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阿尔茨海默病关键蛋白β-淀粉样蛋白的聚集机理

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科学通报 2024年第7期69卷 903-911页

作者：李言言毛玺雯刘珂妤牛铮河南大学药学院开封475004 河南大学迈阿密学院开封475004

阿尔茨海默病是一种典型的神经退行性疾病.由β-淀粉样蛋白的错误折叠和异常聚集导致的淀粉样斑块沉积,是该疾病的主要病理特征之一.淀粉样蛋白倾向于从天然的无规则单体状态聚集形成高度有序的淀粉样纤维,此类病理性纤维的形成及其在... 详细信息

阿尔茨海默病是一种典型的神经退行性疾病.由β-淀粉样蛋白的错误折叠和异常聚集导致的淀粉样斑块沉积,是该疾病的主要病理特征之一.淀粉样蛋白倾向于从天然的无规则单体状态聚集形成高度有序的淀粉样纤维,此类病理性纤维的形成及其在细胞间的扩散与多种神经退行性疾病的发生发展密切相关.本文综述了β-淀粉样蛋白聚集过程中的成核机制,主要包括初级成核过程、次级成核过程和延伸过程;讨论了在β-淀粉样蛋白聚集早期出现的液-液相分离现象,进而分析了液-液相分离和液-固相转化过程在聚集过程中的作用;最后总结了聚集过程中形成的淀粉样纤维的分子结构,以期通过对聚集机理和分子结构的深入研究,串联起蛋白质聚集和聚集体神经毒性之间的联系,理解阿尔茨海默病的发展进程,进而通过调控蛋白质的聚集和相变过程,达到治疗或者缓解阿尔茨海默病的目的.

关键词：阿尔茨海默病 β-淀粉样蛋白蛋白质聚集液-液相分离固体核磁共振

安吉试点园户外游戏环境研究 ——基于人类发展生态学微观系统的视角

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安吉试点园户外游戏环境研究 ——基于人类发展生态学微观系统的...

作者：钱炯妤大理大学

学位级别：硕士

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基于深度学习的蛋白质热稳定性预测方法研究

基于深度学习的蛋白质热稳定性预测方法研究

作者：李梦妤北京化工大学

学位级别：硕士

蛋白质的热稳定性通常用其熔化温度（Tm）来表征,但由于实验确定的Tm信息数量有限,且现有的计算方法预测Tm的准确性不够高,因此需要一种新的计算方法来预测蛋白质的Tm值。在本论文中,我们提出了一种名为DeepTM的模型,它基于图卷积神经... 详细信息

蛋白质的热稳定性通常用其熔化温度（Tm）来表征,但由于实验确定的Tm信息数量有限,且现有的计算方法预测Tm的准确性不够高,因此需要一种新的计算方法来预测蛋白质的Tm值。在本论文中,我们提出了一种名为DeepTM的模型,它基于图卷积神经网络和自注意力网络,旨在精准预测目标蛋白质的Tm值。本论文开发了一个从蛋白质序列直接预测其宿主最佳生长温度（OGT）的深度学习模型。该模型在包含25852条序列的OGT数据集上训练,并在测试集上表现优秀（判定系数=0.74,皮尔逊相关系数=0.86,均方根误差RMSE=12.97℃）。皮尔逊相关系数P显示出OGT预测值与OGT实验值之间极强的相关性。因此,我们使用预测的OGT值替代实验OGT值,进行接下来的Tm预测任务。本论文结合预测的OGT数据和氨基酸序列特征开发了Tm预测模型,并在包含了7790条嗜热蛋白质的数据集上训练了名为DeepTM的模型,模型性能表现优秀（=0.76,=0.87,RMSE=6.17℃）。这一计算结果表明仅使用高Tm值的蛋白质序列训练模型,能够显著提高对Tm的预测能力。此外,我们发现二肽频率、OGT以及蛋白质的进化信息对Tm有较大的影响。本论文将DeepTM应用于蛋白质工程设计领域,成功预测了22个PET塑料降解酶和29个不同类别的热稳定蛋白质的Tm值,并与最近报道的Pro Tstab2和DeepSTABp方法进行了比较。在塑料降解酶的预测中,DeepTM的RMSE相较于Pro Tstab2和DeepSTABp,分别降低了58.85%和60.66%。在热稳定蛋白质的预测中,DeepTM相较与Pro Tstab2,RMSE降低了51.73%。本论文构建了一个名为DeepTM的深度学习模型。该模型仅利用蛋白质的序列信息就能够精准地预测其Tm,实现了完全端到端的预测过程。这为蛋白质热稳定性的预测提供了一个可靠的工具,也为未来进一步的研究和应用提供了方向。

