL＜PSA≤10 ng/mL（f/tPSA≥0.16）、4 ng/mL＜PSA≤10ng/mL（f/tPSA＜0.16）、10 ng/mL＜PSA≤20 ng/mL、20 ng/mL＜PSA≤50 ng/mL、50 ng/mL＜PSA≤100 ng/mL、＞100 ng/mL共7组。在全部患者中，PI-RADS≥3诊断PCa敏感度达0.90，准确率达0.80，优于PI-RADS≥4（敏感度0.67，准确率0.82）。PSA≤4 ng/mL时，PI-RADS≥4的准确率高于PI-RADS≥3（0.88vs0.64）；随着PSA水平的升高，PI-RADS≥4和PI-RADS≥3的诊断准确率逐渐上升并趋同，在50 ng/m＜PSA≤100 ng/mL时，分别两者的诊断准确率分别为0.92和0.91。结论在较高PSA水平时，PI-RADS评分诊断PCa的准确率更高，可减少患者的非必要穿刺。

关键词：前列腺癌 PI-RADS评分前列腺特异性抗原前列腺穿刺活检准确率

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第二相对铝硅铸造合金蠕变性能的影响

第二相对铝硅铸造合金蠕变性能的影响

作者：吴翰丰西安工业大学

学位级别：硕士

铝硅系合金是一种广泛应用的有色金属材料,其蠕变性能对于材料的高温服役寿命至关重要。目前对铝合金蠕变性能的研究大多局限于对蠕变宏观行为的分析,而对材料微观组织的考虑相对较少。本研究利用实验与仿真结合的方法,通过对Al-Si合金... 详细信息

铝硅系合金是一种广泛应用的有色金属材料,其蠕变性能对于材料的高温服役寿命至关重要。目前对铝合金蠕变性能的研究大多局限于对蠕变宏观行为的分析,而对材料微观组织的考虑相对较少。本研究利用实验与仿真结合的方法,通过对Al-Si合金的微观组织进行建模,利用有限元法分析模型的蠕变性能,并结合蠕变试验结果,为提高材料的蠕变性能提供依据。本文主要研究内容及结论如下:本文通过机械搅拌法制备了变质处理以及未变质的Al-12Si-4.5Cu合金,发现加入Al-10Sr变质剂后的金相照片中共晶硅较细,棒状共晶硅细化为短棒及粒状,T6热处理后块状初生硅棱角发生钝化,共晶硅熔断及球化,由长针状转为球状。通过蠕变试验研究了变质前后Al-12Si-4.5Cu合金的蠕变性能,进一步分析了变质前后Al-12Si-4.5Cu合金的蠕变机制。研究显示:在已有实验温度和应力条件下,未变质处理的Al-12Si-4.5Cu合金均展现出更好的蠕变性能,具体表现为更高的蠕变应变率、更低的稳态蠕变速率以及更长的蠕变寿命。变质前后两种材料的蠕变拉伸断口形貌均呈现出韧窝穿晶型断裂。两种材料的断裂机制主要以微孔聚集型断裂为主导。250℃下未变质Al-12Si-4.5Cu合金和变质Al-12Si-4.5Cu合金的应力指数n分别为6.53和6.87,对应的蠕变机制为低温高应力条件下的位错攀移蠕变。350℃下未变质Al-12Si-4.5Cu合金和变质Al-12Si-4.5Cu合金的应力指数n分别为3.92和3.62,对应位错滑移蠕变机制。利用Pro E构建出与金相照片一致的二维实际模型;对金相照片进行矢量化,利用Digimat-FE构造出抽象模型,通过Ansys Workbench对模型进行蠕变有限元分析,并与实验结果对照验证其可行性。蠕变有限元结果表明,在350℃,20MPa下,未变质Al-12Si-4.5Cu合金的稳态蠕变速率为4.37E-7s-1,变质Al-12Si-4.5Cu合金的稳态蠕变速率为5.39E-7s-1,未变质Al-12Si-4.5Cu合金的稳态蠕变速率比变质Al-12Si-4.5Cu合金的稳态蠕变速率低18.9%。实际模型和抽象模型体现出相同的结果:在所有应力条件下未变质模型的稳态蠕变速率均小于变质模型,与实验结果吻合。在此基础上,构建出Al-Si合金的二维和三维RVE模型,探究Si相的含量、取向、长径比、细化程度、偏聚程度以及形状对Al-Si合金的蠕变性能的影响;构建了颗粒增强Al-Si合金的模型,探究颗粒种类、含量以及混杂颗粒对颗粒增强Al-Si合金蠕变性能的影响。结果表明,在二维模型中Si相含量的增加、Si相取向垂直于应力方向、Si相长径比较小以及Si相颗粒均匀分布有助于提高Al-Si合金的蠕变性能。在三维模型中片状Si相模型相较于棒状Si相模型和球状Si相模型表现出更低的等效蠕变应变量,且其稳态蠕变速率较其他两种形状显著降低,具有更好的蠕变性能。在颗粒增强Al-Si合金模型中,添加Ti B2和SiC颗粒可以有效降低基体的平均等效应力和稳态蠕变速率,随着颗粒含量的增加,合金的蠕变性能得到进一步改善。特别是在Ti B2和SiC颗粒协同增强的模型中,具有更低的等效蠕变应变和稳态蠕变速率,表明颗粒的协同作用对提高合金的蠕变性能具有显著效果。

