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通过单细胞转录组测序分析皮肤鳞状细胞癌肿瘤微环境

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通过单细胞转录组测序分析皮肤鳞状细胞癌肿瘤微环境

作者：吴亦琳北京协和医学院

学位级别：硕士

背景皮肤鳞状细胞癌（cutaneous squamous cell carcinoma,CSCC）是一种起源于角质形成细胞的恶性肿瘤,是世界上最常见的非黑色素瘤皮肤癌之一。目前对于CSCC虽然有大量的研究,但是大多基于肿瘤整体水平,对肿瘤的异质性研究非常有限。... 详细信息

背景皮肤鳞状细胞癌（cutaneous squamous cell carcinoma,CSCC）是一种起源于角质形成细胞的恶性肿瘤,是世界上最常见的非黑色素瘤皮肤癌之一。目前对于CSCC虽然有大量的研究,但是大多基于肿瘤整体水平,对肿瘤的异质性研究非常有限。但是在肿瘤的治疗过程中,治疗的有效性经常受到肿瘤的克隆异质性的制约。单细胞转录组测序技术能够帮助我们在单细胞水平对肿瘤内的细胞亚群类型进行研究。本研究旨在通过单细胞转录组测序技术对CSCC和癌旁组织的mRNA进行测序后,进行生物信息分析,探究CSCC与癌旁组织间的细胞异质性、肿瘤微环境差异,以探寻CSCC发病可能存在的机制。方法1.选取符合典型CSCC诊断的患者CSCC肿瘤组织和对应癌旁组织各1例,制备成单细胞悬液;2.使用10x genomics单细胞转录组测序平台对单细胞悬液样本分别进行转录组测序,对获得的原始数据进行统计、过滤、质控;3.对比肿瘤组织和癌旁组织,筛选出差异表达基因并对细胞群进行细胞聚类分群;4.根据细胞亚群表达的基因进行细胞亚群鉴定、合并同类亚群;5.进一步对肿瘤细胞含量高的细胞亚群的差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析。结果1.将合格的测序结果过滤、去批次效应、降维后共分离出20个细胞亚群;2.根据细胞亚群的标记基因对细胞类型注释后得到1 1个细胞亚群,分别是T细胞亚群、B细胞亚群、树突状细胞亚群、内皮细胞亚群、上皮细胞亚群、成纤维细胞亚群、单核细胞亚群、髓源性抑制细胞亚群、肥大细胞亚群、巨噬细胞亚群、黑素细胞亚群;CSCC组和癌旁组细胞亚群类型无明显差异,细胞子亚群类型及细胞比例有明显差异,特别是T细胞亚群、内皮细胞亚群、成纤维细胞亚群;3.对CSCC组中含量比较高的3个细胞亚群的差异基因进行GO富集分析发现这3个细胞亚群主要涉及到血管生成调节、免疫反应的调控及细胞外基质的功能,KEGG富集分析提示可能它们与PI3K-Akt信号通路高度相关。结论1.CSCC肿瘤组织和癌旁组织细胞亚群类型大致一致,但是细胞子亚群比例有明显差别。2.在CSCC发生发展中可能涉及复杂的免疫过程。3.成纤维细胞可能在肿瘤发生过程中发挥重要的作用。4.PI3K-Akt信号通路可能影响这些细胞亚群的功能来参与到CSCC发展过程中的免疫调控异常和血管重塑,从而影响CSCC的发展。

关键词：皮肤鳞状细胞癌 CSCC 单细胞转录组测序肿瘤微环境

人乳头状瘤病毒16 E6/E7基因稳定表达的永生化角质形成细胞的建立及鉴定

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中华皮肤科杂志 2022年第6期55卷 501-507页

作者：许翠何勇吴亦琳吕群李黎明蒋明军南京大学医学院附属鼓楼医院皮肤性病科南京210008 中国医学科学院、北京协和医学院皮肤病研究所中心实验室南京210042

目的构建人乳头状瘤病毒(HPV)16 E6/E7基因稳定表达的人永生化角质形成细胞(KC),为研究HPV16 E6/E7诱导的细胞永生化及恶性转化机制提供细胞模型。方法两步消化法分离培养原代人包皮角质形成细胞(HFK),利用慢病毒感染技术对细胞稳定转染... 详细信息

