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汤富酬课题组与乔杰课题组合作绘制人类心脏高精度发育细胞图谱

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北京大学学报（医学版） 2019年第2期51卷 306-306页

作者：北京大学生命科学学院北京大学生命科学学院

人类胚胎发育是一个极其复杂的过程,从一个单细胞的受精卵开始,首先经过着床前胚胎发育产生胚内和胚外组织,再到着床后原肠胚阶段三个胚层的特化,进而到器官发生、分化、成熟,及至新生命的诞生。整个280 d的胚胎发育过程从一个单细胞受... 详细信息

人类胚胎发育是一个极其复杂的过程,从一个单细胞的受精卵开始,首先经过着床前胚胎发育产生胚内和胚外组织,再到着床后原肠胚阶段三个胚层的特化,进而到器官发生、分化、成熟,及至新生命的诞生。整个280 d的胚胎发育过程从一个单细胞受精卵增殖发育形成含有上万亿个细胞的婴儿,期间基因表达受到严密、精准的调控,这一过程中的基因表达调控机制仍然亟需深入研究。2019年2月12日,北京大学未来基因诊断高精尖创新中心汤富酬课题组与北京大学第三医院乔杰课题组继续紧密合作,在 Cell Reports 发表了题为“利用单细胞转录组分析技术绘制人类心脏发育路线图”(Single-cell transcriptome analysis maps the developmental track of the human heart)的研究成果,对来自中胚层的另一重要器官心脏进行了深入的发育细胞图谱研究。

关键词：胚胎发育过程心脏发育单细胞课题组人类基因表达调控机制图谱合作

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栽培薯蓣茎段离体再生体系建立

植物学报 2024年

作者：冯雯王玉国复旦大学生命科学学院复旦大学生命科学学院

为建立栽培薯蓣（Dioscorea polystachya）组培再生体系,分别以茎尖及茎尖下不同长度的茎段为外植体,探讨不同浓度植物生长调节剂组合、培养基类型以及不同成熟度茎段对腋芽诱导和植株再生的影响。结果表明,培养基配比为MS+1.0 mg·L-16... 详细信息

为建立栽培薯蓣（Dioscorea polystachya）组培再生体系,分别以茎尖及茎尖下不同长度的茎段为外植体,探讨不同浓度植物生长调节剂组合、培养基类型以及不同成熟度茎段对腋芽诱导和植株再生的影响。结果表明,培养基配比为MS+1.0 mg·L-16-BA+0.5 mg·L-1KT和茎尖下12–20 cm的茎段为栽培薯蓣不定芽诱导的最佳组合,诱导率达到90.0%;继代培养最适培养基配方为MS+0.5 mg·L-16-BA+0.05 mg·L-1NAA+0.1 mg·L-1KT,低浓度NAA固定时,增殖系数在一定范围内随6-BA浓度的升高而增高;在相同外源激素条件下,快繁生根采用DKW培养基明显优于用常规的1/2MS培养基,生根率显著提高,达92.86%。添加1 mg PVP以及增加转接次数均能明显降低褐化率。该研究有效解决了稳定性栽培薯蓣种质资源离体扩繁取材部位优化的问题,为规模化生产栽培薯蓣优质脱毒苗奠定了良好基础。

关键词：栽培薯蓣茎段组织培养离体再生

基于3DEEM-PARAFAC的菊花特征组分快速无损鉴别

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食品科学 2024年

作者：陈思雨裴颍顾海洋 1.安徽大学生命科学学院 2.滁州学院生物与食品工程学院安徽大学生命科学学院滁州学院生物与食品工程学院

菊花不仅具有很好的观赏价值，而且气味芬芳，属药、茶两用佳品，它含有丰富的化学成分，赋予了菊花独特的香气和药用价值。为提高菊花特征组分的检测效率，提出一种基于三维荧光光谱耦合平行因子算法（3DEEM-PARAFAC）的快速鉴别方法... 详细信息

