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缢蛏6个群体遗传结构的ISSR分析

应用与环境生物学报 2009年第3期15卷 332-336页

作者：牛东红李家乐冯冰冰刘达博上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海200090

采用ISSR分子标记对采自福建宁德(ND)、浙江台州(TZ)、上海崇明(CM)、山东海阳(HY)、天津汉沽(HG)和辽宁庄河(ZH)的缢蛏6个野生群体进行遗传多样性和遗传关系分析.筛选出10条ISSR引物对6个群体共216个样品进行扩增,共得到138个清晰的扩... 详细信息

采用ISSR分子标记对采自福建宁德(ND)、浙江台州(TZ)、上海崇明(CM)、山东海阳(HY)、天津汉沽(HG)和辽宁庄河(ZH)的缢蛏6个野生群体进行遗传多样性和遗传关系分析.筛选出10条ISSR引物对6个群体共216个样品进行扩增,共得到138个清晰的扩增位点,其中多态性位点135个,多态位点百分率为97.83%,在物种水平上的遗传多样性较为丰富.群体遗传多样性分析结果表明,6个群体的多态位点百分率在61.59%～72.46%之间,基因多样性指数和Shannon’s信息指数分别在0.1043～0.1766和0.1789～0.2808之间,其中ND群体的多样性指数最低.群体间遗传分化、遗传距离和聚类结构显示,ND群体和TZ群体亲缘关系最近,首先聚为一支,之后依次与CM群体及HG群体和HY群体聚类,最后与ZH群体聚在一起,表明地理位置较远的群体,遗传距离也较远.

关键词：缢蛏群体遗传遗传结构 ISSR

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厚壳贻贝海区保苗技术初探

江苏农业科学 2013年第11期41卷 268-270页

作者：刘达博叶士伦苏明兆方伦益叶雅球浙江省嵊泗县海洋与渔业局浙江嵊泗202450 浙江省嵊泗县昌盛海水养殖专业合作社浙江嵊泗202450

为了探索厚壳贻贝海区保苗技术，以稚贝为对象，在不同苗种规格、海区放养深度、放养密度条件下，对厚壳贻贝进行海区保苗技术研究。结果表明，在厚壳贻贝前期暂养过程中，应保证保苗苗种规格在1．5～2．0 mm，放养深度在3～4 m，放养... 详细信息

为了探索厚壳贻贝海区保苗技术，以稚贝为对象，在不同苗种规格、海区放养深度、放养密度条件下，对厚壳贻贝进行海区保苗技术研究。结果表明，在厚壳贻贝前期暂养过程中，应保证保苗苗种规格在1．5～2．0 mm，放养深度在3～4 m，放养密度不宜超过10000粒/袋；在后期包苗后，苗种总粒数要控制在1200粒/串，可大大提高厚壳贻贝的成活率和生长速度。

关键词：厚壳贻贝海区保苗技术

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缢蛏7群体的形态差异与判别分析

海洋渔业 2009年第4期31卷 363-368页

作者：刘达博牛东红姜志勇李家乐上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海201306

运用多变量形态度量学分析方法,对我国沿海庄河、汉沽、海阳、盐城、崇明、宁波、漳州7个地理群体缢蛏的12个形态性状进行了形态差异研究。聚类分析和主成分分析结果表明,汉沽群体和海阳群体首先与庄河群体聚类,之后依次与崇明群体和盐... 详细信息

运用多变量形态度量学分析方法,对我国沿海庄河、汉沽、海阳、盐城、崇明、宁波、漳州7个地理群体缢蛏的12个形态性状进行了形态差异研究。聚类分析和主成分分析结果表明,汉沽群体和海阳群体首先与庄河群体聚类,之后依次与崇明群体和盐城群体聚类,最后与宁波和漳州群体聚为一支。主成分分析构建了3个主成分,其贡献率：主成分1为36.28%,主成分2为22.23%,主成分3为12.72%,累积贡献率为71.23%。判别分析结果表明,7群体间形态差异显著（P〈0.01）。建立7群体缢蛏的判别函数,其判别准确率P1为66.67%-86.67%,P2为68.96%-100%。7群体的综合判别率为77.93%。