目的构建人乳头状瘤病毒(HPV)16 E6/E7基因稳定表达的人永生化角质形成细胞(KC),为研究HPV16 E6/E7诱导的细胞永生化及恶性转化机制提供细胞模型。方法两步消化法分离培养原代人包皮角质形成细胞(HFK),利用慢病毒感染技术对细胞稳定转染HPV16 E6/E7基因,连续培养30代以上,筛选出永生化KC,分为3组:①空白对照组:传代2次的原代HFK;②实验组:传代2次的原代HFK感染LV5-HPV16 E6/E7,感染细胞记录为A0代,感染后以传代次数记录(A1、A2……);③阳性对照组:HPV16阳性宫颈癌细胞SiHa。应用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)、Western印迹实验分别检测空白对照组、实验组、阳性对照组HPV16 E6/E7 mRNA、蛋白及CK14蛋白的表达,CCK-8及Transwell Insert方法检测细胞的增殖及侵袭能力。裸鼠致瘤实验检测实验组A30、阳性对照组SiHa细胞的致瘤能力。结果成功分离原代HFK。LV5-HPV16 E6/E7重组质粒感染原代HFK后,空白对照组细胞无荧光表达,连续传代后出现衰老表现,实验组A30细胞体积、形态较原代HFK无明显变化,且荧光表达率为100%。与空白对照组相比,实验组A1、A10、A20、A30细胞HPV16 E6 mRNA表达水平显著升高(t值分别为7.12、8.07、6.53、5.66;P值分别亦显示无肿瘤形成,裸鼠接种SiHa细胞后可于皮下形成肿瘤。结论通过采用慢病毒技术转染HPV16 E6/E7基因成功建立人永生化角质形成细胞,可作为HPV相关研究中的理想细胞模型。

关键词：人乳头瘤病毒16 角蛋白细胞慢病毒感染细胞系,转化 HPV16 E6/E7

对感染性疾病患儿进行血清降钙素原检测的临床价值分析

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当代医药论丛 2017年第20期15卷 180-181页

作者：吴亦琳苏州大学附属儿童医院江苏苏州215000

目的 :分析对感染性疾病患儿进行血清降钙素原(PCT)检测的临床价值。方法 :将苏州大学附属儿童医院于2016年1月至2017年4月期间收治的92例感染性疾病患儿与同期在该院进行体检的50例健康儿童作为本文的研究对象。将92例感染性疾病患儿中... 详细信息

目的 :分析对感染性疾病患儿进行血清降钙素原(PCT)检测的临床价值。方法 :将苏州大学附属儿童医院于2016年1月至2017年4月期间收治的92例感染性疾病患儿与同期在该院进行体检的50例健康儿童作为本文的研究对象。将92例感染性疾病患儿中的50例细菌感染患儿设为细菌组,将其中的42例病毒感染患儿设为病毒组,将50例健康儿童设为对照组。对这三组儿童均进行PCT、白细胞(WBC)、C反应蛋白(CRP)和中性粒细胞(NE)检测,然后比较其检测的结果。结果 :细菌组患儿PCT、CRP、WBC和NE的水平均高于病毒组患儿和对照组儿童,差异有统计学意义(P<0.05)。细菌组患儿中进行PCT、CRP、WBC和NE检测的结果呈阳性患儿所占的比率均高于病毒组患儿和对照组儿童中进行PCT、CRP、WBC和NE检测的结果呈阳性儿童所占的比率,差异有统计学意义(P<0.05)。在细菌组患儿中,进行PCT检测的结果呈阳性患儿所占的比率高于进行CRP、NE和WBC检测的结果呈阳性患儿所占的比率,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 :对感染性疾病患儿进行PCT检测,能明确其发生感染的类型,可为制定其治疗方案提供依据。

关键词：感染性疾病血清降钙素原细菌感染病毒感染

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线粒体功能紊乱与慢性痛

神经解剖学杂志 2014年第1期30卷 113-116页

作者：郑晨曦涂涛郭保霖吴亦琳罗世成隋秉东董蜀华王亚云第四军医大学人体解剖与组织胚胎学教研室暨梁銶琚脑研究中心西安710032 成都医学院第一附属医院麻醉科成都610500 第四军医大学组织工程研发中心西安710032

线粒体是真核细胞中由双层高度特化的单位膜围成的细胞器，具有多种重要的生理功能。研究表明，线粒体功能紊乱在多种疾病中起作用。疼痛是一种与组织损伤或潜在的损伤相关的不愉快的主观感觉和情感体验，

关键词：线粒体慢性痛电子传递链活性氧通透性转换孔凋亡通路

尿液巨细胞病毒DNA检测在诊断婴幼儿巨细胞病毒感染中的作用评价

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名医 2021年第9期 95-96页

作者：王紫燕吴亦琳朱翌昕周强苏州大学附属儿童医院苏州工业园区疾病控制中心

目的:探究婴幼儿巨细胞病毒感染诊断中尿液巨细胞病毒DNA检测法的作用。方法:选取本院2018年3月至2020年7月收治的40例疑似患有巨细胞病毒感染的婴幼儿为研究对象,对所有患儿行血清巨细胞病毒特异度抗体检测和尿液巨细胞病毒DNA检测。... 详细信息