菊花不仅具有很好的观赏价值，而且气味芬芳，属药、茶两用佳品，它含有丰富的化学成分，赋予了菊花独特的香气和药用价值。为提高菊花特征组分的检测效率，提出一种基于三维荧光光谱耦合平行因子算法（3DEEM-PARAFAC）的快速鉴别方法。以四种菊花为研究对象，在分别获取样品三维荧光光谱矩阵（EEMs）后，首先通过数据预处理去除如拉曼散射和瑞利散射等干扰数据，并剔除异常值，分析光谱特征。然后，采用PARAFAC进行特征提取，通过方差解释率和残差分析法，确定菊花两种特征荧光组分，为氨基酸和黄酮类化合物。最后利用支持向量机（Support Vector Machines，SVM）和BP神经网络（Back Propagation Neural Network，BPNN）对特征变量进行分析，建立菊花快速无损鉴别模型。SVM和BPNN训练集结果分别为（100%，95.93%），测试集结果分别为（94.50%，89.61%）。分析试验结果表明，3DEEM-PARAFAC结合SVC可以实现对菊花特征组分的定性定量分析，能够对菊花进行快速鉴别。研究对菊花的无损分析检测具有一定的意义。

关键词：菊花三维荧光光谱特征组分鉴别平行因子算法支持向量机 BP神经网络

猪血浆蛋白-海藻酸钠凝胶珠对植物乳杆菌的包埋效果研究

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食品与发酵工业 2024年

作者：陈睿康旭袁江兰曾含馨湖北工业大学生命科学与健康工程学院湖北工业大学生命科学与健康工程学院

For resistance to adverse environmental effects to improve survival of Lactobacillus plantarum， in this study， gel beads were prepared by composite preparation of porcine plasma proteins (PPP) and sodium alginate (SA) using the sharp pore-coagulation method to encapsulate Lactobacillus plantarum. When the concentration of PPP was 5% and the concentration of SA was 0.4%， the hardness， springiness， and water holding capacity of the composite gel beads were better than those of the single gel， and the high efficiency of encapsulation could be achieved， with an encapsulation efficiency of 94.51%， and the porous network structure of the composite gel beads as well as the successfully encapsulated Lactobacillus plantarum could be observed by scanning electron microscopy. After simulated gastrointestinal fluid digestion， the survival rate was as high as 89.19%， and the loss of viable bacteria was only 1.09 lgCFU/g for 60 days of storage at 4 ℃， which showed excellent antidigestive property and storage stability. This suggests that the composite gel beads provide strong protection for Lactobacillus plantarum， greatly increasing the number of viable bacterial count that will ultimately act as a probiotic.

关键词：植物乳杆菌包埋猪血浆蛋白海藻酸钠凝胶珠

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基于正交试验的恒山黄芪快繁体系的优化

分子植物育种 2024年

作者：刘建霞张立张永芳刘丽珍薛乃雯 1.山西大同大学农学与生命科学学院 2.山西大同大学设施农业技术研发中心山西大同大学农学与生命科学学院山西大同大学设施农业技术研发中心

为优化黄芪快繁体系的培养条件，实现其高效快速繁殖。本实验选取恒山黄芪无菌苗为外植体，通过设计基本培养基种类、植物激素浓度及光照强度，选出适合黄芪茎段腋芽萌发、丛生芽增殖和组培苗生根的快繁条件。通过正交试验方法筛选出最... 详细信息

为优化黄芪快繁体系的培养条件，实现其高效快速繁殖。本实验选取恒山黄芪无菌苗为外植体，通过设计基本培养基种类、植物激素浓度及光照强度，选出适合黄芪茎段腋芽萌发、丛生芽增殖和组培苗生根的快繁条件。通过正交试验方法筛选出最佳培养模式，以精准优化黄芪快速繁殖体系。结果显示：光强达到6 000 lx以上，MS＋6-BA 0.2 mg/L＋NAA 0.4 mg/L是茎段腋芽最佳萌发培养基，萌发率为94%；MS＋6-BA 0.2 mg/L＋IAA 0.2 mg/L＋GA 0.05 mg/L是丛生芽最佳增殖培养基，增殖系数6.6；1/2 MS＋NAA 0.5 mg/L＋IAA 1.0 mg/L是组培苗最佳生根培养基，生根率69%。本研究所采用的正交设计方法不仅为黄芪快繁体系的优化提供科学依据，同时也为黄芪的产业化育苗及基因工程研究奠定了重要基础。