关键词：蛋白质热稳定性熔化温度深度学习预测器图卷积神经网络自注意力网络序列特征

基于TOD理论的济南轨道交通站域公共空间设计研究 ——以二环西路站为例

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基于TOD理论的济南轨道交通站域公共空间设计研究 ——以二环西路...

作者：龙思妤山东工艺美术学院

学位级别：硕士

随着我国城镇化的快速发展,由人地矛盾所引起的城市土地资源紧缺、环境恶化、交通堵塞、运行低效等问题逐渐受到关注,城市空间如何建立以轨道交通为核心的城市发展模式,成为值得研究与思考的命题。对此,公共交通导向型开发(T0D)理论作... 详细信息

随着我国城镇化的快速发展,由人地矛盾所引起的城市土地资源紧缺、环境恶化、交通堵塞、运行低效等问题逐渐受到关注,城市空间如何建立以轨道交通为核心的城市发展模式,成为值得研究与思考的命题。对此,公共交通导向型开发(T0D)理论作为有效整合城市交通及城市建设的设计方法,在日本、新加坡乃至北京、深圳等国内一线城市开始广泛应用,但基于国情差异,国内研究仍存在概念泛化等问题,且多集中于宏观层面的轨道交通线网及微观层面的综合体建筑设计,对站域公共空间整合性研究相对匮乏,阻碍轨道交通站点对城市发展的触媒效应。本文以济南轨道交通站域公共空间为研究对象,以TOD理论为指导手段,探究TOD理论下城市轨道交通站域公共空间更新设计策略。本文重点分为四个部分,第一,详细梳理轨道交通站点区域空间、TOD理论、城市公共空间相关研究现状,确认研究内容。第二,对TOD理论的概念发展、空间构成、适用地区及核心特性进行基础性研究,同时明确轨道交通站域公共空间类别、要素、人群活动类型及心理需求,进而指出TOD理论应用于轨道交通站域的更新维度,为后文设计实践指明更新路径。第三,依据界定的轨道交通站点分类依据,将济南现有轨道交通站点进行分类,并选取代表性站点进行实地调研,从交通、功能、空间与景观层面归纳现存问题,结合人群满意度分析,总结出更为有效的更新原则。第四,针对其交通层面的道路网络、接驳空间、功能组织层面的用地性质、开发强度、空间层面的广场空间、景观空间、微型空间等要素进行具体的更新,将原本割裂的城市道路系统、功能配置、空间形态重新整合,促成站域公共空间成为有机统一体,为今后商业中心型、片区组团型等同类别站点更新提供借鉴。

关键词： TOD理论站域公共空间更新设计

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农产品直播电商生态系统运行机制研究

农产品直播电商生态系统运行机制研究

作者：赵国妤河南工业大学

学位级别：硕士

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未来制造颠覆性技术创新生态系统演化博弈

计算机集成制造系统 2024年

作者：瞿浩翔徐江徐静妤同济大学设计创意学院

为更好促进未来制造背景下制造业颠覆性技术创新发展，构建包括先进制造企业、研发机构与政府部门的三方演化博弈模型。基于主体策略稳定性分析，探究政府奖惩力度、技术研发成本等因素对系统演化的影响；建立复制动态方程组，分析博弈... 详细信息

为更好促进未来制造背景下制造业颠覆性技术创新发展，构建包括先进制造企业、研发机构与政府部门的三方演化博弈模型。基于主体策略稳定性分析，探究政府奖惩力度、技术研发成本等因素对系统演化的影响；建立复制动态方程组，分析博弈系统均衡点稳定性；运用强化学习算法交叉检验系统鲁棒性。结果表明：系统发展分为新生期、发展期、扩张期与成熟期四个阶段；系统运行在不同条件下均具有较好鲁棒性，且政府部门实际决策过程轨迹振幅较大。制造企业创新收益分配占比的提升在扩张期与成熟期对系统演化速率有正向激励作用，研发机构独立研发成本则在新生期与扩张期呈类似效果，技术外包投入则在全过程中起反向约束作用。

