检索结果-南通市图书馆

作者：卢江杰浙江林学院

学位级别：硕士

毛竹(Phyllostachys pubescens)是禾本科(Gramineae)竹亚科(Bambusoideae)刚竹属(Phyllostachys)植物。是我国竹类资源中最主要的竹种之一,生长快、分布广、利用多、具有重要的经济价值和生态价值。竹亚科植物染色体数目较多而且不稳定... 详细信息

毛竹(Phyllostachys pubescens)是禾本科(Gramineae)竹亚科(Bambusoideae)刚竹属(Phyllostachys)植物。是我国竹类资源中最主要的竹种之一,生长快、分布广、利用多、具有重要的经济价值和生态价值。竹亚科植物染色体数目较多而且不稳定,普遍存在多倍性、非整倍性、混倍性和染色体结构变异等现象,染色体结构和基因组特性等方面的研究很少,研究迫切需要一种快速、高效的方法和技术。SSR(Simple Sequence Repeat)标记作为以PCR技术和测序技术为基础的分子标记,是构建高密度分子遗传图谱、物种分类与进化分析、染色体结构分析、品种遗传多样性研究、品种保护与纯度鉴定、研究杂种优势机理及预测的有效工具,被认为是当前种内遗传变异研究中分辨率最高、揭示力最强的分子标记。本研究查阅了大量相关文献,发现竹类植物中的SSR标记很少,只有Nayak和Rout等开发的印度刺竹(Bambusa arundinacea)的6个SSR位点,为了能在竹类植物中开发大量的可以广泛运用的SSR标记,我们选择了重要竹种毛竹为开发对象,尝试在毛竹中开发一批在竹类植物中具有高通用性标记,那样将为其他竹种SSR标记的开发降低成本,为竹类植物相关研究所用。随着网络数据库数据量的日益增加,利用生物信息学的方法来开发SSR引物已渐成熟。本研究通过搜索GenBank毛竹系列,自行开发了19对SSR引物。用这些引物研究了毛竹11个变型(栽培类型)的遗传多样性发现,毛竹和其变型(栽培类型)之间的遗传多样性很低,从电泳图上看所有的19对SSR标记基本上没有什么多态性条带,这与栽培过程中观察到的不同类型之间可以相互转换的现象一致,暗示其变型的产生可能是其他机制造成的。另外,利用刚竹属中7种代表性的竹种对这些SSR引物的通用性进行了分析,发现有10个毛竹SSR标记PBM014, PBM016, PBM018, PBM020, PBM022, PBM025, PBM023, PBM027, PBM028和PBM004在6个刚竹属其他竹种具有很好的通用性;PBM002和PBM007的通用性最低;PBM026虽然有PCR产物,但是不含有SSR位点;其他SSR标记在其他竹种中也有部分不能通用或有扩增产物但是没有SSR位点的现象。总的来说,我们开发的毛竹SSR标记在同属中的通用性为73.7%。由于GenBank中毛竹序列有限,为了得到更多的SSR位点,我们结合传统的构建微卫星富集文库的策略,自行设计了一套新的SSR引物开发策略。使用常用的EcoRⅠ或MseⅠ对毛竹基因组进行酶切,两端分别相对应接上AFLP接头,随后用改进了的少了第一个选择性碱基的AFLP预扩增引物放大酶切片段数量,再用探针(GA)10,(GACA)6,(CA)10,CAA)10,(GAA)10,(CAT)10和(GAT)10杂交和磁珠富集,用改进的引物经PCR后使单链变成双链。片段产物连接pMD18-T载体后转化大肠杆菌,测序。得到的含有SSR位点的序列设计引物,对毛竹基因组DNA进行扩增后,测序预计大小的目的片段,最终我们构建(GA)10和(GACA)6两个探针的文库,初步得到48个毛竹SSR标记。为了进一步研究竹类植物染色体特点,本研究还利用荧光原位杂交(FISH,fluorescence in situ hybridization)技术,以拟南芥端粒重复序列(CCCTAAA)n及寡核苷酸(AG)12、(AT)11、(AAG)5和(GACA)4等作探针,检测这些微卫星序列在毛竹染色体上的分布。掌握了竹类植物染色体上SSR序列的FISH技术,初步了解了拟南芥端粒重复序列(CCCTAAA)n和毛竹染色体上的分布情况,为接下来探索微卫星序列在竹类植物的染色体上的变化,进而推断竹类植物染色体的结构和进化过程开辟了新的研究思路。此外,利用在刚竹属多个竹种中通用性较好的毛竹SSR标记对部分丛生竹以外竹种的杂交后代进行了幼苗期的鉴定,研究杂交竹种中各亲本的遗传物质交流程度。通过实验发现,PBM014,PBM018和PBM025在亲本的SSR位点上等位基因多态性丰富,在亲本和杂交子代上对应位点上的等位基因稳定遗传,表明确实有遗传物质的交流,直接证实了所待测疑似杂种的真实性,为杂交竹种的后期研究工作奠定基础。