关键词：缢蛏地理群体形态差异判别分析

浙闽沿海缢蛏群体遗传结构的微卫星和线粒体COⅠ序列分析

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水产学报 2011年第12期35卷 1805-1813页

作者：牛东红冯冰冰刘达博沈和定李家乐上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海市高校水产养殖学E-研究院

我国缢蛏养殖规模不断扩大,而缢蛏主产区苗种的遗传结构却缺乏系统的分析研究。利用微卫星标记和线粒体COⅠ序列分析了我国浙闽沿海8个缢蛏群体的遗传多样性和遗传分化水平。基于微卫星标记的遗传多样性分析结果显示,群体的平均有效等... 详细信息

我国缢蛏养殖规模不断扩大,而缢蛏主产区苗种的遗传结构却缺乏系统的分析研究。利用微卫星标记和线粒体COⅠ序列分析了我国浙闽沿海8个缢蛏群体的遗传多样性和遗传分化水平。基于微卫星标记的遗传多样性分析结果显示,群体的平均有效等位基因数(Ne)为6.2～9.0,期望杂合度(He)为0.806～0.875;基于线粒体COⅠ标记的遗传多样性结果显示,单倍型多态性(Hd)为0.942～1.000,核苷酸多样性指数(P)为0.005 6～0.011 5。基于微卫星标记的群体间遗传分化值(FST)为0.001 4～0.063 8,除NH和SM群体外,其他群体间均具有显著性差异;基于线粒体COⅠ标记的群体间遗传分化值(FST)为0.000 9～0.368 0,部分群体间具有显著性差异。基于微卫星标记和线粒体COⅠ标记的聚类结果表明,位于同一海湾内的群体首先聚类在一起,但是浙江和福建沿海8群体并不符合地理距离隔离模式的聚类方式,而呈现出浙江群体和福建群体的交叉聚类。由此可见,我国缢蛏主产区浙闽沿海群体仍具有较高的遗传多样性水平,但是异地群体间产生了基因交流,并形成了新的地方性种群。

关键词：缢蛏微卫星线粒体DNA 遗传结构

乐清湾和三沙湾缢蛏群体遗传多样性的微卫星分析

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上海海洋大学学报 2011年第3期20卷 350-357页

作者：刘达博牛东红冯冰冰钟玉民李家乐上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海市高校水产养殖学E研究院

利用微卫星标记分析了我国浙江乐清湾翁垟(ZWY)、乐成(ZYC)、南岳(ZNY)、南塘(ZNT)、清江(ZQJ)、湖雾(ZHW)、坞根(ZWG)、海山(ZHS)和芦浦(ZLP)9个群体和福建三沙湾漳湾(FZW)、梅田(FMT)、三都(FSD)、渔江(FYJ)、白招(FBZ)、霞塘(FXT)、... 详细信息