关键词：未来制造颠覆性技术创新演化博弈强化学习

带时间窗的多中心开闭混合式电动车配送路径优化问题研究

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中国管理科学 2024年

作者：苟梦圆王勇罗思妤许茂增重庆交通大学经济与管理学院绿色物流智能技术重庆市重点实验室

针对多中心电动车辆路径优化研究在资源共享和开闭混合式车辆路径设计相结合方面存在的不足，研究了带时间窗的多中心开闭混合式电动车配送路径优化问题。首先，构建了包含机械功率、放电效率和能量转化效率等因素的电动车电量消耗最小... 详细信息

针对多中心电动车辆路径优化研究在资源共享和开闭混合式车辆路径设计相结合方面存在的不足，研究了带时间窗的多中心开闭混合式电动车配送路径优化问题。首先，构建了包含机械功率、放电效率和能量转化效率等因素的电动车电量消耗最小化和运营成本最小化的双目标优化模型。然后，提出了基于贪婪算法的改进NSGA-II混合算法求解模型，该混合算法设计了基于时空距离的贪婪算法生成初始种群，并结合问题特征进行了种群异位交叉与变异操作，增强了种群多样性，以及设计了充电站插入策略和资源共享策略，进而提高了算法收敛速度。其次，将所提算法与多目标粒子群算法、多目标差分进化算法和多目标遗传算法进行对比分析，并应用帕累托解数量、超体积与平均理想距离算法性能衡量指标进一步比较分析，综合验证了所提算法的有效性。最后，结合实例对提出的模型和算法进行验证，并对不同开闭混合模式和不同合作模式下的多中心电动配送车辆路径优化方案进行了对比分析。结果表明，多中心开闭混合式电动车配送路径优化方法能够有效降低电动车配送网络的运营成本、减少电动车的总电量消耗和使用数量，并有利于提高多中心电动车配送网络的资源配置效率，进而为城市电动车物流配送网络优化调度以及新能源物流网络构建提供方法支持和理论支撑。

关键词：多中心电动车配送网络开闭混合式路径基于贪婪算法的改进NSGA-II混合算法资源共享策略合作模式

IL-6、CRP和PCT水平对艾滋病相关淋巴瘤初治患者的预后影响

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IL-6、CRP和PCT水平对艾滋病相关淋巴瘤初治患者的预后影响

作者：陈星妤大理大学

学位级别：硕士

波浪往复流作用下沙纹床面的旋涡结构和悬沙运动数值研究

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工程力学 2024年第10期41卷 200-211页

作者：侯新妤陈鑫中国农业大学水利与土木工程学院北京100083 中国农业大学北京市供水管网系统安全与节能工程技术研究中心北京100083

波浪作用下沙纹上的泥沙输运在海岸地貌的塑造中具有重要的地位,但相关的传统数值模型的精度受制于泥沙近底边界条件等因素。从最大程度节省计算成本且保证精度的角度考虑,该文发展了单相流的泥沙输移扩散数值模型以研究波浪往复流作用... 详细信息

波浪作用下沙纹上的泥沙输运在海岸地貌的塑造中具有重要的地位,但相关的传统数值模型的精度受制于泥沙近底边界条件等因素。从最大程度节省计算成本且保证精度的角度考虑,该文发展了单相流的泥沙输移扩散数值模型以研究波浪往复流作用下沙纹床面的旋涡结构和悬沙运动。泥沙近底边界条件考虑了非线性波作用下的加速度效应和非对称边界层发展,以及泥沙的质量守恒和相位差效应。模型考虑了颗粒惯性及尾涡对泥沙运动的影响,同时以更适合沙纹上逆压梯度流的SST k-ω紊流模型闭合时均雷诺应力。数值结果与实验数据符合良好,可以准确预测沙纹固定点的周期浓度变化以及平均悬沙浓度在垂向上的分布。该文进一步选用边界截止涡量进行了涡中心、涡大小和涡强度的定量分析,用数值结果描述了旋涡的形成、发展和喷射过程以及对应的沙云团发展。

关键词：往复流涡动沙纹涡识别颗粒尾涡近底边界条件