目的:探究婴幼儿巨细胞病毒感染诊断中尿液巨细胞病毒DNA检测法的作用。方法:选取本院2018年3月至2020年7月收治的40例疑似患有巨细胞病毒感染的婴幼儿为研究对象,对所有患儿行血清巨细胞病毒特异度抗体检测和尿液巨细胞病毒DNA检测。比较血清病毒特异度抗体检测和该检测法联合尿液巨细胞病毒DNA检测结果阳性率以及治疗前后尿液巨细胞病毒DNA含量。结果:血清巨细胞病毒特异抗体检测联合尿液巨细胞病毒DNA检测结果阳性率、特异度明显较单一使用血清巨细胞病毒特异抗体检测高,组间比较,差异均具有统计学意义(P<0.05)。治疗后患儿尿液巨细胞病毒DNA水平较治疗前明显降低,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:对于巨细胞病毒感染患儿,较单一采用血清巨细胞病毒特异度抗体检测法,联合使用尿液巨细胞病毒DNA检测能明显提高检测结果准确性,检测结果更理想,对早期巨细胞病毒感染患儿诊断及治疗具有重要的临床价值。

关键词：巨细胞病毒DNA检测婴幼儿巨细胞病毒感染

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等待

青年文学家 2021年第31期 139-139页

作者：吴亦琳

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基于多尺度特征融合的由粗到精点云形状补全

计算机辅助设计与图形学学报 2024年第4期36卷 523-532页

作者：张德军王杨谭雪峰吴亦奇陈壹林何发智中国地质大学(武汉)计算机学院武汉430078 智能机器人湖北省重点实验室(武汉工程大学) 武汉430205 武汉大学计算机学院武汉430072

为了以由粗到精的方式实现点云形状补全,提出一个端到端的两阶段多尺度特征融合网络,其中的每个阶段都是由一个编码器-解码器构成.第1阶段中,首先利用点集抽取模块提取残缺点云的全局特征,在获取不同分辨率点特征的同时能关注更多的局... 详细信息

为了以由粗到精的方式实现点云形状补全,提出一个端到端的两阶段多尺度特征融合网络,其中的每个阶段都是由一个编码器-解码器构成.第1阶段中,首先利用点集抽取模块提取残缺点云的全局特征,在获取不同分辨率点特征的同时能关注更多的局部邻域特征,然后使用多层感知机作为解码器生成粗糙的点云骨架;第2阶段中,利用点云骨架和残缺点云提取多尺度局部特征,并通过注意力机制与第1阶段中的多尺度全局特征相互融合,使得每个点都包含全局和局部几何信息;最后将第2阶段中的全局特征和多尺度局部特征逐步进行上采样,并通过多层感知机生成精细的完整点云.采用倒角距离作为评价标准,在ShapeNet,MVP和Completion3D数据集上进行点云补全实验的结果表明,误差分别比基准网络降低17.1%,3.9%和13.9%,验证了所提网络的有效性.

关键词：点云补全多尺度特征融合由粗到精编码器-解码器

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高压均质技术在果蔬制品中的研究进展

食品工业科技 2024年

作者：石亦璁董丽陈芳张泽群崔天琳胡小松中国农业大学食品科学与营养工程学院

果蔬制品的营养品质与安全性保障是其加工领域亟待解决的难题与研究热点，而高压均质作为一种非热加工技术在杀菌、钝酶的同时能最大限度地保留果蔬制品的营养品质以及色泽风味，有望代替热加工技术。本文综述了高压均质处理对果蔬制品... 详细信息

果蔬制品的营养品质与安全性保障是其加工领域亟待解决的难题与研究热点，而高压均质作为一种非热加工技术在杀菌、钝酶的同时能最大限度地保留果蔬制品的营养品质以及色泽风味，有望代替热加工技术。本文综述了高压均质处理对果蔬制品的色泽、稳定性和营养成分等品质的影响，并总结了高压均质处理对微生物的杀灭效果和作用机制，从设备、技术方面讨论了高压均质技术在果蔬制品应用中的前景和挑战，为高压均质技术的创新和设备的革新提供了理论参考。

关键词：高压均质果蔬制品营养品质杀菌理化性质

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固-液接触法制备乙烯

化学教育(中英文) 2024年第13期 91-94页

作者：张尊听王丹鹭史亦琳董丽英陕西师范大学化学化工学院海南卫生健康职业学院药学系

采用滴液式气体发生器为反应装置，以固体乙烯利和30%氢氧化钾溶液制备乙烯。利用固-液接触法制备乙烯，反应速率可控，无盐析和液泛现象，制气效率达90%以上，并且实验装置体积小、制气量大，为实验室制备乙烯提供了一种简便安全的方法。

关键词：乙烯气体制备滴液式气体发生器固-液接触法