关键词：毛竹 SSR标记开发基因组

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45S rDNA在7种竹子植物染色体上的定位

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林业科学 2009年第12期45卷 42-45,F0003页

作者：徐川梅卢江杰汤定钦浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室临安311300

编码18-5.8-25S核糖体RNA的45S rDNA基因,是1个简单的多基因家族基因,一般以串联方式相连,对应于核仁组织区(NOR)。首次利用荧光原位杂交技术(FISH),研究45S rDNA在散生竹类的毛竹和斑竹,混生竹类的茶秆竹、日本矮竹、菲白竹和铺地竹,... 详细信息

编码18-5.8-25S核糖体RNA的45S rDNA基因,是1个简单的多基因家族基因,一般以串联方式相连,对应于核仁组织区(NOR)。首次利用荧光原位杂交技术(FISH),研究45S rDNA在散生竹类的毛竹和斑竹,混生竹类的茶秆竹、日本矮竹、菲白竹和铺地竹,以及丛生竹类的白绿竹染色体上的分布。结果表明:本研究所涉及的散生竹和混生竹的几个竹种,只观察到1对随体染色体的次缢痕区域有45S rDNA位点,而丛生竹类的白绿竹除随体染色体具有45S rDNA位点外,某些非随体染色体上也有不同拷贝数的45SrDNA位点存在。

关键词： FISH 45S rDNA 次缢痕竹子

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3种竹类植物杂种的分子鉴定

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林业科学 2009年第3期45卷 29-34页

作者：卢江杰吉永胜彦方伟汤定钦浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室临安311300 日本世界竹子研究所 Fukuoka 824-0076

利用从GenBank中毛竹GSS序列开发出来的在多个竹种中有高通用性的10多个SSR标记,鉴别部分杂交竹种的杂种真实性。结果表明:3个杂交竹种(Pleioblastus simonii×Phyllostachys violascens,Sasatokugawana×***和Sinobambusa tootsik×***),在其中的3个SSR位点(PBM014,PBM018和PBM025)上扩增产物的电泳条带分别为其父母本条带的组合;进一步对相应的扩增条带测序,结果表明杂种和亲本之间的相对应的序列具有同源性,进而确定杂种的真实性。研究证明利用在竹类植物中有较高通用性的SSR标记可以对杂交竹种的真实性进行早期鉴定。

关键词：杂交竹种 SSR 分子鉴定

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利用RAPD分析13种石斛属植物的遗传多样性和亲缘关系

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中草药 2006年第4期37卷 588-592页

作者：王慧中卢江杰施农农应奇才杭州师范学院生物化学与分子生物学杭州市重点实验室浙江杭州310036

目的通过对13种石斛属植物进行遗传多样性和亲缘关系分析,为更好地开发利用石斛资源奠定基础。方法随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析遗传多样性,U PGM A类平均法进行聚类分析。结果利用筛选出的10个随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,... 详细信息