利用微卫星标记分析了我国浙江乐清湾翁垟(ZWY)、乐成(ZYC)、南岳(ZNY)、南塘(ZNT)、清江(ZQJ)、湖雾(ZHW)、坞根(ZWG)、海山(ZHS)和芦浦(ZLP)9个群体和福建三沙湾漳湾(FZW)、梅田(FMT)、三都(FSD)、渔江(FYJ)、白招(FBZ)、霞塘(FXT)、长春(FCC)、沙江(FSJ)和溪尾(FXW)9个缢蛏群体的遗传多样性和遗传分化,以期评价乐清湾和三沙湾内缢蛏群体的遗传结构差异,为我国缢蛏主要原产地种质资源保护和遗传育种提供基础资料。遗传多样性结果表明,浙江乐清湾和福建三沙湾内的缢蛏群体中各位点平均有效等位基因数Ne变化范围分别为8.146～10.457和7.457～9.947,平均期望杂合度He分别为0.872～0.909和0.846～0.894,Nei’s基因多样性指数分别为0.863～0.899和0.836～0.886,显示乐清湾和三沙湾缢蛏群体的遗传多样性仍处于较高水平。群体间遗传分化指数(FST)结果表明,缢蛏各群体间FST为0.000 1～0.052 3。基于Nei’s遗传距离(DA)构建非加权组平均法(UPGMA)系统树结果显示,18个群体聚类为2支,除ZWY和ZWG群体外,ZYC、ZNY、ZNT、ZQJ、ZHW、ZHS和ZLP浙江群体单独聚为一支;而ZWY、ZWG群体与FZW、FMT、FSD、FSJ、FBZ、FXT、FCC、FSJ和FXW 9个福建群体聚类在一起,因此推测浙江的ZWY、ZWG群体可能来自福建,揭示在缢蛏的养殖过程中可能存在引苗现象。研究亮点:应用微卫星分子标记技术研究缢蛏的种质资源,其研究结果较科学、稳定。浙江和福建是缢蛏的主产区,而乐清湾和三沙湾则是这两个主产区的"产苗和育苗基地",通过微卫星技术评价湾内的遗传结构差异,以探讨这两个主产区之间是否存在引苗现象。

关键词：缢蛏乐清湾三沙湾微卫星标记遗传多样性

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嵊泗列岛海域三种贻贝贝体框架特征的差异

海洋与湖沼 2014年第5期45卷 1078-1084页

作者：白晓倩杨阳邹李昶任夙艺刘达博刘祖毅王志铮浙江海洋学院舟山316022 余姚市水产技术推广中心余姚315400 嵊泗县海洋与渔业局嵊泗202450

以壳长SL、壳宽SW、壳高SH(BD)、OA(壳顶至韧带末端的直线距离)、OB(壳顶至壳背面最高点的直线距离)、OC(壳顶至壳后端最远点的直线距离)、OD(壳顶至壳高性状在腹缘的落点的直线距离)、AB(韧带末端至壳背缘最高点的直线距离)、BC(壳背... 详细信息

以壳长SL、壳宽SW、壳高SH(BD)、OA(壳顶至韧带末端的直线距离)、OB(壳顶至壳背面最高点的直线距离)、OC(壳顶至壳后端最远点的直线距离)、OD(壳顶至壳高性状在腹缘的落点的直线距离)、AB(韧带末端至壳背缘最高点的直线距离)、BC(壳背缘最高点至壳后端最远点的直线距离)、CD(壳后端最远点至壳高性状在腹缘的落点的直线距离)为贝体框架变量,采用多元分析方法系统比较了嵊泗列岛海域厚壳贻贝、紫贻贝和"杂交贻贝"贝体框架特征的差异,结果表明:(1)在所涉9项贝体框架特征指标中,紫贻贝与厚壳贻贝间无显著差异的指标仅为L5(OC/SL)和L7(AB/SL)(P>0.05),而"杂交贻贝"各项指标则均与厚壳贻贝和紫贻贝具显著差异(P0.05),分别为0.452和0.418;(3)经主成分分析,提取到的3个特征值均大于1的主成分,累计贡献率达82.928%,其中第一主成分、第二主成分、第三主成分可依次归为与滤食功能区水平剖面占比相关的贝体框架因子,与消化功能区水平剖面占比相关的贝体框架因子,和与消化功能区垂直剖面占比相关的贝体框架因子,通过第一主成分仅能较清晰地区分厚壳贻贝和"杂交贻贝";(4)采用逐步判别法,以判别贡献率较大的L1(SW/SL)、L3(OA/SL)、L4(OB/SL)、L5(OC/SL)、L6(OD/SL)和L7(AB/SL)为自变量,所建Fisher分类函数方程组可较清晰区分厚壳贻贝、紫贻贝和"杂交贻贝",三者的判别准确率依次为94.6%、94.6%和100%,综合判别准确率为96.4%。