关键词：蠕变性能稳态蠕变速率有限元模拟 Al-Si合金

基于知识辅助深度强化学习的巡飞弹组动态突防决策

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兵工学报 2024年第9期45卷 3161-3176页

作者：孙浩黎海青梁彦马超雄吴翰西北工业大学自动化学院陕西西安710072 西安现代控制技术研究所陕西西安710065

巡飞弹组(Loitering Munition Group,LMG)突防控制决策是提高巡飞弹群组作战自主性与智能性的关键。针对存在截击拦截器和临机防空火力区的动态环境中弹组突防机动指令在线生成困难的问题,提出一种基于知识辅助强化学习方法的LMG突防控... 详细信息

巡飞弹组(Loitering Munition Group,LMG)突防控制决策是提高巡飞弹群组作战自主性与智能性的关键。针对存在截击拦截器和临机防空火力区的动态环境中弹组突防机动指令在线生成困难的问题,提出一种基于知识辅助强化学习方法的LMG突防控制决策算法。结合领域知识、规则知识改进状态空间和回报函数设计提高算法泛化能力与训练收敛速度。构建基于软动作-评价方法的LMG突防控制决策框架,以提高算法探索效率。利用专家经验和模仿学习方法改善多弹多威胁带来的解空间狭窄、算法初始高效训练经验匮乏的问题。实验结果表明,新算法能够在动态环境中实时生成有效的突防机动指令,相较于对比方法效果更好,验证了算法的有效性。

关键词：巡飞弹组知识辅助深度强化学习 Soft Actor-Critic算法动态环境突防控制决策

基于双参数磁共振人工智能模型在前列腺癌诊断中的研究

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基于双参数磁共振人工智能模型在前列腺癌诊断中的研究

作者：吴翰昌中国人民解放军海军军医大学

学位级别：硕士

第一部分基于双参数磁共振成像前列腺癌人工智能诊断模型的建立与验证目的:开发基于双参数磁共振成像的人工智能诊断模型,提高前列腺癌的诊断准确率。方法:本项研究对海军军医大学第一附属医院在2016年8月至2023年6月期间接收的2046名... 详细信息