目的通过对13种石斛属植物进行遗传多样性和亲缘关系分析,为更好地开发利用石斛资源奠定基础。方法随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析遗传多样性,U PGM A类平均法进行聚类分析。结果利用筛选出的10个随机引物对供试材料DNA进行随机扩增,共得到188条带,其中多态性带有180条,多态性百分率为95.74%。采用U PGM A类平均法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,得出反映各种间亲缘关系的树状图。在遗传距离(D)=0.63处,可将供试材料分为3类,RAPD对基因组的分析结果与传统分类学的结果差异不大。结论该标记技术对石斛属植物的遗传多样性和分类研究是可行的。

关键词：石斛属 RAPD 遗传多样性亲缘关系

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13种石斛属植物遗传多样性的AFLP分析

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分子细胞生物学报 2007年第3期40卷 205-210页

作者：王慧中卢江杰施农农赵艳应奇才杭州师范大学生物化学与分子生物学杭州市重点实验室杭州310018 浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室临安311300 浙江工商大学食品生物与环境科学学院杭州310018

采用AFLP技术对13种石斛属植物的遗传多样性进行了分析。选择性扩增引物组合E+ACT/M+CAC、E+AAC/M+CAC和E+ACA/M+CAC分别对这13种材料进行扩增,得到丰富的条带。在100-300bp共得到346条带,多态性带342条,多态性百分率为98.8%。聚类分析... 详细信息

采用AFLP技术对13种石斛属植物的遗传多样性进行了分析。选择性扩增引物组合E+ACT/M+CAC、E+AAC/M+CAC和E+ACA/M+CAC分别对这13种材料进行扩增,得到丰富的条带。在100-300bp共得到346条带,多态性带342条,多态性百分率为98.8%。聚类分析结果表明,在相似系数0.54处,可将13种材料分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类。Ⅰ类包括:串珠石斛、铁皮石斛、广东石斛、重唇石斛、晶帽石斛、细叶石斛、滇桂石斛、报春石斛、玫瑰石斛、球花石斛;Ⅱ类包括:鼓槌石斛;Ⅲ类包括:美花石斛(花,浅红)、美花石斛(花,淡白)。AFLP分析结果与传统分类学的结果基本一致,表明该标记技术对石斛属植物的遗传多样性和分类研究是可行的。

关键词：石斛属 AFLP 银染遗传多样性

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毛竹SSR分子标记在杂交竹种鉴定中的运用

毛竹SSR分子标记在杂交竹种鉴定中的运用

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第六届全国林木遗传育种大会

作者：卢江杰汤定钦浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室

竹类植物是禾本科(Gramineae)竹亚科(Bambusoideae)植物的总称。全世界有竹类植物70多属1 200多种,主要分布在亚洲、非洲和拉丁美洲的热带、亚热带区域,包括中国在内的东南亚季风区为竹类植物的中心分布区。竹类资源作为陆地上森林资源... 详细信息

竹类植物是禾本科(Gramineae)竹亚科(Bambusoideae)植物的总称。全世界有竹类植物70多属1 200多种,主要分布在亚洲、非洲和拉丁美洲的热带、亚热带区域,包括中国在内的东南亚季风区为竹类植物的中心分布区。竹类资源作为陆地上森林资源的重要组成部分,全球竹林面积2 000×10hm以上,约占世界森林总而积的1%。竹类植物种类繁多,分布广,形态差异显著,而且竹类植物因为其独特的生长发育规律,绝大多数竹种开花周期长,花小而且特化,有的竹种开花但不结实,所以自然界中的多数竹类植物很少进行有性繁殖。此外,由于很少有多种竹类植物同时在一个地区开花和各竹种之间存在一定的生殖隔离,所以导致自然界中几乎没有发现有杂交竹种的存在。

关键词：毛竹 SSR 杂交竹种鉴定

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利用FISH技术研究45S rDNA在部分竹种染色体上的分布

利用FISH技术研究45S rDNA在部分竹种染色体上的分布

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第六届全国林木遗传育种大会

作者：徐川梅卢江杰汤定钦浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室

编码18-5.8-25S核糖体RNA的45S rDNA基因,是一个简单的多基因家族基因,一般以串联方式相连,对应于核仁组织区（NOR）。本研究首次利用荧光原位杂交技术,研究了45S rDNA在散生竹类的毛竹和斑竹,混生竹类的茶秆竹、日本矮竹、菲白竹和铺...