关键词：恒山黄芪快繁正交实验优化

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珠芽魔芋应答软腐病菌侵染初期的转录组分析

分子植物育种 2024年

作者：李云芳李珩珺汪子扬赵星李文超徐慧妮李昆志昆明理工大学生命科学与技术学院昆明理工大学生命科学与技术学院

为探讨珠芽魔芋抗软腐菌病的分子机制，本研究以接种软腐菌的珠芽魔芋叶片和接种无菌水的珠芽魔芋叶片为实验材料，通过转录组测序技术，对珠芽魔芋抗软腐病相关基因和代谢途径进行分析。结果表明，共90 393个Unigene被成功注释。GO分... 详细信息

为探讨珠芽魔芋抗软腐菌病的分子机制，本研究以接种软腐菌的珠芽魔芋叶片和接种无菌水的珠芽魔芋叶片为实验材料，通过转录组测序技术，对珠芽魔芋抗软腐病相关基因和代谢途径进行分析。结果表明，共90 393个Unigene被成功注释。GO分析表明6 299个基因注释到36条通路中，主要聚集在与跨膜转运、细胞膜和酶催化活性相关的通路中。KEGG通路富集分析发现1 689个差异基因比对到118个KEGG通路中，通过对转录组中显著上调和显著下调通路分析，推测珠芽魔芋在软腐菌侵染初期通过增强合成亚麻酸、激素和芳香族氨基酸，减少细菌利用的糖类物质供给，从而调控软腐病菌破坏寄主，提高珠芽魔芋抗软腐病菌能力。此外，在激素转导途径中有52个基因上调表达，可能与抗病相关的乙烯、茉莉酸、水杨酸和油菜素内酯基因共36个基因上调表达。qRT-PCR分析验证了与抗病蛋白有关的5个基因的表达量与转录组结果趋于一致。本研究为深入研究珠芽魔芋抗软腐病机理及发掘抗软腐病相关的关键基因提供参考。

关键词：珠芽魔芋转录组软腐病菌差异表达基因代谢通路

基于代谢组学探究牛至精油对绵羊直肠粪便代谢物的影响

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草业科学 2024年

作者：宋淑珍刘立山周瑞 1.甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所 2.西北民族大学生命与工程学院甘肃省农业科学院畜草与绿色农业研究所西北民族大学生命与工程学院

本试验旨在研究饲喂牛至精油对绵羊粪便代谢物的影响。选择体重接近[（20.00±1.27）kg]的萨福克与小尾寒羊杂交公羔12只，随机分为2组，每组6只羊。分别为对照组、牛至精油组。对照组饲喂基础饲粮，牛至精油组饲喂基础饲粮+7 g·d-1·... 详细信息

本试验旨在研究饲喂牛至精油对绵羊粪便代谢物的影响。选择体重接近[（20.00±1.27）kg]的萨福克与小尾寒羊杂交公羔12只，随机分为2组，每组6只羊。分别为对照组、牛至精油组。对照组饲喂基础饲粮，牛至精油组饲喂基础饲粮+7 g·d-1·只-1牛至精油。预试期10 d，正式期72 d。试验期结束后，采集直肠粪便进行液相色谱-串联质谱法（liquid chromatography-tandem mass spectrometry，LC-MS/MS）非靶向代谢组学技术筛选差异代谢物。结果表明：1)两组试验羊的粪便中正、负离子模式共筛选出甲基-2，3-O-二烯丙基-4，6-O-亚苄基-alpha-D-吡喃甘露糖苷、二十二碳-4，7，10，13，16-五烯酸酯、甲基胍、腺嘌呤、18：1碳链溶血磷脂酰乙醇胺、N-乙酰-D-神经氨酸、环己烷羧酸、4-甲氧基苯乙酸、DL-多巴、胸腺嘧啶、去甲氧基姜黄素、5’-甲基硫代腺苷、间羟基苯甲酸等15种差异代谢物（∣LogFC∣>1，P1），且与对照组相比，牛至精油组的差异代谢物全部上调。2)差异代谢物KEGG通路富集到萜类和类固醇的合成，微生物代谢，苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的合成，半胱氨酸和蛋氨酸代谢、芳香族化合物的降解等6条通路（Impact>0.1），分别归属于脂质代谢，消化道微生物代谢和氨基酸代谢。这表明，牛至精油可能参与育肥羊脂质代谢、有机物代谢和氨基酸代谢，通过调节代谢途径发挥其在羊养殖中的健康维护作用。