第一部分基于双参数磁共振成像前列腺癌人工智能诊断模型的建立与验证目的:开发基于双参数磁共振成像的人工智能诊断模型,提高前列腺癌的诊断准确率。方法:本项研究对海军军医大学第一附属医院在2016年8月至2023年6月期间接收的2046名经过穿刺病理确认并在手术前8周进行双参数磁共振(bi-parametric magnetic resonance imaging,bp-MRI)检查的患者进行了回顾性分析,按照时间顺序将病例以7:3的比例分为训练集和验证集,同时收集虹口411医院75例及上海市浦东医院171例的数据作为外部测试集。两名放射科医生根据事先定义的标准对MRI图像进行勾画,采用深度学习u-net算法进行前列腺癌病灶的分割,Har DNet算法对病灶进行分类,最终建立人工智能(Artificial intelligence,AI)模型诊断临床显著性前列腺癌(Clinically significant prostate cancer,cs Pca)。计算受试者操作特征的曲线下面积(Area under the curve,AUC)、敏感度和特异度、阳性预测值、阴性预测值来评价模型之间的诊断性能。结果:纳入3个中心共计2292例患者,其中cs Pca阳性组患者1432例,cs Pca阴性组患者860例。构建的AI模型实现诊断cs Pca的AUC值在训练集、验证集、测试集1、测试集2分别为0.89(95%可信区间[CI]:0.87,0.91)、0.86(95%CI:0.83,0.90)、0.86(95%CI:0.77,0.95)、0.81(95%CI:0.73,0.88)。使用AI模型对医生诊断PI-RADS≤3分的患者进一步筛查,建立了AI辅助诊断模型。实现诊断cs Pca的AUC值在训练集、验证集、测试集1、测试集2中分别为0.88(95%CI:0.86,0.90)、0.84(95%CI:0.80,0.88)、0.88(95%CI:0.80,0.97)、0.85(95%CI:0.78,0.93)。对比医生PI-RADS诊断,AI辅助可以将cs Pca的检出率提高14.99%、9.8%、7.7%、17.21%。结论:基于双参数磁共振构建的AI辅助诊断模型可以准确的检测cs Pca,提高医生诊断前列腺癌的准确率。第二部分构建基于双参数磁共振成像人工智能模型预测前列腺癌包膜侵犯目的:开发基于双参数磁共振成像的人工智能模型,协助医生诊断前列腺癌包膜侵犯,提高诊断准确率。方法:回顾性分析海军军医大学第一附属医院收治的经过前列腺根治性切除术证实的778名前列腺癌患者的临床参数及影像学资料,按照时间顺序分为训练集和验证集,另外收集28名来自虹口411医院的病例进行验证。建立一个分类和分割集成AI模型,先采用第一部分研究训练的U-net算法对病灶及前列腺包膜进行分割,再采用Har DNet算法判断是否发生前列腺包膜侵犯(Extracapsular extension,ECE)。医生依据欧洲泌尿生殖放射学会(European Society of Genitourinary Radiology,ESUR)的诊断标准评估所有前列腺癌患者是否发生ECE。联合模型为AI模型联合PSA以及医生ESUR评分的多因素logistics回归模型。模型效能评估采用AUC、敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值。临床应用采用决策曲线评估。分类净重改善指数(Net reclassification improvement,NRI)和综合判别改善指数(Integrated Discrimination Improvement,IDI)展示联合模型较AI模型的净收益。结果:共有806名前列腺癌病人被纳入研究,其中ECE阳性组328例,ECE阴性组476例。构建的AI模型实现诊断ECE的AUC值在训练集、验证集和测试集分别为0.80(95%CI:0.77,0.84)、0.70(95%CI:0.62,0.78)、0.84(95%CI:0.69,0.98),放射科医生使用ESUR评分诊断包膜侵犯的效能,AUC值分别为0.67(95%CI:0.62,0.71)、0.71(95%CI:0.63,0.79)、0.71(95%CI:0.51,0.92)。通过进一步结合医生ESUR评分和PSA构建多因素logistics回归模型,本研究最终建立了AI联合诊断模型,实现诊断ECE的AUC值为0.82(95%CI:0.79,0.86)、0.77(95%CI:0.70,0.84)、0.83(95%CI:0.68,0.98),优于放射科医生使用ESUR评分诊断包膜侵犯的效能,Delong检验显示差异具有统计学意义(p值<0.01)。决策曲线表明,在联合模型中

关键词：双参数磁共振深度学习前列腺癌人工智能前列腺特异性抗原前列腺癌包膜侵犯深度学习前列腺特异性抗原

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我国农民工群体阅读困境及其原因与应对策略

出版发行研究 2024年第6期 88-95,111页

作者：田菲谷征吴翰洁中国新闻出版研究院北京印刷学院新闻传播学院

我国农民工群体的阅读困境主要体现为以下三个矛盾:农民工群体阅读重要性认知程度较高与自身及其子女实际阅读量较低之间的矛盾;数字化阅读的参与度和倾向性较高与纸质书阅读情况堪忧的矛盾;农民工群体对公共阅读空间和设施及全民阅读... 详细信息

我国农民工群体的阅读困境主要体现为以下三个矛盾:农民工群体阅读重要性认知程度较高与自身及其子女实际阅读量较低之间的矛盾;数字化阅读的参与度和倾向性较高与纸质书阅读情况堪忧的矛盾;农民工群体对公共阅读空间和设施及全民阅读活动日益凸显的需求与实际服务供给不足、宣传不到位之间的矛盾。在分析产生这些困境的原因的基础上,文章提出应进一步完善保障农民工阅读的法规条款;引导农民工群体走进阅读空间;丰富农民工群体的阅读活动;关注农民工子女阅读需求,创建良好的家庭阅读氛围等应对策略。

关键词：农民工阅读全民阅读阅读保障

鼻咽癌组织中基因差异表达及蛋白互作网络分析

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生物技术通讯 2018年第3期29卷 345-350页

作者：李明阳马春霞吴翰欣吴小海俞建昆中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所中心实验室云南昆明650118 昆明医科大学附属第二医院云南昆明650118