关键词：贝体框架特征指标多元分析厚壳贻贝紫贻贝 “杂交贻贝”

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缢蛏SRAP-PCR体系的正交优化

生物技术通报 2011年第6期27卷 99-103页

作者：钟玉民刘达博冯冰冰陈慧林国文李家乐上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室上海201306 福建省闽东水产研究所宁德352100

运用L_(16)(4~5)正交设计对影响缢蛏SRAP-PCR反应的5个因素:Taq酶浓度、Mg^(2+)浓度、模板DNA浓度、dNTPs浓度和引物浓度在4个水平上进行了优化试验,PCR结果采用SPSS v16.0软件分析。结果表明,各因素对SRAP-PCR反应的影响依次为:引物>Ta... 详细信息

运用L_(16)(4~5)正交设计对影响缢蛏SRAP-PCR反应的5个因素:Taq酶浓度、Mg^(2+)浓度、模板DNA浓度、dNTPs浓度和引物浓度在4个水平上进行了优化试验,PCR结果采用SPSS v16.0软件分析。结果表明,各因素对SRAP-PCR反应的影响依次为:引物>Taq酶>模板DNA>Mg^(2+);缢蛏SRAP反应最佳体系为:在20μL PCR反应体系中,引物0.3μmol/L、Taq酶0.5 U、模板DNA 50 ng、dNTPs 0.2 mmol/L及Mg^(2+)2 mmol/L。用不同缢蛏的基因组DNA两次SRAP-PCR扩增,8对引物均能扩增出清晰且重复性好的谱带。因而建立的缢蛏反应体系稳定可靠。

关键词：缢蛏 SRAP 正交设计优化

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缢蛏种群遗传多样性的周年变异分析

生物技术通报 2012年第1期28卷 168-171页

作者：牛东红刘达博陈慧冯冰冰林国文李家乐上海海洋大学水产与生命学院上海201306 福建省闽东水产研究所宁德352100

利用线粒体COI标记分析了福建省宁德市漳湾镇横屿村滩涂5个月份缢蛏群体(S3,S5,S7,S9,S11)的遗传结构,以期评估不同月份时期种群的遗传多样性差异。基于线粒体COI基因的结果表明,5个缢蛏群体的平均核苷酸差异数位于2.7836-3.6894之间,... 详细信息

利用线粒体COI标记分析了福建省宁德市漳湾镇横屿村滩涂5个月份缢蛏群体(S3,S5,S7,S9,S11)的遗传结构,以期评估不同月份时期种群的遗传多样性差异。基于线粒体COI基因的结果表明,5个缢蛏群体的平均核苷酸差异数位于2.7836-3.6894之间,核苷酸多样性指数位于0.0050-0.0066之间,遗传多样性水平大致表现为S3和S5群体较高于S7和S9群体,明显高于S11群体。AMOVA分析结果显示,群体间遗传变异量占总变异的7.18%,而群体内变异达到了92.82%,说明遗传差异主要来自于群体内部。由此可见,从3月份到11月份,缢蛏群体的遗传多样性水平呈现出下降趋势,尤其是在11月份,差异最为明显。

关键词：缢蛏遗传多样性遗传分化线粒体DNA

紫贻贝挂养密度和挂养间距对养成效果的影响效应

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齐鲁渔业 2015年第5期32卷 1-4页

作者：叶雅球刘达博刘祖毅金友定浙江省嵊泗县海洋与渔业局 202450 嵊泗县金盟海水养殖专业合作社

紫贻贝（Mytilus edulis Linnaeus）是瓣鳃纲、贻贝目、贻贝科、贻贝属的软体动物，俗称“黑贻贝”、“海红”。紫贻贝肉味鲜美、营养丰富，是一种经济价值较大、可人工养殖的双壳贝类，主要分布于我国渤海、黄海、东海沿岸。

关键词：紫贻贝影响效应间距密度软体动物营养丰富经济价值双壳贝类