关键词：牛至精油羊微生物代谢氨基酸代谢

玉米纹枯病菌菌核形成相关基因CYP450表达特性分析

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延安大学学报(自然科学版) 2024年

作者：刘博任启峰贺妍刘阳张昊回虹燕贺晓龙 1.延安大学生命科学学院 2.陕西省黄土高原资源植物研究与利用省市共建重点实验室 3.商洛市农业科学研究所延安大学生命科学学院陕西省黄土高原资源植物研究与利用省市共建重点实验室商洛市农业科学研究所

为了从立枯丝核菌菌核形成探寻纹枯病防治方法，试验从田间采集玉米纹枯病发病植株，分离纯化立枯丝核菌菌株。使用生物信息学分析软件对CYP450基因的结构与功能进行分析，可知CYP450可能是一种亲水性蛋白且不存在跨膜序列，由397个氨... 详细信息

为了从立枯丝核菌菌核形成探寻纹枯病防治方法，试验从田间采集玉米纹枯病发病植株，分离纯化立枯丝核菌菌株。使用生物信息学分析软件对CYP450基因的结构与功能进行分析，可知CYP450可能是一种亲水性蛋白且不存在跨膜序列，由397个氨基酸共同编码，含有信号肽。利用实时荧光定量PCR技术，对立枯丝核菌CYP450基因菌核形成过程中基因表达量变化进行研究，探寻CYP450基因在菌核形成过程中的作用。分析结果显示CYP450基因在菌核形成过程中表达量有显著差异，其中在菌丝时期表达量低，菌核形成后表达量有逐渐增高趋势，即在立枯丝核菌菌核形成过程中，CYP450可能参与了玉米纹枯病菌菌核的形成，该结果为玉米纹枯病的防治及抗病育种提供理论依据。

关键词：立枯丝核菌 CYP450基因表达量菌核玉米纹枯病

西藏地区两种蝙蝠新纪录：安氏长舌果蝠和艾氏管鼻蝠

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兽类学报 2024年

作者：刁海欣苏浩晖石子凡裴枭鑫黄秦于传庭李权余文华吴毅蒋学龙陈中正 1.安徽师范大学生态与环境学院皖江流域退化生态系统的恢复与重建省部共建协同创新中心 2.广州大学生命科学学院华南生物多样性保护与利用重点实验室 3.中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室 4.深圳市红树林生态研究中心有限公司安徽师范大学生态与环境学院皖江流域退化生态系统的恢复与重建省部共建协同创新中心广州大学生命科学学院华南生物多样性保护与利用重点实验室中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室深圳市红树林生态研究中心有限公司

2020年10月和2023年12月于西藏墨脱县采集到2号蝙蝠标本，其中1号标本(雄性)体型中等，耳较小，鼻孔不突出，吻部细长；头骨小且细长，颧宽较窄，枕部显著向下转折，上犬齿尖细，上下门齿均为两对且较小，与安氏长舌果蝠(Macroglossus s... 详细信息

2020年10月和2023年12月于西藏墨脱县采集到2号蝙蝠标本，其中1号标本(雄性)体型中等，耳较小，鼻孔不突出，吻部细长；头骨小且细长，颧宽较窄，枕部显著向下转折，上犬齿尖细，上下门齿均为两对且较小，与安氏长舌果蝠(Macroglossus sobrinus)特征相符。基于COI基因构建的最大似然树显示其与安氏长舌果蝠聚为一支，两者遗传距离差异为0.6%，支持其为安氏长舌果蝠。另1号标本(雄性)背毛呈暗黄褐色，带有金属光泽，腹毛灰白，毛基灰黑色，翼膜黑色，耳近似卵圆形，鼻吻部呈短管状突出，与艾氏管鼻蝠(Murina eleryi)特征相符。基于COI基因构建的系统发育分析显示其与艾氏管鼻蝠聚为一支，支持其为艾氏管鼻蝠。安氏长舌果蝠和艾氏管鼻蝠均为西藏地区翼手目新纪录。

关键词：安氏长舌果蝠艾氏管鼻蝠西藏新纪录