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藏猪与大约克猪EDN1基因多态性与表达差异分析

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中国畜牧杂志 2022年第3期58卷 79-83页

作者：韦明邦段梦琪罗布白珍肖青青徐士军陈军军叶幼荣张健商鹏西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000 林芝市巴宜区畜牧兽医总站西藏林芝860000

为探究EDN1基因在猪脂肪沉积机制中所发挥的作用,本实验利用RT-q PCR技术对藏猪及大约克猪心脏、背脂及背最长肌组织中EDN1基因的m RNA表达量进行检测,并采用Sanger测序法对藏猪和大约克猪EDN1基因3’UTR和5’UTR区域进行了单核苷酸多态... 详细信息

为探究EDN1基因在猪脂肪沉积机制中所发挥的作用,本实验利用RT-q PCR技术对藏猪及大约克猪心脏、背脂及背最长肌组织中EDN1基因的m RNA表达量进行检测,并采用Sanger测序法对藏猪和大约克猪EDN1基因3’UTR和5’UTR区域进行了单核苷酸多态性(SNPs)筛选与基因分型。结果表明:在不同品种猪中,藏猪心脏组织EDN1基因m RNA表达量显著高于大约克猪;背脂和背最长肌中m RNA表达量的趋势一致,均为藏猪极显著低于大约克猪;在EDN1基因的3’UTR和5’UTR区域,存在3’A15G、3’C56G、3’A348G和5’A-1793G、5’C-1757A共5个突变位点,且藏猪与大约克猪等位基因频率差异显著。经转录因子预测发现,这些SNPs位点与EDN1基因负向调控脂肪沉积性状相关。该实验结果为进一步探究猪EDN1基因在脂肪沉积性状方面的研究奠定了基础。

关键词：猪 EDN1基因 mRNA表达基因多态性

藏猪和大约克猪FABP3基因多态性及差异表达分析

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福建农业学报 2023年第6期38卷 639-645页

作者：杨绍康薄素雪韩雨晴叶幼荣商鹏强巴央宗西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000

【目的】脂肪酸结合蛋白3(FABP3)参与长链脂肪酸的摄取及利用,在脂肪沉积中发挥重要作用。探究FABP3基因在藏猪和大约克猪间的基因多态性和表达差异可为藏猪品质改良提供分子机制参考。【方法】选取180日龄藏猪和大约克猪为研究对象,对... 详细信息

【目的】脂肪酸结合蛋白3(FABP3)参与长链脂肪酸的摄取及利用,在脂肪沉积中发挥重要作用。探究FABP3基因在藏猪和大约克猪间的基因多态性和表达差异可为藏猪品质改良提供分子机制参考。【方法】选取180日龄藏猪和大约克猪为研究对象,对两猪种FABP3基因5'侧翼区和CDS区进行单核苷酸多态性(SNPs)筛选,使用实时荧光定量检测FABP3基因在肝脏、背最长肌和背脂3个组织中的表达量。【结果】在FABP3基因5'侧翼区筛选到T-114C和C-635A等2个SNPs位点,且SNPs位点基因型频率在藏猪与大约克猪群体间均呈极显著差异(P<0.01);经转录因子预测发现这2个SNPs位点与前脂肪细胞的更新、分化以及脂肪沉积相关,推测这两个多态性位点是参与调控FABP3基因表达的重要功能位点。FABP3基因在藏猪肝脏、背最长肌中的表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),在背脂中的表达量显著高于大约克猪(P<0.05)。【结论】推测FABP3基因可能为调控藏猪脂肪代谢的重要候选基因,在藏猪脂肪沉积中呈正向调控作用。

关键词：藏猪 FABP3基因脂肪沉积多态性位点

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猪ANXA2基因多态性及组织表达差异分析

河南农业科学 2022年第2期51卷 120-126页

作者：卢鸿李新荻王宇罗布白珍段梦琪叶幼荣张健商鹏西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000 林芝市巴宜区畜牧兽医总站西藏林芝860000

为了探究膜联蛋白A2(ANXA2)基因单核苷酸多态性(SNP)及其在组织中的表达差异,以180日龄的藏猪、大约克猪作为试验对象,检测ANXA2基因在肝脏、腹脂和背脂组织上mRNA表达差异,并对ANXA2基因的5′侧翼区进行多态性分析。结果显示,在ANXA2基... 详细信息