目的:利用生物信息学方法从鼻咽癌组织基因芯片中筛选差异表达基因,并分析它们之间的互相作用。方法:利用R语言程序包等相关软件分析鼻咽癌组织和正常组织中差异表达的基因,并对其进行在线GO分析、KEGG富集分析及蛋白互作分析。结果:从2... 详细信息

目的:利用生物信息学方法从鼻咽癌组织基因芯片中筛选差异表达基因,并分析它们之间的互相作用。方法:利用R语言程序包等相关软件分析鼻咽癌组织和正常组织中差异表达的基因,并对其进行在线GO分析、KEGG富集分析及蛋白互作分析。结果:从25例鼻咽癌组织样本和3例正常组织对照样本中共分析出1103个差异表达基因,包括600个上调基因和503个下调基因(P<0.05)。GO分析结果显示,差异表达基因在生物过程中显著富集,包括细胞分裂、DNA复制、G1/S有丝分裂细胞周期的转变和有丝分裂核分裂;在分子功能中,包括与蛋白质结合、与ATP结合、蛋白同二聚化活性、与DNA复制起点结合以及与受损的DNA结合;在细胞组分中,包括细胞质、核质、胞外体和船体中部。KEGG通路分析显示,差异表达基因在细胞周期、DNA复制、癌症途径、p53信号通路、错配修复、小细胞肺癌、卵母细胞减数分裂、氨基糖和核苷酸糖代谢、基部切除修复和人T淋巴细胞病毒(HTLV-Ⅰ)感染等信号通路中显著富集。在蛋白互作分析网络中筛选出10个节点度最高核心基因CDC45、MCM10、MCM3、MCM5、MCM2、CDC7、CDT1、CDC6、SMC2和NCAPG。结论:通过鼻咽癌组织和正常组织的对比筛选,发现多个基因表达发生变化,为相关临床研究提供了重要的信息基础。

关键词：鼻咽癌差异表达基因生物信息学蛋白质相互作用

EB病毒再激活后鼻咽癌细胞系中基因表达差异分析

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生物技术通讯 2018年第4期29卷 471-476页

目的:利用生物信息学方法从EB病毒再激活的鼻咽癌细胞系基因表达谱中筛选差异表达基因,并分析它们之间的互相作用关系。方法:利用edg R包等相关软件从基因表达谱中筛选差异表达的基因,分析它们之间的互相作用关系,并对其进行在线GO分析... 详细信息

目的:利用生物信息学方法从EB病毒再激活的鼻咽癌细胞系基因表达谱中筛选差异表达基因,并分析它们之间的互相作用关系。方法:利用edg R包等相关软件从基因表达谱中筛选差异表达的基因,分析它们之间的互相作用关系,并对其进行在线GO分析、KEGG富集分析及蛋白互作分析。结果:共筛选出4496个差异表达基因,包括1954个上调基因和2542个下调基因。GO分析结果显示,差异表达基因在生物过程(BP)中显著富集,包括病毒应答、Ⅰ型干扰素信号通路、γ干扰素介导的信号传导途径、病毒防御反应、胆固醇生物合成过程、氧化还原过程、类异戊二烯生物合成过程、类固醇代谢过程、脂质代谢过程和花生四烯酸代谢过程;在分子功能(MF)中,包括丝氨酸型内肽酶活性、蛋白同二聚化活性、醛脱氢酶(NAD)活性、氧气结合、3-氯烯丙基醛脱氢酶活性、血红素结合、谷胱甘肽转移酶活性、氧化还原酶活性、铁离子结合和药物结合;在细胞组分(CC)中,包括胞外体、细胞质、细胞器膜、基底外侧质膜、胞外空间、内质网膜、内质网、过氧化物酶体、线粒体、顶端质膜。KEGG通路分析显示,差异表达基因在代谢途径、抗生素生物合成、萜类骨架生物合成、化学致癌作用、丙型肝炎、胆汁分泌、细胞色素P450代谢外源性物质、氨基酸生物合成、类固醇生物合成、精氨酸和脯氨酸代谢等信号通路中显著富集。在蛋白互作分析网络中筛选出10个节点度最高的核心基因MAPK3、IRF7、IRF9、IFI6、TRIM22、IFI27、OAS2、TRIM31、HLA-F和MX1。结论:通过基因芯片对比筛选,EB病毒经化学物质再激活后引起宿主细胞多个基因表达发生变化,为相关临床研究提供了重要的信息基础。

关键词： EB病毒鼻咽癌生物信息学蛋白质相互作用