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鱼类线粒体DNA重排研究进展

Zoological Research 2013年第6期34卷 666-673页

作者：龚理时伟司李真孔晓瑜中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室广东广州510301 中国科学院大学北京100049

一般认为鱼类线粒体基因组在结构上具有高度的保守性，但是通过分析NCBI数据库中的1 255种鱼类线粒体基因组全序列（截至2013年11月3日），发现～52种鱼线粒体基因组发生了重排。进一步的分析发现这些重排具有3种类型：滑移（shuffling... 详细信息

一般认为鱼类线粒体基因组在结构上具有高度的保守性，但是通过分析NCBI数据库中的1 255种鱼类线粒体基因组全序列（截至2013年11月3日），发现～52种鱼线粒体基因组发生了重排。进一步的分析发现这些重排具有3种类型：滑移（shuffling）、移位（translocation）和倒置（inversion），并多发生于WANCY基因簇、IQM基因簇、ND6基因、控制区（D-loop）及其邻接基因等区域。该文根据已报道的4种常见的解释重排的模型：复制-随机丢失（duplication-random loss）、复制-非随机丢失（duplication-nonrandom loss）、线粒体内的重组（intramitochondrial recombination）以及由tRNA基因错误起始引起的复制（tRNA miss-priming model）解释了鱼类重排产生的可能机制，并探讨了重排现象在鱼类系统发生研究中的应用，以期为鱼类线粒体的进化研究提供科学依据。

关键词： mtDNA 移位滑移倒置基因重排系统发生

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5科11种鱼类ITS1特征分析及其在系统分类研究中的适用性

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水产学报 2018年第4期42卷 465-475页

作者：武宝生司李真孔晓瑜时伟杨敏中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院大学

为了探讨ITS1作为分子标记用于鱼类系统演化的适用性,实验选取鲈形目5科11种鱼类为研究对象,包括尖吻鲈科、射水鱼科、军曹鱼科、剑鱼科和鲹科。通过克隆和测序等技术共获得了348条ITS1序列,长度范围为442661 bp;通过对所有序列的长度... 详细信息

为了探讨ITS1作为分子标记用于鱼类系统演化的适用性,实验选取鲈形目5科11种鱼类为研究对象,包括尖吻鲈科、射水鱼科、军曹鱼科、剑鱼科和鲹科。通过克隆和测序等技术共获得了348条ITS1序列,长度范围为442661 bp;通过对所有序列的长度、变异位点数量、GC含量、核苷酸多样性及单倍型多样性指数等遗传特征比较分析发现,11种鱼类ITS1序列无论是在种内还是在种间,长度和序列都表现出较为明显的多态性。特别是在军曹鱼中,70条克隆的长度范围为648661 bp,但有一条序列存在55 bp缺失,结合该序列的GC含量,二级结构和最小自由能,推断该序列为假基因。以鮣为外类群,基于核糖体ITS1序列构建的邻接树显示在物种种类水平上,不同个体的克隆都按种类聚支,ITS1可以用于该类群物种的区分;在属级水平上,ITS1将11属鱼类完全区分开,能够用于属级水平的区分;在科级水平上,虽然鲹科分为2支的分子结果和形态分类存在差异,但ITS1构建的系统关系与线粒体分子标记构建的系统进化树相似。研究表明,核糖体ITS1可以作为一种有效的分子标记用于研究鱼类的系统分类研究,并且不同的分类阶元其解析能力不同,这将为鱼类核糖体的研究提供科学依据。

关键词：鲈形目鲹科 ITS1序列多态性系统演化假基因

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硬骨鱼类核糖体基因间隔区的序列特征分析

热带海洋学报 2016年第6期35卷 74-81页

作者：司李真时伟杨敏龚理孔晓瑜中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室广东广州510301 中国科学院大学北京100049

真核生物核糖体DNA(ribosomalDNA,简称rDNA)是由几十个甚至上万个高度串联重复序列组成的多基因家族,每个重复单元都包括编码区(18S、5.8S和28S)和非编码区(ITS1和ITS2)。间隔区ITS1和ITS2常被用于属级及以下阶元水平的系统关系研究。然... 详细信息