为了探究膜联蛋白A2(ANXA2)基因单核苷酸多态性(SNP)及其在组织中的表达差异,以180日龄的藏猪、大约克猪作为试验对象,检测ANXA2基因在肝脏、腹脂和背脂组织上mRNA表达差异,并对ANXA2基因的5′侧翼区进行多态性分析。结果显示,在ANXA2基因5′侧翼区筛选到4个SNP位点,g.111574291G>A、g.111574499C>T、g.111574522G>C和g.111574638A>G,且藏猪与大约克猪等位基因频率差异显著(P<0.05)。在肝脏中,藏猪和大约克猪ANXA2基因的mRNA表达趋势基本一致;在背脂和腹脂中,藏猪ANXA2基因的mRNA表达量极显著低于大约克猪(P<0.01)。综上,ANXA2基因可能是调控脂肪沉积和脂肪代谢的重要候选基因。

关键词： ANXA2基因藏猪大约克猪组织表达单核苷酸多态性

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隆子县黑鸡产业发展现状及对策

甘肃畜牧兽医 2021年第9期51卷 56-57页

作者：次仁卓玛严飞飞张健商鹏叶幼荣西藏隆子县隆子镇农牧综合服务中心西藏山南856600 西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000

隆子黑鸡因全身羽毛黑色而得名,具有耐寒、抗高反、觅食能力强、出肉率高、蛋品质佳及遗传性稳定等优势。近年来,通过政策和资金支持,隆子县黑鸡养殖规模不断扩大,但在饲养管理、品种改良、疫病防治等方面仍存在一些问题。

关键词：隆子黑鸡现状问题对策

非洲猪瘟防控常态化下猪生产学教学实践改革初探

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中南农业科技 2022年第1期43卷 134-136页

作者：商鹏张健谭占坤叶幼荣徐业芬强巴央宗西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000

非洲猪瘟(ASF)防控常态化下猪生产学教学与实践改革是提高养猪专业人才技能的必经之路。以非洲猪瘟防控常态化为大背景,以猪生产学课程改革和实践改革事例进行探讨,总结模块化教学和新增实践内容的意义,分析取得的效果,旨在为农业院校... 详细信息

非洲猪瘟(ASF)防控常态化下猪生产学教学与实践改革是提高养猪专业人才技能的必经之路。以非洲猪瘟防控常态化为大背景,以猪生产学课程改革和实践改革事例进行探讨,总结模块化教学和新增实践内容的意义,分析取得的效果,旨在为农业院校猪生产学教学改革提供参考。

关键词：非洲猪瘟(ASF) 猪生产学教学改革实践改革

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藏猪MYL1基因的克隆及生物信息学分析

黑龙江畜牧兽医 2022年第2期 122-127,132,140-142页

作者：巩兴龙罗布白珍韦明邦肖青青徐士军叶幼荣张健商鹏西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000 林芝市巴宜区畜牧兽医总站西藏林芝860001

为了克隆藏猪肌球蛋白轻链1 (myosin light chain 1, MYL1)基因编码区序列,并对其进行生物信息学分析,试验根据NCBI网站GenBank中公布的野猪MYL1基因mRNA序列(登录号为NM;14374.2)设计特异性引物,以提取的藏猪背最长肌组织总RNA反转录... 详细信息

为了克隆藏猪肌球蛋白轻链1 (myosin light chain 1, MYL1)基因编码区序列,并对其进行生物信息学分析,试验根据NCBI网站GenBank中公布的野猪MYL1基因mRNA序列(登录号为NM;14374.2)设计特异性引物,以提取的藏猪背最长肌组织总RNA反转录得到的cDNA为模板,对藏猪MYL1基因编码区序列进行PCR扩增,将目的基因进行测序,应用生物信息学分析软件对藏猪MYL1基因编码区序列的同源性、蛋白质的结构和功能(氨基酸组成、一般理化性质、疏水性、二级结构及三级结构、磷酸化位点、跨膜螺旋结构和信号肽亚细胞定位及蛋白网络互作)进行分析。结果表明:藏猪MYL1基因编码区序列全长为453 bp;藏猪与野猪的亲缘关系最近,与斑马鱼的亲缘关系最远;藏猪MYL1基因编码区序列与野猪、牛、智人、马、绵羊、犬、穴兔、家鼠、鸡和斑马鱼的核苷酸序列相似性分别为100%、92.1%、91.4%、91.2%、91.2%、90.5%、90.3%、89.2%、80.6%和68.2%;藏猪MYL1蛋白存在19种氨基酸,由150个氨基酸组成;藏猪MYL1蛋白分子质量为16 657.86 u,分子式为C;H;N;O;S;,脂肪系数为79.33,理论等电点pI为4.63,不稳定系数为37.81,负电荷氨基酸残基(Asp+Glu)总数为26个,正电荷氨基酸残基(Arg+Lys)总数为15个,理论半衰期为30 h,为亲水蛋白;二级结构中α螺旋占比最大(58.67%),其次为无规则卷曲(24.67%),β转角(8.67%)和延伸链(8.00%)占比较小;三级结构与二级结构预测结果相符合;氨基酸序列中共有16个磷酸化位点,其中有8个丝氨酸磷酸化位点,6个苏氨酸磷酸化位点,2个酪氨酸磷酸化位点;无跨膜螺旋结构,为非跨膜蛋白;无信号肽,为非分泌蛋白;主要定位于细胞质(47.8%)中,在细胞核约占26.1%,在细胞骨架约占8.3%,在内质网、高尔基体、分泌系统的囊泡、液泡中均约占4.3%;与TNNC2蛋白及MYH1、MYH3、MYH7等蛋白之间存在互作网络关系,与TNNC2蛋白相关系数高达0.999,与肌球蛋白重链家族MYH1、MYH3和MYH7蛋白相关系数分别为0.979,0.975和0.971,与MYBPC1和TPM1蛋白相关系数均为0.969,与TPM2和TNNI3蛋白相关系数均为0.965。说明藏猪MYL1基因可能具有较强大的生物学功能。