编码18-5.8-25S核糖体RNA的45S rDNA基因,是一个简单的多基因家族基因,一般以串联方式相连,对应于核仁组织区（NOR）。本研究首次利用荧光原位杂交技术,研究了45S rDNA在散生竹类的毛竹和斑竹,混生竹类的茶秆竹、日本矮竹、菲白竹和铺地竹以及丛生竹类的白绿竹染色体上的分布。结果表明:在本研究所涉及的散生竹和混生竹的几个竹种,只观察到一对随体染色体的次缢痕区域有45S rDNA位点,而丛生竹类的白绿竹除随体染色体具有45S rDNA位点外,某些非随体染色体上也有不同拷贝数的45S rDNA位点存在。

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植物细胞质雄性不育及其在育种中的应用

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浙江林学院学报 2006年第6期23卷 689-693页

作者：胡滨陈观平施农农卢江杰王慧中杭州师范学院杭州市生物化学与分子生物学重点实验室浙江杭州310018 浙江林学院林业与生物技术学院浙江临安311300

细胞质雄性不育的研究在杂种优势利用上具有重要的实践意义。主要以能量为切入点阐述了植物线粒体引起细胞质雄性不育的作用机制,对提出的2种主要假说做了相关分析;从转录后调控和翻译后调控2个层面对育性恢复的机制作了详细的阐述;综... 详细信息

细胞质雄性不育的研究在杂种优势利用上具有重要的实践意义。主要以能量为切入点阐述了植物线粒体引起细胞质雄性不育的作用机制,对提出的2种主要假说做了相关分析;从转录后调控和翻译后调控2个层面对育性恢复的机制作了详细的阐述;综述了近年来细胞质不育在植物育种上的应用所取得的成就。随着对多个物种全基因组和线粒体基因组序列测序的完成以及比较基因组学和生物信息学方法的建立和不断完善,相信对细胞质雄性不育机制的研究会有很大的进展。

关键词：育种学基因工程细胞质雄性不育

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利用AFLP技术研究不同产地绿竹的遗传多样性

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世界竹藤通讯 2008年第5期6卷 10-14页

作者：卢江杰郑蓉杨萍汤定钦浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室临安311300 福建省林业科学研究院福州350012

应用AFLP技术对21个不同产地的绿竹遗传多样性进行了研究。结果显示:所用20对选择性引物组合对样品的扩增PCR产物均得到了清晰的条带,对条带的分析表明21个不同产地的绿竹之间多态性位点很少,由此证明所选绿竹样品之间的遗传多样性水平... 详细信息

应用AFLP技术对21个不同产地的绿竹遗传多样性进行了研究。结果显示:所用20对选择性引物组合对样品的扩增PCR产物均得到了清晰的条带,对条带的分析表明21个不同产地的绿竹之间多态性位点很少,由此证明所选绿竹样品之间的遗传多样性水平较低。

关键词：绿竹 AFLP 遗传多样性

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雷竹OsFCA同源基因的克隆与序列分析

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世界竹藤通讯 2009年第4期7卷 6-8页

作者：李丕委王弋卢江杰郭小勤浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室浙江临安311300

分别以雷竹嫩叶的基因组DNA和幼穗的cDNA为模板,采用PCR方法扩增出长为490bp及262bp的片段。序列分析结果表明,该基因序列包含1个长为228bp的内含子。其编码区共编码86个氨基酸。其氨基酸序列与水稻中OsFCA、小麦中TaFCA的一致性分别为7... 详细信息

分别以雷竹嫩叶的基因组DNA和幼穗的cDNA为模板,采用PCR方法扩增出长为490bp及262bp的片段。序列分析结果表明,该基因序列包含1个长为228bp的内含子。其编码区共编码86个氨基酸。其氨基酸序列与水稻中OsFCA、小麦中TaFCA的一致性分别为79.8%与69.9%,表明雷竹中可能存在调控开花的自主调控途径。

关键词：雷竹 OsFCA同源基因开花自主调控途径

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