真核生物核糖体DNA(ribosomalDNA,简称rDNA)是由几十个甚至上万个高度串联重复序列组成的多基因家族,每个重复单元都包括编码区(18S、5.8S和28S)和非编码区(ITS1和ITS2)。间隔区ITS1和ITS2常被用于属级及以下阶元水平的系统关系研究。然而,越来越多的研究发现,这些串联重复序列并非完全一致,有些甚至存在个体内差异,这种基因组内ITS多态性的发现,使我们对ITS用于物种系统发育重建的适用性产生了质疑。因此,我们对GeneBank中硬骨鱼类的10目ITS序列的长度和保守位点比例进行了统计分析,结果显示:ITS1长度范围为272~918bp,保守位点比例在各分类单元之间具有明显的区别,并且这种区别可以作为判断物种之间关系的特征。当序列之间保守位点比例为89.51%~100%时,为种内关系;在61.53%~81.36%范围时,为种间关系;在32.47%~58.87%范围时,为属间关系;而在1.62%~30.46%时,达到科间水平。而一些物种的保守位点比例超出此范围时,依据此标准判断就会产生偏差。ITS2的长度范围为128~694bp,保守位点比例在各分类阶元之间互相重合,在各分类阶元之间不存在明显的差异,因此该特征不能用于区分各阶元之间的关系。

关键词：硬骨鱼类 ITS1 ITS2 序列长度序列保守位点比例系统发育

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11种鲈形目鱼类的核糖体基因GC含量及其与硬骨鱼类的特征比较

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中国水产科学 2017年第4期24卷 657-668页

作者：司李真武宝生孔晓瑜杨敏龚理时伟中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室中国科学院大学

核糖体基因为串联重复多拷贝的基因,包括3个编码基因(18S,5.8S,28S)和两个间隔区ITS1(internal transcribed spacer 1)和ITS2(internal transcribed spacer 2)。目前,对核糖体基因的相关报道主要集中在个体内不同拷贝间的多态特征,以及... 详细信息

核糖体基因为串联重复多拷贝的基因,包括3个编码基因(18S,5.8S,28S)和两个间隔区ITS1(internal transcribed spacer 1)和ITS2(internal transcribed spacer 2)。目前,对核糖体基因的相关报道主要集中在个体内不同拷贝间的多态特征,以及其作为分子标记在系统演化关系中的应用,GC含量作为一项非常重要的核苷酸序列指标,而鲜有报道。为了探讨鱼类的核糖体基因GC含量特征以及间隔区是否也存在GC平衡现象,本研究选择了鲈形目(Perciformes)5科11种鱼类5个片段的核糖体基因进行研究,包括尖吻鲈科(Latidae)、射水鱼科(Toxotidae)、军曹鱼科(Rachycentridae)、剑鱼科(Xiphiidae)、鲹科(Carangidae)。获得了1651个单克隆序列,通过分析并比较已有的其他硬骨鱼序列片段的GC含量变化特征,结果发现:本研究鱼类的18S的GC含量为52.6%~57.1%(平均54.6%),5.8S为55.6%~58.9%(平均57.4%),28S为64.2%~65.8%(平均64.6%),ITS1为56.5%~73.0%(平均65.0%),ITS2为62.3%~77.5%(平均69.1%)。编码区的GC含量相对较保守,变异范围较小,18S和5.8S变化范围明显小于间隔区,28S则位于间隔区的最低值和最高值之间。因此,我们发现硬骨鱼核糖体ITS高于60%的GC含量是该类群的一个特征,并且高GC含量的ITS1和ITS2序列中不存在明显的高GC富集区,其含量高低的变化与序列长度也没有相关性。本研究11种鱼类的ITS1和ITS2的GC含量在种内的相似性既有大于也有小于种间相同片段的相似性,因此GC平衡现象只存在部分种类中。本研究结果可为鱼类核糖体基因序列特征的进一步研究及利用提供科学依据。

关键词：编码基因间隔区 18S 5.8S ITS1 ITS2

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11种鲈形目鱼类ITS2特征及系统应用

中国水产科学 2018年第6期25卷 1151-1160页

作者：武宝生司李真孔晓瑜时伟龚理杨敏刘静中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室中国科学院大学广东省应用海洋生物学重点实验室中国科学院海洋研究所海洋生物分类与系统演化实验室

ITS2 (Internal transcribed spacer 2)是位于核糖体5.8S和28S基因之间的非编码序列。为了探讨该片段的多样性特征以及进化模式,本研究选取了鲈形目(Perciformes) 5科11种鱼类为研究对象,共获得了444条ITS2克隆序列,其长度范围为332～51... 详细信息