关键词：藏猪 MYL1基因克隆肌肉生长发育生物信息学

藏猪和大约克夏猪CXCL10基因多态性及表达差异分析

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中国畜牧杂志 2022年第11期58卷 100-104页

作者：刘思源何辰庆陈军军叶幼荣张健商鹏强巴央宗西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000

为探讨CXCL10基因在藏猪和大约克夏猪中的差异表达和多态性分析,本研究采用一代测序(Sanger测序)法对藏猪和大约克夏猪CXCL10基因起始密码子上游3 kb区域进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)筛选并进行基因分型;采... 详细信息

为探讨CXCL10基因在藏猪和大约克夏猪中的差异表达和多态性分析,本研究采用一代测序(Sanger测序)法对藏猪和大约克夏猪CXCL10基因起始密码子上游3 kb区域进行单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)筛选并进行基因分型;采用RT-qPCR检测CXCL10基因在180日龄藏猪和大约克夏猪背最长肌、腿肌、肝脏组织中的mRNA水平表达情况。结果显示:在CXCL10基因起始密码子上游3 kb区域,存在T-832G、A-808G和T-694C这3个品种间极显著差异的SNPs位点,且均符合哈迪-温伯格定律;转录因子预测结果显示,这些SNPs位点的突变导致了ARGFX、ARID3A/B的结合位点消失;CXCL10基因在藏猪背最长肌、腿肌和肝脏组织中的表达量均极显著高于大约克夏猪。由此推测,CXCL10基因可能参与肌肉生长发育的负向调控。本研究结果为进一步研究藏猪生长发育机制奠定了基础。

关键词：猪 CXCL10基因 mRNA表达多态性

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猪PFN1基因在骨骼肌组织中的表达模式及多态性研究

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家畜生态学报 2023年第11期44卷 10-15页

作者：李新荻王宇卢鸿罗布白珍何辰庆段梦琪叶幼荣张健商鹏西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心西藏林芝860000 林芝市巴宜区畜牧兽医总站西藏林芝860000

为探究猪前纤维蛋白1(Profilin-1,PFN1)基因多态性及其在猪骨骼肌组织中的mRNA表达规律,以藏猪(Tibet pigs, TP)和大约克猪(Yorkshire pigs, YP)作为试验动物,采用Sanger测序技术对PFN1基因CDS区、5’UTR启动子区进行单核苷酸多态性(Sin... 详细信息

为探究猪前纤维蛋白1(Profilin-1,PFN1)基因多态性及其在猪骨骼肌组织中的mRNA表达规律,以藏猪(Tibet pigs, TP)和大约克猪(Yorkshire pigs, YP)作为试验动物,采用Sanger测序技术对PFN1基因CDS区、5’UTR启动子区进行单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism, SNP)的筛选与基因分型,预测分析了PFN1基因的SNPs位点突变前后转录因子的功能特性;采用RT-qPCR技术检测PFN1基因在30、90、180日龄三个时期TP和YP的腿肌与背最长肌中的mRNA表达量。结果表明:PFN1基因启动子区域存在三个SNPs,且TP与YP基因频率差异显著;产生了8个新增转录因子结合位点,这些位点调控骨骼肌生长发育、细胞形态建成和保持等过程;PFN1基因表达水平于30日龄时最高,随日龄的增加而下降,90、180日龄时TP的PFN1基因表达量均显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)低于YP。综上表明,猪PFN1基因SNPs位点多态性与骨骼肌mRNA的差异表达相关,推测PFN1基因对猪早期骨骼肌生长发育与肌纤维细胞形态保持起重要的调控作用,本研究结果为后续进一步探索其分子作用机制奠定基础。

关键词：藏猪 PFN1基因单核苷酸多态性骨骼肌 mRNA表达

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镉对发育期小鼠肺细胞DNA损伤的影响

镉对发育期小鼠肺细胞DNA损伤的影响