ITS2 (Internal transcribed spacer 2)是位于核糖体5.8S和28S基因之间的非编码序列。为了探讨该片段的多样性特征以及进化模式,本研究选取了鲈形目(Perciformes) 5科11种鱼类为研究对象,共获得了444条ITS2克隆序列,其长度范围为332～515 bp。比较种内不同序列的长度发现,金带细鲹(Selaroides leptolepis)在种内存在24 bp的差异,剑鱼(Xiphias gladius)在种内存在32 bp的差异,这2种鱼类的差异较为明显;其余9种鱼类的长度相对比较保守,长度差异小于14 bp。依据11种鱼类的保守位点数、变异位点数、简约信息位点数、单倍型数、保守位点比例、单倍型多样性指数、核苷酸多样性等特征分析发现,种内存在着不同程度差异,特别是金带细鲹的ITS2序列存在着Type A、Type B和Type C 3种类型,各类型间差异较大。根据序列的多样性特征推断,金带细鲹和剑鱼的进化方式为非协同进化;蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)、大甲鲹(Megalaspis cordyla)、吉打副叶鲹(Alepes djedaba)和日本竹筴鱼(Trachurus japonicas)的长度和变异位点均存在着一定程度的差异,但差异并不明显,视为不严格的协同进化;泰拉鰆鲹(Scomberoides tala)、布氏鲳鲹(Trachinotus blochii)、尖吻鲈(Lates calcarifer)、射水鱼(Toxotes chatareus)和军曹鱼(Rachycentron canadum) 5种鱼类为协同进化;另外,协同和非协同进化状态与分类系统没有相关性。序列比对发现,大甲鲹种内存在着由协同进化方式演变为非严格的协同进化方式的过度序列;在金带细鲹的3个不同个体中,序列间存在着从协同进化、非严格的协同进化演变为非协同进化的3种进化方式。基于ITS2序列构建的11种鱼类的邻接系统树显示,每种鱼类的克隆都分别按种单独聚为一支,鲹科7属鱼类各属也是单独聚支,表明ITS2不仅可以用在种类的分子鉴定,同时也可以作为分子标记应用于鲹科和属级水平的系统关系研究。

关键词：多态性协同进化非协同进化系统关系 ITS2 鲈形目

卟啉改性D-A型共轭高分子的合成及光电性能

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功能高分子学报 2025年

作者：孙赛况挺蒋建忠高凯张斌李真董文芊中石化(上海)石油化工研究院有限公司华东理工大学化学与分子工程学院教育部结构可控先进功能材料及其制备重点实验室

随着智能化时代的到来，信息量激增，人们对更大容量、稳定性强、功能全的存储设备需求增加。在众多材料中，有机高分子材料因其可调节的电学性能而受到关注。本文通过Knoevenagel缩合合成了含卟啉的D-A型共轭高分子PCN-ZnPor(对苯二甲... 详细信息

随着智能化时代的到来，信息量激增，人们对更大容量、稳定性强、功能全的存储设备需求增加。在众多材料中，有机高分子材料因其可调节的电学性能而受到关注。本文通过Knoevenagel缩合合成了含卟啉的D-A型共轭高分子PCN-ZnPor(对苯二甲腈-锌卟啉)，该材料具有良好的热稳定性且可溶于极性溶剂。以此高分子为活性层制备的Al/PCN-ZnPor/ITO器件展现出非易失性可擦写阻变存储性能，开启电压为-3.04V，电流开关比为7×10～3，且稳定性较好。研究表明，含卟啉的高分子材料在高密度存储领域具有巨大潜力。

关键词：有机高分子 D-A型卟啉非易失性存储器件

阻燃PA56复合材料的等温结晶行为和拉伸性能

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化工新型材料 2025年

作者：李桂丽张舒琪姜欣吕以撒李真真河南城建学院材料与化工学院神马集团神马实业有限公司

阻燃剂在提升尼龙（PA）材料阻燃性能的同时，会对其结晶性能产生影响，并进一步影响PA材料的力学性能。为探究10-(2，5-二羟基苯基)-10-氢-9-氧杂-10-磷杂菲-10-氧化物（DOPO-HQ）和三聚氰胺氰尿酸盐（MCA）这两种阻燃剂对尼龙56（PA5... 详细信息

阻燃剂在提升尼龙（PA）材料阻燃性能的同时，会对其结晶性能产生影响，并进一步影响PA材料的力学性能。为探究10-(2，5-二羟基苯基)-10-氢-9-氧杂-10-磷杂菲-10-氧化物（DOPO-HQ）和三聚氰胺氰尿酸盐（MCA）这两种阻燃剂对尼龙56（PA56）结晶行为和拉伸性能的影响，采用熔融共混法制备了阻燃剂添加质量为5%的PA56阻燃复合材料，分析了复合材料的等温结晶过程、拉伸性能和断裂机制。结果表明：MCA的加入提高了PA56的熔融结晶温度和等温结晶速率，降低了PA56的半结晶时间、结晶活化能和断裂伸长率，DOPO-HQ具有与MCA相反的作用；MCA和DOPO-HQ的加入均能使PA56的Avrami指数由1.99～2.25提高至2.40～3.05，晶体生长模式由二维片状转变为三维球状。

关键词：尼龙56 三聚氰胺氰尿酸盐 10-(2,5-二羟基苯基)-10-氢-9-氧杂-10-磷杂菲-10-氧化物等温结晶动力学拉伸性能

基于液体粘度及气液流量比调控实现散斑均匀细化

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中国激光 2025年

作者：许赛李真成黄耀华陈柳曹春晓李兴无沙爱学中国航发北京航空材料研究院应用评价中心

针对喷涂法制备散斑的尺寸细化及均匀化难点，开展了液体粘度及喷涂工艺参数对雾滴粒径的影响规律研究。利用激光衍射粒度分析仪测量了不同粘度和气液流量比下的雾滴粒径，建立了雾滴特征粒径与气液流量比、雷诺数及韦伯数之间的关联模... 详细信息

针对喷涂法制备散斑的尺寸细化及均匀化难点，开展了液体粘度及喷涂工艺参数对雾滴粒径的影响规律研究。利用激光衍射粒度分析仪测量了不同粘度和气液流量比下的雾滴粒径，建立了雾滴特征粒径与气液流量比、雷诺数及韦伯数之间的关联模型。结果表明，降低液体粘度、增大气液流量比可减小雾滴粒径，使散斑细化并均匀分布，最终获得了尺寸均值为13.59μm、方差为5.95μm的散斑。

关键词：数字图像相关应变喷雾散斑细化

磁共振指引下改良括约肌间瘘管结扎术在肛周深部脓肿治疗中的有效性和安全性

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实用医学杂志 2025年第1期 65-70页

作者：司志龙王豪肖飞武汉市第四医院结直肠肛门外科

目的探讨磁共振指引下改良括约肌间瘘管结扎术（modified ligation of intersphincteric fistula tract, modified, LIFT）在肛周深部脓肿治疗中的有效性和安全性。方法回顾性分析2019年9月至2023年6月在武汉市第四医院结直肠肛门外... 详细信息

目的探讨磁共振指引下改良括约肌间瘘管结扎术（modified ligation of intersphincteric fistula tract, modified, LIFT）在肛周深部脓肿治疗中的有效性和安全性。方法回顾性分析2019年9月至2023年6月在武汉市第四医院结直肠肛门外科手术治疗的符合入排标准的肛周深部脓肿患者148例，其中研究组51例采用改良LIFT术，对照组97例行单纯切开引流术。采用倾向评分匹配法获得基线资料平衡的两组患者各47例，共94例患者纳入本研究。比较两组患者的手术时间、住院时间、疼痛指数、术后并发症、肛门功能及愈合率。结果所有94例患者术前磁共振均能发现起源于括约肌间隙的原发病灶；研究组手术时间为（43.75±11.77）min，长于对照组的（28.90±8.67）min，差异有统计学意义（P 0.05）；两组在住院时间、术后疼痛指数、术后并发症和手术前后肛门功能方面差异均无统计学意义（P> 0.05）。结论磁共振指引下改良括约肌间瘘管结扎术可有条件地应用于肛周深部脓肿患者的治疗，能提高初次手术的愈合率，不会明显增加术后并发症的发生率，同时可以避免肛门功能的损伤。

关键词：肛周脓肿磁共振括约肌间瘘管结扎术内口缝扎挂线倾向评分匹配

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